MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid

Total Repeats: 38843

< Previous12...66676869707172737475767778Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38501	NC_022111	ACG	2	6	1754782	1754787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355510
38502	NC_022111	AGATAT	2	12	1754795	1754806	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532355510
38503	NC_022111	AGG	3	9	1754822	1754830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532355510
38504	NC_022111	GTG	2	6	1754925	1754930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532355510
38505	NC_022111	TGCAA	2	10	1754937	1754946	40 %	20 %	20 %	20 %	532355510
38506	NC_022111	ATT	2	6	1754973	1754978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355510
38507	NC_022111	ATG	2	6	1755003	1755008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355510
38508	NC_022111	CAA	3	9	1755114	1755122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355510
38509	NC_022111	GAA	2	6	1755234	1755239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355510
38510	NC_022111	CAG	2	6	1755460	1755465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355510
38511	NC_022111	TGA	2	6	1755509	1755514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355510
38512	NC_022111	AGC	2	6	1755560	1755565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355510
38513	NC_022111	TAA	2	6	1755602	1755607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355510
38514	NC_022111	CTTTTT	2	12	1755690	1755701	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38515	NC_022111	ATTCT	2	10	1755752	1755761	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38516	NC_022111	CT	3	6	1755760	1755765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38517	NC_022111	ACTT	2	8	1755793	1755800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38518	NC_022111	A	6	6	1755803	1755808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38519	NC_022111	CTA	2	6	1755833	1755838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38520	NC_022111	TTAT	2	8	1755844	1755851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38521	NC_022111	GTT	2	6	1755883	1755888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38522	NC_022111	ATT	2	6	1755917	1755922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355511
38523	NC_022111	CT	3	6	1755973	1755978	0 %	50 %	0 %	50 %	532355511
38524	NC_022111	TGT	2	6	1755995	1756000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355511
38525	NC_022111	GAA	2	6	1756017	1756022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355511
38526	NC_022111	TAC	2	6	1756041	1756046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355511
38527	NC_022111	AAT	2	6	1756086	1756091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355511
38528	NC_022111	TTTCT	2	10	1756119	1756128	0 %	80 %	0 %	20 %	532355511
38529	NC_022111	TGA	2	6	1756223	1756228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355511
38530	NC_022111	T	6	6	1756239	1756244	0 %	100 %	0 %	0 %	532355511
38531	NC_022111	AATGA	2	10	1756306	1756315	60 %	20 %	20 %	0 %	532355511
38532	NC_022111	ATTC	2	8	1756410	1756417	25 %	50 %	0 %	25 %	532355511
38533	NC_022111	GAA	2	6	1756427	1756432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355511
38534	NC_022111	CAG	2	6	1756475	1756480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355511
38535	NC_022111	T	6	6	1756481	1756486	0 %	100 %	0 %	0 %	532355511
38536	NC_022111	ACT	2	6	1756633	1756638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355511
38537	NC_022111	TGC	2	6	1756653	1756658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355511
38538	NC_022111	ATT	2	6	1756671	1756676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355511
38539	NC_022111	T	6	6	1756714	1756719	0 %	100 %	0 %	0 %	532355511
38540	NC_022111	TCG	2	6	1756726	1756731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355511
38541	NC_022111	GCATT	2	10	1756741	1756750	20 %	40 %	20 %	20 %	532355511
38542	NC_022111	ATAC	2	8	1756765	1756772	50 %	25 %	0 %	25 %	532355511
38543	NC_022111	TATT	2	8	1756853	1756860	25 %	75 %	0 %	0 %	532355511
38544	NC_022111	TA	4	8	1756940	1756947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38545	NC_022111	AAT	2	6	1757038	1757043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38546	NC_022111	TATT	2	8	1757074	1757081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38547	NC_022111	TCT	2	6	1757137	1757142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355512
38548	NC_022111	TAA	2	6	1757260	1757265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38549	NC_022111	ATG	2	6	1757286	1757291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38550	NC_022111	ATT	2	6	1757408	1757413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355513
38551	NC_022111	TC	3	6	1757447	1757452	0 %	50 %	0 %	50 %	532355513
38552	NC_022111	GCA	2	6	1757453	1757458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355513
38553	NC_022111	GAACT	2	10	1757501	1757510	40 %	20 %	20 %	20 %	532355513
38554	NC_022111	CT	3	6	1757521	1757526	0 %	50 %	0 %	50 %	532355513
38555	NC_022111	TAG	2	6	1757589	1757594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355513
38556	NC_022111	GTT	2	6	1757596	1757601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355513
38557	NC_022111	ATTCA	2	10	1757692	1757701	40 %	40 %	0 %	20 %	532355513
38558	NC_022111	TCA	2	6	1757727	1757732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355513
38559	NC_022111	CTTT	2	8	1757733	1757740	0 %	75 %	0 %	25 %	532355513
38560	NC_022111	GTC	2	6	1757752	1757757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355513
38561	NC_022111	AGAT	2	8	1757765	1757772	50 %	25 %	25 %	0 %	532355513
38562	NC_022111	GAAA	2	8	1757865	1757872	75 %	0 %	25 %	0 %	532355513
38563	NC_022111	GTAA	2	8	1758001	1758008	50 %	25 %	25 %	0 %	532355513
38564	NC_022111	GTT	2	6	1758033	1758038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355513
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38567	NC_022111	AGT	2	6	1758238	1758243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355513
38568	NC_022111	AATCAT	2	12	1758276	1758287	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532355513
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38570	NC_022111	ACTA	2	8	1758361	1758368	50 %	25 %	0 %	25 %	532355513
38571	NC_022111	TGT	2	6	1758382	1758387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355513
38572	NC_022111	TAA	2	6	1758401	1758406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355513
38573	NC_022111	TAC	2	6	1758415	1758420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355513
38574	NC_022111	AAT	2	6	1758430	1758435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355513
38575	NC_022111	TA	3	6	1758436	1758441	50 %	50 %	0 %	0 %	532355513
38576	NC_022111	TG	3	6	1758446	1758451	0 %	50 %	50 %	0 %	532355513
38577	NC_022111	ATTGTT	2	12	1758495	1758506	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38578	NC_022111	AT	3	6	1758576	1758581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38579	NC_022111	ATA	3	9	1758589	1758597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38580	NC_022111	AAAT	2	8	1758625	1758632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38581	NC_022111	CGG	2	6	1758719	1758724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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38583	NC_022111	AT	3	6	1758847	1758852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38584	NC_022111	AAT	2	6	1758873	1758878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38585	NC_022111	ATA	2	6	1758882	1758887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38586	NC_022111	A	7	7	1758890	1758896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38587	NC_022111	CAAG	2	8	1758963	1758970	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38588	NC_022111	T	7	7	1758979	1758985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38589	NC_022111	TATTGA	2	12	1759041	1759052	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38590	NC_022111	ATATT	2	10	1759076	1759085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38591	NC_022111	CTT	2	6	1759109	1759114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38592	NC_022111	TA	4	8	1759115	1759122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38593	NC_022111	TAT	2	6	1759127	1759132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38594	NC_022111	AT	3	6	1759131	1759136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38595	NC_022111	ATTT	2	8	1759139	1759146	25 %	75 %	0 %	0 %	532355514
38596	NC_022111	T	8	8	1759154	1759161	0 %	100 %	0 %	0 %	532355514
38597	NC_022111	TTA	2	6	1759165	1759170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355514
38598	NC_022111	TTC	2	6	1759199	1759204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355514
38599	NC_022111	GTT	2	6	1759218	1759223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355514
38600	NC_022111	CTC	2	6	1759228	1759233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532355514
38601	NC_022111	ACT	2	6	1759274	1759279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355514
38602	NC_022111	CAA	2	6	1759287	1759292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355514
38603	NC_022111	GTT	2	6	1759308	1759313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355514
38604	NC_022111	ACC	2	6	1759356	1759361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532355514
38605	NC_022111	CGT	2	6	1759378	1759383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355514
38606	NC_022111	AATC	2	8	1759400	1759407	50 %	25 %	0 %	25 %	532355514
38607	NC_022111	T	6	6	1759419	1759424	0 %	100 %	0 %	0 %	532355514
38608	NC_022111	GAA	2	6	1759431	1759436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355514
38609	NC_022111	GTTT	2	8	1759448	1759455	0 %	75 %	25 %	0 %	532355514
38610	NC_022111	TAGT	2	8	1759480	1759487	25 %	50 %	25 %	0 %	532355514
38611	NC_022111	CCAA	2	8	1759490	1759497	50 %	0 %	0 %	50 %	532355514
38612	NC_022111	TCGC	2	8	1759619	1759626	0 %	25 %	25 %	50 %	532355514
38613	NC_022111	AACC	2	8	1759707	1759714	50 %	0 %	0 %	50 %	532355514
38614	NC_022111	TGTCTT	2	12	1759721	1759732	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532355514
38615	NC_022111	AAC	2	6	1759743	1759748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355514
38616	NC_022111	ATC	2	6	1759824	1759829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355514
38617	NC_022111	TA	3	6	1759913	1759918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38618	NC_022111	A	6	6	1759924	1759929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38619	NC_022111	GA	3	6	1759936	1759941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38620	NC_022111	AAT	2	6	1759981	1759986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38621	NC_022111	TTC	2	6	1760034	1760039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355515
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38623	NC_022111	CAT	2	6	1760249	1760254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355515
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