MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pectobacterium atrosepticum SCRI1043 chromosome

Total Repeats: 87258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004547	GTA	2	6	36414	36419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118992
502	NC_004547	GAA	2	6	36425	36430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50118992
503	NC_004547	ATCA	2	8	36434	36441	50 %	25 %	0 %	25 %	50118992
504	NC_004547	GCC	2	6	36497	36502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118992
505	NC_004547	CTT	2	6	36529	36534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118992
506	NC_004547	GAA	2	6	36536	36541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50118992
507	NC_004547	TGA	2	6	36555	36560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118992
508	NC_004547	TGC	2	6	36576	36581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118992
509	NC_004547	CAA	2	6	36613	36618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50118992
510	NC_004547	ACTTC	2	10	36619	36628	20 %	40 %	0 %	40 %	50118992
511	NC_004547	ATT	2	6	37064	37069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50118993
512	NC_004547	ACC	2	6	37091	37096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118993
513	NC_004547	CAA	2	6	37115	37120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50118993
514	NC_004547	A	6	6	37210	37215	100 %	0 %	0 %	0 %	50118993
515	NC_004547	CGG	2	6	37279	37284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118993
516	NC_004547	CTG	2	6	37322	37327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118993
517	NC_004547	GTT	2	6	37328	37333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50118993
518	NC_004547	GATG	2	8	37339	37346	25 %	25 %	50 %	0 %	50118993
519	NC_004547	A	6	6	37376	37381	100 %	0 %	0 %	0 %	50118993
520	NC_004547	CAA	2	6	37417	37422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50118993
521	NC_004547	GATG	2	8	37636	37643	25 %	25 %	50 %	0 %	50118993
522	NC_004547	TC	3	6	37662	37667	0 %	50 %	0 %	50 %	50118993
523	NC_004547	ACA	2	6	37677	37682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50118993
524	NC_004547	TATCGG	2	12	37696	37707	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	50118993
525	NC_004547	CAA	2	6	37739	37744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50118993
526	NC_004547	TTG	2	6	37752	37757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50118993
527	NC_004547	ATC	2	6	37853	37858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118993
528	NC_004547	TTC	2	6	37964	37969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118993
529	NC_004547	AAG	2	6	37998	38003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50118993
530	NC_004547	GTG	2	6	38118	38123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118993
531	NC_004547	CGT	2	6	38156	38161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118993
532	NC_004547	TTA	2	6	38196	38201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50118993
533	NC_004547	GAA	2	6	38258	38263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50118993
534	NC_004547	CATGAC	2	12	38401	38412	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50118993
535	NC_004547	CTG	2	6	38426	38431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118993
536	NC_004547	ATC	2	6	38603	38608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118993
537	NC_004547	TCAC	2	8	38614	38621	25 %	25 %	0 %	50 %	50118993
538	NC_004547	TGA	2	6	38689	38694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118993
539	NC_004547	TGA	3	9	38752	38760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118993
540	NC_004547	CGC	2	6	38778	38783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118993
541	NC_004547	TTCGTA	2	12	38790	38801	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50118993
542	NC_004547	GC	3	6	38830	38835	0 %	0 %	50 %	50 %	50118993
543	NC_004547	GCA	2	6	38844	38849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118993
544	NC_004547	TGT	2	6	39048	39053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50118994
545	NC_004547	ATTGAT	2	12	39055	39066	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50118994
546	NC_004547	AGC	2	6	39100	39105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118994
547	NC_004547	CCA	2	6	39194	39199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118994
548	NC_004547	GCTG	2	8	39247	39254	0 %	25 %	50 %	25 %	50118994
549	NC_004547	CAT	2	6	39294	39299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118994
550	NC_004547	GTG	2	6	39328	39333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118994
551	NC_004547	AAG	2	6	39479	39484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50118994
552	NC_004547	T	6	6	39508	39513	0 %	100 %	0 %	0 %	50118994
553	NC_004547	CGC	2	6	39537	39542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118994
554	NC_004547	GGT	2	6	39585	39590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118994
555	NC_004547	T	6	6	39598	39603	0 %	100 %	0 %	0 %	50118994
556	NC_004547	CCAGCG	2	12	39723	39734	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	50118995
557	NC_004547	GT	3	6	39840	39845	0 %	50 %	50 %	0 %	50118995
558	NC_004547	TGG	2	6	39904	39909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118995
559	NC_004547	TGG	2	6	39918	39923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118995
560	NC_004547	TGG	2	6	39939	39944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118995
561	NC_004547	ATG	2	6	40101	40106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118995
562	NC_004547	CAT	2	6	40234	40239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50118996
563	NC_004547	TGC	2	6	40325	40330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118996
564	NC_004547	ATG	2	6	40373	40378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118996
565	NC_004547	CAC	2	6	40387	40392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118996
566	NC_004547	CG	3	6	40545	40550	0 %	0 %	50 %	50 %	50118996
567	NC_004547	CTT	2	6	40602	40607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118996
568	NC_004547	ACG	2	6	40654	40659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118996
569	NC_004547	TGA	2	6	40676	40681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118996
570	NC_004547	GAT	2	6	40702	40707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118996
571	NC_004547	A	6	6	40775	40780	100 %	0 %	0 %	0 %	50118996
572	NC_004547	A	6	6	40810	40815	100 %	0 %	0 %	0 %	50118996
573	NC_004547	CAC	2	6	40821	40826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118996
574	NC_004547	CAC	2	6	40855	40860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118996
575	NC_004547	GCA	2	6	40874	40879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118996
576	NC_004547	TC	3	6	40885	40890	0 %	50 %	0 %	50 %	50118996
577	NC_004547	TGC	3	9	40922	40930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118996
578	NC_004547	TGG	2	6	40944	40949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118996
579	NC_004547	CCGA	2	8	41001	41008	25 %	0 %	25 %	50 %	50118996
580	NC_004547	GC	3	6	41071	41076	0 %	0 %	50 %	50 %	50118996
581	NC_004547	TGA	2	6	41103	41108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118996
582	NC_004547	TGC	2	6	41144	41149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118996
583	NC_004547	GGT	2	6	41179	41184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118996
584	NC_004547	TGC	2	6	41543	41548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118997
585	NC_004547	CGG	2	6	41616	41621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118997
586	NC_004547	GCC	2	6	41625	41630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118997
587	NC_004547	TGAT	2	8	41762	41769	25 %	50 %	25 %	0 %	50118997
588	NC_004547	GCG	2	6	41863	41868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118997
589	NC_004547	CGTTG	2	10	41887	41896	0 %	40 %	40 %	20 %	50118997
590	NC_004547	TGG	2	6	41936	41941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50118997
591	NC_004547	CAG	2	6	41950	41955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118997
592	NC_004547	GGAAA	2	10	41991	42000	60 %	0 %	40 %	0 %	50118997
593	NC_004547	GCCA	2	8	42062	42069	25 %	0 %	25 %	50 %	50118997
594	NC_004547	ACA	2	6	42134	42139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50118997
595	NC_004547	ATT	2	6	42163	42168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50118997
596	NC_004547	GCC	2	6	42199	42204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118997
597	NC_004547	CCG	2	6	42240	42245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118997
598	NC_004547	ATCA	2	8	42421	42428	50 %	25 %	0 %	25 %	50118997
599	NC_004547	TAACAG	2	12	42441	42452	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50118997
600	NC_004547	TCT	2	6	42551	42556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118997
601	NC_004547	TGGTTG	2	12	42623	42634	0 %	50 %	50 %	0 %	50118997
602	NC_004547	TTGAGT	2	12	42674	42685	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	50118997
603	NC_004547	TAG	2	6	42721	42726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118997
604	NC_004547	GCC	2	6	42757	42762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118997
605	NC_004547	CTGC	2	8	42858	42865	0 %	25 %	25 %	50 %	50118997
606	NC_004547	CTG	2	6	42945	42950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118997
607	NC_004547	CGG	2	6	42973	42978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118997
608	NC_004547	CTG	2	6	43104	43109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118997
609	NC_004547	ACC	2	6	43139	43144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118997
610	NC_004547	A	6	6	43151	43156	100 %	0 %	0 %	0 %	50118997
611	NC_004547	CAG	3	9	43159	43167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118997
612	NC_004547	AAT	2	6	43178	43183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50118997
613	NC_004547	TTC	2	6	43364	43369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50118998
614	NC_004547	AATCC	2	10	43442	43451	40 %	20 %	0 %	40 %	50118998
615	NC_004547	GCT	2	6	43474	43479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118998
616	NC_004547	AAT	2	6	43514	43519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50118998
617	NC_004547	ATCAGC	2	12	43671	43682	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50118998
618	NC_004547	CGC	2	6	43813	43818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118998
619	NC_004547	GCT	2	6	43855	43860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50118998
620	NC_004547	ATCAGC	2	12	43920	43931	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50118998
621	NC_004547	GCG	2	6	43972	43977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50118998
622	NC_004547	ATG	2	6	43986	43991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50118998
623	NC_004547	GC	3	6	44011	44016	0 %	0 %	50 %	50 %	50118998
624	NC_004547	GCA	2	6	44023	44028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50118998
625	NC_004547	GCGAC	2	10	44077	44086	20 %	0 %	40 %	40 %	50118998
626	NC_004547	CAC	2	6	44126	44131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50118998
627	NC_004547	TTA	2	6	44178	44183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50118998
628	NC_004547	GCC	3	9	44198	44206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50118998
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747	NC_004547	CGG	2	6	50579	50584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119003
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