MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid

Total Repeats: 38843

< Previous12...678910111213141516...7778Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022111	TAA	4	12	230221	230232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_022111	AACA	2	8	230235	230242	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5003	NC_022111	GTGTT	2	10	230284	230293	0 %	60 %	40 %	0 %	532354298
5004	NC_022111	AT	3	6	230345	230350	50 %	50 %	0 %	0 %	532354298
5005	NC_022111	TTA	2	6	230417	230422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354298
5006	NC_022111	GAT	2	6	230442	230447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354298
5007	NC_022111	AAGC	2	8	230471	230478	50 %	0 %	25 %	25 %	532354298
5008	NC_022111	GTG	2	6	230571	230576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532354298
5009	NC_022111	TAA	2	6	230681	230686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354298
5010	NC_022111	AAC	2	6	230711	230716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354298
5011	NC_022111	GCCACT	2	12	230733	230744	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532354298
5012	NC_022111	ATC	2	6	230758	230763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354298
5013	NC_022111	A	6	6	230774	230779	100 %	0 %	0 %	0 %	532354298
5014	NC_022111	AGT	2	6	230826	230831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354298
5015	NC_022111	ACTT	2	8	230832	230839	25 %	50 %	0 %	25 %	532354298
5016	NC_022111	TAT	2	6	230943	230948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354298
5017	NC_022111	AAG	2	6	231061	231066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354298
5018	NC_022111	AGG	2	6	231107	231112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532354298
5019	NC_022111	ATG	2	6	231139	231144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354298
5020	NC_022111	AC	3	6	231158	231163	50 %	0 %	0 %	50 %	532354298
5021	NC_022111	TGGGGT	2	12	231168	231179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532354298
5022	NC_022111	AAG	2	6	231184	231189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354298
5023	NC_022111	TTTA	2	8	231214	231221	25 %	75 %	0 %	0 %	532354298
5024	NC_022111	TGT	2	6	231269	231274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354298
5025	NC_022111	TAA	2	6	231362	231367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354298
5026	NC_022111	AAG	2	6	231436	231441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354298
5027	NC_022111	TAA	2	6	231524	231529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354298
5028	NC_022111	CAC	2	6	231551	231556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532354298
5029	NC_022111	ATGA	2	8	231729	231736	50 %	25 %	25 %	0 %	532354298
5030	NC_022111	ATG	2	6	231751	231756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354298
5031	NC_022111	GCT	2	6	231813	231818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532354298
5032	NC_022111	GAA	2	6	231849	231854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354298
5033	NC_022111	GTG	2	6	231859	231864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532354298
5034	NC_022111	TGA	2	6	231871	231876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354298
5035	NC_022111	CAAC	2	8	231892	231899	50 %	0 %	0 %	50 %	532354298
5036	NC_022111	TAT	2	6	231987	231992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354298
5037	NC_022111	AAAG	2	8	232057	232064	75 %	0 %	25 %	0 %	532354298
5038	NC_022111	GGT	2	6	232076	232081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532354298
5039	NC_022111	GAAGTA	2	12	232110	232121	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	532354298
5040	NC_022111	AAG	2	6	232183	232188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354298
5041	NC_022111	AAAT	2	8	232216	232223	75 %	25 %	0 %	0 %	532354298
5042	NC_022111	TTA	2	6	232264	232269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354298
5043	NC_022111	TAT	2	6	232293	232298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354298
5044	NC_022111	GCTC	2	8	232549	232556	0 %	25 %	25 %	50 %	532354298
5045	NC_022111	GAAAGC	2	12	232557	232568	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532354298
5046	NC_022111	A	6	6	232659	232664	100 %	0 %	0 %	0 %	532354298
5047	NC_022111	TGA	2	6	232666	232671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354298
5048	NC_022111	AAAT	2	8	232674	232681	75 %	25 %	0 %	0 %	532354298
5049	NC_022111	TAA	2	6	232708	232713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_022111	T	7	7	232753	232759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_022111	AAGC	2	8	232785	232792	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5052	NC_022111	GCTAT	2	10	232798	232807	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5053	NC_022111	AACGCA	2	12	232855	232866	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_022111	TCTT	2	8	232911	232918	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5055	NC_022111	A	7	7	232997	233003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_022111	T	6	6	233055	233060	0 %	100 %	0 %	0 %	532354299
5057	NC_022111	TAAAA	2	10	233064	233073	80 %	20 %	0 %	0 %	532354299
5058	NC_022111	A	6	6	233070	233075	100 %	0 %	0 %	0 %	532354299
5059	NC_022111	CAA	2	6	233083	233088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354299
5060	NC_022111	TTG	2	6	233121	233126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354299
5061	NC_022111	A	6	6	233293	233298	100 %	0 %	0 %	0 %	532354299
5062	NC_022111	AG	4	8	233300	233307	50 %	0 %	50 %	0 %	532354299
5063	NC_022111	TAA	2	6	233372	233377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_022111	A	7	7	233376	233382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_022111	AAATA	2	10	233406	233415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_022111	TGA	2	6	233425	233430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354300
5067	NC_022111	ATA	2	6	233491	233496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354300
5068	NC_022111	TAC	2	6	233537	233542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354300
5069	NC_022111	CGAA	2	8	233629	233636	50 %	0 %	25 %	25 %	532354300
5070	NC_022111	TTGC	2	8	233656	233663	0 %	50 %	25 %	25 %	532354300
5071	NC_022111	CAA	2	6	233767	233772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354300
5072	NC_022111	ATG	3	9	233812	233820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354300
5073	NC_022111	GA	3	6	233843	233848	50 %	0 %	50 %	0 %	532354300
5074	NC_022111	ACG	2	6	233881	233886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354300
5075	NC_022111	AGG	2	6	233969	233974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532354300
5076	NC_022111	AT	3	6	234033	234038	50 %	50 %	0 %	0 %	532354300
5077	NC_022111	AGC	2	6	234142	234147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354300
5078	NC_022111	GTA	2	6	234192	234197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354300
5079	NC_022111	GAA	2	6	234207	234212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354300
5080	NC_022111	TGC	2	6	234221	234226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532354300
5081	NC_022111	GATT	2	8	234235	234242	25 %	50 %	25 %	0 %	532354300
5082	NC_022111	TGG	2	6	234256	234261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532354300
5083	NC_022111	GTGCTG	2	12	234268	234279	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	532354300
5084	NC_022111	A	6	6	234324	234329	100 %	0 %	0 %	0 %	532354300
5085	NC_022111	GT	3	6	234333	234338	0 %	50 %	50 %	0 %	532354300
5086	NC_022111	AAC	2	6	234365	234370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354300
5087	NC_022111	AGC	2	6	234387	234392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354300
5088	NC_022111	CAT	2	6	234497	234502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354300
5089	NC_022111	TG	3	6	234549	234554	0 %	50 %	50 %	0 %	532354300
5090	NC_022111	GAG	2	6	234582	234587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532354300
5091	NC_022111	TCT	2	6	234590	234595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354300
5092	NC_022111	ATC	2	6	234663	234668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_022111	A	6	6	234730	234735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_022111	AAC	2	6	234756	234761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354301
5095	NC_022111	AATG	2	8	234921	234928	50 %	25 %	25 %	0 %	532354301
5096	NC_022111	AAC	2	6	234946	234951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354301
5097	NC_022111	ACA	2	6	234961	234966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354301
5098	NC_022111	TTG	2	6	234992	234997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354301
5099	NC_022111	CTG	2	6	235049	235054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532354301
5100	NC_022111	TA	4	8	235125	235132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_022111	ATTTT	2	10	235190	235199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_022111	AT	3	6	235207	235212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_022111	TTC	2	6	235221	235226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_022111	TGTATA	2	12	235304	235315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_022111	TA	4	8	235318	235325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_022111	TGA	2	6	235342	235347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_022111	CAA	2	6	235354	235359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_022111	TAA	2	6	235403	235408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_022111	AAAT	2	8	235411	235418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_022111	GAA	2	6	235431	235436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354302
5111	NC_022111	AGA	2	6	235470	235475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354302
5112	NC_022111	ATG	2	6	235517	235522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354302
5113	NC_022111	ACT	2	6	235575	235580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354302
5114	NC_022111	AGA	2	6	235596	235601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354302
5115	NC_022111	TTG	2	6	235706	235711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354302
5116	NC_022111	TAC	2	6	235785	235790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354302
5117	NC_022111	GAAAT	2	10	235882	235891	60 %	20 %	20 %	0 %	532354302
5118	NC_022111	TGGACG	2	12	235935	235946	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532354302
5119	NC_022111	TCG	2	6	235962	235967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532354302
5120	NC_022111	AAAG	2	8	236004	236011	75 %	0 %	25 %	0 %	532354302
5121	NC_022111	TGA	2	6	236039	236044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354302
5122	NC_022111	TGA	2	6	236046	236051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354302
5123	NC_022111	AGA	2	6	236067	236072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354302
5124	NC_022111	GAAA	2	8	236106	236113	75 %	0 %	25 %	0 %	532354302
5125	NC_022111	GATAT	2	10	236129	236138	40 %	40 %	20 %	0 %	532354302
5126	NC_022111	AATG	2	8	236151	236158	50 %	25 %	25 %	0 %	532354302
5127	NC_022111	AGC	2	6	236220	236225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354302
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5129	NC_022111	GAA	2	6	236281	236286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354302
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5132	NC_022111	GTATT	2	10	236524	236533	20 %	60 %	20 %	0 %	532354302
5133	NC_022111	CAATA	2	10	236594	236603	60 %	20 %	0 %	20 %	532354302
5134	NC_022111	GAT	2	6	236611	236616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354302
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5138	NC_022111	TGTT	2	8	236725	236732	0 %	75 %	25 %	0 %	532354302
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5146	NC_022111	TGA	2	6	237123	237128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354302
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5235	NC_022111	CAAG	2	8	242272	242279	50 %	0 %	25 %	25 %	532354305
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5238	NC_022111	TTTTC	2	10	242318	242327	0 %	80 %	0 %	20 %	532354305
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5245	NC_022111	T	6	6	242495	242500	0 %	100 %	0 %	0 %	532354305
5246	NC_022111	TA	3	6	242515	242520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_022111	T	6	6	242537	242542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_022111	ATA	2	6	242572	242577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_022111	AGTT	2	8	242621	242628	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_022111	ATA	2	6	242644	242649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5251	NC_022111	TTA	2	6	242744	242749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_022111	ATAGC	2	10	242779	242788	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5253	NC_022111	CAG	2	6	242819	242824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5254	NC_022111	AGG	2	6	242836	242841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_022111	ATG	2	6	242850	242855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_022111	A	6	6	242885	242890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_022111	TAT	3	9	242927	242935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_022111	AAC	2	6	243043	243048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354306
5259	NC_022111	ATA	2	6	243104	243109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354306
5260	NC_022111	TTTCT	2	10	243115	243124	0 %	80 %	0 %	20 %	532354306
5261	NC_022111	AAGA	2	8	243241	243248	75 %	0 %	25 %	0 %	532354306
5262	NC_022111	TCG	2	6	243274	243279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532354306
5263	NC_022111	TGC	2	6	243331	243336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532354306
5264	NC_022111	CA	3	6	243453	243458	50 %	0 %	0 %	50 %	532354306
5265	NC_022111	GAT	2	6	243544	243549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354306
5266	NC_022111	GGC	2	6	243553	243558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532354306
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5270	NC_022111	TGT	2	6	243671	243676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354306
5271	NC_022111	AGTG	2	8	243697	243704	25 %	25 %	50 %	0 %	532354306
5272	NC_022111	GAT	2	6	243748	243753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354306
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5279	NC_022111	CAT	2	6	244148	244153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354307
5280	NC_022111	ATTG	2	8	244189	244196	25 %	50 %	25 %	0 %	532354307
5281	NC_022111	TTGTGG	2	12	244273	244284	0 %	50 %	50 %	0 %	532354307
5282	NC_022111	GT	3	6	244375	244380	0 %	50 %	50 %	0 %	532354307
5283	NC_022111	TGT	2	6	244388	244393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354307
5284	NC_022111	GTT	2	6	244419	244424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354307
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5291	NC_022111	CAA	2	6	244916	244921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354307
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5310	NC_022111	AGA	2	6	245800	245805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354309
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5323	NC_022111	CATT	2	8	246373	246380	25 %	50 %	0 %	25 %	532354310
5324	NC_022111	T	6	6	246379	246384	0 %	100 %	0 %	0 %	532354310
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5328	NC_022111	ATC	2	6	246702	246707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354310
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5332	NC_022111	CATAT	2	10	246865	246874	40 %	40 %	0 %	20 %	532354310
5333	NC_022111	A	6	6	246887	246892	100 %	0 %	0 %	0 %	532354310
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5342	NC_022111	TTGG	2	8	247151	247158	0 %	50 %	50 %	0 %	532354310
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5350	NC_022111	TA	3	6	247597	247602	50 %	50 %	0 %	0 %	532354310
5351	NC_022111	AAAT	2	8	247621	247628	75 %	25 %	0 %	0 %	532354310
5352	NC_022111	GAAA	2	8	247633	247640	75 %	0 %	25 %	0 %	532354310
5353	NC_022111	AAG	2	6	247678	247683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354310
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5355	NC_022111	TAAA	2	8	247723	247730	75 %	25 %	0 %	0 %	532354310
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5364	NC_022111	GTT	2	6	248055	248060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354310
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5367	NC_022111	GAA	2	6	248181	248186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354310
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5370	NC_022111	GCA	2	6	248286	248291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354310
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5443	NC_022111	GA	3	6	251444	251449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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