MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pectobacterium atrosepticum SCRI1043 chromosome

Total Repeats: 87258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_004547	TGC	2	6	1116260	1116265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119937
19002	NC_004547	CCGC	2	8	1116280	1116287	0 %	0 %	25 %	75 %	50119937
19003	NC_004547	ACGG	2	8	1116315	1116322	25 %	0 %	50 %	25 %	50119937
19004	NC_004547	GTT	2	6	1116366	1116371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119937
19005	NC_004547	GCG	2	6	1116406	1116411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119937
19006	NC_004547	TGC	2	6	1116449	1116454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119937
19007	NC_004547	GCG	2	6	1116822	1116827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119938
19008	NC_004547	ATCGA	2	10	1116877	1116886	40 %	20 %	20 %	20 %	50119938
19009	NC_004547	CT	4	8	1116897	1116904	0 %	50 %	0 %	50 %	50119938
19010	NC_004547	CAGG	2	8	1116952	1116959	25 %	0 %	50 %	25 %	50119938
19011	NC_004547	CTGA	2	8	1116969	1116976	25 %	25 %	25 %	25 %	50119938
19012	NC_004547	ATT	2	6	1116984	1116989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119938
19013	NC_004547	GCGG	2	8	1117046	1117053	0 %	0 %	75 %	25 %	50119938
19014	NC_004547	CTG	2	6	1117143	1117148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119938
19015	NC_004547	ACA	2	6	1117294	1117299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119938
19016	NC_004547	A	6	6	1117340	1117345	100 %	0 %	0 %	0 %	50119938
19017	NC_004547	CGG	2	6	1117408	1117413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119938
19018	NC_004547	CGT	2	6	1117422	1117427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119938
19019	NC_004547	CGG	2	6	1117432	1117437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119938
19020	NC_004547	GAC	2	6	1117455	1117460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119938
19021	NC_004547	TGG	2	6	1117471	1117476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119938
19022	NC_004547	CAG	2	6	1117485	1117490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119938
19023	NC_004547	TCTGG	2	10	1117541	1117550	0 %	40 %	40 %	20 %	50119938
19024	NC_004547	GCG	2	6	1117590	1117595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119938
19025	NC_004547	GTGG	2	8	1117713	1117720	0 %	25 %	75 %	0 %	50119938
19026	NC_004547	GGC	2	6	1117751	1117756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119938
19027	NC_004547	CTGG	2	8	1117835	1117842	0 %	25 %	50 %	25 %	50119938
19028	NC_004547	AGC	2	6	1117876	1117881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119938
19029	NC_004547	TAGGAT	2	12	1117921	1117932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119938
19030	NC_004547	GAC	2	6	1117961	1117966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119938
19031	NC_004547	AGC	2	6	1117987	1117992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119938
19032	NC_004547	T	6	6	1118116	1118121	0 %	100 %	0 %	0 %	50119939
19033	NC_004547	GCA	2	6	1118127	1118132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119939
19034	NC_004547	CGG	2	6	1118142	1118147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119939
19035	NC_004547	TG	4	8	1118181	1118188	0 %	50 %	50 %	0 %	50119939
19036	NC_004547	CTG	2	6	1118215	1118220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119939
19037	NC_004547	GC	3	6	1118221	1118226	0 %	0 %	50 %	50 %	50119939
19038	NC_004547	TGA	2	6	1118263	1118268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119939
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19041	NC_004547	TTC	2	6	1118437	1118442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119939
19042	NC_004547	CGGA	2	8	1118446	1118453	25 %	0 %	50 %	25 %	50119939
19043	NC_004547	CCG	2	6	1118468	1118473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119939
19044	NC_004547	GC	3	6	1118565	1118570	0 %	0 %	50 %	50 %	50119939
19045	NC_004547	CGT	2	6	1118571	1118576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119939
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19050	NC_004547	ATC	2	6	1118774	1118779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119939
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19052	NC_004547	CGC	2	6	1118886	1118891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119939
19053	NC_004547	CTT	2	6	1118913	1118918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119939
19054	NC_004547	ACG	2	6	1118926	1118931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119939
19055	NC_004547	AGT	2	6	1118949	1118954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119939
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19060	NC_004547	TGT	2	6	1119036	1119041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119939
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19063	NC_004547	GGGC	2	8	1119191	1119198	0 %	0 %	75 %	25 %	50119939
19064	NC_004547	ACG	2	6	1119206	1119211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119939
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19066	NC_004547	TAC	2	6	1119372	1119377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119939
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19082	NC_004547	ATTC	2	8	1120393	1120400	25 %	50 %	0 %	25 %	50119940
19083	NC_004547	GC	3	6	1120424	1120429	0 %	0 %	50 %	50 %	50119940
19084	NC_004547	TCG	2	6	1120496	1120501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119940
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19087	NC_004547	CGA	2	6	1120647	1120652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119940
19088	NC_004547	TTCTG	2	10	1120771	1120780	0 %	60 %	20 %	20 %	50119940
19089	NC_004547	GAA	2	6	1120808	1120813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119940
19090	NC_004547	CAG	3	9	1120841	1120849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119940
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19097	NC_004547	ATGCC	2	10	1122100	1122109	20 %	20 %	20 %	40 %	50119941
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19099	NC_004547	ATG	2	6	1122219	1122224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119941
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19101	NC_004547	GATC	2	8	1122332	1122339	25 %	25 %	25 %	25 %	50119941
19102	NC_004547	GTG	2	6	1122340	1122345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119941
19103	NC_004547	GTGG	2	8	1122386	1122393	0 %	25 %	75 %	0 %	50119941
19104	NC_004547	CTT	2	6	1122439	1122444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119941
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19107	NC_004547	TGG	2	6	1122502	1122507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119941
19108	NC_004547	CGCT	2	8	1122531	1122538	0 %	25 %	25 %	50 %	50119941
19109	NC_004547	TGA	2	6	1122622	1122627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119941
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19114	NC_004547	TCA	2	6	1123034	1123039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119942
19115	NC_004547	GATT	2	8	1123058	1123065	25 %	50 %	25 %	0 %	50119942
19116	NC_004547	GCA	2	6	1123082	1123087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119942
19117	NC_004547	CCT	2	6	1123210	1123215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50119942
19118	NC_004547	CAC	2	6	1123230	1123235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119942
19119	NC_004547	GCA	2	6	1123257	1123262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119942
19120	NC_004547	GCA	2	6	1123364	1123369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119942
19121	NC_004547	GTG	2	6	1123400	1123405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119942
19122	NC_004547	GCG	2	6	1123501	1123506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119942
19123	NC_004547	TGG	2	6	1123556	1123561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119942
19124	NC_004547	CGG	2	6	1123627	1123632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119942
19125	NC_004547	TC	3	6	1123644	1123649	0 %	50 %	0 %	50 %	50119942
19126	NC_004547	GCCGT	2	10	1123702	1123711	0 %	20 %	40 %	40 %	50119942
19127	NC_004547	TGA	2	6	1123781	1123786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119942
19128	NC_004547	CAA	2	6	1123790	1123795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119942
19129	NC_004547	T	6	6	1123808	1123813	0 %	100 %	0 %	0 %	50119942
19130	NC_004547	TCAG	2	8	1123907	1123914	25 %	25 %	25 %	25 %	50119943
19131	NC_004547	GCG	2	6	1123919	1123924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119943
19132	NC_004547	GCCT	2	8	1123930	1123937	0 %	25 %	25 %	50 %	50119943
19133	NC_004547	CA	3	6	1123986	1123991	50 %	0 %	0 %	50 %	50119943
19134	NC_004547	GAC	2	6	1124013	1124018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119943
19135	NC_004547	GCA	2	6	1124054	1124059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119943
19136	NC_004547	CG	3	6	1124197	1124202	0 %	0 %	50 %	50 %	50119943
19137	NC_004547	AAC	2	6	1124221	1124226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119943
19138	NC_004547	CAG	2	6	1124284	1124289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119943
19139	NC_004547	TCA	2	6	1124306	1124311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119943
19140	NC_004547	CAG	2	6	1124338	1124343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119943
19141	NC_004547	GCACG	2	10	1124385	1124394	20 %	0 %	40 %	40 %	50119943
19142	NC_004547	CTT	2	6	1124403	1124408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119943
19143	NC_004547	TAA	2	6	1124420	1124425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50119943
19144	NC_004547	CACGTT	2	12	1124437	1124448	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	50119943
19145	NC_004547	TCG	2	6	1124472	1124477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119943
19146	NC_004547	CTTTG	2	10	1124553	1124562	0 %	60 %	20 %	20 %	50119943
19147	NC_004547	CCA	2	6	1124583	1124588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119943
19148	NC_004547	GTT	2	6	1124639	1124644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119944
19149	NC_004547	GA	3	6	1124658	1124663	50 %	0 %	50 %	0 %	50119944
19150	NC_004547	CAT	2	6	1124772	1124777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119944
19151	NC_004547	CAT	2	6	1124842	1124847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119944
19152	NC_004547	GCT	2	6	1124862	1124867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119944
19153	NC_004547	TCT	2	6	1124885	1124890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119944
19154	NC_004547	CAG	2	6	1124896	1124901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119944
19155	NC_004547	GCG	3	9	1124945	1124953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119944
19156	NC_004547	TG	3	6	1124966	1124971	0 %	50 %	50 %	0 %	50119944
19157	NC_004547	GT	3	6	1124974	1124979	0 %	50 %	50 %	0 %	50119944
19158	NC_004547	CTG	2	6	1125021	1125026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119944
19159	NC_004547	TG	3	6	1125051	1125056	0 %	50 %	50 %	0 %	50119944
19160	NC_004547	CAG	2	6	1125079	1125084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119944
19161	NC_004547	TCCG	2	8	1125108	1125115	0 %	25 %	25 %	50 %	50119944
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19164	NC_004547	CCG	2	6	1125299	1125304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119944
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19170	NC_004547	TCCT	2	8	1125481	1125488	0 %	50 %	0 %	50 %	50119944
19171	NC_004547	GTG	2	6	1125569	1125574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119944
19172	NC_004547	CAT	2	6	1125579	1125584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119944
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19174	NC_004547	TGA	2	6	1125827	1125832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119944
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19176	NC_004547	TGCC	2	8	1125947	1125954	0 %	25 %	25 %	50 %	50119945
19177	NC_004547	ATC	2	6	1125957	1125962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119945
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19180	NC_004547	CATGAC	2	12	1126094	1126105	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50119945
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19184	NC_004547	CCA	2	6	1126183	1126188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119945
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19188	NC_004547	CTG	2	6	1126382	1126387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119945
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19205	NC_004547	CAG	2	6	1127090	1127095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119945
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19209	NC_004547	CTG	2	6	1127345	1127350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119945
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19211	NC_004547	TGAG	2	8	1127371	1127378	25 %	25 %	50 %	0 %	50119945
19212	NC_004547	ATC	2	6	1127397	1127402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119945
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19215	NC_004547	TGC	2	6	1127814	1127819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119946
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19217	NC_004547	TCAA	2	8	1127870	1127877	50 %	25 %	0 %	25 %	50119946
19218	NC_004547	GAT	2	6	1127911	1127916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119946
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19220	NC_004547	GAT	2	6	1127950	1127955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119946
19221	NC_004547	TGCG	2	8	1127979	1127986	0 %	25 %	50 %	25 %	50119946
19222	NC_004547	AGCG	2	8	1128011	1128018	25 %	0 %	50 %	25 %	50119946
19223	NC_004547	AGG	2	6	1128054	1128059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50119946
19224	NC_004547	CAG	2	6	1128169	1128174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119946
19225	NC_004547	TCA	2	6	1128176	1128181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119946
19226	NC_004547	CGA	2	6	1128213	1128218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119946
19227	NC_004547	CAG	2	6	1128294	1128299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119946
19228	NC_004547	CAG	2	6	1128445	1128450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119946
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19231	NC_004547	CTG	2	6	1128552	1128557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119946
19232	NC_004547	TTC	2	6	1128563	1128568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119946
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19351	NC_004547	GCG	2	6	1135702	1135707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119952
19352	NC_004547	CGC	2	6	1135737	1135742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119952
19353	NC_004547	GCG	2	6	1135769	1135774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119952
19354	NC_004547	TCA	2	6	1135835	1135840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119952
19355	NC_004547	CGC	2	6	1135847	1135852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119952
19356	NC_004547	CAT	2	6	1135863	1135868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119952
19357	NC_004547	GC	3	6	1135997	1136002	0 %	0 %	50 %	50 %	50119952
19358	NC_004547	CAC	2	6	1136013	1136018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119952
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19362	NC_004547	TGC	2	6	1136197	1136202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119952
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19367	NC_004547	GCTG	2	8	1136429	1136436	0 %	25 %	50 %	25 %	50119952
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19372	NC_004547	CA	3	6	1137043	1137048	50 %	0 %	0 %	50 %	50119954
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19374	NC_004547	A	6	6	1137116	1137121	100 %	0 %	0 %	0 %	50119954
19375	NC_004547	AGAC	2	8	1137129	1137136	50 %	0 %	25 %	25 %	50119954
19376	NC_004547	AAG	2	6	1137186	1137191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119954
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19468	NC_004547	CAG	2	6	1141856	1141861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119959
19469	NC_004547	ACC	2	6	1141862	1141867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119959
19470	NC_004547	ATG	2	6	1142048	1142053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119959
19471	NC_004547	CGG	2	6	1142077	1142082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119959
19472	NC_004547	CTAGTT	2	12	1142088	1142099	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50119959
19473	NC_004547	TCTG	2	8	1142171	1142178	0 %	50 %	25 %	25 %	50119959
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19475	NC_004547	GCT	2	6	1142233	1142238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119959
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19491	NC_004547	GGC	2	6	1143813	1143818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119961
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19496	NC_004547	TTTC	2	8	1144063	1144070	0 %	75 %	0 %	25 %	50119961
19497	NC_004547	TGA	2	6	1144915	1144920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119962
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19499	NC_004547	CGG	2	6	1145075	1145080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119962
19500	NC_004547	TAC	2	6	1145146	1145151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119962

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