MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas aeruginosa PAO1 chromosome

Total Repeats: 146384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_002516	CGC	2	6	819380	819385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595948
19003	NC_002516	CAG	2	6	819392	819397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595948
19004	NC_002516	CTGCG	2	10	819422	819431	0 %	20 %	40 %	40 %	15595948
19005	NC_002516	CAC	2	6	819487	819492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15595948
19006	NC_002516	GAA	2	6	819506	819511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15595948
19007	NC_002516	CGC	2	6	819529	819534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595948
19008	NC_002516	GCG	2	6	819536	819541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595948
19009	NC_002516	GTG	2	6	819573	819578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595948
19010	NC_002516	GAT	2	6	819596	819601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15595948
19011	NC_002516	GCCGAT	2	12	819650	819661	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15595948
19012	NC_002516	CGA	2	6	819664	819669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595948
19013	NC_002516	AGC	2	6	819747	819752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595948
19014	NC_002516	ATC	2	6	819759	819764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15595948
19015	NC_002516	GCCA	2	8	819792	819799	25 %	0 %	25 %	50 %	15595948
19016	NC_002516	GCC	2	6	819800	819805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595948
19017	NC_002516	GCG	2	6	819820	819825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595948
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19019	NC_002516	CGG	2	6	819892	819897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595949
19020	NC_002516	CAG	2	6	819921	819926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595949
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19023	NC_002516	CAG	3	9	820053	820061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595949
19024	NC_002516	GGT	2	6	820137	820142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595949
19025	NC_002516	TGA	2	6	820172	820177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15595949
19026	NC_002516	GAT	2	6	820254	820259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15595949
19027	NC_002516	TGC	2	6	820315	820320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595949
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19033	NC_002516	CGCAG	2	10	820598	820607	20 %	0 %	40 %	40 %	15595949
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19119	NC_002516	GTG	2	6	824143	824148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595952
19120	NC_002516	TGG	2	6	824422	824427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595953
19121	NC_002516	ATC	2	6	824431	824436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15595953
19122	NC_002516	CTG	2	6	824493	824498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595953
19123	NC_002516	GCC	2	6	824511	824516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595953
19124	NC_002516	CCTGGC	2	12	824519	824530	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15595953
19125	NC_002516	GAG	2	6	824535	824540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15595953
19126	NC_002516	GC	3	6	824598	824603	0 %	0 %	50 %	50 %	15595953
19127	NC_002516	GCGCGG	2	12	824606	824617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595953
19128	NC_002516	TGCTGA	2	12	824632	824643	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15595953
19129	NC_002516	GC	3	6	824646	824651	0 %	0 %	50 %	50 %	15595953
19130	NC_002516	CGA	2	6	824693	824698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595953
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19132	NC_002516	CGC	2	6	824757	824762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595953
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19134	NC_002516	CGA	2	6	824837	824842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595953
19135	NC_002516	CTGACC	2	12	824850	824861	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15595953
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19139	NC_002516	GAG	2	6	824955	824960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15595953
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19142	NC_002516	CTG	2	6	825057	825062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595953
19143	NC_002516	GCT	3	9	825102	825110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595954
19144	NC_002516	TGGC	2	8	825112	825119	0 %	25 %	50 %	25 %	15595954
19145	NC_002516	CCTGCT	2	12	825120	825131	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15595954
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19147	NC_002516	TCT	2	6	825323	825328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15595954
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19152	NC_002516	ACG	2	6	825437	825442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595954
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19156	NC_002516	TGA	2	6	825572	825577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15595954
19157	NC_002516	CTG	2	6	825586	825591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595954
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19192	NC_002516	GGAT	2	8	826749	826756	25 %	25 %	50 %	0 %	15595955
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19237	NC_002516	GGTT	2	8	828785	828792	0 %	50 %	50 %	0 %	15595957
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19239	NC_002516	GCG	2	6	828826	828831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595957
19240	NC_002516	GAT	2	6	828841	828846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15595957
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19242	NC_002516	GCA	2	6	829323	829328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595958
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19360	NC_002516	CGG	2	6	834862	834867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595963
19361	NC_002516	CCG	2	6	834931	834936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595963
19362	NC_002516	TGG	2	6	834949	834954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595963
19363	NC_002516	GAC	3	9	835044	835052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595963
19364	NC_002516	GCA	3	9	835090	835098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595963
19365	NC_002516	CCG	2	6	835129	835134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595963
19366	NC_002516	AGC	2	6	835135	835140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595963
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19371	NC_002516	TGC	2	6	835324	835329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595963
19372	NC_002516	CAT	2	6	835555	835560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15595964
19373	NC_002516	GCG	2	6	835614	835619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595964
19374	NC_002516	GAGCGC	2	12	835670	835681	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15595964
19375	NC_002516	CGCT	2	8	835799	835806	0 %	25 %	25 %	50 %	15595964
19376	NC_002516	GCC	2	6	835808	835813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595964
19377	NC_002516	GC	3	6	835821	835826	0 %	0 %	50 %	50 %	15595964
19378	NC_002516	CAT	2	6	835978	835983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15595964
19379	NC_002516	CCCCG	2	10	836071	836080	0 %	0 %	20 %	80 %	15595964
19380	NC_002516	ATC	2	6	836114	836119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15595964
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19383	NC_002516	CCA	2	6	836224	836229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15595964
19384	NC_002516	GGCG	2	8	836284	836291	0 %	0 %	75 %	25 %	15595964
19385	NC_002516	TCA	2	6	836301	836306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15595964
19386	NC_002516	GC	3	6	836331	836336	0 %	0 %	50 %	50 %	15595964
19387	NC_002516	AAC	2	6	836360	836365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15595964
19388	NC_002516	TCG	2	6	836495	836500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595964
19389	NC_002516	GGCTTC	2	12	836534	836545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595964
19390	NC_002516	TGC	2	6	836565	836570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595964
19391	NC_002516	ATC	2	6	836579	836584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15595964
19392	NC_002516	GACCTG	2	12	836609	836620	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15595964
19393	NC_002516	CAC	2	6	836623	836628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15595964
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19412	NC_002516	CCCTGG	2	12	837380	837391	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15595965
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19420	NC_002516	CAA	2	6	837636	837641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15595965
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19470	NC_002516	CAG	2	6	839988	839993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595968
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19475	NC_002516	AGA	3	9	840146	840154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15595968
19476	NC_002516	TCA	2	6	840155	840160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15595968
19477	NC_002516	CG	3	6	840201	840206	0 %	0 %	50 %	50 %	15595968
19478	NC_002516	GTCAAG	2	12	840256	840267	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15595968
19479	NC_002516	GGC	2	6	840268	840273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595968
19480	NC_002516	CGA	3	9	840279	840287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595968
19481	NC_002516	CGC	3	9	840393	840401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595969
19482	NC_002516	TGC	2	6	840416	840421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595969
19483	NC_002516	GCCG	2	8	840425	840432	0 %	0 %	50 %	50 %	15595969
19484	NC_002516	TGG	2	6	840452	840457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595969
19485	NC_002516	TTC	2	6	840460	840465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15595969
19486	NC_002516	GC	3	6	840483	840488	0 %	0 %	50 %	50 %	15595969
19487	NC_002516	GCG	2	6	840497	840502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595969
19488	NC_002516	GGCGCG	2	12	840557	840568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595969
19489	NC_002516	CGG	2	6	840680	840685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595969
19490	NC_002516	CGC	2	6	840717	840722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595969
19491	NC_002516	GCT	2	6	840732	840737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595969
19492	NC_002516	GGC	2	6	840738	840743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595969
19493	NC_002516	GCT	2	6	840762	840767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595969
19494	NC_002516	GC	3	6	840768	840773	0 %	0 %	50 %	50 %	15595969
19495	NC_002516	CTG	2	6	840787	840792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595969
19496	NC_002516	GGCC	2	8	840879	840886	0 %	0 %	50 %	50 %	15595969
19497	NC_002516	GCCGAC	2	12	840946	840957	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15595969
19498	NC_002516	GGC	3	9	840978	840986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595969
19499	NC_002516	GCTC	2	8	841008	841015	0 %	25 %	25 %	50 %	15595969
19500	NC_002516	CGGC	2	8	841026	841033	0 %	0 %	50 %	50 %	15595969

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