MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 plasmid pDC3000B

Total Repeats: 997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004632	ACC	2	6	39764	39769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171591
502	NC_004632	T	6	6	39933	39938	0 %	100 %	0 %	0 %	29171592
503	NC_004632	CAGC	2	8	39959	39966	25 %	0 %	25 %	50 %	29171592
504	NC_004632	ACC	2	6	39989	39994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171592
505	NC_004632	TGG	2	6	39995	40000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171592
506	NC_004632	GCCAG	2	10	40022	40031	20 %	0 %	40 %	40 %	29171592
507	NC_004632	GCTG	2	8	40041	40048	0 %	25 %	50 %	25 %	29171592
508	NC_004632	CTC	2	6	40066	40071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29171592
509	NC_004632	GAT	2	6	40072	40077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171592
510	NC_004632	GGT	2	6	40111	40116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171592
511	NC_004632	GCGA	2	8	40181	40188	25 %	0 %	50 %	25 %	29171592
512	NC_004632	CTG	2	6	40220	40225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171592
513	NC_004632	ACC	2	6	40237	40242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171592
514	NC_004632	GTT	2	6	40323	40328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29171592
515	NC_004632	TGG	2	6	40353	40358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171592
516	NC_004632	GGC	2	6	40386	40391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171592
517	NC_004632	ATTC	2	8	40461	40468	25 %	50 %	0 %	25 %	29171592
518	NC_004632	CG	3	6	40470	40475	0 %	0 %	50 %	50 %	29171592
519	NC_004632	ATC	2	6	40573	40578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171592
520	NC_004632	GGGT	2	8	40580	40587	0 %	25 %	75 %	0 %	29171592
521	NC_004632	GGC	2	6	40614	40619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171592
522	NC_004632	CAT	2	6	40764	40769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171592
523	NC_004632	GCT	2	6	40779	40784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171592
524	NC_004632	CAC	2	6	40788	40793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171592
525	NC_004632	CAT	2	6	40824	40829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171592
526	NC_004632	GAT	2	6	40834	40839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171592
527	NC_004632	GC	3	6	40845	40850	0 %	0 %	50 %	50 %	29171592
528	NC_004632	ATT	2	6	40900	40905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29171592
529	NC_004632	ACG	2	6	40917	40922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171592
530	NC_004632	CAAA	2	8	41074	41081	75 %	0 %	0 %	25 %	29171593
531	NC_004632	CCT	2	6	41187	41192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29171593
532	NC_004632	GGCA	2	8	41193	41200	25 %	0 %	50 %	25 %	29171593
533	NC_004632	GCG	2	6	41282	41287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171593
534	NC_004632	GA	3	6	41288	41293	50 %	0 %	50 %	0 %	29171593
535	NC_004632	GCA	2	6	41365	41370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171593
536	NC_004632	TCG	2	6	41414	41419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171593
537	NC_004632	CTGG	2	8	41458	41465	0 %	25 %	50 %	25 %	29171593
538	NC_004632	GATC	2	8	41490	41497	25 %	25 %	25 %	25 %	29171593
539	NC_004632	TGT	2	6	41525	41530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29171593
540	NC_004632	GCC	2	6	41531	41536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171593
541	NC_004632	CAA	2	6	41674	41679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29171593
542	NC_004632	TGG	2	6	41773	41778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171594
543	NC_004632	TGC	2	6	41785	41790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171594
544	NC_004632	GGC	2	6	41816	41821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171594
545	NC_004632	GCA	2	6	41894	41899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171594
546	NC_004632	GAT	2	6	41906	41911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171594
547	NC_004632	CGGCG	2	10	41964	41973	0 %	0 %	60 %	40 %	29171594
548	NC_004632	GGT	3	9	41984	41992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171594
549	NC_004632	ACA	2	6	42010	42015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29171594
550	NC_004632	CTG	2	6	42039	42044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171594
551	NC_004632	ATC	2	6	42105	42110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171594
552	NC_004632	ACT	2	6	42145	42150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171594
553	NC_004632	CAG	2	6	42333	42338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171595
554	NC_004632	TGC	2	6	42339	42344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171595
555	NC_004632	GCGT	2	8	42445	42452	0 %	25 %	50 %	25 %	29171595
556	NC_004632	TGA	2	6	42472	42477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171595
557	NC_004632	CAA	2	6	42494	42499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29171595
558	NC_004632	A	6	6	42537	42542	100 %	0 %	0 %	0 %	29171595
559	NC_004632	CTTGTT	2	12	42669	42680	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	29171596
560	NC_004632	TCA	2	6	42725	42730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171596
561	NC_004632	ATT	2	6	42736	42741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29171596
562	NC_004632	GGC	2	6	42742	42747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171596
563	NC_004632	GCT	2	6	42753	42758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171596
564	NC_004632	TGG	2	6	42841	42846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171596
565	NC_004632	G	6	6	42866	42871	0 %	0 %	100 %	0 %	29171596
566	NC_004632	CCA	2	6	42989	42994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171597
567	NC_004632	AGG	2	6	43019	43024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29171597
568	NC_004632	ATC	2	6	43063	43068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171597
569	NC_004632	AGA	2	6	43141	43146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29171597
570	NC_004632	CCG	2	6	43196	43201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171597
571	NC_004632	GCT	2	6	43255	43260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171597
572	NC_004632	CT	3	6	43259	43264	0 %	50 %	0 %	50 %	29171597
573	NC_004632	TGAC	2	8	43295	43302	25 %	25 %	25 %	25 %	29171597
574	NC_004632	TTTTGC	2	12	43323	43334	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	29171597
575	NC_004632	TCA	2	6	43439	43444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171597
576	NC_004632	ACG	2	6	43450	43455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171597
577	NC_004632	TGG	2	6	43457	43462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171597
578	NC_004632	TGGC	2	8	43567	43574	0 %	25 %	50 %	25 %	29171597
579	NC_004632	GCC	2	6	43578	43583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171597
580	NC_004632	TGA	2	6	43584	43589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171597
581	NC_004632	GAC	2	6	43616	43621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171597
582	NC_004632	GCC	2	6	43727	43732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171597
583	NC_004632	GGGGA	2	10	43739	43748	20 %	0 %	80 %	0 %	29171597
584	NC_004632	GTC	2	6	43792	43797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171597
585	NC_004632	TGA	2	6	43811	43816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171597
586	NC_004632	TCG	2	6	43893	43898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171597
587	NC_004632	CTG	2	6	43901	43906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171597
588	NC_004632	TCA	2	6	43913	43918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171597
589	NC_004632	GCG	2	6	43960	43965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171597
590	NC_004632	CAAG	2	8	44016	44023	50 %	0 %	25 %	25 %	29171597
591	NC_004632	GCT	2	6	44035	44040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171597
592	NC_004632	CGC	2	6	44106	44111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171597
593	NC_004632	TGG	2	6	44189	44194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171597
594	NC_004632	T	6	6	44200	44205	0 %	100 %	0 %	0 %	29171597
595	NC_004632	TGG	3	9	44297	44305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171597
596	NC_004632	GC	3	6	44359	44364	0 %	0 %	50 %	50 %	29171597
597	NC_004632	GGT	2	6	44391	44396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171597
598	NC_004632	TGG	2	6	44420	44425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171597
599	NC_004632	TGC	2	6	44438	44443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171597
600	NC_004632	CAG	2	6	44446	44451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171597
601	NC_004632	GGC	2	6	44532	44537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171597
602	NC_004632	G	6	6	44547	44552	0 %	0 %	100 %	0 %	29171597
603	NC_004632	ACG	2	6	44576	44581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171597
604	NC_004632	AAGC	2	8	44824	44831	50 %	0 %	25 %	25 %	29171597
605	NC_004632	GCTGAG	2	12	44905	44916	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	29171597
606	NC_004632	GGC	2	6	44943	44948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171597
607	NC_004632	ACTTGA	2	12	44949	44960	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	29171597
608	NC_004632	GGAG	2	8	44982	44989	25 %	0 %	75 %	0 %	29171597
609	NC_004632	TGA	2	6	45024	45029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171597
610	NC_004632	TCA	2	6	45041	45046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171597
611	NC_004632	CTA	2	6	45047	45052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171597
612	NC_004632	TGA	2	6	45138	45143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171597
613	NC_004632	CCTG	2	8	45174	45181	0 %	25 %	25 %	50 %	29171597
614	NC_004632	GTC	2	6	45208	45213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171597
615	NC_004632	GCG	2	6	45244	45249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171597
616	NC_004632	CCG	2	6	45271	45276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171597
617	NC_004632	AGC	2	6	45381	45386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171597
618	NC_004632	CCA	2	6	45388	45393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171597
619	NC_004632	GGCCGA	2	12	45411	45422	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	29171597
620	NC_004632	CAA	2	6	45461	45466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29171597
621	NC_004632	GCG	2	6	45472	45477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171597
622	NC_004632	GGC	3	9	45528	45536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171597
623	NC_004632	CCT	2	6	45577	45582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29171597
624	NC_004632	ACA	2	6	45588	45593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29171597
625	NC_004632	CGT	2	6	45730	45735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171597
626	NC_004632	CAC	2	6	45738	45743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171597
627	NC_004632	CCGGC	2	10	45755	45764	0 %	0 %	40 %	60 %	29171597
628	NC_004632	CGA	2	6	45807	45812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171597
629	NC_004632	GCA	2	6	46003	46008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171597
630	NC_004632	GAA	2	6	46104	46109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29171597
631	NC_004632	GCA	2	6	46116	46121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171597
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633	NC_004632	CCG	2	6	46198	46203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171597
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636	NC_004632	CGG	2	6	46339	46344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171597
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643	NC_004632	GGC	2	6	46620	46625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171597
644	NC_004632	CGTTT	2	10	46670	46679	0 %	60 %	20 %	20 %	29171597
645	NC_004632	TCA	2	6	46706	46711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171597
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747	NC_004632	CTG	2	6	52407	52412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171603
748	NC_004632	GCT	2	6	52515	52520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171604
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752	NC_004632	GTTG	2	8	52733	52740	0 %	50 %	50 %	0 %	29171604
753	NC_004632	ATC	2	6	52833	52838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171604
754	NC_004632	GACG	2	8	53661	53668	25 %	0 %	50 %	25 %	29171605
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756	NC_004632	CGA	2	6	53772	53777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171605
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