MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 29262

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_000868	CTT	2	6	1480914	1480919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521723
24502	NC_000868	TTA	2	6	1480920	1480925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521723
24503	NC_000868	CTC	2	6	1480939	1480944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521723
24504	NC_000868	GCA	2	6	1480949	1480954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521723
24505	NC_000868	CGC	2	6	1480966	1480971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14521723
24506	NC_000868	TAT	2	6	1480972	1480977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521723
24507	NC_000868	TTAT	2	8	1480985	1480992	25 %	75 %	0 %	0 %	14521723
24508	NC_000868	CCT	2	6	1480993	1480998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521723
24509	NC_000868	CGT	2	6	1481085	1481090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521723
24510	NC_000868	AT	3	6	1481200	1481205	50 %	50 %	0 %	0 %	14521723
24511	NC_000868	ATCT	2	8	1481212	1481219	25 %	50 %	0 %	25 %	14521723
24512	NC_000868	ATC	2	6	1481402	1481407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521723
24513	NC_000868	AGAAA	2	10	1481575	1481584	80 %	0 %	20 %	0 %	14521723
24514	NC_000868	GAG	2	6	1481769	1481774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521724
24515	NC_000868	CCTTC	2	10	1481788	1481797	0 %	40 %	0 %	60 %	14521724
24516	NC_000868	TTA	2	6	1481812	1481817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521724
24517	NC_000868	AGT	2	6	1481848	1481853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521724
24518	NC_000868	CGT	2	6	1481950	1481955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521724
24519	NC_000868	CCTCAG	2	12	1482007	1482018	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	14521724
24520	NC_000868	CTG	2	6	1482065	1482070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521724
24521	NC_000868	TAT	2	6	1482083	1482088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521724
24522	NC_000868	CTT	2	6	1482092	1482097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521724
24523	NC_000868	TCT	2	6	1482153	1482158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521724
24524	NC_000868	CTC	2	6	1482161	1482166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521724
24525	NC_000868	ACC	2	6	1482283	1482288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14521724
24526	NC_000868	CGC	2	6	1482355	1482360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14521724
24527	NC_000868	GAG	2	6	1482431	1482436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521724
24528	NC_000868	TGG	2	6	1482465	1482470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14521724
24529	NC_000868	G	6	6	1482483	1482488	0 %	0 %	100 %	0 %	14521724
24530	NC_000868	ACG	2	6	1482498	1482503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521724
24531	NC_000868	TTA	2	6	1482529	1482534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521724
24532	NC_000868	ACT	2	6	1482561	1482566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521724
24533	NC_000868	TGG	2	6	1482590	1482595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14521724
24534	NC_000868	GCAA	2	8	1482704	1482711	50 %	0 %	25 %	25 %	14521725
24535	NC_000868	GTC	2	6	1482752	1482757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521725
24536	NC_000868	TCC	2	6	1482880	1482885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521725
24537	NC_000868	GA	3	6	1482976	1482981	50 %	0 %	50 %	0 %	14521725
24538	NC_000868	CTTT	2	8	1483015	1483022	0 %	75 %	0 %	25 %	14521725
24539	NC_000868	TCCT	2	8	1483023	1483030	0 %	50 %	0 %	50 %	14521725
24540	NC_000868	AAT	2	6	1483060	1483065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521725
24541	NC_000868	TCCA	2	8	1483159	1483166	25 %	25 %	0 %	50 %	14521725
24542	NC_000868	ATC	2	6	1483203	1483208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521725
24543	NC_000868	GATA	2	8	1483260	1483267	50 %	25 %	25 %	0 %	14521725
24544	NC_000868	CCCT	2	8	1483291	1483298	0 %	25 %	0 %	75 %	14521725
24545	NC_000868	CTC	2	6	1483338	1483343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521725
24546	NC_000868	AGG	2	6	1483350	1483355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521725
24547	NC_000868	ATT	3	9	1483494	1483502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521725
24548	NC_000868	TCCT	2	8	1483519	1483526	0 %	50 %	0 %	50 %	14521725
24549	NC_000868	CGT	2	6	1483585	1483590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521725
24550	NC_000868	CTC	2	6	1483712	1483717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521725
24551	NC_000868	TAT	2	6	1483811	1483816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521725
24552	NC_000868	GTC	2	6	1483830	1483835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521725
24553	NC_000868	TTC	2	6	1483928	1483933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521725
24554	NC_000868	CCA	2	6	1483979	1483984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14521725
24555	NC_000868	GGGA	2	8	1484166	1484173	25 %	0 %	75 %	0 %	14521726
24556	NC_000868	ACG	2	6	1484181	1484186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521726
24557	NC_000868	GTC	2	6	1484358	1484363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521726
24558	NC_000868	TCG	2	6	1484424	1484429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521726
24559	NC_000868	AG	3	6	1484465	1484470	50 %	0 %	50 %	0 %	14521726
24560	NC_000868	CTT	2	6	1484570	1484575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521726
24561	NC_000868	CTC	2	6	1484579	1484584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521726
24562	NC_000868	GGA	2	6	1484711	1484716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521727
24563	NC_000868	ATA	3	9	1484799	1484807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521727
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24565	NC_000868	AGGG	2	8	1485033	1485040	25 %	0 %	75 %	0 %	14521727
24566	NC_000868	GA	3	6	1485068	1485073	50 %	0 %	50 %	0 %	14521727
24567	NC_000868	AGG	2	6	1485103	1485108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521727
24568	NC_000868	AGG	2	6	1485150	1485155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521727
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24570	NC_000868	AGGA	2	8	1485198	1485205	50 %	0 %	50 %	0 %	14521727
24571	NC_000868	AG	3	6	1485212	1485217	50 %	0 %	50 %	0 %	14521727
24572	NC_000868	CTT	2	6	1485252	1485257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521727
24573	NC_000868	ATA	2	6	1485312	1485317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521727
24574	NC_000868	GAG	2	6	1485321	1485326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521727
24575	NC_000868	AG	3	6	1485325	1485330	50 %	0 %	50 %	0 %	14521727
24576	NC_000868	AAG	2	6	1485333	1485338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521727
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24578	NC_000868	GA	3	6	1485592	1485597	50 %	0 %	50 %	0 %	14521727
24579	NC_000868	CAA	2	6	1485614	1485619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14521727
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24590	NC_000868	AT	3	6	1486437	1486442	50 %	50 %	0 %	0 %	14521728
24591	NC_000868	GAA	2	6	1486481	1486486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521728
24592	NC_000868	AGG	3	9	1486514	1486522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521728
24593	NC_000868	AGCCCT	2	12	1486556	1486567	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	14521728
24594	NC_000868	GATA	2	8	1486686	1486693	50 %	25 %	25 %	0 %	14521729
24595	NC_000868	CGC	2	6	1486743	1486748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14521729
24596	NC_000868	CAT	2	6	1486813	1486818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521729
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24600	NC_000868	GA	4	8	1487051	1487058	50 %	0 %	50 %	0 %	14521729
24601	NC_000868	AGG	2	6	1487097	1487102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521729
24602	NC_000868	TCT	2	6	1487105	1487110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521729
24603	NC_000868	TTGGGG	2	12	1487132	1487143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14521729
24604	NC_000868	AAT	2	6	1487148	1487153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521729
24605	NC_000868	ACT	2	6	1487255	1487260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521729
24606	NC_000868	GAT	2	6	1487409	1487414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521729
24607	NC_000868	GGCTA	2	10	1487423	1487432	20 %	20 %	40 %	20 %	14521729
24608	NC_000868	GA	3	6	1487499	1487504	50 %	0 %	50 %	0 %	14521730
24609	NC_000868	AGG	2	6	1487555	1487560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521730
24610	NC_000868	ATA	2	6	1487575	1487580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521730
24611	NC_000868	TAA	2	6	1487606	1487611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521730
24612	NC_000868	ACTTG	2	10	1487682	1487691	20 %	40 %	20 %	20 %	14521730
24613	NC_000868	GAA	2	6	1487713	1487718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521730
24614	NC_000868	ATA	2	6	1487764	1487769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521730
24615	NC_000868	AGGA	2	8	1487811	1487818	50 %	0 %	50 %	0 %	14521730
24616	NC_000868	TTCC	2	8	1487916	1487923	0 %	50 %	0 %	50 %	14521730
24617	NC_000868	AG	3	6	1487959	1487964	50 %	0 %	50 %	0 %	14521730
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24974	NC_000868	TCA	2	6	1509491	1509496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521748
24975	NC_000868	TC	3	6	1509567	1509572	0 %	50 %	0 %	50 %	14521748
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24980	NC_000868	CT	3	6	1509842	1509847	0 %	50 %	0 %	50 %	14521749
24981	NC_000868	TTTC	2	8	1509864	1509871	0 %	75 %	0 %	25 %	14521749
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