MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid

Total Repeats: 38843

< Previous12...910111213141516171819...7778Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022111	CTT	2	6	298655	298660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354347
6502	NC_022111	T	6	6	298659	298664	0 %	100 %	0 %	0 %	532354347
6503	NC_022111	CTT	2	6	298698	298703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354347
6504	NC_022111	TGGAGC	2	12	298755	298766	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532354347
6505	NC_022111	GTT	2	6	298778	298783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354347
6506	NC_022111	TTC	2	6	298836	298841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354347
6507	NC_022111	AGA	3	9	298853	298861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354347
6508	NC_022111	CTTTT	2	10	298878	298887	0 %	80 %	0 %	20 %	532354347
6509	NC_022111	TA	4	8	298901	298908	50 %	50 %	0 %	0 %	532354347
6510	NC_022111	GAT	2	6	298925	298930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354347
6511	NC_022111	ACT	2	6	299064	299069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354347
6512	NC_022111	AAT	2	6	299082	299087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354347
6513	NC_022111	TTG	2	6	299088	299093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354347
6514	NC_022111	TCT	2	6	299104	299109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354347
6515	NC_022111	AAG	2	6	299156	299161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354347
6516	NC_022111	CAT	2	6	299183	299188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354347
6517	NC_022111	GT	3	6	299194	299199	0 %	50 %	50 %	0 %	532354347
6518	NC_022111	TA	3	6	299250	299255	50 %	50 %	0 %	0 %	532354347
6519	NC_022111	TGC	2	6	299262	299267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532354347
6520	NC_022111	ATC	2	6	299280	299285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354347
6521	NC_022111	CTT	2	6	299337	299342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354347
6522	NC_022111	AT	3	6	299370	299375	50 %	50 %	0 %	0 %	532354347
6523	NC_022111	ATG	2	6	299432	299437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354347
6524	NC_022111	AT	3	6	299456	299461	50 %	50 %	0 %	0 %	532354347
6525	NC_022111	TCC	2	6	299502	299507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532354347
6526	NC_022111	TTA	2	6	299543	299548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354347
6527	NC_022111	CTT	2	6	299558	299563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354347
6528	NC_022111	CTTT	2	8	299572	299579	0 %	75 %	0 %	25 %	532354347
6529	NC_022111	TGG	2	6	299605	299610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532354347
6530	NC_022111	TCC	2	6	299634	299639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532354347
6531	NC_022111	ATC	2	6	299674	299679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354347
6532	NC_022111	GT	3	6	299726	299731	0 %	50 %	50 %	0 %	532354347
6533	NC_022111	AAGG	2	8	299732	299739	50 %	0 %	50 %	0 %	532354347
6534	NC_022111	CTG	2	6	299759	299764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532354347
6535	NC_022111	TAG	2	6	299771	299776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354347
6536	NC_022111	TGG	2	6	299781	299786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532354347
6537	NC_022111	AAC	2	6	299790	299795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354347
6538	NC_022111	CTT	2	6	299813	299818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354347
6539	NC_022111	GCAT	2	8	299833	299840	25 %	25 %	25 %	25 %	532354347
6540	NC_022111	CTT	2	6	299852	299857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354347
6541	NC_022111	TA	3	6	299859	299864	50 %	50 %	0 %	0 %	532354347
6542	NC_022111	TTTTG	2	10	299888	299897	0 %	80 %	20 %	0 %	532354347
6543	NC_022111	GAT	2	6	299922	299927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354347
6544	NC_022111	CCT	2	6	299944	299949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532354347
6545	NC_022111	TAT	2	6	299954	299959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354347
6546	NC_022111	GCAAGA	2	12	300034	300045	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532354347
6547	NC_022111	ATA	2	6	300068	300073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354347
6548	NC_022111	AGT	2	6	300125	300130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354347
6549	NC_022111	AGTG	2	8	300134	300141	25 %	25 %	50 %	0 %	532354347
6550	NC_022111	ACG	2	6	300144	300149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354347
6551	NC_022111	ACC	2	6	300165	300170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532354347
6552	NC_022111	AAC	2	6	300174	300179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354347
6553	NC_022111	T	7	7	300198	300204	0 %	100 %	0 %	0 %	532354347
6554	NC_022111	TG	3	6	300211	300216	0 %	50 %	50 %	0 %	532354347
6555	NC_022111	TATT	2	8	300304	300311	25 %	75 %	0 %	0 %	532354347
6556	NC_022111	A	8	8	300345	300352	100 %	0 %	0 %	0 %	532354347
6557	NC_022111	TGCGA	2	10	300417	300426	20 %	20 %	40 %	20 %	532354347
6558	NC_022111	GAT	2	6	300476	300481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354347
6559	NC_022111	TATG	2	8	300483	300490	25 %	50 %	25 %	0 %	532354347
6560	NC_022111	GAATA	2	10	300501	300510	60 %	20 %	20 %	0 %	532354347
6561	NC_022111	TTCT	2	8	300543	300550	0 %	75 %	0 %	25 %	532354347
6562	NC_022111	TTG	2	6	300551	300556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354347
6563	NC_022111	GTAA	2	8	300571	300578	50 %	25 %	25 %	0 %	532354347
6564	NC_022111	AATG	2	8	300637	300644	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_022111	ATT	2	6	300701	300706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354348
6566	NC_022111	AT	3	6	300721	300726	50 %	50 %	0 %	0 %	532354348
6567	NC_022111	TGG	2	6	300739	300744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532354348
6568	NC_022111	AT	3	6	300771	300776	50 %	50 %	0 %	0 %	532354348
6569	NC_022111	TAA	2	6	300795	300800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354348
6570	NC_022111	TAT	2	6	300812	300817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354348
6571	NC_022111	AGA	2	6	300829	300834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354348
6572	NC_022111	TAA	2	6	300861	300866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354348
6573	NC_022111	TCA	2	6	300871	300876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354348
6574	NC_022111	CAA	2	6	300893	300898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354348
6575	NC_022111	TAC	2	6	300962	300967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354348
6576	NC_022111	ATT	2	6	301000	301005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354349
6577	NC_022111	TTTG	2	8	301006	301013	0 %	75 %	25 %	0 %	532354349
6578	NC_022111	TAA	2	6	301019	301024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354349
6579	NC_022111	GT	3	6	301057	301062	0 %	50 %	50 %	0 %	532354349
6580	NC_022111	AAT	2	6	301070	301075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354349
6581	NC_022111	CAG	2	6	301132	301137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354349
6582	NC_022111	GTCTG	2	10	301143	301152	0 %	40 %	40 %	20 %	532354349
6583	NC_022111	ATTGC	2	10	301156	301165	20 %	40 %	20 %	20 %	532354349
6584	NC_022111	ATGA	2	8	301187	301194	50 %	25 %	25 %	0 %	532354349
6585	NC_022111	AGC	2	6	301208	301213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354349
6586	NC_022111	TG	3	6	301218	301223	0 %	50 %	50 %	0 %	532354349
6587	NC_022111	TAA	2	6	301230	301235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354349
6588	NC_022111	TA	3	6	301237	301242	50 %	50 %	0 %	0 %	532354349
6589	NC_022111	TA	3	6	301268	301273	50 %	50 %	0 %	0 %	532354349
6590	NC_022111	GTT	2	6	301277	301282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354349
6591	NC_022111	GT	3	6	301318	301323	0 %	50 %	50 %	0 %	532354349
6592	NC_022111	ACC	2	6	301394	301399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532354349
6593	NC_022111	TTG	2	6	301412	301417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354349
6594	NC_022111	ACT	2	6	301556	301561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354349
6595	NC_022111	ATG	2	6	301632	301637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354349
6596	NC_022111	A	6	6	301708	301713	100 %	0 %	0 %	0 %	532354349
6597	NC_022111	ATC	2	6	301763	301768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354349
6598	NC_022111	ATT	2	6	301796	301801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354349
6599	NC_022111	CTTG	2	8	301857	301864	0 %	50 %	25 %	25 %	532354349
6600	NC_022111	TAA	2	6	301872	301877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354349
6601	NC_022111	CAC	2	6	301906	301911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532354349
6602	NC_022111	ATT	2	6	301913	301918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354349
6603	NC_022111	GTTT	2	8	301976	301983	0 %	75 %	25 %	0 %	532354349
6604	NC_022111	AT	3	6	302025	302030	50 %	50 %	0 %	0 %	532354349
6605	NC_022111	AAG	2	6	302038	302043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354349
6606	NC_022111	CAA	2	6	302149	302154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354349
6607	NC_022111	TAA	2	6	302189	302194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354349
6608	NC_022111	TAA	2	6	302246	302251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354349
6609	NC_022111	TGA	2	6	302268	302273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354349
6610	NC_022111	AAT	2	6	302323	302328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354349
6611	NC_022111	TTG	2	6	302369	302374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354349
6612	NC_022111	AGA	2	6	302402	302407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354349
6613	NC_022111	CAT	2	6	302455	302460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354349
6614	NC_022111	TGT	2	6	302468	302473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354349
6615	NC_022111	CAA	2	6	302491	302496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354349
6616	NC_022111	AAAG	2	8	302541	302548	75 %	0 %	25 %	0 %	532354349
6617	NC_022111	CCT	2	6	302595	302600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532354349
6618	NC_022111	TCT	2	6	302652	302657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354349
6619	NC_022111	CCA	2	6	302667	302672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532354349
6620	NC_022111	TCC	2	6	302774	302779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532354349
6621	NC_022111	AAC	2	6	302837	302842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354349
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6623	NC_022111	A	6	6	302874	302879	100 %	0 %	0 %	0 %	532354349
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6982	NC_022111	AT	3	6	320149	320154	50 %	50 %	0 %	0 %	532354361
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6994	NC_022111	TTATT	2	10	320860	320869	20 %	80 %	0 %	0 %	532354362
6995	NC_022111	ATC	2	6	321011	321016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354362
6996	NC_022111	ATGA	2	8	321032	321039	50 %	25 %	25 %	0 %	532354362
6997	NC_022111	TTG	2	6	321097	321102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354362
6998	NC_022111	TA	3	6	321115	321120	50 %	50 %	0 %	0 %	532354362
6999	NC_022111	CT	3	6	321164	321169	0 %	50 %	0 %	50 %	532354362
7000	NC_022111	ATG	2	6	321180	321185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354362

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