MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 plasmid pGT5

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001773	ATG	2	6	170	175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74076684
2	NC_001773	GGGT	2	8	234	241	0 %	25 %	75 %	0 %	74076684
3	NC_001773	AT	3	6	281	286	50 %	50 %	0 %	0 %	74076684
4	NC_001773	AGA	2	6	309	314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74076684
5	NC_001773	GT	3	6	355	360	0 %	50 %	50 %	0 %	74076684
6	NC_001773	AGT	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74076684
7	NC_001773	TGA	2	6	543	548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74076684
8	NC_001773	GA	3	6	553	558	50 %	0 %	50 %	0 %	74076684
9	NC_001773	TC	4	8	567	574	0 %	50 %	0 %	50 %	74076684
10	NC_001773	TTG	2	6	656	661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74076684
11	NC_001773	CTT	3	9	718	726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74076684
12	NC_001773	GTG	2	6	743	748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74076684
13	NC_001773	TGA	2	6	765	770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74076684
14	NC_001773	ATC	2	6	827	832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74076684
15	NC_001773	AGG	2	6	860	865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74076684
16	NC_001773	CTT	2	6	904	909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74076684
17	NC_001773	G	7	7	937	943	0 %	0 %	100 %	0 %	74076684
18	NC_001773	TCA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74076684
19	NC_001773	TC	3	6	1024	1029	0 %	50 %	0 %	50 %	74076684
20	NC_001773	AAG	2	6	1030	1035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74076684
21	NC_001773	GAA	2	6	1311	1316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74076684
22	NC_001773	TC	3	6	1344	1349	0 %	50 %	0 %	50 %	74076684
23	NC_001773	ATT	2	6	1394	1399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74076684
24	NC_001773	TCT	2	6	1427	1432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74076684
25	NC_001773	TGA	2	6	1500	1505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74076684
26	NC_001773	TAA	2	6	1692	1697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	74076684
27	NC_001773	GGA	2	6	1815	1820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74076684
28	NC_001773	GTT	2	6	1821	1826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74076684
29	NC_001773	ATC	2	6	1973	1978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74076684
30	NC_001773	TC	3	6	1977	1982	0 %	50 %	0 %	50 %	74076684
31	NC_001773	ATT	2	6	2023	2028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74076684
32	NC_001773	TCC	3	9	2037	2045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74076684
33	NC_001773	AAG	2	6	2275	2280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74076685
34	NC_001773	GTG	2	6	2309	2314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74076685
35	NC_001773	TAT	2	6	2340	2345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74076685
36	NC_001773	CTC	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	74076685
37	NC_001773	ATT	2	6	2438	2443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74076685
38	NC_001773	TC	3	6	2450	2455	0 %	50 %	0 %	50 %	74076685
39	NC_001773	TGA	2	6	2472	2477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74076685
40	NC_001773	CTT	2	6	2530	2535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74076685
41	NC_001773	TCA	2	6	2577	2582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74076685
42	NC_001773	GT	3	6	2594	2599	0 %	50 %	50 %	0 %	74076685
43	NC_001773	GTT	2	6	2634	2639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74076685
44	NC_001773	TAT	2	6	2674	2679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74076685
45	NC_001773	ATTG	2	8	2716	2723	25 %	50 %	25 %	0 %	74076685
46	NC_001773	TGGTG	2	10	2757	2766	0 %	40 %	60 %	0 %	74076685
47	NC_001773	GTG	2	6	2792	2797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74076685
48	NC_001773	GTT	2	6	2818	2823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74076685
49	NC_001773	GAG	2	6	2832	2837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74076685
50	NC_001773	GTT	2	6	3003	3008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74076685
51	NC_001773	TGA	2	6	3009	3014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	74076685
52	NC_001773	TAT	2	6	3052	3057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74076685
53	NC_001773	ATT	2	6	3070	3075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	74076685
54	NC_001773	G	6	6	3088	3093	0 %	0 %	100 %	0 %	74076685
55	NC_001773	TCT	2	6	3140	3145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74076685
56	NC_001773	GAG	2	6	3291	3296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74076685
57	NC_001773	AAG	3	9	3310	3318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74076685
58	NC_001773	TC	3	6	3325	3330	0 %	50 %	0 %	50 %	74076685
59	NC_001773	GTTA	2	8	3331	3338	25 %	50 %	25 %	0 %	74076685
60	NC_001773	TAC	2	6	3400	3405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74076685

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.