MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas sp. VLB120

Total Repeats: 118545

< Previous12...226227228229230231232233234235236237238Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
118501	NC_022738	GAT	2	6	5642273	5642278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557225833
118502	NC_022738	GAC	2	6	5642309	5642314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225833
118503	NC_022738	TTG	2	6	5642316	5642321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557225833
118504	NC_022738	AGT	2	6	5642353	5642358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557225833
118505	NC_022738	GCC	2	6	5642378	5642383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557225833
118506	NC_022738	TTTC	2	8	5642392	5642399	0 %	75 %	0 %	25 %	557225833
118507	NC_022738	GGC	2	6	5642462	5642467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557225833
118508	NC_022738	AGGT	2	8	5642472	5642479	25 %	25 %	50 %	0 %	557225833
118509	NC_022738	CGA	2	6	5642501	5642506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225833
118510	NC_022738	AGGT	2	8	5642583	5642590	25 %	25 %	50 %	0 %	557225833
118511	NC_022738	TGAAGC	2	12	5642617	5642628	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	557225833
118512	NC_022738	ACC	2	6	5642670	5642675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557225833
118513	NC_022738	GTT	2	6	5642677	5642682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557225833
118514	NC_022738	GAC	2	6	5642731	5642736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225833
118515	NC_022738	CCA	2	6	5642802	5642807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557225833
118516	NC_022738	TGGAA	2	10	5642820	5642829	40 %	20 %	40 %	0 %	557225833
118517	NC_022738	GAC	2	6	5642845	5642850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225833
118518	NC_022738	CCAC	2	8	5642886	5642893	25 %	0 %	0 %	75 %	557225833
118519	NC_022738	CCGG	2	8	5643024	5643031	0 %	0 %	50 %	50 %	557225833
118520	NC_022738	GCA	2	6	5643066	5643071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225833
118521	NC_022738	CGA	2	6	5643151	5643156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225833
118522	NC_022738	GAA	2	6	5643197	5643202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557225834
118523	NC_022738	AGGA	2	8	5643210	5643217	50 %	0 %	50 %	0 %	557225834
118524	NC_022738	G	6	6	5643220	5643225	0 %	0 %	100 %	0 %	557225834
118525	NC_022738	ACC	2	6	5643238	5643243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557225834
118526	NC_022738	CGA	2	6	5643272	5643277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225834
118527	NC_022738	CCAC	2	8	5643286	5643293	25 %	0 %	0 %	75 %	557225834
118528	NC_022738	TG	3	6	5643481	5643486	0 %	50 %	50 %	0 %	557225835
118529	NC_022738	TATC	2	8	5643532	5643539	25 %	50 %	0 %	25 %	557225835
118530	NC_022738	GC	3	6	5643554	5643559	0 %	0 %	50 %	50 %	557225835
118531	NC_022738	CTG	2	6	5643590	5643595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557225835
118532	NC_022738	GGAA	2	8	5643604	5643611	50 %	0 %	50 %	0 %	557225835
118533	NC_022738	CTT	2	6	5643662	5643667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557225835
118534	NC_022738	CAG	2	6	5643722	5643727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225835
118535	NC_022738	CAC	2	6	5643821	5643826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557225835
118536	NC_022738	ACG	3	9	5643870	5643878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557225836
118537	NC_022738	GC	5	10	5643933	5643942	0 %	0 %	50 %	50 %	557225836
118538	NC_022738	TTGG	2	8	5643953	5643960	0 %	50 %	50 %	0 %	557225836
118539	NC_022738	AAGC	2	8	5644046	5644053	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118540	NC_022738	GTGG	2	8	5644125	5644132	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
118541	NC_022738	A	7	7	5644165	5644171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118542	NC_022738	GAA	2	6	5644197	5644202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118543	NC_022738	TCT	2	6	5644225	5644230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118544	NC_022738	TGA	2	6	5644301	5644306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118545	NC_022738	GTTT	2	8	5644528	5644535	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...226227228229230231232233234235236237238Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.