MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus furiosus DSM 3638 chromosome

Total Repeats: 36586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003413	TCC	2	6	112	117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18976373
2	NC_003413	TCG	2	6	173	178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18976373
3	NC_003413	ACC	2	6	184	189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18976373
4	NC_003413	ATA	2	6	242	247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18976373
5	NC_003413	ATT	2	6	323	328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18976373
6	NC_003413	CAG	2	6	339	344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18976373
7	NC_003413	T	7	7	398	404	0 %	100 %	0 %	0 %	18976373
8	NC_003413	TAAT	2	8	429	436	50 %	50 %	0 %	0 %	18976373
9	NC_003413	ATA	3	9	454	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18976373
10	NC_003413	CCT	2	6	524	529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18976373
11	NC_003413	TTC	2	6	565	570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18976373
12	NC_003413	AAC	2	6	583	588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18976373
13	NC_003413	AAG	2	6	604	609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18976373
14	NC_003413	TTCA	2	8	619	626	25 %	50 %	0 %	25 %	18976373
15	NC_003413	TCTA	2	8	736	743	25 %	50 %	0 %	25 %	18976373
16	NC_003413	TCA	2	6	770	775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18976373
17	NC_003413	TC	3	6	805	810	0 %	50 %	0 %	50 %	18976373
18	NC_003413	ATA	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18976373
19	NC_003413	T	6	6	886	891	0 %	100 %	0 %	0 %	18976373
20	NC_003413	T	6	6	896	901	0 %	100 %	0 %	0 %	18976373
21	NC_003413	AAT	2	6	915	920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18976373
22	NC_003413	TATGGA	2	12	940	951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18976374
23	NC_003413	G	6	6	1051	1056	0 %	0 %	100 %	0 %	18976374
24	NC_003413	ATT	2	6	1057	1062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18976374
25	NC_003413	T	6	6	1138	1143	0 %	100 %	0 %	0 %	18976374
26	NC_003413	CT	3	6	1171	1176	0 %	50 %	0 %	50 %	18976374
27	NC_003413	CTG	2	6	1196	1201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18976374
28	NC_003413	TTC	2	6	1230	1235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18976374
29	NC_003413	TTG	2	6	1317	1322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18976374
30	NC_003413	TAG	2	6	1341	1346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18976374
31	NC_003413	T	7	7	1383	1389	0 %	100 %	0 %	0 %	18976374
32	NC_003413	AGA	2	6	1413	1418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18976374
33	NC_003413	AAC	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18976374
34	NC_003413	TAT	2	6	1442	1447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18976374
35	NC_003413	T	6	6	1447	1452	0 %	100 %	0 %	0 %	18976374
36	NC_003413	ATT	3	9	1456	1464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18976374
37	NC_003413	AT	3	6	1501	1506	50 %	50 %	0 %	0 %	18976374
38	NC_003413	ATT	2	6	1510	1515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18976374
39	NC_003413	T	6	6	1527	1532	0 %	100 %	0 %	0 %	18976374
40	NC_003413	AT	3	6	1611	1616	50 %	50 %	0 %	0 %	18976374
41	NC_003413	TC	4	8	1627	1634	0 %	50 %	0 %	50 %	18976374
42	NC_003413	AT	3	6	1644	1649	50 %	50 %	0 %	0 %	18976374
43	NC_003413	GCA	2	6	1684	1689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18976374
44	NC_003413	GTT	2	6	1696	1701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18976374
45	NC_003413	TC	3	6	1721	1726	0 %	50 %	0 %	50 %	18976374
46	NC_003413	TAAT	2	8	1787	1794	50 %	50 %	0 %	0 %	18976374
47	NC_003413	CTT	2	6	2103	2108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18976374
48	NC_003413	ATA	2	6	2164	2169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18976374
49	NC_003413	ACC	2	6	2248	2253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18976375
50	NC_003413	ACATT	2	10	2265	2274	40 %	40 %	0 %	20 %	18976375
51	NC_003413	ATT	2	6	2334	2339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18976375
52	NC_003413	TTA	2	6	2340	2345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18976375
53	NC_003413	AAT	2	6	2346	2351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18976375
54	NC_003413	AT	3	6	2425	2430	50 %	50 %	0 %	0 %	18976375
55	NC_003413	AGA	2	6	2435	2440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18976375
56	NC_003413	ATT	2	6	2447	2452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18976375
57	NC_003413	TTTTA	2	10	2459	2468	20 %	80 %	0 %	0 %	18976375
58	NC_003413	A	6	6	2486	2491	100 %	0 %	0 %	0 %	18976375
59	NC_003413	GGA	2	6	2529	2534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18976375
60	NC_003413	TAT	2	6	2660	2665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18976375
61	NC_003413	AGTT	2	8	2750	2757	25 %	50 %	25 %	0 %	18976375
62	NC_003413	T	7	7	2756	2762	0 %	100 %	0 %	0 %	18976375
63	NC_003413	CTT	2	6	2777	2782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18976375
64	NC_003413	CAAA	2	8	2845	2852	75 %	0 %	0 %	25 %	18976375
65	NC_003413	CTA	2	6	2917	2922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18976375
66	NC_003413	CTT	2	6	2936	2941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18976375
67	NC_003413	AT	3	6	2986	2991	50 %	50 %	0 %	0 %	18976375
68	NC_003413	CTC	2	6	3011	3016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18976375
69	NC_003413	AT	3	6	3053	3058	50 %	50 %	0 %	0 %	18976375
70	NC_003413	AAC	2	6	3086	3091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18976375
71	NC_003413	TAA	2	6	3097	3102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18976375
72	NC_003413	TAT	2	6	3109	3114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18976375
73	NC_003413	ATT	2	6	3167	3172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18976375
74	NC_003413	TTA	2	6	3192	3197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18976375
75	NC_003413	TAAT	2	8	3229	3236	50 %	50 %	0 %	0 %	18976375
76	NC_003413	TTC	2	6	3318	3323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18976375
77	NC_003413	CTT	2	6	3379	3384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18976376
78	NC_003413	CA	3	6	3402	3407	50 %	0 %	0 %	50 %	18976376
79	NC_003413	TA	3	6	3428	3433	50 %	50 %	0 %	0 %	18976376
80	NC_003413	AT	3	6	3491	3496	50 %	50 %	0 %	0 %	18976376
81	NC_003413	AAG	2	6	3497	3502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18976376
82	NC_003413	AAG	2	6	3578	3583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18976376
83	NC_003413	T	6	6	3632	3637	0 %	100 %	0 %	0 %	18976376
84	NC_003413	AAG	2	6	3638	3643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18976376
85	NC_003413	AAAAT	2	10	3677	3686	80 %	20 %	0 %	0 %	18976376
86	NC_003413	T	6	6	3725	3730	0 %	100 %	0 %	0 %	18976376
87	NC_003413	ATA	2	6	3738	3743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18976376
88	NC_003413	T	6	6	3744	3749	0 %	100 %	0 %	0 %	18976376
89	NC_003413	TAT	2	6	3785	3790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18976376
90	NC_003413	TA	3	6	3879	3884	50 %	50 %	0 %	0 %	18976376
91	NC_003413	TGA	2	6	3890	3895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18976376
92	NC_003413	ATC	2	6	3906	3911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18976376
93	NC_003413	AGA	2	6	4066	4071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18976376
94	NC_003413	TAA	2	6	4099	4104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18976376
95	NC_003413	TA	3	6	4140	4145	50 %	50 %	0 %	0 %	18976377
96	NC_003413	ATG	2	6	4391	4396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18976377
97	NC_003413	GAT	2	6	4400	4405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18976377
98	NC_003413	AG	3	6	4409	4414	50 %	0 %	50 %	0 %	18976377
99	NC_003413	T	6	6	4525	4530	0 %	100 %	0 %	0 %	18976377
100	NC_003413	AATT	2	8	4645	4652	50 %	50 %	0 %	0 %	18976377
101	NC_003413	CTTT	2	8	4707	4714	0 %	75 %	0 %	25 %	18976377
102	NC_003413	AGT	2	6	4784	4789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18976377
103	NC_003413	ATA	2	6	4832	4837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18976377
104	NC_003413	GA	3	6	5379	5384	50 %	0 %	50 %	0 %	18976378
105	NC_003413	AG	3	6	5401	5406	50 %	0 %	50 %	0 %	18976378
106	NC_003413	TGG	2	6	5610	5615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18976378
107	NC_003413	GA	3	6	5617	5622	50 %	0 %	50 %	0 %	18976378
108	NC_003413	TTTG	2	8	5625	5632	0 %	75 %	25 %	0 %	18976378
109	NC_003413	GAA	2	6	5661	5666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18976378
110	NC_003413	CCG	2	6	5786	5791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18976378
111	NC_003413	TAT	2	6	5826	5831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18976378
112	NC_003413	AGG	2	6	5887	5892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18976378
113	NC_003413	AAT	2	6	5940	5945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18976378
114	NC_003413	ACT	2	6	5950	5955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18976378
115	NC_003413	AGG	2	6	5966	5971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18976378
116	NC_003413	CAA	2	6	6003	6008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18976378
117	NC_003413	TGA	2	6	6111	6116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18976378
118	NC_003413	TAC	2	6	6495	6500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18976379
119	NC_003413	ATT	2	6	6548	6553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18976379
120	NC_003413	GAG	2	6	6559	6564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18976379
121	NC_003413	AGG	2	6	6597	6602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18976379
122	NC_003413	GAG	2	6	6724	6729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18976379
123	NC_003413	CTA	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18976379
124	NC_003413	AG	3	6	6785	6790	50 %	0 %	50 %	0 %	18976379
125	NC_003413	AGG	2	6	6837	6842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18976379
126	NC_003413	GAT	2	6	6991	6996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18976379
127	NC_003413	GAA	2	6	6998	7003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18976379
128	NC_003413	CTTT	2	8	7023	7030	0 %	75 %	0 %	25 %	18976379
129	NC_003413	ACTC	2	8	7124	7131	25 %	25 %	0 %	50 %	18976379
130	NC_003413	AT	3	6	7145	7150	50 %	50 %	0 %	0 %	18976379
131	NC_003413	ACTC	2	8	7153	7160	25 %	25 %	0 %	50 %	18976379
132	NC_003413	ACCT	2	8	7535	7542	25 %	25 %	0 %	50 %	18976379
133	NC_003413	GAGCTT	2	12	7553	7564	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	18976379
134	NC_003413	GA	3	6	7571	7576	50 %	0 %	50 %	0 %	18976379
135	NC_003413	AGTT	2	8	7587	7594	25 %	50 %	25 %	0 %	18976379
136	NC_003413	GAA	2	6	7624	7629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18976379
137	NC_003413	AGG	2	6	7706	7711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18976379
138	NC_003413	GGA	2	6	7773	7778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18976379
139	NC_003413	TCA	2	6	7812	7817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18976379
140	NC_003413	CGA	2	6	7845	7850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18976379
141	NC_003413	TTC	3	9	7853	7861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18976379
142	NC_003413	GAAG	2	8	7903	7910	50 %	0 %	50 %	0 %	18976379
143	NC_003413	ACAGGG	2	12	8142	8153	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	18976380
144	NC_003413	TCA	2	6	8187	8192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18976380
145	NC_003413	TGG	2	6	8229	8234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18976380
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149	NC_003413	AG	3	6	8550	8555	50 %	0 %	50 %	0 %	18976381
150	NC_003413	GACA	2	8	8568	8575	50 %	0 %	25 %	25 %	18976381
151	NC_003413	A	6	6	8613	8618	100 %	0 %	0 %	0 %	18976381
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161	NC_003413	TACT	2	8	8934	8941	25 %	50 %	0 %	25 %	18976381
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263	NC_003413	CTT	2	6	14168	14173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18976387
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265	NC_003413	TGCAAT	2	12	14234	14245	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	18976387
266	NC_003413	TAT	2	6	14246	14251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18976387
267	NC_003413	GAG	2	6	14278	14283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18976387
268	NC_003413	G	7	7	14312	14318	0 %	0 %	100 %	0 %	18976387
269	NC_003413	A	6	6	14370	14375	100 %	0 %	0 %	0 %	18976387
270	NC_003413	GGT	2	6	14602	14607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18976388
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272	NC_003413	AT	3	6	14780	14785	50 %	50 %	0 %	0 %	18976388
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398	NC_003413	AG	4	8	22434	22441	50 %	0 %	50 %	0 %	33359447
399	NC_003413	AGAT	2	8	22446	22453	50 %	25 %	25 %	0 %	33359447
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401	NC_003413	GGA	2	6	22554	22559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33359447
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