MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 29262

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_000868	GGC	2	6	689864	689869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520943
11502	NC_000868	ATC	2	6	689961	689966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520943
11503	NC_000868	CT	3	6	690247	690252	0 %	50 %	0 %	50 %	14520944
11504	NC_000868	ATAG	2	8	690265	690272	50 %	25 %	25 %	0 %	14520944
11505	NC_000868	TC	3	6	690326	690331	0 %	50 %	0 %	50 %	14520944
11506	NC_000868	TAT	2	6	690361	690366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520944
11507	NC_000868	CTT	2	6	690385	690390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520944
11508	NC_000868	AGAGAA	2	12	690405	690416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520944
11509	NC_000868	TGGCTA	2	12	690470	690481	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	14520944
11510	NC_000868	GGAG	2	8	690586	690593	25 %	0 %	75 %	0 %	14520944
11511	NC_000868	GAA	2	6	690595	690600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520944
11512	NC_000868	TGA	2	6	690672	690677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520944
11513	NC_000868	GA	3	6	690684	690689	50 %	0 %	50 %	0 %	14520944
11514	NC_000868	ACCC	2	8	690742	690749	25 %	0 %	0 %	75 %	14520944
11515	NC_000868	AAC	2	6	690750	690755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520944
11516	NC_000868	AAAAG	2	10	690801	690810	80 %	0 %	20 %	0 %	14520944
11517	NC_000868	GCG	2	6	690839	690844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520944
11518	NC_000868	AT	3	6	690885	690890	50 %	50 %	0 %	0 %	14520944
11519	NC_000868	AG	3	6	690935	690940	50 %	0 %	50 %	0 %	14520944
11520	NC_000868	TCAAAA	2	12	690981	690992	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	14520944
11521	NC_000868	ATG	2	6	691086	691091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520944
11522	NC_000868	AAC	2	6	691161	691166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520945
11523	NC_000868	TAA	2	6	691226	691231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520945
11524	NC_000868	AGA	2	6	691329	691334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520945
11525	NC_000868	AGG	2	6	691362	691367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520945
11526	NC_000868	GAA	2	6	691453	691458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520946
11527	NC_000868	TGAAA	2	10	691551	691560	60 %	20 %	20 %	0 %	14520946
11528	NC_000868	GGTCAT	2	12	691598	691609	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	14520946
11529	NC_000868	GAA	2	6	691741	691746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520946
11530	NC_000868	TAA	2	6	691748	691753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520946
11531	NC_000868	TAC	2	6	691756	691761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520946
11532	NC_000868	ATG	2	6	691802	691807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520947
11533	NC_000868	AGG	2	6	691833	691838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520947
11534	NC_000868	ACA	2	6	691881	691886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520947
11535	NC_000868	AG	4	8	691899	691906	50 %	0 %	50 %	0 %	14520947
11536	NC_000868	TCC	2	6	691914	691919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520947
11537	NC_000868	AAG	2	6	692032	692037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520947
11538	NC_000868	CAT	2	6	692059	692064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520947
11539	NC_000868	ATA	2	6	692078	692083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520947
11540	NC_000868	AG	3	6	692252	692257	50 %	0 %	50 %	0 %	14520947
11541	NC_000868	GA	3	6	692318	692323	50 %	0 %	50 %	0 %	14520947
11542	NC_000868	AGG	2	6	692346	692351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520947
11543	NC_000868	AAG	2	6	692408	692413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520947
11544	NC_000868	TTGC	2	8	692427	692434	0 %	50 %	25 %	25 %	14520947
11545	NC_000868	GAG	2	6	692465	692470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520947
11546	NC_000868	AAC	2	6	692492	692497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520947
11547	NC_000868	GTT	2	6	692498	692503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520947
11548	NC_000868	ATA	2	6	692549	692554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520947
11549	NC_000868	ACCT	2	8	692559	692566	25 %	25 %	0 %	50 %	14520947
11550	NC_000868	ACG	2	6	692610	692615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520947
11551	NC_000868	TAT	2	6	692630	692635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520947
11552	NC_000868	AGAA	2	8	692674	692681	75 %	0 %	25 %	0 %	14520947
11553	NC_000868	AG	3	6	692730	692735	50 %	0 %	50 %	0 %	14520947
11554	NC_000868	TAA	2	6	692736	692741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520947
11555	NC_000868	TGA	2	6	692795	692800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520947
11556	NC_000868	T	6	6	692841	692846	0 %	100 %	0 %	0 %	14520948
11557	NC_000868	TTC	2	6	692874	692879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520948
11558	NC_000868	CTT	2	6	692918	692923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520948
11559	NC_000868	TTCC	2	8	692931	692938	0 %	50 %	0 %	50 %	14520948
11560	NC_000868	AAT	2	6	692948	692953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520948
11561	NC_000868	AGT	2	6	692958	692963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520948
11562	NC_000868	TGG	2	6	692964	692969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520948
11563	NC_000868	GAA	2	6	692976	692981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520948
11564	NC_000868	CCAA	2	8	693112	693119	50 %	0 %	0 %	50 %	14520948
11565	NC_000868	GCCA	2	8	693327	693334	25 %	0 %	25 %	50 %	14520948
11566	NC_000868	CTT	2	6	693512	693517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520948
11567	NC_000868	CTTCT	2	10	693524	693533	0 %	60 %	0 %	40 %	14520948
11568	NC_000868	CTT	3	9	693546	693554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520948
11569	NC_000868	GATA	2	8	693713	693720	50 %	25 %	25 %	0 %	14520948
11570	NC_000868	TCT	2	6	693743	693748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520948
11571	NC_000868	ATA	2	6	693811	693816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520948
11572	NC_000868	TTG	2	6	693914	693919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520949
11573	NC_000868	CCTT	2	8	693924	693931	0 %	50 %	0 %	50 %	14520949
11574	NC_000868	CTA	2	6	694063	694068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520949
11575	NC_000868	GTG	2	6	694085	694090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520949
11576	NC_000868	ATA	2	6	694108	694113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520949
11577	NC_000868	AT	3	6	694118	694123	50 %	50 %	0 %	0 %	14520949
11578	NC_000868	AGG	2	6	694128	694133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520949
11579	NC_000868	CTC	2	6	694151	694156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520949
11580	NC_000868	ACT	2	6	694230	694235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520949
11581	NC_000868	CAA	2	6	694241	694246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520949
11582	NC_000868	CT	3	6	694290	694295	0 %	50 %	0 %	50 %	14520949
11583	NC_000868	TCA	2	6	694297	694302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520949
11584	NC_000868	TTTAAG	2	12	694325	694336	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	14520950
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11587	NC_000868	TGGA	2	8	694437	694444	25 %	25 %	50 %	0 %	14520950
11588	NC_000868	TGG	2	6	694476	694481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520950
11589	NC_000868	TCT	3	9	694502	694510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520950
11590	NC_000868	TCTGGA	2	12	694528	694539	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	14520950
11591	NC_000868	CGG	2	6	694601	694606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520950
11592	NC_000868	GAC	2	6	694665	694670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520950
11593	NC_000868	CTGAA	2	10	694749	694758	40 %	20 %	20 %	20 %	14520950
11594	NC_000868	GCAA	2	8	694810	694817	50 %	0 %	25 %	25 %	14520950
11595	NC_000868	ACC	2	6	694845	694850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520950
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11597	NC_000868	ATT	2	6	695026	695031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520950
11598	NC_000868	TCT	2	6	695040	695045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520950
11599	NC_000868	CT	3	6	695195	695200	0 %	50 %	0 %	50 %	14520950
11600	NC_000868	CTT	2	6	695274	695279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520950
11601	NC_000868	TCC	2	6	695431	695436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520951
11602	NC_000868	TTA	2	6	695445	695450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520951
11603	NC_000868	CAA	2	6	695628	695633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520951
11604	NC_000868	TTG	2	6	695687	695692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520951
11605	NC_000868	TCA	2	6	695744	695749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520951
11606	NC_000868	ATT	2	6	695767	695772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520951
11607	NC_000868	AAC	2	6	695791	695796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520951
11608	NC_000868	TCC	2	6	695809	695814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520951
11609	NC_000868	GTT	2	6	695833	695838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520951
11610	NC_000868	AT	3	6	695877	695882	50 %	50 %	0 %	0 %	14520951
11611	NC_000868	TA	3	6	695964	695969	50 %	50 %	0 %	0 %	14520951
11612	NC_000868	GTA	2	6	696085	696090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520951
11613	NC_000868	TTC	2	6	696111	696116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520951
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11616	NC_000868	CTC	2	6	696314	696319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520952
11617	NC_000868	TCT	3	9	696322	696330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520952
11618	NC_000868	CTT	2	6	696332	696337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520952
11619	NC_000868	TCCA	2	8	696406	696413	25 %	25 %	0 %	50 %	14520952
11620	NC_000868	GAG	2	6	696422	696427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520952
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11990	NC_000868	TCT	2	6	716351	716356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520970
11991	NC_000868	TTA	2	6	716405	716410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520970
11992	NC_000868	TGG	2	6	716422	716427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520970
11993	NC_000868	G	6	6	716449	716454	0 %	0 %	100 %	0 %	14520970
11994	NC_000868	CTC	2	6	716515	716520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520970
11995	NC_000868	TCC	2	6	716558	716563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520970
11996	NC_000868	CTTG	2	8	716627	716634	0 %	50 %	25 %	25 %	14520970
11997	NC_000868	GAG	2	6	716671	716676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520970
11998	NC_000868	ATC	2	6	716753	716758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520970
11999	NC_000868	TCCAC	2	10	716790	716799	20 %	20 %	0 %	60 %	14520970
12000	NC_000868	CCA	2	6	716809	716814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520970

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