MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid

Total Repeats: 38843

< Previous12...4243444546474849505152...7778Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_022111	TGT	2	6	1023307	1023312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354950
23003	NC_022111	AGT	2	6	1023323	1023328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354950
23004	NC_022111	A	7	7	1023344	1023350	100 %	0 %	0 %	0 %	532354950
23005	NC_022111	C	6	6	1023352	1023357	0 %	0 %	0 %	100 %	532354950
23006	NC_022111	GCT	2	6	1023363	1023368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532354950
23007	NC_022111	T	6	6	1023368	1023373	0 %	100 %	0 %	0 %	532354950
23008	NC_022111	ATT	2	6	1023440	1023445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354950
23009	NC_022111	GGC	2	6	1023456	1023461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532354950
23010	NC_022111	AAT	2	6	1023499	1023504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354950
23011	NC_022111	ATT	2	6	1023522	1023527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354950
23012	NC_022111	AAGAG	2	10	1023557	1023566	60 %	0 %	40 %	0 %	532354950
23013	NC_022111	TTC	2	6	1023651	1023656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354950
23014	NC_022111	TTG	2	6	1023661	1023666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354950
23015	NC_022111	AAGAG	2	10	1023695	1023704	60 %	0 %	40 %	0 %	532354950
23016	NC_022111	TTG	2	6	1023730	1023735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354950
23017	NC_022111	TTG	2	6	1023799	1023804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354950
23018	NC_022111	TTG	2	6	1023868	1023873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354950
23019	NC_022111	TTG	2	6	1023937	1023942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354950
23020	NC_022111	CCCA	2	8	1023997	1024004	25 %	0 %	0 %	75 %	532354950
23021	NC_022111	TTA	2	6	1024009	1024014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354950
23022	NC_022111	AAGAG	2	10	1024040	1024049	60 %	0 %	40 %	0 %	532354950
23023	NC_022111	TTG	2	6	1024075	1024080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354950
23024	NC_022111	TAT	2	6	1024094	1024099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354950
23025	NC_022111	TGG	2	6	1024121	1024126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532354950
23026	NC_022111	C	9	9	1024141	1024149	0 %	0 %	0 %	100 %	532354950
23027	NC_022111	TCCTGT	2	12	1024163	1024174	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532354950
23028	NC_022111	AC	3	6	1024183	1024188	50 %	0 %	0 %	50 %	532354950
23029	NC_022111	TCA	2	6	1024191	1024196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354950
23030	NC_022111	CAC	2	6	1024219	1024224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532354950
23031	NC_022111	TTAA	2	8	1024307	1024314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23032	NC_022111	T	6	6	1024325	1024330	0 %	100 %	0 %	0 %	532354951
23033	NC_022111	ATTG	2	8	1024335	1024342	25 %	50 %	25 %	0 %	532354951
23034	NC_022111	AAG	2	6	1024382	1024387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354951
23035	NC_022111	ATAA	2	8	1024430	1024437	75 %	25 %	0 %	0 %	532354951
23036	NC_022111	ATT	2	6	1024444	1024449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23037	NC_022111	GAT	2	6	1024482	1024487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23038	NC_022111	TTAAA	2	10	1024493	1024502	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23039	NC_022111	TA	3	6	1024553	1024558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23040	NC_022111	ATT	2	6	1024585	1024590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23041	NC_022111	CAAA	2	8	1024617	1024624	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23042	NC_022111	A	7	7	1024628	1024634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23043	NC_022111	TAA	2	6	1024742	1024747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23044	NC_022111	GTA	2	6	1024779	1024784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23045	NC_022111	AAAC	2	8	1024791	1024798	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23046	NC_022111	GTT	2	6	1024846	1024851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23047	NC_022111	GAAA	2	8	1024880	1024887	75 %	0 %	25 %	0 %	532354952
23048	NC_022111	TCT	2	6	1024896	1024901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354952
23049	NC_022111	GTT	2	6	1024935	1024940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354952
23050	NC_022111	T	7	7	1024946	1024952	0 %	100 %	0 %	0 %	532354952
23051	NC_022111	TCC	2	6	1025028	1025033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532354952
23052	NC_022111	TGC	2	6	1025069	1025074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532354952
23053	NC_022111	GCTT	2	8	1025216	1025223	0 %	50 %	25 %	25 %	532354952
23054	NC_022111	TCG	2	6	1025238	1025243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532354952
23055	NC_022111	TTC	2	6	1025246	1025251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354952
23056	NC_022111	CCG	2	6	1025383	1025388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532354952
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23058	NC_022111	AAC	2	6	1025410	1025415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354952
23059	NC_022111	TCAA	2	8	1025442	1025449	50 %	25 %	0 %	25 %	532354952
23060	NC_022111	TAA	2	6	1025457	1025462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354952
23061	NC_022111	ATGG	2	8	1025477	1025484	25 %	25 %	50 %	0 %	532354952
23062	NC_022111	T	6	6	1025507	1025512	0 %	100 %	0 %	0 %	532354952
23063	NC_022111	TCT	2	6	1025628	1025633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354953
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23067	NC_022111	CGAA	2	8	1026013	1026020	50 %	0 %	25 %	25 %	532354953
23068	NC_022111	ATC	2	6	1026030	1026035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354953
23069	NC_022111	TC	3	6	1026034	1026039	0 %	50 %	0 %	50 %	532354953
23070	NC_022111	CCT	2	6	1026042	1026047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532354953
23071	NC_022111	CTT	2	6	1026076	1026081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354953
23072	NC_022111	AAG	2	6	1026138	1026143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354953
23073	NC_022111	TTGC	2	8	1026154	1026161	0 %	50 %	25 %	25 %	532354953
23074	NC_022111	GAG	2	6	1026178	1026183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532354953
23075	NC_022111	CGCT	2	8	1026306	1026313	0 %	25 %	25 %	50 %	532354953
23076	NC_022111	TCG	3	9	1026351	1026359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532354953
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23079	NC_022111	AAT	2	6	1026530	1026535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354953
23080	NC_022111	TGA	2	6	1026556	1026561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354953
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23084	NC_022111	AGAA	2	8	1026749	1026756	75 %	0 %	25 %	0 %	532354953
23085	NC_022111	TAT	2	6	1026784	1026789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354953
23086	NC_022111	AG	3	6	1026853	1026858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23087	NC_022111	GAT	2	6	1026994	1026999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354954
23088	NC_022111	CT	3	6	1027007	1027012	0 %	50 %	0 %	50 %	532354954
23089	NC_022111	CTA	2	6	1027036	1027041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354954
23090	NC_022111	TGA	2	6	1027048	1027053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354954
23091	NC_022111	CAT	2	6	1027123	1027128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354954
23092	NC_022111	CGT	2	6	1027165	1027170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532354954
23093	NC_022111	AT	3	6	1027175	1027180	50 %	50 %	0 %	0 %	532354954
23094	NC_022111	CTT	2	6	1027210	1027215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354954
23095	NC_022111	AT	3	6	1027225	1027230	50 %	50 %	0 %	0 %	532354954
23096	NC_022111	TCT	2	6	1027242	1027247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354954
23097	NC_022111	T	6	6	1027255	1027260	0 %	100 %	0 %	0 %	532354954
23098	NC_022111	CTGTG	2	10	1027300	1027309	0 %	40 %	40 %	20 %	532354954
23099	NC_022111	TAT	3	9	1027375	1027383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354954
23100	NC_022111	TGT	2	6	1027389	1027394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354954
23101	NC_022111	AG	3	6	1027455	1027460	50 %	0 %	50 %	0 %	532354954
23102	NC_022111	GTG	2	6	1027461	1027466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532354954
23103	NC_022111	GT	3	6	1027502	1027507	0 %	50 %	50 %	0 %	532354954
23104	NC_022111	TTAC	2	8	1027542	1027549	25 %	50 %	0 %	25 %	532354954
23105	NC_022111	TGT	3	9	1027555	1027563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354954
23106	NC_022111	TTC	2	6	1027571	1027576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354954
23107	NC_022111	AAC	2	6	1027671	1027676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354954
23108	NC_022111	AC	3	6	1027711	1027716	50 %	0 %	0 %	50 %	532354954
23109	NC_022111	ATG	2	6	1027749	1027754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354954
23110	NC_022111	T	6	6	1027771	1027776	0 %	100 %	0 %	0 %	532354954
23111	NC_022111	GCT	2	6	1027839	1027844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532354954
23112	NC_022111	T	6	6	1027902	1027907	0 %	100 %	0 %	0 %	532354954
23113	NC_022111	CGT	2	6	1027984	1027989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532354954
23114	NC_022111	CAG	2	6	1028005	1028010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354954
23115	NC_022111	TTGCG	2	10	1028139	1028148	0 %	40 %	40 %	20 %	532354954
23116	NC_022111	CATT	2	8	1028194	1028201	25 %	50 %	0 %	25 %	532354954
23117	NC_022111	AT	3	6	1028253	1028258	50 %	50 %	0 %	0 %	532354954
23118	NC_022111	TTTGC	2	10	1028272	1028281	0 %	60 %	20 %	20 %	532354954
23119	NC_022111	TTGA	2	8	1028293	1028300	25 %	50 %	25 %	0 %	532354954
23120	NC_022111	TGT	2	6	1028304	1028309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354954
23121	NC_022111	CTC	2	6	1028326	1028331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532354955
23122	NC_022111	TTC	2	6	1028365	1028370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354955
23123	NC_022111	CTG	2	6	1028394	1028399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532354955
23124	NC_022111	TGA	2	6	1028445	1028450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354955
23125	NC_022111	TTG	2	6	1028510	1028515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354955
23126	NC_022111	CTT	2	6	1028623	1028628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354955
23127	NC_022111	CCA	2	6	1028633	1028638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532354955
23128	NC_022111	GCA	2	6	1028726	1028731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354955
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23132	NC_022111	ATA	2	6	1028981	1028986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354955
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23134	NC_022111	AT	3	6	1029077	1029082	50 %	50 %	0 %	0 %	532354955
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23136	NC_022111	T	6	6	1029102	1029107	0 %	100 %	0 %	0 %	532354956
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23142	NC_022111	TAG	2	6	1029521	1029526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354956
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23149	NC_022111	TCT	2	6	1030053	1030058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354957
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23186	NC_022111	GAC	2	6	1031378	1031383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23229	NC_022111	TTTC	2	8	1033322	1033329	0 %	75 %	0 %	25 %	532354958
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23235	NC_022111	T	6	6	1033506	1033511	0 %	100 %	0 %	0 %	532354958
23236	NC_022111	TTG	3	9	1033524	1033532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354958
23237	NC_022111	TTC	2	6	1033539	1033544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354958
23238	NC_022111	TTCT	2	8	1033548	1033555	0 %	75 %	0 %	25 %	532354958
23239	NC_022111	TTC	2	6	1033560	1033565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354958
23240	NC_022111	T	6	6	1033680	1033685	0 %	100 %	0 %	0 %	532354958
23241	NC_022111	TCT	2	6	1033687	1033692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354958
23242	NC_022111	TCT	3	9	1033708	1033716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354958
23243	NC_022111	CTA	2	6	1033754	1033759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354958
23244	NC_022111	T	7	7	1033763	1033769	0 %	100 %	0 %	0 %	532354958
23245	NC_022111	TTC	2	6	1033779	1033784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354958
23246	NC_022111	CT	3	6	1033804	1033809	0 %	50 %	0 %	50 %	532354958
23247	NC_022111	TTC	2	6	1033857	1033862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354958
23248	NC_022111	T	6	6	1033881	1033886	0 %	100 %	0 %	0 %	532354958
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23250	NC_022111	TTTG	2	8	1033932	1033939	0 %	75 %	25 %	0 %	532354958
23251	NC_022111	TGA	2	6	1033968	1033973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354958
23252	NC_022111	TCT	2	6	1033979	1033984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354958
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23256	NC_022111	GCA	2	6	1034077	1034082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354958
23257	NC_022111	TTTCT	2	10	1034085	1034094	0 %	80 %	0 %	20 %	532354958
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23259	NC_022111	TCTTT	2	10	1034227	1034236	0 %	80 %	0 %	20 %	532354958
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23261	NC_022111	TTCTT	2	10	1034309	1034318	0 %	80 %	0 %	20 %	532354958
23262	NC_022111	AT	3	6	1034347	1034352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23263	NC_022111	TCA	2	6	1034558	1034563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354959
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23266	NC_022111	TGAA	2	8	1034780	1034787	50 %	25 %	25 %	0 %	532354959
23267	NC_022111	CT	3	6	1034839	1034844	0 %	50 %	0 %	50 %	532354959
23268	NC_022111	CA	3	6	1034878	1034883	50 %	0 %	0 %	50 %	532354959
23269	NC_022111	TCT	2	6	1034958	1034963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354959
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23275	NC_022111	GTTCTA	2	12	1035267	1035278	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532354959
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23292	NC_022111	TGT	2	6	1036142	1036147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23341	NC_022111	CAA	2	6	1038563	1038568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354962
23342	NC_022111	TAT	2	6	1038623	1038628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23343	NC_022111	T	6	6	1038657	1038662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23344	NC_022111	CTA	2	6	1038676	1038681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23345	NC_022111	ATT	2	6	1038723	1038728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354963
23346	NC_022111	A	7	7	1038767	1038773	100 %	0 %	0 %	0 %	532354963
23347	NC_022111	A	6	6	1038776	1038781	100 %	0 %	0 %	0 %	532354963
23348	NC_022111	TAC	2	6	1038803	1038808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354963
23349	NC_022111	TAG	2	6	1038817	1038822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354963
23350	NC_022111	TGC	2	6	1038823	1038828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532354963
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23353	NC_022111	GA	3	6	1038960	1038965	50 %	0 %	50 %	0 %	532354963
23354	NC_022111	CAC	2	6	1038991	1038996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532354963
23355	NC_022111	TATT	2	8	1039004	1039011	25 %	75 %	0 %	0 %	532354963
23356	NC_022111	TAA	2	6	1039021	1039026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354963
23357	NC_022111	ATTC	2	8	1039062	1039069	25 %	50 %	0 %	25 %	532354963
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23360	NC_022111	CGA	2	6	1039120	1039125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354963
23361	NC_022111	ACA	2	6	1039255	1039260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23362	NC_022111	ATA	2	6	1039277	1039282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23363	NC_022111	TTGATT	2	12	1039285	1039296	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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23365	NC_022111	AAAT	2	8	1039392	1039399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23366	NC_022111	TAG	2	6	1039406	1039411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23367	NC_022111	ATT	2	6	1039429	1039434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354964
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23393	NC_022111	TGA	2	6	1040467	1040472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354965
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23400	NC_022111	A	6	6	1040877	1040882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23416	NC_022111	T	6	6	1041502	1041507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23420	NC_022111	GAAA	2	8	1041596	1041603	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23421	NC_022111	CA	4	8	1041683	1041690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23422	NC_022111	TTAT	2	8	1041700	1041707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23423	NC_022111	AC	3	6	1041712	1041717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23424	NC_022111	TATT	2	8	1041719	1041726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23425	NC_022111	ACA	2	6	1041786	1041791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23440	NC_022111	CTTT	2	8	1042598	1042605	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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23466	NC_022111	AT	3	6	1044117	1044122	50 %	50 %	0 %	0 %	532354968
23467	NC_022111	TCT	2	6	1044130	1044135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354968
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23470	NC_022111	TTC	2	6	1044261	1044266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354968
23471	NC_022111	GCATT	2	10	1044332	1044341	20 %	40 %	20 %	20 %	532354968
23472	NC_022111	AAG	2	6	1044424	1044429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354968
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23474	NC_022111	TTG	2	6	1044469	1044474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354968
23475	NC_022111	CAT	2	6	1044497	1044502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354968
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23478	NC_022111	CTT	2	6	1044705	1044710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354968
23479	NC_022111	TTG	2	6	1044730	1044735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354968
23480	NC_022111	GTT	2	6	1044848	1044853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354968
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23482	NC_022111	ATC	2	6	1044877	1044882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354968
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23493	NC_022111	CAC	2	6	1045390	1045395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532354968
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23497	NC_022111	TAT	2	6	1045607	1045612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354968
23498	NC_022111	AAC	2	6	1045659	1045664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354968
23499	NC_022111	AGAA	2	8	1045727	1045734	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23500	NC_022111	ATT	2	6	1045740	1045745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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