MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus abyssi GE5 chromosome

Total Repeats: 29262

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_000868	CTT	2	6	306360	306365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520514
5002	NC_000868	CTC	2	6	306378	306383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520514
5003	NC_000868	TAC	2	6	306444	306449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520514
5004	NC_000868	TCG	2	6	306481	306486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520514
5005	NC_000868	CATC	2	8	306570	306577	25 %	25 %	0 %	50 %	14520514
5006	NC_000868	GCT	2	6	306652	306657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520514
5007	NC_000868	GAG	2	6	306660	306665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520514
5008	NC_000868	ATA	2	6	306717	306722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520514
5009	NC_000868	TAT	2	6	306756	306761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520514
5010	NC_000868	TC	3	6	306791	306796	0 %	50 %	0 %	50 %	14520514
5011	NC_000868	TTA	2	6	306917	306922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520514
5012	NC_000868	TTC	2	6	306954	306959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520514
5013	NC_000868	CTC	2	6	307296	307301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520515
5014	NC_000868	TTC	2	6	307307	307312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520515
5015	NC_000868	CAT	2	6	307313	307318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520515
5016	NC_000868	ACG	2	6	307321	307326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520515
5017	NC_000868	ATT	2	6	307369	307374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520515
5018	NC_000868	TTC	2	6	307382	307387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520515
5019	NC_000868	AG	3	6	307527	307532	50 %	0 %	50 %	0 %	14520515
5020	NC_000868	TTA	2	6	307619	307624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520515
5021	NC_000868	CTA	2	6	307735	307740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520515
5022	NC_000868	TCT	2	6	307742	307747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520515
5023	NC_000868	GTT	2	6	307819	307824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520515
5024	NC_000868	CCTTC	2	10	307902	307911	0 %	40 %	0 %	60 %	14520515
5025	NC_000868	ACTA	2	8	308058	308065	50 %	25 %	0 %	25 %	14520515
5026	NC_000868	TGAA	2	8	308101	308108	50 %	25 %	25 %	0 %	14520515
5027	NC_000868	TCA	2	6	308201	308206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520515
5028	NC_000868	TCTTTT	2	12	308293	308304	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	14520515
5029	NC_000868	CTC	2	6	308340	308345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520515
5030	NC_000868	AAC	2	6	308346	308351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520515
5031	NC_000868	AAT	2	6	308424	308429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520515
5032	NC_000868	AAT	2	6	308496	308501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520515
5033	NC_000868	TAC	2	6	308519	308524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520515
5034	NC_000868	CGT	2	6	308555	308560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520515
5035	NC_000868	ACG	2	6	308563	308568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520515
5036	NC_000868	TAT	2	6	308580	308585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520515
5037	NC_000868	TCT	2	6	308645	308650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520515
5038	NC_000868	CTT	2	6	308662	308667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520515
5039	NC_000868	AGG	2	6	308749	308754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520515
5040	NC_000868	AG	4	8	308932	308939	50 %	0 %	50 %	0 %	14520515
5041	NC_000868	TCA	2	6	308973	308978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520516
5042	NC_000868	TCA	2	6	309048	309053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520516
5043	NC_000868	CGA	2	6	309066	309071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520516
5044	NC_000868	GTA	2	6	309120	309125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520516
5045	NC_000868	TCA	2	6	309210	309215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520516
5046	NC_000868	CTAG	2	8	309224	309231	25 %	25 %	25 %	25 %	14520516
5047	NC_000868	GGAAG	2	10	309302	309311	40 %	0 %	60 %	0 %	14520516
5048	NC_000868	CT	3	6	309347	309352	0 %	50 %	0 %	50 %	14520516
5049	NC_000868	CTT	2	6	309354	309359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520516
5050	NC_000868	TCG	2	6	309510	309515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520516
5051	NC_000868	AGG	2	6	309565	309570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520516
5052	NC_000868	TTA	2	6	309576	309581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520516
5053	NC_000868	TC	3	6	309588	309593	0 %	50 %	0 %	50 %	14520516
5054	NC_000868	TG	3	6	309637	309642	0 %	50 %	50 %	0 %	14520516
5055	NC_000868	TAAG	2	8	309644	309651	50 %	25 %	25 %	0 %	14520516
5056	NC_000868	CTC	2	6	309770	309775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520516
5057	NC_000868	CAT	2	6	309817	309822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520516
5058	NC_000868	CGA	2	6	309846	309851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520516
5059	NC_000868	TCC	2	6	309889	309894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520516
5060	NC_000868	TAG	2	6	309896	309901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520516
5061	NC_000868	TTC	2	6	309994	309999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520516
5062	NC_000868	TCT	2	6	310031	310036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520516
5063	NC_000868	ACG	2	6	310166	310171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520516
5064	NC_000868	GTA	2	6	310225	310230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520516
5065	NC_000868	ATT	2	6	310238	310243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520516
5066	NC_000868	AGC	2	6	310262	310267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520516
5067	NC_000868	TCGT	2	8	310310	310317	0 %	50 %	25 %	25 %	14520516
5068	NC_000868	GAA	2	6	310354	310359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520516
5069	NC_000868	TGC	2	6	310423	310428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520516
5070	NC_000868	ATT	2	6	310880	310885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520517
5071	NC_000868	GAG	2	6	310988	310993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520517
5072	NC_000868	TGG	2	6	311077	311082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520517
5073	NC_000868	AGGAA	2	10	311209	311218	60 %	0 %	40 %	0 %	14520517
5074	NC_000868	TGG	2	6	311275	311280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520517
5075	NC_000868	ATA	2	6	311432	311437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520517
5076	NC_000868	GGA	2	6	311645	311650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520518
5077	NC_000868	ATT	2	6	311678	311683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520518
5078	NC_000868	AGAA	2	8	311685	311692	75 %	0 %	25 %	0 %	14520518
5079	NC_000868	AAAT	2	8	311719	311726	75 %	25 %	0 %	0 %	14520518
5080	NC_000868	GA	3	6	311785	311790	50 %	0 %	50 %	0 %	14520518
5081	NC_000868	GAAA	2	8	311954	311961	75 %	0 %	25 %	0 %	14520518
5082	NC_000868	TAT	2	6	312094	312099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520519
5083	NC_000868	TAA	3	9	312163	312171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520519
5084	NC_000868	TCT	2	6	312246	312251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520519
5085	NC_000868	CAG	2	6	312324	312329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520519
5086	NC_000868	AATG	2	8	312341	312348	50 %	25 %	25 %	0 %	14520519
5087	NC_000868	TAA	2	6	312412	312417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520519
5088	NC_000868	ATCC	2	8	312463	312470	25 %	25 %	0 %	50 %	14520519
5089	NC_000868	GA	3	6	312487	312492	50 %	0 %	50 %	0 %	14520519
5090	NC_000868	GTC	2	6	312501	312506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14520519
5091	NC_000868	CTT	2	6	312630	312635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520519
5092	NC_000868	TA	3	6	312637	312642	50 %	50 %	0 %	0 %	14520519
5093	NC_000868	ATG	2	6	312696	312701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520519
5094	NC_000868	ATT	2	6	312845	312850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520520
5095	NC_000868	ATTG	2	8	312874	312881	25 %	50 %	25 %	0 %	14520520
5096	NC_000868	TTC	2	6	312956	312961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520520
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5098	NC_000868	ATT	2	6	313215	313220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520520
5099	NC_000868	TAA	2	6	313251	313256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520520
5100	NC_000868	AG	3	6	313298	313303	50 %	0 %	50 %	0 %	14520520
5101	NC_000868	ATA	2	6	313344	313349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520520
5102	NC_000868	GAA	2	6	313415	313420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520520
5103	NC_000868	ATC	2	6	313442	313447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520520
5104	NC_000868	AAG	2	6	313542	313547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520520
5105	NC_000868	GA	3	6	313664	313669	50 %	0 %	50 %	0 %	14520520
5106	NC_000868	AGG	2	6	313698	313703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520520
5107	NC_000868	AGA	2	6	313777	313782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520520
5108	NC_000868	CAG	2	6	313820	313825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520520
5109	NC_000868	ACT	2	6	313883	313888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520520
5110	NC_000868	AAGG	2	8	313907	313914	50 %	0 %	50 %	0 %	14520520
5111	NC_000868	CAT	2	6	313988	313993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520520
5112	NC_000868	AGG	2	6	314085	314090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520520
5113	NC_000868	CTC	2	6	314142	314147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520521
5114	NC_000868	T	6	6	314176	314181	0 %	100 %	0 %	0 %	14520521
5115	NC_000868	CTC	2	6	314203	314208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520521
5116	NC_000868	AAT	2	6	314236	314241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520521
5117	NC_000868	TTCCC	2	10	314301	314310	0 %	40 %	0 %	60 %	14520521
5118	NC_000868	CTTCT	2	10	314341	314350	0 %	60 %	0 %	40 %	14520521
5119	NC_000868	CAA	2	6	314372	314377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14520521
5120	NC_000868	GAT	2	6	314621	314626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520521
5121	NC_000868	GAA	2	6	314671	314676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520521
5122	NC_000868	CT	3	6	314773	314778	0 %	50 %	0 %	50 %	14520521
5123	NC_000868	CAT	2	6	314933	314938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520521
5124	NC_000868	TCC	2	6	314941	314946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520521
5125	NC_000868	C	7	7	314984	314990	0 %	0 %	0 %	100 %	14520521
5126	NC_000868	TCA	2	6	315014	315019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520521
5127	NC_000868	AAT	2	6	315087	315092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520522
5128	NC_000868	TGA	2	6	315102	315107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520522
5129	NC_000868	A	6	6	315175	315180	100 %	0 %	0 %	0 %	14520522
5130	NC_000868	GAGG	2	8	315327	315334	25 %	0 %	75 %	0 %	14520522
5131	NC_000868	TGA	2	6	315351	315356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520522
5132	NC_000868	AAG	2	6	315379	315384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520522
5133	NC_000868	ATT	2	6	315491	315496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14520522
5134	NC_000868	TAA	2	6	315534	315539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520522
5135	NC_000868	TTG	2	6	315581	315586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520522
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5137	NC_000868	A	6	6	315715	315720	100 %	0 %	0 %	0 %	14520522
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5139	NC_000868	AGG	2	6	316124	316129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520523
5140	NC_000868	GAGC	2	8	316165	316172	25 %	0 %	50 %	25 %	14520523
5141	NC_000868	AG	3	6	316246	316251	50 %	0 %	50 %	0 %	14520523
5142	NC_000868	AGA	2	6	316260	316265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520523
5143	NC_000868	TAC	2	6	316289	316294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14520523
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5145	NC_000868	TCC	2	6	316461	316466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14520523
5146	NC_000868	CGA	2	6	316474	316479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14520523
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5148	NC_000868	GAG	2	6	316517	316522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520523
5149	NC_000868	TGA	2	6	316557	316562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520523
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5151	NC_000868	GAA	2	6	316574	316579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520523
5152	NC_000868	AG	3	6	316615	316620	50 %	0 %	50 %	0 %	14520523
5153	NC_000868	A	6	6	316677	316682	100 %	0 %	0 %	0 %	14520523
5154	NC_000868	TTG	2	6	316752	316757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520524
5155	NC_000868	TGAT	2	8	316798	316805	25 %	50 %	25 %	0 %	14520524
5156	NC_000868	GAT	2	6	316887	316892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520524
5157	NC_000868	TA	3	6	316920	316925	50 %	50 %	0 %	0 %	14520524
5158	NC_000868	GA	3	6	316929	316934	50 %	0 %	50 %	0 %	14520524
5159	NC_000868	GAA	2	6	316937	316942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520524
5160	NC_000868	AAGG	2	8	316943	316950	50 %	0 %	50 %	0 %	14520524
5161	NC_000868	GAA	2	6	316973	316978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520524
5162	NC_000868	GAAGA	2	10	317092	317101	60 %	0 %	40 %	0 %	14520525
5163	NC_000868	TA	3	6	317110	317115	50 %	50 %	0 %	0 %	14520525
5164	NC_000868	GGA	2	6	317316	317321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520525
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5167	NC_000868	GAGC	2	8	317436	317443	25 %	0 %	50 %	25 %	14520525
5168	NC_000868	GA	3	6	317469	317474	50 %	0 %	50 %	0 %	14520525
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5211	NC_000868	AGAT	2	8	320094	320101	50 %	25 %	25 %	0 %	14520528
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5228	NC_000868	AC	3	6	320936	320941	50 %	0 %	0 %	50 %	14520529
5229	NC_000868	GGT	2	6	320997	321002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14520529
5230	NC_000868	GA	3	6	321003	321008	50 %	0 %	50 %	0 %	14520529
5231	NC_000868	TTGA	2	8	321060	321067	25 %	50 %	25 %	0 %	14520530
5232	NC_000868	AAG	2	6	321095	321100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520530
5233	NC_000868	GGA	2	6	321133	321138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520530
5234	NC_000868	AAGA	2	8	321170	321177	75 %	0 %	25 %	0 %	14520530
5235	NC_000868	GGA	2	6	321191	321196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14520530
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5240	NC_000868	ATA	2	6	321492	321497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520531
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5246	NC_000868	AGA	2	6	321682	321687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14520531
5247	NC_000868	A	6	6	321725	321730	100 %	0 %	0 %	0 %	14520531
5248	NC_000868	GA	3	6	321735	321740	50 %	0 %	50 %	0 %	14520531
5249	NC_000868	GTT	2	6	321773	321778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14520531
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5254	NC_000868	ATG	2	6	322271	322276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14520531
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5282	NC_000868	TACC	2	8	324160	324167	25 %	25 %	0 %	50 %	14520534
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5369	NC_000868	CTT	2	6	328102	328107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14520540
5370	NC_000868	CCCTTA	2	12	328122	328133	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	14520540
5371	NC_000868	ATCT	2	8	328160	328167	25 %	50 %	0 %	25 %	14520540
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5498	NC_000868	TG	3	6	334711	334716	0 %	50 %	50 %	0 %	14520555
5499	NC_000868	CCTCT	2	10	334746	334755	0 %	40 %	0 %	60 %	14520555
5500	NC_000868	AAT	2	6	334793	334798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14520556

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