MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas aeruginosa PAO1 chromosome

Total Repeats: 146384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12122	NC_002516	GGA	2	6	510367	510372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	554753030
12123	NC_002516	CTG	2	6	510470	510475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554753030
12124	NC_002516	TCG	2	6	510507	510512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554753030
12125	NC_002516	CGA	2	6	510544	510549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554753030
12126	NC_002516	CTG	2	6	510566	510571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554753030
12127	NC_002516	GC	4	8	510582	510589	0 %	0 %	50 %	50 %	554753030
12128	NC_002516	CTGGC	2	10	510595	510604	0 %	20 %	40 %	40 %	15595651
12129	NC_002516	GC	3	6	510612	510617	0 %	0 %	50 %	50 %	15595651
12130	NC_002516	CTT	2	6	510628	510633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15595651
12131	NC_002516	GGC	2	6	510672	510677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595651
12132	NC_002516	GTC	2	6	510715	510720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595651
12133	NC_002516	TCC	2	6	510761	510766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15595651
12134	NC_002516	CGG	2	6	510843	510848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595651
12135	NC_002516	AGG	2	6	510857	510862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15595651
12136	NC_002516	GC	3	6	510897	510902	0 %	0 %	50 %	50 %	15595651
12137	NC_002516	GATA	2	8	510911	510918	50 %	25 %	25 %	0 %	15595651
12138	NC_002516	GGAAGC	2	12	510945	510956	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15595651
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12140	NC_002516	GGT	2	6	511009	511014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595651
12141	NC_002516	GCGGT	2	10	511052	511061	0 %	20 %	60 %	20 %	15595651
12142	NC_002516	GTC	2	6	511069	511074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595651
12143	NC_002516	CTG	2	6	511093	511098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595651
12144	NC_002516	CGG	2	6	511160	511165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595651
12145	NC_002516	GCA	2	6	511179	511184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595651
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12148	NC_002516	CTG	2	6	511328	511333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595651
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12151	NC_002516	GCC	2	6	511417	511422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595651
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12156	NC_002516	GCA	2	6	511548	511553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595651
12157	NC_002516	CGG	2	6	511563	511568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595651
12158	NC_002516	CAG	2	6	511603	511608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595651
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12161	NC_002516	TCG	2	6	511694	511699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595651
12162	NC_002516	GTG	2	6	511745	511750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595651
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12165	NC_002516	GCA	2	6	511779	511784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595651
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12168	NC_002516	CTG	2	6	511924	511929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595651
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12200	NC_002516	CGGC	2	8	513380	513387	0 %	0 %	50 %	50 %	15595652
12201	NC_002516	CCA	2	6	513389	513394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15595652
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12208	NC_002516	CTG	2	6	513666	513671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595652
12209	NC_002516	GATC	2	8	513752	513759	25 %	25 %	25 %	25 %	15595652
12210	NC_002516	GAA	2	6	513762	513767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15595652
12211	NC_002516	GCT	2	6	513770	513775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595652
12212	NC_002516	CAG	2	6	513879	513884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595652
12213	NC_002516	GAT	2	6	513912	513917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15595652
12214	NC_002516	TCG	2	6	513964	513969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595652
12215	NC_002516	ACC	2	6	514045	514050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15595652
12216	NC_002516	GC	3	6	514055	514060	0 %	0 %	50 %	50 %	15595652
12217	NC_002516	CGC	3	9	514097	514105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595652
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12220	NC_002516	CGG	2	6	514147	514152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595652
12221	NC_002516	GGA	2	6	514310	514315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15595652
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12223	NC_002516	GAG	2	6	514405	514410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15595652
12224	NC_002516	CGT	2	6	515153	515158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595654
12225	NC_002516	CGC	2	6	515167	515172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595654
12226	NC_002516	TGT	2	6	515175	515180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15595654
12227	NC_002516	GCC	2	6	515210	515215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595654
12228	NC_002516	AGGCCA	2	12	515268	515279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595654
12229	NC_002516	GC	3	6	515292	515297	0 %	0 %	50 %	50 %	15595654
12230	NC_002516	TCG	2	6	515303	515308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595654
12231	NC_002516	AAG	2	6	515336	515341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15595654
12232	NC_002516	TGC	2	6	515373	515378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595654
12233	NC_002516	CCG	2	6	515382	515387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595654
12234	NC_002516	TGC	2	6	515427	515432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595654
12235	NC_002516	CGG	2	6	515455	515460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595654
12236	NC_002516	GGT	2	6	515476	515481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595654
12237	NC_002516	GCT	2	6	515509	515514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595654
12238	NC_002516	TGC	2	6	515562	515567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595654
12239	NC_002516	CGC	2	6	515573	515578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595654
12240	NC_002516	ACCT	2	8	515629	515636	25 %	25 %	0 %	50 %	15595654
12241	NC_002516	GC	3	6	515640	515645	0 %	0 %	50 %	50 %	15595654
12242	NC_002516	CGC	2	6	515647	515652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595654
12243	NC_002516	AGA	2	6	515658	515663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15595654
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12245	NC_002516	CG	4	8	515759	515766	0 %	0 %	50 %	50 %	308198344
12246	NC_002516	AGC	2	6	515777	515782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308198344
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12248	NC_002516	GCCA	2	8	515804	515811	25 %	0 %	25 %	50 %	308198344
12249	NC_002516	GTC	2	6	515836	515841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308198344
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12253	NC_002516	GCCA	2	8	515927	515934	25 %	0 %	25 %	50 %	308198344
12254	NC_002516	GGC	2	6	515949	515954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308198344
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12258	NC_002516	CGC	3	9	516215	516223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595655
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12289	NC_002516	GCTC	2	8	517453	517460	0 %	25 %	25 %	50 %	15595655
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12354	NC_002516	CGA	2	6	520305	520310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595656
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12357	NC_002516	ACG	2	6	520463	520468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595656
12358	NC_002516	GCGCC	2	10	520496	520505	0 %	0 %	40 %	60 %	15595656
12359	NC_002516	CGG	2	6	520511	520516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595656
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12361	NC_002516	CG	3	6	520555	520560	0 %	0 %	50 %	50 %	15595656
12362	NC_002516	CGG	2	6	520562	520567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595656
12363	NC_002516	CGG	2	6	520577	520582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595656
12364	NC_002516	GAA	2	6	520584	520589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15595656
12365	NC_002516	GCC	3	9	520594	520602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595656
12366	NC_002516	CAC	2	6	520745	520750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15595657
12367	NC_002516	CTG	2	6	520773	520778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595657
12368	NC_002516	GCC	2	6	520785	520790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595657
12369	NC_002516	GCC	2	6	520818	520823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595657
12370	NC_002516	CCA	2	6	520867	520872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15595657
12371	NC_002516	CGG	2	6	520940	520945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595657
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12374	NC_002516	CGG	2	6	521063	521068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595657
12375	NC_002516	GCG	3	9	521092	521100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595657
12376	NC_002516	GCT	2	6	521120	521125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595657
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12383	NC_002516	CGA	2	6	521776	521781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595658
12384	NC_002516	GCG	2	6	521886	521891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595658
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12394	NC_002516	CAT	2	6	522440	522445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15595658
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12399	NC_002516	CTTGC	2	10	522672	522681	0 %	40 %	20 %	40 %	554752999
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12434	NC_002516	TGC	2	6	524253	524258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595661
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12470	NC_002516	TCG	2	6	525273	525278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595661
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12474	NC_002516	CG	3	6	525357	525362	0 %	0 %	50 %	50 %	15595661
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12477	NC_002516	TGC	2	6	525587	525592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595662
12478	NC_002516	CAGC	2	8	525618	525625	25 %	0 %	25 %	50 %	15595662
12479	NC_002516	GCT	2	6	525639	525644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595662
12480	NC_002516	GGT	2	6	525645	525650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595662
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12482	NC_002516	AGC	2	6	525722	525727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595662
12483	NC_002516	GCG	2	6	525728	525733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595662
12484	NC_002516	GC	3	6	525811	525816	0 %	0 %	50 %	50 %	15595662
12485	NC_002516	ACA	2	6	525830	525835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15595662
12486	NC_002516	GAA	2	6	525877	525882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15595662
12487	NC_002516	GGA	2	6	525888	525893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15595662
12488	NC_002516	GCAC	2	8	526032	526039	25 %	0 %	25 %	50 %	15595662
12489	NC_002516	AGCG	2	8	526108	526115	25 %	0 %	50 %	25 %	15595662
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12491	NC_002516	AGCG	2	8	526204	526211	25 %	0 %	50 %	25 %	15595662
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12496	NC_002516	GC	4	8	526324	526331	0 %	0 %	50 %	50 %	15595662
12497	NC_002516	CG	3	6	526381	526386	0 %	0 %	50 %	50 %	15595662
12498	NC_002516	GCT	2	6	526398	526403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595662
12499	NC_002516	TCA	2	6	526406	526411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15595662
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