MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 29262

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_000868	AAT	2	6	601831	601836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33356704
10002	NC_000868	GAT	2	6	601973	601978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520853
10003	NC_000868	AAG	2	6	602001	602006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520853
10004	NC_000868	AGC	2	6	602014	602019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520853
10005	NC_000868	AGG	2	6	602047	602052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520853
10006	NC_000868	TAA	2	6	602056	602061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520853
10007	NC_000868	GA	3	6	602122	602127	50 %	0 %	50 %	0 %	14520853
10008	NC_000868	G	7	7	602259	602265	0 %	0 %	100 %	0 %	14520853
10009	NC_000868	CTT	2	6	602370	602375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520854
10010	NC_000868	TCA	2	6	602509	602514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520854
10011	NC_000868	TC	4	8	602548	602555	0 %	50 %	0 %	50 %	14520854
10012	NC_000868	GGA	3	9	602630	602638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520854
10013	NC_000868	ATT	2	6	602656	602661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520854
10014	NC_000868	TAG	2	6	602690	602695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520854
10015	NC_000868	TGT	2	6	602812	602817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520854
10016	NC_000868	TAT	2	6	602838	602843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520854
10017	NC_000868	TCTCT	2	10	602888	602897	0 %	60 %	0 %	40 %	14520854
10018	NC_000868	CTAT	2	8	603004	603011	25 %	50 %	0 %	25 %	14520854
10019	NC_000868	GAT	2	6	603021	603026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520854
10020	NC_000868	ACT	2	6	603046	603051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520854
10021	NC_000868	CCT	2	6	603092	603097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520854
10022	NC_000868	TTC	2	6	603112	603117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520854
10023	NC_000868	CTTT	2	8	603158	603165	0 %	75 %	0 %	25 %	14520854
10024	NC_000868	GTA	2	6	603182	603187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520854
10025	NC_000868	CTG	2	6	603257	603262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520854
10026	NC_000868	T	6	6	603468	603473	0 %	100 %	0 %	0 %	14520854
10027	NC_000868	CTT	2	6	603483	603488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520854
10028	NC_000868	ATG	2	6	603490	603495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520854
10029	NC_000868	CTT	2	6	603507	603512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520854
10030	NC_000868	TCC	2	6	603562	603567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520854
10031	NC_000868	TCC	2	6	603602	603607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520854
10032	NC_000868	AC	3	6	603638	603643	50 %	0 %	0 %	50 %	14520854
10033	NC_000868	TCT	2	6	603647	603652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520854
10034	NC_000868	CCTT	2	8	603656	603663	0 %	50 %	0 %	50 %	14520855
10035	NC_000868	TCG	2	6	603670	603675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520855
10036	NC_000868	TCT	2	6	603703	603708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520855
10037	NC_000868	TA	3	6	603730	603735	50 %	50 %	0 %	0 %	14520855
10038	NC_000868	TTA	2	6	603763	603768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520855
10039	NC_000868	T	6	6	603851	603856	0 %	100 %	0 %	0 %	14520855
10040	NC_000868	TCG	2	6	603891	603896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520855
10041	NC_000868	ATA	2	6	603907	603912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520855
10042	NC_000868	AGA	2	6	603966	603971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520855
10043	NC_000868	TTC	2	6	604092	604097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520855
10044	NC_000868	TAT	2	6	604133	604138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520855
10045	NC_000868	CTT	2	6	604167	604172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520855
10046	NC_000868	CTT	2	6	604205	604210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520855
10047	NC_000868	CCT	2	6	604333	604338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520855
10048	NC_000868	TCTTT	2	10	604376	604385	0 %	80 %	0 %	20 %	14520855
10049	NC_000868	ATT	2	6	604392	604397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520855
10050	NC_000868	AGA	2	6	604403	604408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520855
10051	NC_000868	TCT	2	6	604417	604422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520855
10052	NC_000868	CT	3	6	604454	604459	0 %	50 %	0 %	50 %	14520855
10053	NC_000868	CTA	2	6	604503	604508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520855
10054	NC_000868	TCCTT	2	10	604554	604563	0 %	60 %	0 %	40 %	14520855
10055	NC_000868	TTC	2	6	604637	604642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520855
10056	NC_000868	CT	3	6	604652	604657	0 %	50 %	0 %	50 %	14520855
10057	NC_000868	TTA	2	6	604678	604683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520855
10058	NC_000868	GT	3	6	604693	604698	0 %	50 %	50 %	0 %	14520855
10059	NC_000868	TTA	2	6	604807	604812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520855
10060	NC_000868	GT	3	6	604885	604890	0 %	50 %	50 %	0 %	14520855
10061	NC_000868	GAG	2	6	604919	604924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520855
10062	NC_000868	ACT	2	6	605114	605119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520856
10063	NC_000868	AGT	2	6	605133	605138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520856
10064	NC_000868	GTC	2	6	605272	605277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520856
10065	NC_000868	ATT	2	6	605290	605295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520856
10066	NC_000868	TAA	2	6	605417	605422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520856
10067	NC_000868	CAC	2	6	605423	605428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520856
10068	NC_000868	TAG	2	6	605459	605464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520856
10069	NC_000868	GTG	2	6	605501	605506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520856
10070	NC_000868	GAA	2	6	605522	605527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520856
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10072	NC_000868	CTAT	2	8	605542	605549	25 %	50 %	0 %	25 %	14520856
10073	NC_000868	GA	3	6	605713	605718	50 %	0 %	50 %	0 %	14520857
10074	NC_000868	AAG	2	6	605770	605775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520857
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10080	NC_000868	CCA	2	6	606276	606281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14520859
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10089	NC_000868	CTT	2	6	606789	606794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520859
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10091	NC_000868	CTT	3	9	606818	606826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520859
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10105	NC_000868	GAAC	2	8	607279	607286	50 %	0 %	25 %	25 %	14520859
10106	NC_000868	GAC	2	6	607295	607300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520859
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10112	NC_000868	TAT	2	6	607643	607648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520860
10113	NC_000868	CTTC	2	8	607672	607679	0 %	50 %	0 %	50 %	14520860
10114	NC_000868	CGG	2	6	607738	607743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14520860
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10116	NC_000868	AGCT	2	8	607840	607847	25 %	25 %	25 %	25 %	14520860
10117	NC_000868	TTG	2	6	607908	607913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520860
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10119	NC_000868	CCATA	2	10	608125	608134	40 %	20 %	0 %	40 %	14520860
10120	NC_000868	GTTCA	2	10	608159	608168	20 %	40 %	20 %	20 %	14520860
10121	NC_000868	TCC	2	6	608225	608230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520860
10122	NC_000868	TTC	2	6	608276	608281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520860
10123	NC_000868	CCCA	2	8	608293	608300	25 %	0 %	0 %	75 %	14520860
10124	NC_000868	TTA	2	6	608323	608328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520860
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10126	NC_000868	TGG	2	6	608581	608586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520861
10127	NC_000868	TGA	2	6	608714	608719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520861
10128	NC_000868	TTCA	2	8	608753	608760	25 %	50 %	0 %	25 %	14520861
10129	NC_000868	AATGG	2	10	608822	608831	40 %	20 %	40 %	0 %	14520861
10130	NC_000868	AGG	2	6	608868	608873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520861
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10132	NC_000868	GAG	2	6	608982	608987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520861
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10143	NC_000868	CAT	2	6	609725	609730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520861
10144	NC_000868	AGGGG	2	10	609741	609750	20 %	0 %	80 %	0 %	14520861
10145	NC_000868	GGA	2	6	609771	609776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520861
10146	NC_000868	TGA	2	6	609812	609817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520861
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10151	NC_000868	CTGG	2	8	610019	610026	0 %	25 %	50 %	25 %	14520862
10152	NC_000868	TTC	2	6	610046	610051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520862
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10154	NC_000868	CCT	2	6	610114	610119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520862
10155	NC_000868	CAT	2	6	610134	610139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520862
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10166	NC_000868	GTT	2	6	610818	610823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520863
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10236	NC_000868	CAATC	2	10	614864	614873	40 %	20 %	0 %	40 %	14520866
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10238	NC_000868	CCTT	2	8	614896	614903	0 %	50 %	0 %	50 %	14520866
10239	NC_000868	TG	3	6	614905	614910	0 %	50 %	50 %	0 %	14520866
10240	NC_000868	CCG	2	6	614920	614925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14520866
10241	NC_000868	TGC	2	6	614945	614950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520866
10242	NC_000868	CTC	2	6	615025	615030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520866
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10368	NC_000868	CAA	2	6	622670	622675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520873
10369	NC_000868	CTT	2	6	622737	622742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520873
10370	NC_000868	TTCCC	2	10	622828	622837	0 %	40 %	0 %	60 %	14520873
10371	NC_000868	TCAACC	2	12	622888	622899	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	14520873
10372	NC_000868	CCT	2	6	622910	622915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520874
10373	NC_000868	CCCT	2	8	622998	623005	0 %	25 %	0 %	75 %	14520874
10374	NC_000868	AGG	2	6	623007	623012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520874
10375	NC_000868	TCC	2	6	623080	623085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520874
10376	NC_000868	TGA	2	6	623090	623095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520874
10377	NC_000868	GTA	2	6	623197	623202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520874
10378	NC_000868	GTA	2	6	623213	623218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520874
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10380	NC_000868	AGT	2	6	623253	623258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520874
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10382	NC_000868	ATA	2	6	623433	623438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520875
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10386	NC_000868	ACT	2	6	623665	623670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520875
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10399	NC_000868	TAT	2	6	624449	624454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520876
10400	NC_000868	CTC	2	6	624524	624529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520876
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10474	NC_000868	GGCCA	2	10	628974	628983	20 %	0 %	40 %	40 %	14520882
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10481	NC_000868	AGGGT	2	10	629367	629376	20 %	20 %	60 %	0 %	14520883
10482	NC_000868	AG	3	6	629441	629446	50 %	0 %	50 %	0 %	14520883
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10488	NC_000868	TCC	2	6	629766	629771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520885
10489	NC_000868	CTC	2	6	629842	629847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520885
10490	NC_000868	TTA	2	6	629962	629967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520885
10491	NC_000868	TGG	2	6	630097	630102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520885
10492	NC_000868	TCT	2	6	630208	630213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520885
10493	NC_000868	CCT	2	6	630301	630306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520885
10494	NC_000868	CCT	2	6	630334	630339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520885
10495	NC_000868	CTT	2	6	630472	630477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520885
10496	NC_000868	GTT	2	6	630488	630493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520885
10497	NC_000868	GAGG	2	8	631067	631074	25 %	0 %	75 %	0 %	14520886
10498	NC_000868	T	6	6	631109	631114	0 %	100 %	0 %	0 %	14520886
10499	NC_000868	TA	3	6	631132	631137	50 %	50 %	0 %	0 %	14520886
10500	NC_000868	TCC	2	6	631179	631184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520886

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