MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pectobacterium atrosepticum SCRI1043 chromosome

Total Repeats: 87258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_004547	GTCT	2	8	651528	651535	0 %	50 %	25 %	25 %	50119540
11002	NC_004547	GAA	2	6	651544	651549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119540
11003	NC_004547	CAG	2	6	651557	651562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119540
11004	NC_004547	GGTT	2	8	651677	651684	0 %	50 %	50 %	0 %	50119540
11005	NC_004547	GAC	2	6	651950	651955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119541
11006	NC_004547	GAT	2	6	652067	652072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119541
11007	NC_004547	TGA	2	6	652080	652085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119541
11008	NC_004547	A	7	7	652095	652101	100 %	0 %	0 %	0 %	50119541
11009	NC_004547	ATT	2	6	652133	652138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119541
11010	NC_004547	TGAT	2	8	652296	652303	25 %	50 %	25 %	0 %	50119541
11011	NC_004547	TAC	2	6	652304	652309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119541
11012	NC_004547	ACTG	2	8	652365	652372	25 %	25 %	25 %	25 %	50119541
11013	NC_004547	TACTT	2	10	652463	652472	20 %	60 %	0 %	20 %	50119542
11014	NC_004547	CTG	2	6	652509	652514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119542
11015	NC_004547	TG	4	8	652513	652520	0 %	50 %	50 %	0 %	50119542
11016	NC_004547	TGA	3	9	652589	652597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119542
11017	NC_004547	ATT	2	6	652690	652695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119542
11018	NC_004547	ATG	2	6	652699	652704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119542
11019	NC_004547	TTA	2	6	652710	652715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119542
11020	NC_004547	A	7	7	652719	652725	100 %	0 %	0 %	0 %	50119542
11021	NC_004547	TCT	2	6	652797	652802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119542
11022	NC_004547	GGA	2	6	652808	652813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50119542
11023	NC_004547	GCG	2	6	652816	652821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119542
11024	NC_004547	ATTGAA	2	12	652858	652869	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50119542
11025	NC_004547	CTT	2	6	653085	653090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119543
11026	NC_004547	AAT	2	6	653202	653207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50119543
11027	NC_004547	CT	3	6	653400	653405	0 %	50 %	0 %	50 %	50119543
11028	NC_004547	TTGA	2	8	653406	653413	25 %	50 %	25 %	0 %	50119543
11029	NC_004547	CAT	2	6	653432	653437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119543
11030	NC_004547	ACG	2	6	653675	653680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119544
11031	NC_004547	ACT	2	6	653708	653713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119544
11032	NC_004547	GCT	2	6	653735	653740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119544
11033	NC_004547	GTC	2	6	653950	653955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119544
11034	NC_004547	AAT	2	6	653965	653970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50119544
11035	NC_004547	GCT	2	6	653986	653991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119544
11036	NC_004547	CTG	2	6	654065	654070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119544
11037	NC_004547	GAG	2	6	654080	654085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50119544
11038	NC_004547	GAC	2	6	654128	654133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119544
11039	NC_004547	ATG	2	6	654243	654248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119544
11040	NC_004547	ATG	2	6	654256	654261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119544
11041	NC_004547	TCT	2	6	654274	654279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119545
11042	NC_004547	TGA	2	6	654294	654299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119545
11043	NC_004547	TGCG	2	8	654339	654346	0 %	25 %	50 %	25 %	50119545
11044	NC_004547	TCA	2	6	654372	654377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119545
11045	NC_004547	T	6	6	654428	654433	0 %	100 %	0 %	0 %	50119545
11046	NC_004547	GCA	2	6	654471	654476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119545
11047	NC_004547	ATG	2	6	654497	654502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119545
11048	NC_004547	ACA	2	6	654744	654749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119546
11049	NC_004547	GGT	2	6	654761	654766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119546
11050	NC_004547	GCG	2	6	654835	654840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119546
11051	NC_004547	CGC	2	6	654923	654928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119546
11052	NC_004547	TCA	2	6	655000	655005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119546
11053	NC_004547	CAC	2	6	655069	655074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119546
11054	NC_004547	CCG	2	6	655185	655190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119547
11055	NC_004547	ATT	2	6	655252	655257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119547
11056	NC_004547	GTT	2	6	655293	655298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119547
11057	NC_004547	TTA	2	6	655315	655320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119547
11058	NC_004547	CGG	2	6	655610	655615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119547
11059	NC_004547	TC	3	6	655620	655625	0 %	50 %	0 %	50 %	50119547
11060	NC_004547	GTT	2	6	655730	655735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119547
11061	NC_004547	AG	3	6	655776	655781	50 %	0 %	50 %	0 %	50119547
11062	NC_004547	TTG	2	6	655784	655789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119547
11063	NC_004547	CTGG	2	8	655923	655930	0 %	25 %	50 %	25 %	50119547
11064	NC_004547	GCA	2	6	655987	655992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119547
11065	NC_004547	CACT	2	8	656004	656011	25 %	25 %	0 %	50 %	50119547
11066	NC_004547	ACG	2	6	656032	656037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119547
11067	NC_004547	GT	3	6	656041	656046	0 %	50 %	50 %	0 %	50119547
11068	NC_004547	GTG	2	6	656053	656058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119547
11069	NC_004547	ACA	2	6	656075	656080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119547
11070	NC_004547	ATT	2	6	656151	656156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119547
11071	NC_004547	GTT	2	6	656221	656226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119547
11072	NC_004547	GAT	2	6	656248	656253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119547
11073	NC_004547	GAA	2	6	656347	656352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119547
11074	NC_004547	GAT	2	6	656365	656370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119547
11075	NC_004547	CGC	2	6	656382	656387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119547
11076	NC_004547	GCG	2	6	656515	656520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119547
11077	NC_004547	GCG	2	6	656568	656573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119547
11078	NC_004547	GGAAT	2	10	656638	656647	40 %	20 %	40 %	0 %	50119547
11079	NC_004547	ATG	2	6	656743	656748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119547
11080	NC_004547	GAT	2	6	656898	656903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119547
11081	NC_004547	GCA	2	6	656932	656937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119547
11082	NC_004547	ATG	2	6	656938	656943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119547
11083	NC_004547	GAT	2	6	657042	657047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119547
11084	NC_004547	GGCA	2	8	657256	657263	25 %	0 %	50 %	25 %	50119548
11085	NC_004547	GTT	2	6	657323	657328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119548
11086	NC_004547	TGAG	2	8	657394	657401	25 %	25 %	50 %	0 %	50119548
11087	NC_004547	TGA	2	6	657593	657598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119548
11088	NC_004547	GCA	2	6	657632	657637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119548
11089	NC_004547	TG	3	6	657693	657698	0 %	50 %	50 %	0 %	50119548
11090	NC_004547	TGA	2	6	657734	657739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119548
11091	NC_004547	AG	3	6	657806	657811	50 %	0 %	50 %	0 %	50119548
11092	NC_004547	GCC	2	6	657853	657858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119548
11093	NC_004547	CGTTG	2	10	657872	657881	0 %	40 %	40 %	20 %	50119548
11094	NC_004547	ACT	2	6	657895	657900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119548
11095	NC_004547	ATG	2	6	657904	657909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119548
11096	NC_004547	CAT	2	6	657911	657916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119548
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11099	NC_004547	ATT	2	6	658160	658165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119549
11100	NC_004547	AT	3	6	658171	658176	50 %	50 %	0 %	0 %	50119549
11101	NC_004547	CAG	2	6	658178	658183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119549
11102	NC_004547	GAC	2	6	658220	658225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119549
11103	NC_004547	TGT	2	6	658278	658283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119549
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11105	NC_004547	CAAC	2	8	658392	658399	50 %	0 %	0 %	50 %	50119549
11106	NC_004547	TGGC	2	8	658400	658407	0 %	25 %	50 %	25 %	50119549
11107	NC_004547	CTG	2	6	658478	658483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119549
11108	NC_004547	CAT	2	6	658492	658497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119549
11109	NC_004547	CAGGG	2	10	658539	658548	20 %	0 %	60 %	20 %	50119549
11110	NC_004547	CGC	2	6	658718	658723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119549
11111	NC_004547	GATA	2	8	658780	658787	50 %	25 %	25 %	0 %	50119549
11112	NC_004547	GAT	2	6	658802	658807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119549
11113	NC_004547	T	6	6	658807	658812	0 %	100 %	0 %	0 %	50119549
11114	NC_004547	ATT	2	6	658956	658961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119549
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11116	NC_004547	GTCT	2	8	659037	659044	0 %	50 %	25 %	25 %	50119549
11117	NC_004547	ATC	2	6	659047	659052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119549
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11119	NC_004547	GGC	2	6	659065	659070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119549
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11121	NC_004547	TAA	2	6	659821	659826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50119550
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11123	NC_004547	GAT	2	6	659881	659886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119550
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11126	NC_004547	T	7	7	660112	660118	0 %	100 %	0 %	0 %	50119550
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11129	NC_004547	T	6	6	660220	660225	0 %	100 %	0 %	0 %	50119550
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11153	NC_004547	GA	3	6	661386	661391	50 %	0 %	50 %	0 %	50119551
11154	NC_004547	GTC	2	6	661428	661433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119551
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11164	NC_004547	T	6	6	661705	661710	0 %	100 %	0 %	0 %	50119552
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11228	NC_004547	TGC	2	6	664491	664496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119552
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11230	NC_004547	CA	3	6	664603	664608	50 %	0 %	0 %	50 %	50119552
11231	NC_004547	AGC	2	6	664650	664655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119552
11232	NC_004547	CGG	2	6	664697	664702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119552
11233	NC_004547	TGA	2	6	664828	664833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119552
11234	NC_004547	TGGA	2	8	664888	664895	25 %	25 %	50 %	0 %	50119552
11235	NC_004547	ATC	2	6	664984	664989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119552
11236	NC_004547	TGC	2	6	665092	665097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119552
11237	NC_004547	GCG	2	6	665098	665103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119552
11238	NC_004547	A	6	6	665122	665127	100 %	0 %	0 %	0 %	50119552
11239	NC_004547	A	6	6	665142	665147	100 %	0 %	0 %	0 %	50119552
11240	NC_004547	TGG	2	6	665172	665177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119552
11241	NC_004547	TAGG	2	8	665212	665219	25 %	25 %	50 %	0 %	50119552
11242	NC_004547	TCC	2	6	665252	665257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50119552
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11244	NC_004547	AAG	2	6	665302	665307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119552
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11365	NC_004547	TTG	2	6	671928	671933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119553
11366	NC_004547	CGA	2	6	671947	671952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119553
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11477	NC_004547	TGT	2	6	677725	677730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119555
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11481	NC_004547	TGA	2	6	677932	677937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119555
11482	NC_004547	TA	3	6	678034	678039	50 %	50 %	0 %	0 %	50119555
11483	NC_004547	TGC	2	6	678115	678120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119556
11484	NC_004547	CCA	2	6	678158	678163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119556
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11490	NC_004547	A	7	7	678393	678399	100 %	0 %	0 %	0 %	50119556
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