MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pectobacterium atrosepticum SCRI1043 chromosome

Total Repeats: 87258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004547	TGG	2	6	232787	232792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119167
4002	NC_004547	CCG	2	6	232840	232845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119167
4003	NC_004547	TGG	2	6	232985	232990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119167
4004	NC_004547	CAC	2	6	233031	233036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119167
4005	NC_004547	ATG	2	6	233075	233080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119167
4006	NC_004547	GTA	2	6	233206	233211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119167
4007	NC_004547	TCA	2	6	233227	233232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119167
4008	NC_004547	CAT	2	6	233261	233266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119167
4009	NC_004547	CCG	2	6	233270	233275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119167
4010	NC_004547	GCGG	2	8	233337	233344	0 %	0 %	75 %	25 %	50119167
4011	NC_004547	CG	3	6	233383	233388	0 %	0 %	50 %	50 %	50119167
4012	NC_004547	CAT	2	6	233409	233414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119167
4013	NC_004547	CGC	2	6	233498	233503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119167
4014	NC_004547	GGC	2	6	233544	233549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119167
4015	NC_004547	AGA	2	6	233568	233573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119167
4016	NC_004547	GCG	2	6	233632	233637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119167
4017	NC_004547	CTG	2	6	233670	233675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119167
4018	NC_004547	TCG	2	6	233695	233700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119167
4019	NC_004547	GCGT	2	8	233813	233820	0 %	25 %	50 %	25 %	50119167
4020	NC_004547	CAA	2	6	233828	233833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119167
4021	NC_004547	CTG	2	6	233984	233989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119168
4022	NC_004547	CGCT	2	8	234006	234013	0 %	25 %	25 %	50 %	50119168
4023	NC_004547	CCG	2	6	234042	234047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119168
4024	NC_004547	AGGG	2	8	234052	234059	25 %	0 %	75 %	0 %	50119168
4025	NC_004547	CGA	2	6	234106	234111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119168
4026	NC_004547	CTT	2	6	234115	234120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119168
4027	NC_004547	GC	3	6	234128	234133	0 %	0 %	50 %	50 %	50119168
4028	NC_004547	ATC	2	6	234144	234149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119168
4029	NC_004547	ATC	3	9	234153	234161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119168
4030	NC_004547	TCT	2	6	234174	234179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119168
4031	NC_004547	T	6	6	234191	234196	0 %	100 %	0 %	0 %	50119168
4032	NC_004547	GCT	2	6	234250	234255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119168
4033	NC_004547	ACA	2	6	234325	234330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119168
4034	NC_004547	ATCGC	2	10	234336	234345	20 %	20 %	20 %	40 %	50119168
4035	NC_004547	CAG	2	6	234428	234433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119168
4036	NC_004547	TCT	2	6	234463	234468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119168
4037	NC_004547	AGT	2	6	234510	234515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119168
4038	NC_004547	GAA	2	6	234557	234562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119168
4039	NC_004547	AAT	2	6	234659	234664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50119168
4040	NC_004547	AAG	2	6	234696	234701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119168
4041	NC_004547	CGC	2	6	234734	234739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119168
4042	NC_004547	CAGCA	2	10	234743	234752	40 %	0 %	20 %	40 %	50119168
4043	NC_004547	CGCT	2	8	234823	234830	0 %	25 %	25 %	50 %	50119168
4044	NC_004547	ACG	2	6	234861	234866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119168
4045	NC_004547	TCG	2	6	234922	234927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119168
4046	NC_004547	CCG	2	6	235071	235076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119168
4047	NC_004547	CTT	2	6	235136	235141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119168
4048	NC_004547	CGA	2	6	235180	235185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119168
4049	NC_004547	TGC	2	6	235224	235229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119168
4050	NC_004547	TCA	2	6	235248	235253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119168
4051	NC_004547	GCG	2	6	235266	235271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119168
4052	NC_004547	GGT	2	6	235346	235351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119168
4053	NC_004547	TCA	2	6	235357	235362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119168
4054	NC_004547	CCAG	2	8	235414	235421	25 %	0 %	25 %	50 %	50119168
4055	NC_004547	GGC	2	6	235460	235465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119168
4056	NC_004547	ACA	2	6	235488	235493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119168
4057	NC_004547	GCG	2	6	235545	235550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119168
4058	NC_004547	GC	3	6	235561	235566	0 %	0 %	50 %	50 %	50119168
4059	NC_004547	GCC	2	6	235601	235606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119168
4060	NC_004547	CGGC	2	8	235807	235814	0 %	0 %	50 %	50 %	50119168
4061	NC_004547	GCA	2	6	235879	235884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119168
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4063	NC_004547	ATC	2	6	236258	236263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119169
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4065	NC_004547	ATTC	2	8	236332	236339	25 %	50 %	0 %	25 %	50119169
4066	NC_004547	CTG	2	6	236436	236441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119169
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4068	NC_004547	TGC	2	6	236558	236563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119169
4069	NC_004547	GAT	2	6	236572	236577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119169
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4071	NC_004547	ATC	2	6	236705	236710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119169
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4073	NC_004547	CGG	2	6	236762	236767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119169
4074	NC_004547	TTTC	2	8	236797	236804	0 %	75 %	0 %	25 %	50119169
4075	NC_004547	TGC	2	6	236904	236909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119169
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4078	NC_004547	TTGA	2	8	237085	237092	25 %	50 %	25 %	0 %	50119169
4079	NC_004547	GCT	2	6	237156	237161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119169
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4082	NC_004547	GCA	2	6	237327	237332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119169
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4087	NC_004547	TCAT	2	8	237515	237522	25 %	50 %	0 %	25 %	50119169
4088	NC_004547	CG	3	6	237545	237550	0 %	0 %	50 %	50 %	50119169
4089	NC_004547	TAC	2	6	237632	237637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119170
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4092	NC_004547	CGG	2	6	237709	237714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119170
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4096	NC_004547	TGG	2	6	237859	237864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119170
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4101	NC_004547	T	6	6	238268	238273	0 %	100 %	0 %	0 %	50119171
4102	NC_004547	TGG	2	6	238298	238303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119171
4103	NC_004547	CATT	2	8	238346	238353	25 %	50 %	0 %	25 %	50119171
4104	NC_004547	CAT	2	6	238371	238376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119171
4105	NC_004547	T	6	6	238524	238529	0 %	100 %	0 %	0 %	50119171
4106	NC_004547	TGC	2	6	238619	238624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119171
4107	NC_004547	TGG	2	6	238632	238637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119171
4108	NC_004547	ATC	2	6	238645	238650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119171
4109	NC_004547	CTTA	2	8	238791	238798	25 %	50 %	0 %	25 %	50119171
4110	NC_004547	TGGC	2	8	238822	238829	0 %	25 %	50 %	25 %	50119171
4111	NC_004547	GTCG	2	8	238875	238882	0 %	25 %	50 %	25 %	50119171
4112	NC_004547	CAT	2	6	238941	238946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119171
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4114	NC_004547	TGG	2	6	239072	239077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119171
4115	NC_004547	GT	3	6	239080	239085	0 %	50 %	50 %	0 %	50119171
4116	NC_004547	CCA	2	6	239103	239108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119171
4117	NC_004547	TTC	2	6	239146	239151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119171
4118	NC_004547	ACG	2	6	239185	239190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119171
4119	NC_004547	CGG	3	9	239271	239279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119171
4120	NC_004547	TGA	2	6	239481	239486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119171
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4122	NC_004547	AAT	2	6	239521	239526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50119171
4123	NC_004547	ATGA	2	8	239569	239576	50 %	25 %	25 %	0 %	50119171
4124	NC_004547	CCT	2	6	239747	239752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50119172
4125	NC_004547	TGT	2	6	239790	239795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119172
4126	NC_004547	TTC	2	6	239941	239946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119172
4127	NC_004547	CTG	2	6	240016	240021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119172
4128	NC_004547	TG	3	6	240049	240054	0 %	50 %	50 %	0 %	50119172
4129	NC_004547	GCG	2	6	240131	240136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119172
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4132	NC_004547	GCG	2	6	240214	240219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119172
4133	NC_004547	TAT	2	6	245964	245969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119173
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4135	NC_004547	T	6	6	246147	246152	0 %	100 %	0 %	0 %	50119173
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4144	NC_004547	GGT	2	6	246814	246819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119173
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4149	NC_004547	TC	3	6	247040	247045	0 %	50 %	0 %	50 %	50119174
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4154	NC_004547	TGT	2	6	247256	247261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119174
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4238	NC_004547	ACAAAG	2	12	253152	253163	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	50119179
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4241	NC_004547	TGCTC	2	10	253384	253393	0 %	40 %	20 %	40 %	50119180
4242	NC_004547	GTG	2	6	253482	253487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119180
4243	NC_004547	GCT	2	6	253559	253564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119180
4244	NC_004547	GCT	2	6	253568	253573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119180
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4369	NC_004547	AAC	2	6	260561	260566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119184
4370	NC_004547	ATC	2	6	260603	260608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119184
4371	NC_004547	ACT	2	6	260778	260783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119184
4372	NC_004547	GAA	2	6	260842	260847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119184
4373	NC_004547	ACC	2	6	260909	260914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119184
4374	NC_004547	GCC	2	6	260921	260926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119184
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4376	NC_004547	CGT	2	6	260953	260958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119184
4377	NC_004547	CTG	2	6	260999	261004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119184
4378	NC_004547	GCGT	2	8	261175	261182	0 %	25 %	50 %	25 %	50119184
4379	NC_004547	TGA	2	6	261183	261188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119184
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4383	NC_004547	CT	3	6	261361	261366	0 %	50 %	0 %	50 %	50119184
4384	NC_004547	GC	3	6	261371	261376	0 %	0 %	50 %	50 %	50119184
4385	NC_004547	GAT	2	6	261475	261480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119184
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4393	NC_004547	GAT	2	6	261823	261828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119184
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4400	NC_004547	ATG	2	6	262196	262201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119184
4401	NC_004547	GTG	2	6	262218	262223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119184
4402	NC_004547	GCT	2	6	262321	262326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119184
4403	NC_004547	GTG	2	6	262336	262341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119184
4404	NC_004547	CGT	2	6	262369	262374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119184
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4412	NC_004547	CGGTG	2	10	262732	262741	0 %	20 %	60 %	20 %	50119184
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4424	NC_004547	CTG	2	6	263651	263656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119184
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4434	NC_004547	CAGT	2	8	264364	264371	25 %	25 %	25 %	25 %	50119185
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4443	NC_004547	GCT	2	6	264669	264674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119185
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4447	NC_004547	GGGGC	2	10	264761	264770	0 %	0 %	80 %	20 %	50119185
4448	NC_004547	GAA	4	12	264798	264809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119185
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4463	NC_004547	CTTT	2	8	265250	265257	0 %	75 %	0 %	25 %	50119185
4464	NC_004547	TTC	2	6	265336	265341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119185
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4472	NC_004547	GGC	2	6	265581	265586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119185
4473	NC_004547	GCT	2	6	265601	265606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119185
4474	NC_004547	GGGATG	2	12	265624	265635	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	50119185
4475	NC_004547	CAT	2	6	265789	265794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119186
4476	NC_004547	AT	3	6	265929	265934	50 %	50 %	0 %	0 %	50119186
4477	NC_004547	TGA	2	6	266102	266107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119187
4478	NC_004547	AGC	2	6	266138	266143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119187
4479	NC_004547	GCCT	2	8	266177	266184	0 %	25 %	25 %	50 %	50119187
4480	NC_004547	ATC	2	6	266243	266248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119187
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4482	NC_004547	CCCG	2	8	266319	266326	0 %	0 %	25 %	75 %	50119187
4483	NC_004547	ACGT	2	8	266399	266406	25 %	25 %	25 %	25 %	50119187
4484	NC_004547	AGCC	2	8	266452	266459	25 %	0 %	25 %	50 %	50119187
4485	NC_004547	GAT	2	6	266608	266613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119187
4486	NC_004547	TTGT	2	8	266644	266651	0 %	75 %	25 %	0 %	50119187
4487	NC_004547	GACT	2	8	266763	266770	25 %	25 %	25 %	25 %	50119187
4488	NC_004547	AAC	2	6	266854	266859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119187
4489	NC_004547	TCA	2	6	266870	266875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119187
4490	NC_004547	GCA	2	6	266913	266918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119187
4491	NC_004547	ATT	2	6	266932	266937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119187
4492	NC_004547	GAT	2	6	266941	266946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119187
4493	NC_004547	CCGCGC	2	12	266974	266985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119187
4494	NC_004547	TGA	2	6	267000	267005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119187
4495	NC_004547	TGT	2	6	267020	267025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119187
4496	NC_004547	GAA	2	6	267039	267044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119187
4497	NC_004547	TCG	2	6	267171	267176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119187
4498	NC_004547	GC	4	8	267207	267214	0 %	0 %	50 %	50 %	50119187
4499	NC_004547	AT	3	6	267233	267238	50 %	50 %	0 %	0 %	50119187
4500	NC_004547	CTG	2	6	267243	267248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119187

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