MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid

Total Repeats: 38843

< Previous12...66676869707172737475767778Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_022111	TGC	3	9	1682705	1682713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355460
37002	NC_022111	GTTT	2	8	1682741	1682748	0 %	75 %	25 %	0 %	532355460
37003	NC_022111	TTG	2	6	1682781	1682786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355460
37004	NC_022111	T	6	6	1682790	1682795	0 %	100 %	0 %	0 %	532355460
37005	NC_022111	ACT	2	6	1682975	1682980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355460
37006	NC_022111	TGAAA	2	10	1683008	1683017	60 %	20 %	20 %	0 %	532355460
37007	NC_022111	AAC	2	6	1683024	1683029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355460
37008	NC_022111	AAG	2	6	1683030	1683035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355460
37009	NC_022111	T	6	6	1683044	1683049	0 %	100 %	0 %	0 %	532355460
37010	NC_022111	AAT	2	6	1683077	1683082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37011	NC_022111	ATC	2	6	1683185	1683190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355461
37012	NC_022111	ATG	2	6	1683302	1683307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355461
37013	NC_022111	AAG	2	6	1683308	1683313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355461
37014	NC_022111	AGG	2	6	1683323	1683328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532355461
37015	NC_022111	GAA	2	6	1683400	1683405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355461
37016	NC_022111	TAAG	2	8	1683496	1683503	50 %	25 %	25 %	0 %	532355461
37017	NC_022111	TAC	2	6	1683775	1683780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355461
37018	NC_022111	CTT	2	6	1683792	1683797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355461
37019	NC_022111	TTC	2	6	1683880	1683885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355461
37020	NC_022111	GTT	2	6	1683946	1683951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355461
37021	NC_022111	TCA	2	6	1683957	1683962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355461
37022	NC_022111	TTC	3	9	1683997	1684005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355461
37023	NC_022111	TA	3	6	1684008	1684013	50 %	50 %	0 %	0 %	532355461
37024	NC_022111	GTT	3	9	1684040	1684048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37025	NC_022111	TGT	2	6	1684053	1684058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37026	NC_022111	ATT	2	6	1684075	1684080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37027	NC_022111	ATT	2	6	1684082	1684087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37028	NC_022111	CTT	2	6	1684107	1684112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355462
37029	NC_022111	TTCT	2	8	1684123	1684130	0 %	75 %	0 %	25 %	532355462
37030	NC_022111	TGC	2	6	1684138	1684143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355462
37031	NC_022111	AT	3	6	1684173	1684178	50 %	50 %	0 %	0 %	532355462
37032	NC_022111	CATT	2	8	1684212	1684219	25 %	50 %	0 %	25 %	532355462
37033	NC_022111	CTT	2	6	1684239	1684244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355462
37034	NC_022111	ACT	2	6	1684327	1684332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355462
37035	NC_022111	TAAA	2	8	1684349	1684356	75 %	25 %	0 %	0 %	532355462
37036	NC_022111	A	7	7	1684404	1684410	100 %	0 %	0 %	0 %	532355462
37037	NC_022111	TGC	2	6	1684414	1684419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355462
37038	NC_022111	AAAT	2	8	1684428	1684435	75 %	25 %	0 %	0 %	532355462
37039	NC_022111	ATG	2	6	1684548	1684553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355462
37040	NC_022111	TTTG	2	8	1684605	1684612	0 %	75 %	25 %	0 %	532355462
37041	NC_022111	TGT	2	6	1684655	1684660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37042	NC_022111	GTT	2	6	1684704	1684709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37043	NC_022111	ATGA	2	8	1684742	1684749	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37044	NC_022111	TATTT	2	10	1684789	1684798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37045	NC_022111	T	6	6	1684820	1684825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37046	NC_022111	GAAA	2	8	1684845	1684852	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37047	NC_022111	GT	3	6	1684970	1684975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37048	NC_022111	AAT	2	6	1685039	1685044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37049	NC_022111	GTG	2	6	1685140	1685145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37050	NC_022111	T	8	8	1685147	1685154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37051	NC_022111	T	8	8	1685160	1685167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37052	NC_022111	AAT	2	6	1685182	1685187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37053	NC_022111	ATA	2	6	1685228	1685233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37054	NC_022111	ATAA	2	8	1685273	1685280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37055	NC_022111	TAAAA	2	10	1685290	1685299	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37056	NC_022111	AAT	2	6	1685302	1685307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355463
37057	NC_022111	T	6	6	1685315	1685320	0 %	100 %	0 %	0 %	532355463
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37059	NC_022111	TTA	2	6	1685351	1685356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355463
37060	NC_022111	TTG	2	6	1685388	1685393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355463
37061	NC_022111	TGT	2	6	1685404	1685409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355463
37062	NC_022111	TG	3	6	1685473	1685478	0 %	50 %	50 %	0 %	532355463
37063	NC_022111	CTTT	2	8	1685712	1685719	0 %	75 %	0 %	25 %	532355463
37064	NC_022111	AAT	2	6	1685745	1685750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355463
37065	NC_022111	TGC	2	6	1685775	1685780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37066	NC_022111	GCA	2	6	1685804	1685809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37067	NC_022111	T	7	7	1685810	1685816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37068	NC_022111	TAA	2	6	1685940	1685945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37069	NC_022111	ATT	2	6	1685961	1685966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37070	NC_022111	GTA	2	6	1685983	1685988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37071	NC_022111	TAA	2	6	1685989	1685994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37072	NC_022111	A	6	6	1685993	1685998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37073	NC_022111	TGT	2	6	1686052	1686057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37074	NC_022111	GGA	2	6	1686219	1686224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37075	NC_022111	TA	3	6	1686275	1686280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37076	NC_022111	TTA	2	6	1686281	1686286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37077	NC_022111	T	6	6	1686322	1686327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37078	NC_022111	AGAA	2	8	1686336	1686343	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37079	NC_022111	A	6	6	1686355	1686360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37080	NC_022111	GTT	2	6	1686418	1686423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37081	NC_022111	ATG	2	6	1686434	1686439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37082	NC_022111	GAA	3	9	1686443	1686451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37083	NC_022111	AAT	2	6	1686455	1686460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37084	NC_022111	ATT	2	6	1686529	1686534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37085	NC_022111	TAT	2	6	1686545	1686550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37086	NC_022111	AT	4	8	1686549	1686556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37087	NC_022111	GAGAA	2	10	1686559	1686568	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37088	NC_022111	TATT	2	8	1686593	1686600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37089	NC_022111	T	6	6	1686605	1686610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37090	NC_022111	ATAA	2	8	1686632	1686639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37091	NC_022111	TG	3	6	1686679	1686684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37092	NC_022111	ATA	2	6	1686702	1686707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37093	NC_022111	T	8	8	1686708	1686715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37094	NC_022111	TC	3	6	1686731	1686736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37095	NC_022111	TAATT	2	10	1686743	1686752	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37096	NC_022111	ATG	2	6	1686772	1686777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355464
37097	NC_022111	CTTT	2	8	1686917	1686924	0 %	75 %	0 %	25 %	532355464
37098	NC_022111	GAA	2	6	1686978	1686983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355464
37099	NC_022111	ATA	2	6	1687064	1687069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355464
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37103	NC_022111	GAA	2	6	1687263	1687268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355464
37104	NC_022111	AAC	2	6	1687277	1687282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355464
37105	NC_022111	AT	3	6	1687302	1687307	50 %	50 %	0 %	0 %	532355464
37106	NC_022111	CAA	2	6	1687313	1687318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355464
37107	NC_022111	GCT	3	9	1687324	1687332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355464
37108	NC_022111	ATT	2	6	1687409	1687414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355464
37109	NC_022111	TTCG	2	8	1687439	1687446	0 %	50 %	25 %	25 %	532355464
37110	NC_022111	GAA	2	6	1687515	1687520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355464
37111	NC_022111	CAA	2	6	1687537	1687542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355464
37112	NC_022111	AGA	2	6	1687563	1687568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355464
37113	NC_022111	TATTC	2	10	1687589	1687598	20 %	60 %	0 %	20 %	532355464
37114	NC_022111	CTT	2	6	1687630	1687635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355464
37115	NC_022111	ATCA	2	8	1687711	1687718	50 %	25 %	0 %	25 %	532355464
37116	NC_022111	ATT	2	6	1687743	1687748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355464
37117	NC_022111	TA	3	6	1687784	1687789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37118	NC_022111	TGT	2	6	1687822	1687827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37119	NC_022111	TAG	3	9	1687830	1687838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37120	NC_022111	ATA	2	6	1687862	1687867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37121	NC_022111	A	7	7	1687881	1687887	100 %	0 %	0 %	0 %	532355465
37122	NC_022111	AACC	2	8	1687896	1687903	50 %	0 %	0 %	50 %	532355465
37123	NC_022111	GAA	2	6	1687991	1687996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355465
37124	NC_022111	GTAA	2	8	1688016	1688023	50 %	25 %	25 %	0 %	532355465
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37202	NC_022111	A	8	8	1692722	1692729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37203	NC_022111	AT	4	8	1692755	1692762	50 %	50 %	0 %	0 %	532355467
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37226	NC_022111	GTT	2	6	1694147	1694152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37227	NC_022111	A	6	6	1694185	1694190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37228	NC_022111	A	6	6	1694209	1694214	100 %	0 %	0 %	0 %	532355468
37229	NC_022111	TTG	2	6	1694235	1694240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355468
37230	NC_022111	TTC	2	6	1694245	1694250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355468
37231	NC_022111	GATGA	2	10	1694288	1694297	40 %	20 %	40 %	0 %	532355468
37232	NC_022111	GACA	2	8	1694349	1694356	50 %	0 %	25 %	25 %	532355468
37233	NC_022111	A	6	6	1694394	1694399	100 %	0 %	0 %	0 %	532355468
37234	NC_022111	ATA	2	6	1694427	1694432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355468
37235	NC_022111	TTATC	2	10	1694465	1694474	20 %	60 %	0 %	20 %	532355468
37236	NC_022111	CTAT	2	8	1694634	1694641	25 %	50 %	0 %	25 %	532355468
37237	NC_022111	TTC	2	6	1694654	1694659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355468
37238	NC_022111	TTAT	2	8	1694745	1694752	25 %	75 %	0 %	0 %	532355468
37239	NC_022111	CAAC	2	8	1694760	1694767	50 %	0 %	0 %	50 %	532355468
37240	NC_022111	TAA	2	6	1694860	1694865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355468
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37363	NC_022111	ACT	2	6	1700643	1700648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355471
37364	NC_022111	ATT	2	6	1700751	1700756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355471
37365	NC_022111	ATC	2	6	1700814	1700819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355471
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37381	NC_022111	AGA	2	6	1701945	1701950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37382	NC_022111	ATT	2	6	1701996	1702001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355472
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37450	NC_022111	ATAA	2	8	1706930	1706937	75 %	25 %	0 %	0 %	532355474
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37473	NC_022111	TA	3	6	1708296	1708301	50 %	50 %	0 %	0 %	532355475
37474	NC_022111	CAGC	2	8	1708401	1708408	25 %	0 %	25 %	50 %	532355475
37475	NC_022111	AT	3	6	1708415	1708420	50 %	50 %	0 %	0 %	532355475
37476	NC_022111	A	6	6	1708436	1708441	100 %	0 %	0 %	0 %	532355475
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