MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid

Total Repeats: 38843

< Previous12...66676869707172737475767778Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_022111	GTT	2	6	1525039	1525044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33502	NC_022111	GAC	3	9	1525150	1525158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33503	NC_022111	GGTGTA	2	12	1525167	1525178	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
33504	NC_022111	ACT	2	6	1525203	1525208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33505	NC_022111	ATT	2	6	1525234	1525239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33506	NC_022111	ATTT	2	8	1525253	1525260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33507	NC_022111	GGT	2	6	1525324	1525329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33508	NC_022111	TGCAA	2	10	1525386	1525395	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33509	NC_022111	GTAG	2	8	1525405	1525412	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33510	NC_022111	T	6	6	1525418	1525423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33511	NC_022111	AG	3	6	1525429	1525434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33512	NC_022111	CT	3	6	1525457	1525462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33513	NC_022111	T	7	7	1525462	1525468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33514	NC_022111	A	6	6	1525480	1525485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33515	NC_022111	TTTAA	2	10	1525588	1525597	40 %	60 %	0 %	0 %	532355321
33516	NC_022111	CTT	2	6	1525607	1525612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355321
33517	NC_022111	GAT	2	6	1525615	1525620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355321
33518	NC_022111	ATCA	2	8	1525622	1525629	50 %	25 %	0 %	25 %	532355321
33519	NC_022111	TCA	2	6	1525641	1525646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355321
33520	NC_022111	ATT	2	6	1525655	1525660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355321
33521	NC_022111	TAT	3	9	1525691	1525699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355322
33522	NC_022111	AAT	2	6	1525710	1525715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355322
33523	NC_022111	T	6	6	1525723	1525728	0 %	100 %	0 %	0 %	532355322
33524	NC_022111	AT	3	6	1525768	1525773	50 %	50 %	0 %	0 %	532355322
33525	NC_022111	CAT	2	6	1525782	1525787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355322
33526	NC_022111	GTT	2	6	1525801	1525806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355322
33527	NC_022111	TTC	2	6	1525816	1525821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355322
33528	NC_022111	TCCA	2	8	1525846	1525853	25 %	25 %	0 %	50 %	532355322
33529	NC_022111	TA	3	6	1525881	1525886	50 %	50 %	0 %	0 %	532355322
33530	NC_022111	ATT	2	6	1525909	1525914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355322
33531	NC_022111	ATA	2	6	1525960	1525965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355322
33532	NC_022111	TAT	2	6	1525975	1525980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355322
33533	NC_022111	TCT	2	6	1526051	1526056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355322
33534	NC_022111	CAAT	2	8	1526066	1526073	50 %	25 %	0 %	25 %	532355322
33535	NC_022111	TCA	2	6	1526156	1526161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355322
33536	NC_022111	GTAA	2	8	1526198	1526205	50 %	25 %	25 %	0 %	532355322
33537	NC_022111	AAC	2	6	1526215	1526220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355322
33538	NC_022111	ATAA	2	8	1526229	1526236	75 %	25 %	0 %	0 %	532355322
33539	NC_022111	TGCT	2	8	1526276	1526283	0 %	50 %	25 %	25 %	532355323
33540	NC_022111	GCAAAA	2	12	1526332	1526343	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	532355323
33541	NC_022111	ACA	2	6	1526392	1526397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355323
33542	NC_022111	CGT	2	6	1526404	1526409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355323
33543	NC_022111	GTT	2	6	1526410	1526415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355323
33544	NC_022111	AAAT	2	8	1526430	1526437	75 %	25 %	0 %	0 %	532355323
33545	NC_022111	CAA	2	6	1526468	1526473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355323
33546	NC_022111	GGT	2	6	1526491	1526496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532355323
33547	NC_022111	GCT	2	6	1526536	1526541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355323
33548	NC_022111	TTG	2	6	1526561	1526566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355323
33549	NC_022111	CGT	2	6	1526614	1526619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355323
33550	NC_022111	ACT	2	6	1526629	1526634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355323
33551	NC_022111	CAA	2	6	1526636	1526641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355323
33552	NC_022111	AAG	2	6	1526642	1526647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355323
33553	NC_022111	GAA	2	6	1526680	1526685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355323
33554	NC_022111	CAG	2	6	1526690	1526695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355323
33555	NC_022111	AAT	2	6	1526696	1526701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355323
33556	NC_022111	CTTT	2	8	1526754	1526761	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33557	NC_022111	T	6	6	1526804	1526809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33558	NC_022111	T	6	6	1526822	1526827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33559	NC_022111	TGT	2	6	1526899	1526904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33560	NC_022111	A	6	6	1526937	1526942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33561	NC_022111	ATA	2	6	1526946	1526951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33562	NC_022111	ATT	2	6	1526968	1526973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33563	NC_022111	TTC	2	6	1526974	1526979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33564	NC_022111	AG	3	6	1527022	1527027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33565	NC_022111	TTC	2	6	1527034	1527039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33566	NC_022111	ATC	2	6	1527045	1527050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33567	NC_022111	TTG	2	6	1527051	1527056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33568	NC_022111	CTT	2	6	1527152	1527157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355324
33569	NC_022111	CAC	2	6	1527181	1527186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532355324
33570	NC_022111	TCA	2	6	1527386	1527391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355324
33571	NC_022111	TGT	2	6	1527433	1527438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355324
33572	NC_022111	ACC	2	6	1527452	1527457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532355324
33573	NC_022111	CAG	2	6	1527489	1527494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355324
33574	NC_022111	AAG	2	6	1527525	1527530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355324
33575	NC_022111	A	7	7	1527532	1527538	100 %	0 %	0 %	0 %	532355324
33576	NC_022111	TCTTCA	2	12	1527576	1527587	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33577	NC_022111	TAT	2	6	1527602	1527607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33578	NC_022111	TTGT	2	8	1527634	1527641	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33579	NC_022111	TAT	2	6	1527669	1527674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33580	NC_022111	ATG	2	6	1527703	1527708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355325
33581	NC_022111	TGG	2	6	1527846	1527851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532355325
33582	NC_022111	TCA	2	6	1527885	1527890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355325
33583	NC_022111	GAC	2	6	1527929	1527934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355325
33584	NC_022111	AGA	2	6	1527957	1527962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355325
33585	NC_022111	A	6	6	1527975	1527980	100 %	0 %	0 %	0 %	532355325
33586	NC_022111	CATT	2	8	1528074	1528081	25 %	50 %	0 %	25 %	532355325
33587	NC_022111	GTT	2	6	1528170	1528175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355325
33588	NC_022111	GTT	2	6	1528200	1528205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355325
33589	NC_022111	ATA	2	6	1528214	1528219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355325
33590	NC_022111	TGA	2	6	1528269	1528274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355325
33591	NC_022111	AC	3	6	1528416	1528421	50 %	0 %	0 %	50 %	532355325
33592	NC_022111	CACAT	2	10	1528432	1528441	40 %	20 %	0 %	40 %	532355325
33593	NC_022111	TC	3	6	1528445	1528450	0 %	50 %	0 %	50 %	532355325
33594	NC_022111	AGA	3	9	1528455	1528463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355325
33595	NC_022111	TCA	2	6	1528508	1528513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355325
33596	NC_022111	CATG	2	8	1528518	1528525	25 %	25 %	25 %	25 %	532355325
33597	NC_022111	TGGT	2	8	1528597	1528604	0 %	50 %	50 %	0 %	532355325
33598	NC_022111	AAC	2	6	1528634	1528639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355325
33599	NC_022111	GTA	2	6	1528648	1528653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355325
33600	NC_022111	CAT	2	6	1528728	1528733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355325
33601	NC_022111	AG	3	6	1528765	1528770	50 %	0 %	50 %	0 %	532355325
33602	NC_022111	GTT	2	6	1528771	1528776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355325
33603	NC_022111	TG	3	6	1528822	1528827	0 %	50 %	50 %	0 %	532355325
33604	NC_022111	CCA	2	6	1528921	1528926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532355325
33605	NC_022111	AGG	2	6	1528941	1528946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532355325
33606	NC_022111	CTCA	2	8	1528997	1529004	25 %	25 %	0 %	50 %	532355325
33607	NC_022111	TCT	2	6	1529059	1529064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355325
33608	NC_022111	GCAG	2	8	1529166	1529173	25 %	0 %	50 %	25 %	532355325
33609	NC_022111	GAAGA	2	10	1529206	1529215	60 %	0 %	40 %	0 %	532355325
33610	NC_022111	AAGAT	2	10	1529228	1529237	60 %	20 %	20 %	0 %	532355325
33611	NC_022111	CAT	2	6	1529319	1529324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355325
33612	NC_022111	AAC	2	6	1529395	1529400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355325
33613	NC_022111	CAA	2	6	1529506	1529511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355325
33614	NC_022111	ATG	2	6	1529515	1529520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355325
33615	NC_022111	ACA	2	6	1529669	1529674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355325
33616	NC_022111	TAA	2	6	1529730	1529735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355325
33617	NC_022111	ATG	2	6	1529792	1529797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355325
33618	NC_022111	GCAC	2	8	1529854	1529861	25 %	0 %	25 %	50 %	532355325
33619	NC_022111	CACT	2	8	1529871	1529878	25 %	25 %	0 %	50 %	532355325
33620	NC_022111	AAG	2	6	1529942	1529947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355325
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33622	NC_022111	CTT	2	6	1530165	1530170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355325
33623	NC_022111	AAC	2	6	1530229	1530234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355325
33624	NC_022111	AAG	2	6	1530274	1530279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355325
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33627	NC_022111	TAA	2	6	1530403	1530408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33628	NC_022111	A	6	6	1530425	1530430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33629	NC_022111	AAAG	2	8	1530456	1530463	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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33634	NC_022111	AG	3	6	1530586	1530591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33635	NC_022111	GTC	2	6	1530678	1530683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355326
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33642	NC_022111	GCA	3	9	1531048	1531056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355326
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33656	NC_022111	TTA	2	6	1531820	1531825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33657	NC_022111	T	8	8	1531838	1531845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33658	NC_022111	ATC	2	6	1531913	1531918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355327
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33670	NC_022111	TTTG	2	8	1532872	1532879	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33671	NC_022111	TTTA	2	8	1532880	1532887	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33672	NC_022111	GTTA	2	8	1532891	1532898	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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33675	NC_022111	AATGT	2	10	1532985	1532994	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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33678	NC_022111	TAA	2	6	1533068	1533073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33709	NC_022111	TTA	2	6	1534498	1534503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33710	NC_022111	TA	5	10	1534512	1534521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33711	NC_022111	TC	3	6	1534543	1534548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33712	NC_022111	ATT	2	6	1534603	1534608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33714	NC_022111	AAAT	2	8	1534644	1534651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33726	NC_022111	AAAAG	2	10	1535450	1535459	80 %	0 %	20 %	0 %	532355329
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33728	NC_022111	AAT	2	6	1535548	1535553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33729	NC_022111	TA	3	6	1535584	1535589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33730	NC_022111	CTCAT	2	10	1535660	1535669	20 %	40 %	0 %	40 %	532355330
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33736	NC_022111	CTG	2	6	1535868	1535873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355330
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33980	NC_022111	AGA	2	6	1547439	1547444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355339
33981	NC_022111	CAA	2	6	1547460	1547465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355339
33982	NC_022111	ATA	2	6	1547477	1547482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355339
33983	NC_022111	ATC	2	6	1547512	1547517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355339
33984	NC_022111	AAG	2	6	1547586	1547591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355339
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33987	NC_022111	AT	3	6	1547798	1547803	50 %	50 %	0 %	0 %	532355339
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33999	NC_022111	GTT	2	6	1548586	1548591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355339
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