MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 29262

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_000868	CTT	2	6	1275346	1275351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521517
21003	NC_000868	TCTCC	2	10	1275372	1275381	0 %	40 %	0 %	60 %	14521517
21004	NC_000868	TAT	2	6	1275403	1275408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521517
21005	NC_000868	CCT	2	6	1275417	1275422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521517
21006	NC_000868	TCAC	2	8	1275458	1275465	25 %	25 %	0 %	50 %	14521518
21007	NC_000868	TCC	2	6	1275578	1275583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521518
21008	NC_000868	AGTA	2	8	1275602	1275609	50 %	25 %	25 %	0 %	14521518
21009	NC_000868	CCT	2	6	1275619	1275624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521518
21010	NC_000868	CT	3	6	1275630	1275635	0 %	50 %	0 %	50 %	14521518
21011	NC_000868	AT	3	6	1275639	1275644	50 %	50 %	0 %	0 %	14521518
21012	NC_000868	CAA	2	6	1275766	1275771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14521518
21013	NC_000868	TAT	2	6	1275836	1275841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521518
21014	NC_000868	TTA	2	6	1275882	1275887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521518
21015	NC_000868	AGTCC	2	10	1275930	1275939	20 %	20 %	20 %	40 %	14521518
21016	NC_000868	TTA	2	6	1275955	1275960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521518
21017	NC_000868	ATCCA	2	10	1275962	1275971	40 %	20 %	0 %	40 %	14521518
21018	NC_000868	ATT	2	6	1275978	1275983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521518
21019	NC_000868	ACC	2	6	1276088	1276093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14521519
21020	NC_000868	CTT	2	6	1276120	1276125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521519
21021	NC_000868	GGT	2	6	1276166	1276171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14521519
21022	NC_000868	GT	3	6	1276170	1276175	0 %	50 %	50 %	0 %	14521519
21023	NC_000868	TAA	2	6	1276185	1276190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521519
21024	NC_000868	TCG	2	6	1276205	1276210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521519
21025	NC_000868	AGGA	2	8	1276362	1276369	50 %	0 %	50 %	0 %	14521519
21026	NC_000868	ACG	2	6	1276379	1276384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521519
21027	NC_000868	AAG	2	6	1276478	1276483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521519
21028	NC_000868	ATC	2	6	1276505	1276510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521519
21029	NC_000868	CTT	2	6	1276525	1276530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521519
21030	NC_000868	AGT	2	6	1276532	1276537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521519
21031	NC_000868	TCC	2	6	1276584	1276589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521519
21032	NC_000868	AGG	2	6	1276604	1276609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521519
21033	NC_000868	GAG	2	6	1276843	1276848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521520
21034	NC_000868	GCAA	2	8	1276877	1276884	50 %	0 %	25 %	25 %	14521520
21035	NC_000868	GAA	2	6	1276913	1276918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521520
21036	NC_000868	CTA	2	6	1277105	1277110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521520
21037	NC_000868	GA	3	6	1277330	1277335	50 %	0 %	50 %	0 %	14521520
21038	NC_000868	TCA	2	6	1277337	1277342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521520
21039	NC_000868	TCG	2	6	1277493	1277498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521520
21040	NC_000868	GCTC	2	8	1277565	1277572	0 %	25 %	25 %	50 %	14521520
21041	NC_000868	GGAG	2	8	1277580	1277587	25 %	0 %	75 %	0 %	14521520
21042	NC_000868	CGT	2	6	1277617	1277622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521520
21043	NC_000868	ATA	2	6	1277633	1277638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521520
21044	NC_000868	AAG	2	6	1277708	1277713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521520
21045	NC_000868	GAG	3	9	1277783	1277791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521520
21046	NC_000868	ACG	2	6	1277814	1277819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521520
21047	NC_000868	ACT	2	6	1277831	1277836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521520
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21049	NC_000868	TCA	2	6	1278125	1278130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521521
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21051	NC_000868	TC	3	6	1278218	1278223	0 %	50 %	0 %	50 %	14521521
21052	NC_000868	TAA	2	6	1278263	1278268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521521
21053	NC_000868	TAG	2	6	1278335	1278340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521521
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21055	NC_000868	GAC	2	6	1278676	1278681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521522
21056	NC_000868	TCA	2	6	1278704	1278709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521522
21057	NC_000868	CTT	2	6	1278714	1278719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521522
21058	NC_000868	CT	3	6	1278818	1278823	0 %	50 %	0 %	50 %	14521522
21059	NC_000868	TCC	2	6	1278922	1278927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521522
21060	NC_000868	GCG	2	6	1278935	1278940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14521522
21061	NC_000868	TGAG	3	12	1279035	1279046	25 %	25 %	50 %	0 %	14521522
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21063	NC_000868	ACT	2	6	1279073	1279078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521522
21064	NC_000868	CTT	2	6	1279099	1279104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521522
21065	NC_000868	TCC	2	6	1279330	1279335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521522
21066	NC_000868	TCT	2	6	1279440	1279445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521522
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21072	NC_000868	CT	3	6	1279788	1279793	0 %	50 %	0 %	50 %	14521523
21073	NC_000868	CTAG	2	8	1279846	1279853	25 %	25 %	25 %	25 %	14521523
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21080	NC_000868	CTT	2	6	1280160	1280165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521523
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21084	NC_000868	TTCT	2	8	1280330	1280337	0 %	75 %	0 %	25 %	14521523
21085	NC_000868	GTTC	2	8	1280340	1280347	0 %	50 %	25 %	25 %	14521523
21086	NC_000868	GAG	2	6	1280740	1280745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521524
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21089	NC_000868	ATGC	2	8	1280932	1280939	25 %	25 %	25 %	25 %	14521524
21090	NC_000868	CTA	2	6	1280968	1280973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521524
21091	NC_000868	ATA	2	6	1280986	1280991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521524
21092	NC_000868	CGA	2	6	1281003	1281008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521524
21093	NC_000868	CCAG	2	8	1281036	1281043	25 %	0 %	25 %	50 %	14521524
21094	NC_000868	AGGA	2	8	1281047	1281054	50 %	0 %	50 %	0 %	14521524
21095	NC_000868	GAT	2	6	1281072	1281077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521524
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21099	NC_000868	CACCT	2	10	1281233	1281242	20 %	20 %	0 %	60 %	14521524
21100	NC_000868	GCT	2	6	1281262	1281267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521524
21101	NC_000868	CGT	2	6	1281330	1281335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521524
21102	NC_000868	TTC	2	6	1281412	1281417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521524
21103	NC_000868	CCG	2	6	1281523	1281528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14521524
21104	NC_000868	ACG	2	6	1281536	1281541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521524
21105	NC_000868	AGA	2	6	1281542	1281547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521524
21106	NC_000868	TTG	2	6	1281557	1281562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14521524
21107	NC_000868	GAG	2	6	1281617	1281622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521524
21108	NC_000868	AAAG	2	8	1281687	1281694	75 %	0 %	25 %	0 %	14521524
21109	NC_000868	CAT	2	6	1281712	1281717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521524
21110	NC_000868	TCGATG	2	12	1281725	1281736	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	14521524
21111	NC_000868	TCC	2	6	1281807	1281812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521525
21112	NC_000868	AGT	2	6	1281832	1281837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521525
21113	NC_000868	TGGT	2	8	1281897	1281904	0 %	50 %	50 %	0 %	14521525
21114	NC_000868	TTA	2	6	1282032	1282037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14521525
21115	NC_000868	CCT	3	9	1282039	1282047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521525
21116	NC_000868	CTT	2	6	1282094	1282099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521525
21117	NC_000868	AGA	2	6	1282119	1282124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521525
21118	NC_000868	CCT	2	6	1282213	1282218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521525
21119	NC_000868	TC	3	6	1282472	1282477	0 %	50 %	0 %	50 %	14521526
21120	NC_000868	CGA	2	6	1282543	1282548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14521526
21121	NC_000868	CGT	2	6	1282630	1282635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521526
21122	NC_000868	TTC	2	6	1282669	1282674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521526
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21124	NC_000868	CTT	2	6	1282730	1282735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521526
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21126	NC_000868	TGGGT	2	10	1282761	1282770	0 %	40 %	60 %	0 %	14521526
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21130	NC_000868	TATCAC	2	12	1282856	1282867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521526
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21133	NC_000868	GCAA	2	8	1283315	1283322	50 %	0 %	25 %	25 %	14521527
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21148	NC_000868	TA	3	6	1284345	1284350	50 %	50 %	0 %	0 %	14521528
21149	NC_000868	AGA	2	6	1284398	1284403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521528
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21220	NC_000868	AGGA	2	8	1288514	1288521	50 %	0 %	50 %	0 %	14521532
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21224	NC_000868	CAGAAG	2	12	1288722	1288733	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	14521532
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21227	NC_000868	CTCC	2	8	1288808	1288815	0 %	25 %	0 %	75 %	14521533
21228	NC_000868	TCT	2	6	1288816	1288821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521533
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21230	NC_000868	CTTC	2	8	1289071	1289078	0 %	50 %	0 %	50 %	14521533
21231	NC_000868	TTC	2	6	1289096	1289101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521533
21232	NC_000868	TTC	2	6	1289214	1289219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14521533
21233	NC_000868	CTTC	2	8	1289332	1289339	0 %	50 %	0 %	50 %	14521533
21234	NC_000868	AAGCCT	2	12	1289345	1289356	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	14521533
21235	NC_000868	GA	3	6	1289426	1289431	50 %	0 %	50 %	0 %	14521534
21236	NC_000868	TCC	2	6	1289528	1289533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521534
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21477	NC_000868	AAT	2	6	1303420	1303425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14521546
21478	NC_000868	ATC	2	6	1303461	1303466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521546
21479	NC_000868	CAA	2	6	1303510	1303515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14521546
21480	NC_000868	CTC	2	6	1303517	1303522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521546
21481	NC_000868	ATC	2	6	1303610	1303615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14521546
21482	NC_000868	GAG	2	6	1303696	1303701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521546
21483	NC_000868	G	6	6	1303722	1303727	0 %	0 %	100 %	0 %	14521546
21484	NC_000868	GGA	2	6	1303738	1303743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14521546
21485	NC_000868	AAG	2	6	1303757	1303762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521546
21486	NC_000868	AGA	2	6	1303789	1303794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521546
21487	NC_000868	C	6	6	1303826	1303831	0 %	0 %	0 %	100 %	14521546
21488	NC_000868	GCT	2	6	1303991	1303996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14521546
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21491	NC_000868	GA	4	8	1304069	1304076	50 %	0 %	50 %	0 %	14521546
21492	NC_000868	TAG	2	6	1304112	1304117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14521546
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21496	NC_000868	AAG	2	6	1304201	1304206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521546
21497	NC_000868	GAA	2	6	1304270	1304275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14521546
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21500	NC_000868	TCC	2	6	1304368	1304373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14521546

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