MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pectobacterium atrosepticum SCRI1043 chromosome

Total Repeats: 87258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_004547	CACGAC	2	12	538619	538630	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	50119424
9003	NC_004547	TGA	2	6	538648	538653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119424
9004	NC_004547	GCG	2	6	538682	538687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119424
9005	NC_004547	TGC	2	6	538737	538742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119424
9006	NC_004547	GGC	2	6	538784	538789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119424
9007	NC_004547	GGC	2	6	538793	538798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119424
9008	NC_004547	GTTC	2	8	538902	538909	0 %	50 %	25 %	25 %	50119424
9009	NC_004547	TCG	2	6	538938	538943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119424
9010	NC_004547	GTG	2	6	538982	538987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119424
9011	NC_004547	TTCG	2	8	539035	539042	0 %	50 %	25 %	25 %	50119424
9012	NC_004547	TGA	2	6	539175	539180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119424
9013	NC_004547	TGA	2	6	539382	539387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119425
9014	NC_004547	ACGG	2	8	539416	539423	25 %	0 %	50 %	25 %	50119425
9015	NC_004547	GCC	2	6	539425	539430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119425
9016	NC_004547	CCATTT	2	12	539454	539465	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	50119425
9017	NC_004547	GAC	2	6	539476	539481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119425
9018	NC_004547	ACG	2	6	539541	539546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119425
9019	NC_004547	CTGG	2	8	539557	539564	0 %	25 %	50 %	25 %	50119425
9020	NC_004547	ATC	2	6	539600	539605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119425
9021	NC_004547	CGTG	2	8	539729	539736	0 %	25 %	50 %	25 %	50119425
9022	NC_004547	CGA	2	6	539763	539768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119425
9023	NC_004547	ATC	2	6	539794	539799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119425
9024	NC_004547	CTG	2	6	539844	539849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119425
9025	NC_004547	AG	3	6	539877	539882	50 %	0 %	50 %	0 %	50119425
9026	NC_004547	ACT	2	6	539915	539920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119425
9027	NC_004547	TGG	2	6	539942	539947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119425
9028	NC_004547	CTG	2	6	539983	539988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119425
9029	NC_004547	CTG	2	6	540040	540045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119425
9030	NC_004547	AG	3	6	540046	540051	50 %	0 %	50 %	0 %	50119425
9031	NC_004547	ACG	2	6	540053	540058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119425
9032	NC_004547	CAC	2	6	540060	540065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119425
9033	NC_004547	CTG	2	6	540072	540077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119425
9034	NC_004547	A	7	7	540080	540086	100 %	0 %	0 %	0 %	50119425
9035	NC_004547	TCA	2	6	540113	540118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119426
9036	NC_004547	CGC	2	6	540133	540138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119426
9037	NC_004547	AGT	2	6	540163	540168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119426
9038	NC_004547	GTT	2	6	540170	540175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119426
9039	NC_004547	CTT	2	6	540298	540303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119426
9040	NC_004547	TTA	2	6	540603	540608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50119426
9041	NC_004547	TACC	2	8	540697	540704	25 %	25 %	0 %	50 %	50119426
9042	NC_004547	GGC	2	6	540725	540730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119426
9043	NC_004547	CGC	2	6	540787	540792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119426
9044	NC_004547	ACC	2	6	540798	540803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50119426
9045	NC_004547	GC	3	6	540834	540839	0 %	0 %	50 %	50 %	50119426
9046	NC_004547	CCG	2	6	540882	540887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119426
9047	NC_004547	AG	3	6	540931	540936	50 %	0 %	50 %	0 %	50119426
9048	NC_004547	GAT	2	6	541024	541029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119426
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9051	NC_004547	GTC	2	6	541259	541264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119426
9052	NC_004547	ATCA	2	8	541304	541311	50 %	25 %	0 %	25 %	50119426
9053	NC_004547	CAG	2	6	541433	541438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119426
9054	NC_004547	CGC	2	6	541489	541494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119426
9055	NC_004547	GGTT	2	8	541554	541561	0 %	50 %	50 %	0 %	50119426
9056	NC_004547	GGA	2	6	541607	541612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50119426
9057	NC_004547	CAG	2	6	541733	541738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119426
9058	NC_004547	TGA	2	6	541879	541884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119426
9059	NC_004547	GTG	2	6	541911	541916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119426
9060	NC_004547	ACG	2	6	541938	541943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119426
9061	NC_004547	T	6	6	541945	541950	0 %	100 %	0 %	0 %	50119426
9062	NC_004547	GCAG	2	8	541980	541987	25 %	0 %	50 %	25 %	50119426
9063	NC_004547	CAG	2	6	542006	542011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119426
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9065	NC_004547	ATG	3	9	542039	542047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119426
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9070	NC_004547	TGC	2	6	542444	542449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119427
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9086	NC_004547	CCGGC	2	10	543074	543083	0 %	0 %	40 %	60 %	50119427
9087	NC_004547	CAG	2	6	543105	543110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119427
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9089	NC_004547	CAG	2	6	543171	543176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119427
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9092	NC_004547	GCC	2	6	543258	543263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119427
9093	NC_004547	CAT	2	6	543333	543338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119427
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9102	NC_004547	CTG	3	9	544345	544353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119428
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9105	NC_004547	TGG	3	9	544484	544492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119428
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9119	NC_004547	AGTA	2	8	545475	545482	50 %	25 %	25 %	0 %	50119429
9120	NC_004547	CTT	2	6	545510	545515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119429
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9122	NC_004547	ATG	2	6	545566	545571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119429
9123	NC_004547	TAC	3	9	545574	545582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50119429
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9232	NC_004547	GT	3	6	550829	550834	0 %	50 %	50 %	0 %	50119432
9233	NC_004547	CAG	2	6	550838	550843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119432
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9236	NC_004547	AGC	3	9	550998	551006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119432
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9238	NC_004547	GCG	2	6	551087	551092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119432
9239	NC_004547	T	7	7	551310	551316	0 %	100 %	0 %	0 %	50119432
9240	NC_004547	GCCA	2	8	551330	551337	25 %	0 %	25 %	50 %	50119432
9241	NC_004547	TGG	3	9	551355	551363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119432
9242	NC_004547	CAA	2	6	551501	551506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119433
9243	NC_004547	GCA	2	6	551579	551584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119433
9244	NC_004547	CGC	2	6	551605	551610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119433
9245	NC_004547	GTC	2	6	551633	551638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119433
9246	NC_004547	ACA	2	6	551692	551697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50119433
9247	NC_004547	ATG	2	6	551863	551868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119433
9248	NC_004547	CAG	3	9	551910	551918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119433
9249	NC_004547	CCGT	2	8	551936	551943	0 %	25 %	25 %	50 %	50119433
9250	NC_004547	GAGC	2	8	551990	551997	25 %	0 %	50 %	25 %	50119433
9251	NC_004547	TGA	2	6	552010	552015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50119433
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9255	NC_004547	GGT	2	6	552285	552290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119433
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9265	NC_004547	GCG	2	6	552726	552731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119433
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9274	NC_004547	CTG	2	6	553387	553392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119433
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9280	NC_004547	GTG	2	6	553795	553800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119433
9281	NC_004547	GGT	2	6	553817	553822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119433
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9283	NC_004547	CCGA	2	8	553866	553873	25 %	0 %	25 %	50 %	50119433
9284	NC_004547	CTG	2	6	554160	554165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119433
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9291	NC_004547	TACC	2	8	554400	554407	25 %	25 %	0 %	50 %	50119433
9292	NC_004547	GCC	2	6	554489	554494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	50119433
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9332	NC_004547	GCA	2	6	556734	556739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119433
9333	NC_004547	TCAG	2	8	556756	556763	25 %	25 %	25 %	25 %	50119433
9334	NC_004547	GCT	2	6	556892	556897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119433
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9342	NC_004547	TGC	2	6	557515	557520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119433
9343	NC_004547	TG	3	6	557590	557595	0 %	50 %	50 %	0 %	50119433
9344	NC_004547	GCA	2	6	557681	557686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119433
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9348	NC_004547	CAG	2	6	557876	557881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119434
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9350	NC_004547	GCTG	2	8	557913	557920	0 %	25 %	50 %	25 %	50119434
9351	NC_004547	GT	3	6	557948	557953	0 %	50 %	50 %	0 %	50119434
9352	NC_004547	GCG	2	6	557954	557959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119434
9353	NC_004547	CAG	2	6	558011	558016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119434
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9355	NC_004547	AGC	2	6	558119	558124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119434
9356	NC_004547	TCG	2	6	558132	558137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50119434
9357	NC_004547	TGT	2	6	558157	558162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50119434
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9360	NC_004547	TGG	2	6	558351	558356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50119434
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9363	NC_004547	GCG	2	6	558584	558589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119434
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9490	NC_004547	GCTG	2	8	566049	566056	0 %	25 %	50 %	25 %	50119440
9491	NC_004547	GGGCGC	2	12	566104	566115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50119440
9492	NC_004547	TTC	2	6	566248	566253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50119440
9493	NC_004547	GC	3	6	566260	566265	0 %	0 %	50 %	50 %	50119440
9494	NC_004547	TC	3	6	566289	566294	0 %	50 %	0 %	50 %	50119440
9495	NC_004547	TGCTT	2	10	566320	566329	0 %	60 %	20 %	20 %	50119440
9496	NC_004547	TC	3	6	566331	566336	0 %	50 %	0 %	50 %	50119440
9497	NC_004547	GA	3	6	566355	566360	50 %	0 %	50 %	0 %	50119440
9498	NC_004547	ACAGCG	2	12	566379	566390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50119441
9499	NC_004547	GAA	2	6	566431	566436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119441
9500	NC_004547	GAA	2	6	566513	566518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50119441

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