MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas aeruginosa PAO1 chromosome

Total Repeats: 146384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_002516	GCT	2	6	249516	249521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595417
6002	NC_002516	CGC	2	6	249618	249623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595417
6003	NC_002516	GCA	2	6	249638	249643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595417
6004	NC_002516	TCG	2	6	249652	249657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595417
6005	NC_002516	GGC	2	6	249660	249665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595417
6006	NC_002516	AGC	2	6	249722	249727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595417
6007	NC_002516	CGG	2	6	249733	249738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595417
6008	NC_002516	GC	3	6	249739	249744	0 %	0 %	50 %	50 %	15595417
6009	NC_002516	TCG	2	6	249767	249772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595417
6010	NC_002516	GATCCT	2	12	249792	249803	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15595417
6011	NC_002516	CTG	3	9	249829	249837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595417
6012	NC_002516	CGC	3	9	249840	249848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595417
6013	NC_002516	CTGGC	2	10	249850	249859	0 %	20 %	40 %	40 %	15595417
6014	NC_002516	CAT	2	6	249870	249875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15595417
6015	NC_002516	CCGT	2	8	249924	249931	0 %	25 %	25 %	50 %	15595417
6016	NC_002516	GAT	2	6	249978	249983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15595417
6017	NC_002516	GGT	2	6	249990	249995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595417
6018	NC_002516	CGGA	2	8	250023	250030	25 %	0 %	50 %	25 %	15595417
6019	NC_002516	GTG	2	6	250048	250053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595417
6020	NC_002516	TGG	2	6	250070	250075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595417
6021	NC_002516	GGT	2	6	250077	250082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595417
6022	NC_002516	GCTCA	2	10	250237	250246	20 %	20 %	20 %	40 %	15595418
6023	NC_002516	CGC	2	6	250284	250289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595418
6024	NC_002516	CAC	2	6	250291	250296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15595418
6025	NC_002516	ACG	2	6	250382	250387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595418
6026	NC_002516	GCC	2	6	250442	250447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595418
6027	NC_002516	CGC	4	12	250455	250466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595418
6028	NC_002516	GCC	2	6	250469	250474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595418
6029	NC_002516	AAC	2	6	250481	250486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15595418
6030	NC_002516	TAC	2	6	250492	250497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15595418
6031	NC_002516	TTC	2	6	250504	250509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15595418
6032	NC_002516	CAC	2	6	250512	250517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15595418
6033	NC_002516	CGG	2	6	250523	250528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595418
6034	NC_002516	TGG	2	6	250529	250534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595418
6035	NC_002516	CTG	2	6	250558	250563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595418
6036	NC_002516	GCG	2	6	250635	250640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595418
6037	NC_002516	AGA	3	9	250667	250675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15595418
6038	NC_002516	GCA	2	6	250718	250723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595418
6039	NC_002516	CGG	2	6	250731	250736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595418
6040	NC_002516	TGC	2	6	250766	250771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595418
6041	NC_002516	CGA	2	6	250788	250793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595418
6042	NC_002516	CGG	2	6	250812	250817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595418
6043	NC_002516	CGC	2	6	250843	250848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595418
6044	NC_002516	GCG	2	6	250849	250854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595418
6045	NC_002516	GGA	2	6	250863	250868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15595418
6046	NC_002516	CGC	2	6	250899	250904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595418
6047	NC_002516	TCG	2	6	250907	250912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595418
6048	NC_002516	CGG	2	6	250932	250937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595418
6049	NC_002516	CGC	2	6	250949	250954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595418
6050	NC_002516	ACG	2	6	250994	250999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595418
6051	NC_002516	TGC	2	6	251000	251005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595418
6052	NC_002516	CGA	2	6	251013	251018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595418
6053	NC_002516	CGG	2	6	251025	251030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595418
6054	NC_002516	GGC	2	6	251131	251136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595418
6055	NC_002516	TGG	2	6	251168	251173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595418
6056	NC_002516	GGC	3	9	251223	251231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595418
6057	NC_002516	CGA	2	6	251262	251267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595418
6058	NC_002516	GAG	2	6	251290	251295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15595418
6059	NC_002516	CTGC	2	8	251316	251323	0 %	25 %	25 %	50 %	15595418
6060	NC_002516	TCG	2	6	251375	251380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595418
6061	NC_002516	CTGGC	2	10	251440	251449	0 %	20 %	40 %	40 %	15595418
6062	NC_002516	GAG	2	6	251470	251475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15595418
6063	NC_002516	ATC	2	6	251482	251487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15595418
6064	NC_002516	TGG	2	6	251525	251530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595418
6065	NC_002516	CGA	2	6	251547	251552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595418
6066	NC_002516	CG	4	8	251589	251596	0 %	0 %	50 %	50 %	15595418
6067	NC_002516	CGC	2	6	251842	251847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595419
6068	NC_002516	GGC	2	6	251848	251853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595419
6069	NC_002516	CAGAGC	2	12	251861	251872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595419
6070	NC_002516	CGG	2	6	251890	251895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595419
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6072	NC_002516	GCG	3	9	251946	251954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595419
6073	NC_002516	GGT	2	6	251959	251964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595419
6074	NC_002516	CGA	2	6	252073	252078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595419
6075	NC_002516	CGA	2	6	252198	252203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595419
6076	NC_002516	GGA	2	6	252331	252336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15595419
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6080	NC_002516	GTG	2	6	252464	252469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595419
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6084	NC_002516	GCCA	2	8	252623	252630	25 %	0 %	25 %	50 %	15595419
6085	NC_002516	CGCAGA	2	12	252633	252644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595419
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6088	NC_002516	GC	3	6	252753	252758	0 %	0 %	50 %	50 %	15595419
6089	NC_002516	GAG	2	6	252794	252799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15595419
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6091	NC_002516	CAA	2	6	252928	252933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15595420
6092	NC_002516	GGCGC	2	10	252981	252990	0 %	0 %	60 %	40 %	15595420
6093	NC_002516	GGCC	2	8	253017	253024	0 %	0 %	50 %	50 %	15595420
6094	NC_002516	TGG	2	6	253029	253034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595420
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6098	NC_002516	CGGCG	2	10	253162	253171	0 %	0 %	60 %	40 %	15595420
6099	NC_002516	CCAGCG	2	12	253206	253217	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15595420
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6101	NC_002516	CG	3	6	253423	253428	0 %	0 %	50 %	50 %	15595420
6102	NC_002516	GC	3	6	253518	253523	0 %	0 %	50 %	50 %	15595420
6103	NC_002516	GGT	2	6	253540	253545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595420
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6105	NC_002516	TGC	2	6	253653	253658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595420
6106	NC_002516	CGC	2	6	253680	253685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595420
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6109	NC_002516	TGGA	2	8	253778	253785	25 %	25 %	50 %	0 %	15595420
6110	NC_002516	GGCA	2	8	253879	253886	25 %	0 %	50 %	25 %	15595421
6111	NC_002516	GTA	2	6	253896	253901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15595421
6112	NC_002516	GCG	2	6	253909	253914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595421
6113	NC_002516	CG	3	6	253952	253957	0 %	0 %	50 %	50 %	15595421
6114	NC_002516	CGG	2	6	253965	253970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595421
6115	NC_002516	CGG	2	6	253988	253993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595421
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6117	NC_002516	GC	3	6	254020	254025	0 %	0 %	50 %	50 %	15595421
6118	NC_002516	AGC	2	6	254029	254034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595421
6119	NC_002516	CCT	2	6	254051	254056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15595421
6120	NC_002516	CAG	2	6	254076	254081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595421
6121	NC_002516	GC	3	6	254104	254109	0 %	0 %	50 %	50 %	15595421
6122	NC_002516	GCG	2	6	254122	254127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595421
6123	NC_002516	GAT	2	6	254130	254135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15595421
6124	NC_002516	GTC	2	6	254190	254195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595421
6125	NC_002516	GCG	2	6	254254	254259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595421
6126	NC_002516	GGGT	2	8	254269	254276	0 %	25 %	75 %	0 %	15595421
6127	NC_002516	GAT	2	6	254280	254285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15595421
6128	NC_002516	CGGG	2	8	254298	254305	0 %	0 %	75 %	25 %	15595421
6129	NC_002516	GGA	2	6	254360	254365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15595421
6130	NC_002516	TCG	2	6	254377	254382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595421
6131	NC_002516	CAG	3	9	254385	254393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595421
6132	NC_002516	TCG	2	6	254410	254415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595421
6133	NC_002516	GCCCAG	2	12	254418	254429	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15595421
6134	NC_002516	GTA	2	6	254439	254444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15595421
6135	NC_002516	CG	3	6	254462	254467	0 %	0 %	50 %	50 %	15595421
6136	NC_002516	GGCC	2	8	254498	254505	0 %	0 %	50 %	50 %	15595421
6137	NC_002516	TAT	2	6	254555	254560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15595421
6138	NC_002516	GCT	2	6	254568	254573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595421
6139	NC_002516	A	7	7	254817	254823	100 %	0 %	0 %	0 %	15595422
6140	NC_002516	GCC	2	6	254917	254922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595422
6141	NC_002516	GGA	2	6	254958	254963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15595422
6142	NC_002516	TCGT	2	8	255005	255012	0 %	50 %	25 %	25 %	15595422
6143	NC_002516	GCG	2	6	255038	255043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595422
6144	NC_002516	ACG	2	6	255044	255049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595422
6145	NC_002516	CCTC	2	8	255062	255069	0 %	25 %	0 %	75 %	15595422
6146	NC_002516	GCA	2	6	255072	255077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595422
6147	NC_002516	CG	3	6	255088	255093	0 %	0 %	50 %	50 %	15595422
6148	NC_002516	C	6	6	255114	255119	0 %	0 %	0 %	100 %	15595422
6149	NC_002516	AGGTCG	2	12	255188	255199	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15595422
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6151	NC_002516	GCG	2	6	255230	255235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595422
6152	NC_002516	CCGCA	2	10	255262	255271	20 %	0 %	20 %	60 %	15595422
6153	NC_002516	TGG	2	6	255305	255310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595422
6154	NC_002516	CGA	2	6	255321	255326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595422
6155	NC_002516	CCGA	2	8	255474	255481	25 %	0 %	25 %	50 %	15595423
6156	NC_002516	TCAC	2	8	255557	255564	25 %	25 %	0 %	50 %	15595423
6157	NC_002516	GCC	2	6	255577	255582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595423
6158	NC_002516	CTG	2	6	255655	255660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595423
6159	NC_002516	GAA	2	6	255678	255683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15595423
6160	NC_002516	GGC	2	6	255700	255705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595423
6161	NC_002516	TGC	2	6	255845	255850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595423
6162	NC_002516	GC	3	6	255849	255854	0 %	0 %	50 %	50 %	15595423
6163	NC_002516	GGC	2	6	255930	255935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595423
6164	NC_002516	TGC	2	6	256001	256006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595423
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6166	NC_002516	GGC	2	6	256044	256049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595423
6167	NC_002516	GAG	2	6	256072	256077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15595423
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6172	NC_002516	CGA	2	6	256263	256268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595423
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6180	NC_002516	CGT	2	6	256463	256468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595424
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6183	NC_002516	CGGA	2	8	256601	256608	25 %	0 %	50 %	25 %	15595424
6184	NC_002516	ACC	2	6	256662	256667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15595424
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6230	NC_002516	GCCTG	2	10	258096	258105	0 %	20 %	40 %	40 %	15595425
6231	NC_002516	CGA	2	6	258127	258132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595425
6232	NC_002516	CGG	2	6	258154	258159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595425
6233	NC_002516	GCG	2	6	258237	258242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595425
6234	NC_002516	GAA	2	6	258493	258498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15595426
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6237	NC_002516	CCT	2	6	258530	258535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15595426
6238	NC_002516	TCTACG	2	12	258563	258574	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15595426
6239	NC_002516	CTT	2	6	258603	258608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15595426
6240	NC_002516	CCG	2	6	258644	258649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595426
6241	NC_002516	CGC	2	6	258657	258662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595426
6242	NC_002516	CGG	2	6	258684	258689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595426
6243	NC_002516	GGT	2	6	258747	258752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595426
6244	NC_002516	GAT	2	6	258753	258758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15595426
6245	NC_002516	GCT	2	6	258825	258830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595426
6246	NC_002516	GCG	2	6	258866	258871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595426
6247	NC_002516	CTT	2	6	258927	258932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15595426
6248	NC_002516	CGG	2	6	258960	258965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595426
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6250	NC_002516	GCA	2	6	258999	259004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595426
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6252	NC_002516	GCG	2	6	259092	259097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595426
6253	NC_002516	CTT	2	6	259182	259187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15595426
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6333	NC_002516	GC	3	6	262223	262228	0 %	0 %	50 %	50 %	15595429
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6345	NC_002516	GCGT	2	8	262804	262811	0 %	25 %	50 %	25 %	15595430
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6351	NC_002516	CTG	2	6	263181	263186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595430
6352	NC_002516	AGC	2	6	263235	263240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595430
6353	NC_002516	GGCGC	2	10	263264	263273	0 %	0 %	60 %	40 %	15595430
6354	NC_002516	GGC	2	6	263361	263366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15595430
6355	NC_002516	CGGTGG	2	12	263413	263424	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	15595430
6356	NC_002516	GCGCGA	2	12	263462	263473	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15595430
6357	NC_002516	GC	3	6	263478	263483	0 %	0 %	50 %	50 %	15595430
6358	NC_002516	GAA	2	6	263691	263696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15595431
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6361	NC_002516	TCG	2	6	263729	263734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595431
6362	NC_002516	AAC	2	6	263812	263817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15595431
6363	NC_002516	GCA	2	6	263876	263881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15595431
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6488	NC_002516	GC	3	6	269256	269261	0 %	0 %	50 %	50 %	15595435
6489	NC_002516	GTC	2	6	269286	269291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595435
6490	NC_002516	CTG	2	6	269373	269378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595435
6491	NC_002516	GCT	2	6	269381	269386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595435
6492	NC_002516	GC	3	6	269387	269392	0 %	0 %	50 %	50 %	15595435
6493	NC_002516	CG	4	8	269444	269451	0 %	0 %	50 %	50 %	15595435
6494	NC_002516	GCT	2	6	269501	269506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595435
6495	NC_002516	CGCC	2	8	269507	269514	0 %	0 %	25 %	75 %	15595435
6496	NC_002516	CTG	2	6	269723	269728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15595436
6497	NC_002516	GCCA	2	8	269753	269760	25 %	0 %	25 %	50 %	15595436
6498	NC_002516	TGG	2	6	269805	269810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15595436
6499	NC_002516	GCC	2	6	269889	269894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15595436
6500	NC_002516	TTC	2	6	269945	269950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15595436

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