MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paracoccus aminophilus JCM 7686 plasmid pAMI5

Total Repeats: 6483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022043	GGC	2	6	154216	154221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320627
3502	NC_022043	CTG	2	6	154226	154231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320627
3503	NC_022043	CGA	2	6	154400	154405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320628
3504	NC_022043	TCG	2	6	154420	154425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320628
3505	NC_022043	TCA	2	6	154457	154462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320628
3506	NC_022043	GCGA	2	8	154582	154589	25 %	0 %	50 %	25 %	530320628
3507	NC_022043	TCA	2	6	154610	154615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320628
3508	NC_022043	GCT	3	9	154661	154669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320628
3509	NC_022043	ACC	2	6	154768	154773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530320628
3510	NC_022043	AGGC	2	8	154782	154789	25 %	0 %	50 %	25 %	530320628
3511	NC_022043	CAT	2	6	154854	154859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320628
3512	NC_022043	TTG	2	6	154870	154875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530320628
3513	NC_022043	TCG	2	6	154894	154899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320628
3514	NC_022043	CGC	2	6	154910	154915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320628
3515	NC_022043	ACC	2	6	154926	154931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530320628
3516	NC_022043	AGC	2	6	155071	155076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320628
3517	NC_022043	CGG	2	6	155132	155137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320628
3518	NC_022043	TCCTC	2	10	155163	155172	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3519	NC_022043	TCTT	2	8	155270	155277	0 %	75 %	0 %	25 %	530320629
3520	NC_022043	GTTGCC	2	12	155299	155310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320629
3521	NC_022043	GAG	2	6	155348	155353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530320629
3522	NC_022043	CCG	2	6	155423	155428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320629
3523	NC_022043	GCT	2	6	155445	155450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320629
3524	NC_022043	GTC	2	6	155473	155478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320629
3525	NC_022043	CGC	2	6	155505	155510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320629
3526	NC_022043	CCGC	2	8	155522	155529	0 %	0 %	25 %	75 %	530320629
3527	NC_022043	ATC	2	6	155537	155542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320629
3528	NC_022043	GCA	2	6	155646	155651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320629
3529	NC_022043	CG	3	6	155652	155657	0 %	0 %	50 %	50 %	530320629
3530	NC_022043	CGG	2	6	155688	155693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320629
3531	NC_022043	CGT	2	6	155718	155723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320629
3532	NC_022043	CGA	2	6	155806	155811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320629
3533	NC_022043	TTG	2	6	155855	155860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530320629
3534	NC_022043	CAG	2	6	155989	155994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320629
3535	NC_022043	CCAGCG	2	12	156114	156125	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	530320629
3536	NC_022043	GGT	2	6	156238	156243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530320629
3537	NC_022043	GCC	2	6	156253	156258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320629
3538	NC_022043	CCG	2	6	156270	156275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320629
3539	NC_022043	CTG	2	6	156295	156300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320629
3540	NC_022043	TCG	2	6	156317	156322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320629
3541	NC_022043	AGC	2	6	156378	156383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320629
3542	NC_022043	AGC	2	6	156405	156410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320629
3543	NC_022043	GTC	2	6	156433	156438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320629
3544	NC_022043	T	6	6	156472	156477	0 %	100 %	0 %	0 %	530320629
3545	NC_022043	CTG	2	6	156490	156495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320629
3546	NC_022043	GTC	2	6	156551	156556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320629
3547	NC_022043	CGCC	2	8	156570	156577	0 %	0 %	25 %	75 %	530320629
3548	NC_022043	TTC	2	6	156590	156595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530320629
3549	NC_022043	GC	3	6	156601	156606	0 %	0 %	50 %	50 %	530320629
3550	NC_022043	CGA	2	6	156699	156704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320629
3551	NC_022043	TTG	2	6	156821	156826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530320629
3552	NC_022043	GCG	2	6	156865	156870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320629
3553	NC_022043	CGG	2	6	156892	156897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320629
3554	NC_022043	CGG	2	6	156912	156917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320629
3555	NC_022043	CAG	2	6	156994	156999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320629
3556	NC_022043	TC	3	6	157030	157035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3557	NC_022043	AGGC	2	8	157040	157047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3558	NC_022043	ATT	2	6	157080	157085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530320630
3559	NC_022043	T	6	6	157084	157089	0 %	100 %	0 %	0 %	530320630
3560	NC_022043	CGCC	2	8	157140	157147	0 %	0 %	25 %	75 %	530320630
3561	NC_022043	GAT	2	6	157288	157293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320630
3562	NC_022043	CGG	2	6	157333	157338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320630
3563	NC_022043	GCC	2	6	157366	157371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320630
3564	NC_022043	ATG	2	6	157391	157396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320630
3565	NC_022043	GCCG	2	8	157507	157514	0 %	0 %	50 %	50 %	530320630
3566	NC_022043	GTC	2	6	157578	157583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320630
3567	NC_022043	TGGC	2	8	157593	157600	0 %	25 %	50 %	25 %	530320630
3568	NC_022043	TGATC	2	10	157652	157661	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3569	NC_022043	GC	4	8	157760	157767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_022043	CGGTC	2	10	157776	157785	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3571	NC_022043	CCT	2	6	157813	157818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_022043	ATT	2	6	157874	157879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_022043	T	6	6	157933	157938	0 %	100 %	0 %	0 %	530320631
3574	NC_022043	G	6	6	158035	158040	0 %	0 %	100 %	0 %	530320631
3575	NC_022043	TGC	2	6	158048	158053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320631
3576	NC_022043	TGCCG	2	10	158092	158101	0 %	20 %	40 %	40 %	530320631
3577	NC_022043	GC	4	8	158278	158285	0 %	0 %	50 %	50 %	530320631
3578	NC_022043	GCA	2	6	158292	158297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320631
3579	NC_022043	TGC	2	6	158316	158321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320631
3580	NC_022043	CGC	2	6	158337	158342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320631
3581	NC_022043	CG	3	6	158379	158384	0 %	0 %	50 %	50 %	530320631
3582	NC_022043	GAT	2	6	158481	158486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320631
3583	NC_022043	GGC	2	6	158497	158502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320631
3584	NC_022043	GC	3	6	158550	158555	0 %	0 %	50 %	50 %	530320631
3585	NC_022043	GGC	2	6	158579	158584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320631
3586	NC_022043	GCG	2	6	158597	158602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320631
3587	NC_022043	GAA	2	6	158694	158699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530320632
3588	NC_022043	CGC	2	6	158712	158717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320632
3589	NC_022043	GACCA	2	10	158718	158727	40 %	0 %	20 %	40 %	530320632
3590	NC_022043	AATC	2	8	158756	158763	50 %	25 %	0 %	25 %	530320632
3591	NC_022043	GCA	2	6	158774	158779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320632
3592	NC_022043	GTC	2	6	158839	158844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320632
3593	NC_022043	TGCG	2	8	158851	158858	0 %	25 %	50 %	25 %	530320632
3594	NC_022043	GAC	2	6	158890	158895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320632
3595	NC_022043	AGG	2	6	158981	158986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530320632
3596	NC_022043	ACC	2	6	159028	159033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530320632
3597	NC_022043	GC	3	6	159063	159068	0 %	0 %	50 %	50 %	530320632
3598	NC_022043	CGC	2	6	159099	159104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320632
3599	NC_022043	CGC	2	6	159110	159115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320632
3600	NC_022043	ATG	2	6	159232	159237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320632
3601	NC_022043	CGC	2	6	159314	159319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320632
3602	NC_022043	AGC	2	6	159352	159357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320632
3603	NC_022043	GAC	2	6	159368	159373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320632
3604	NC_022043	CGC	2	6	159377	159382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320632
3605	NC_022043	GC	3	6	159409	159414	0 %	0 %	50 %	50 %	530320632
3606	NC_022043	TCT	2	6	159477	159482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_022043	GAAAT	2	10	159581	159590	60 %	20 %	20 %	0 %	530320633
3608	NC_022043	GCC	2	6	159597	159602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320633
3609	NC_022043	CCCGG	2	10	159651	159660	0 %	0 %	40 %	60 %	530320633
3610	NC_022043	CAG	2	6	159673	159678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320633
3611	NC_022043	TCA	2	6	159704	159709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320633
3612	NC_022043	GAC	2	6	159727	159732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320633
3613	NC_022043	CG	3	6	159795	159800	0 %	0 %	50 %	50 %	530320633
3614	NC_022043	GCT	2	6	159882	159887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320633
3615	NC_022043	CCCG	2	8	159892	159899	0 %	0 %	25 %	75 %	530320633
3616	NC_022043	GC	4	8	159903	159910	0 %	0 %	50 %	50 %	530320633
3617	NC_022043	GCA	2	6	159996	160001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320633
3618	NC_022043	CGCGG	2	10	160082	160091	0 %	0 %	60 %	40 %	530320633
3619	NC_022043	CCCGC	2	10	160107	160116	0 %	0 %	20 %	80 %	530320633
3620	NC_022043	GC	3	6	160236	160241	0 %	0 %	50 %	50 %	530320633
3621	NC_022043	GCG	2	6	160284	160289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320633
3622	NC_022043	TCG	2	6	160421	160426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320634
3623	NC_022043	GCC	2	6	160474	160479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320634
3624	NC_022043	GACC	2	8	160483	160490	25 %	0 %	25 %	50 %	530320634
3625	NC_022043	GCG	2	6	160551	160556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320634
3626	NC_022043	GTCCTT	2	12	160576	160587	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	530320634
3627	NC_022043	CG	3	6	160596	160601	0 %	0 %	50 %	50 %	530320634
3628	NC_022043	AGCG	2	8	160603	160610	25 %	0 %	50 %	25 %	530320634
3629	NC_022043	ACC	2	6	160688	160693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530320634
3630	NC_022043	GTA	2	6	160705	160710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320634
3631	NC_022043	CGC	2	6	160801	160806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320634
3632	NC_022043	GC	3	6	160815	160820	0 %	0 %	50 %	50 %	530320634
3633	NC_022043	CCT	2	6	160968	160973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530320634
3634	NC_022043	CG	3	6	161017	161022	0 %	0 %	50 %	50 %	530320634
3635	NC_022043	CG	3	6	161158	161163	0 %	0 %	50 %	50 %	530320634
3636	NC_022043	GCC	2	6	161173	161178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320634
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3639	NC_022043	TGA	2	6	161232	161237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320634
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3641	NC_022043	CTG	2	6	161333	161338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3642	NC_022043	GAC	3	9	161443	161451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320635
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3644	NC_022043	CGG	2	6	161514	161519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320635
3645	NC_022043	CG	3	6	161649	161654	0 %	0 %	50 %	50 %	530320635
3646	NC_022043	CGG	2	6	161676	161681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320635
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3648	NC_022043	GAT	2	6	161776	161781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320635
3649	NC_022043	CG	3	6	161799	161804	0 %	0 %	50 %	50 %	530320635
3650	NC_022043	ATCG	2	8	161833	161840	25 %	25 %	25 %	25 %	530320635
3651	NC_022043	AAG	2	6	161849	161854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530320635
3652	NC_022043	CGC	2	6	161935	161940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320635
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3655	NC_022043	CAGC	2	8	161985	161992	25 %	0 %	25 %	50 %	530320635
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3663	NC_022043	CG	4	8	162134	162141	0 %	0 %	50 %	50 %	530320636
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3689	NC_022043	AGATC	2	10	163613	163622	40 %	20 %	20 %	20 %	530320637
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3703	NC_022043	GTG	2	6	164442	164447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3742	NC_022043	TGA	2	6	166121	166126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320638
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3744	NC_022043	GCG	2	6	166236	166241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320638
3745	NC_022043	ATC	2	6	166261	166266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320638
3746	NC_022043	TCG	2	6	166291	166296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320638
3747	NC_022043	ACC	2	6	166318	166323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530320638
3748	NC_022043	TTG	2	6	166345	166350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530320638
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3783	NC_022043	TGG	2	6	168102	168107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530320640
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3795	NC_022043	GGC	2	6	168391	168396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3796	NC_022043	GTC	2	6	168442	168447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3822	NC_022043	TATAT	2	10	169964	169973	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3823	NC_022043	CTCCG	2	10	170015	170024	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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3826	NC_022043	GGACC	2	10	170081	170090	20 %	0 %	40 %	40 %	530320643
3827	NC_022043	G	7	7	170149	170155	0 %	0 %	100 %	0 %	530320643
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3837	NC_022043	TGAC	2	8	170530	170537	25 %	25 %	25 %	25 %	530320644
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3846	NC_022043	GA	3	6	170824	170829	50 %	0 %	50 %	0 %	530320644
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3861	NC_022043	TC	3	6	171275	171280	0 %	50 %	0 %	50 %	530320644
3862	NC_022043	GGC	4	12	171326	171337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320644
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3865	NC_022043	TGG	2	6	171699	171704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530320644
3866	NC_022043	GC	3	6	171724	171729	0 %	0 %	50 %	50 %	530320644
3867	NC_022043	GCC	2	6	171775	171780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320644
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3869	NC_022043	CTTC	2	8	171848	171855	0 %	50 %	0 %	50 %	530320644
3870	NC_022043	GATC	2	8	171857	171864	25 %	25 %	25 %	25 %	530320644
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3993	NC_022043	GCC	2	6	176930	176935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320648
3994	NC_022043	CGA	2	6	176941	176946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320648
3995	NC_022043	GCCA	2	8	177033	177040	25 %	0 %	25 %	50 %	530320648
3996	NC_022043	AAC	2	6	177120	177125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530320648
3997	NC_022043	GTG	2	6	177141	177146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530320648
3998	NC_022043	GGCGAT	2	12	177152	177163	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	530320648
3999	NC_022043	GATCAG	2	12	177197	177208	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	530320648
4000	NC_022043	CGG	2	6	177252	177257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320648

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