MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Psychrobacter sp. G plasmid PsyG_3

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021669	AG	3	6	5	10	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021669	TAA	2	6	60	65	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021669	CAATA	2	10	203	212	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021669	CA	3	6	227	232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021669	T	6	6	359	364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021669	ATG	2	6	377	382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021669	TGA	2	6	405	410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021669	CAAG	2	8	444	451	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021669	AAGA	2	8	506	513	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021669	GAA	2	6	521	526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021669	AC	3	6	542	547	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021669	GAC	2	6	560	565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021669	GCT	2	6	590	595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021669	CAG	2	6	688	693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021669	TAGAC	2	10	715	724	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021669	TA	3	6	761	766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021669	AAAAAC	2	12	783	794	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021669	AAG	2	6	828	833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021669	GCG	2	6	894	899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021669	ACT	2	6	1021	1026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021669	ATT	2	6	1038	1043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021669	ACA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	521206440
23	NC_021669	TTA	2	6	1120	1125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	521206440
24	NC_021669	GCG	2	6	1155	1160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	521206440
25	NC_021669	T	6	6	1207	1212	0 %	100 %	0 %	0 %	521206440
26	NC_021669	TAC	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521206440
27	NC_021669	T	6	6	1225	1230	0 %	100 %	0 %	0 %	521206440
28	NC_021669	TAT	2	6	1347	1352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	521206441
29	NC_021669	CTT	2	6	1377	1382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	521206441
30	NC_021669	GAT	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	521206441
31	NC_021669	TCT	2	6	1440	1445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	521206441
32	NC_021669	ATGA	2	8	1459	1466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021669	A	6	6	1493	1498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021669	CAGT	2	8	1633	1640	25 %	25 %	25 %	25 %	521206442
35	NC_021669	GCT	2	6	1715	1720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	521206442
36	NC_021669	TCTACT	2	12	1750	1761	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	521206442
37	NC_021669	TTTTGG	2	12	1779	1790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	521206442
38	NC_021669	CTT	2	6	1823	1828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	521206442
39	NC_021669	ATC	2	6	1965	1970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521206442
40	NC_021669	GCC	2	6	1986	1991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	521206442
41	NC_021669	GAT	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	521206442
42	NC_021669	CAT	2	6	2057	2062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521206442
43	NC_021669	AAG	2	6	2106	2111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	521206442
44	NC_021669	A	6	6	2130	2135	100 %	0 %	0 %	0 %	521206442
45	NC_021669	ATC	2	6	2205	2210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521206442
46	NC_021669	TCA	2	6	2228	2233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	521206442
47	NC_021669	TAG	2	6	2503	2508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021669	TAG	2	6	2517	2522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021669	GAA	2	6	2546	2551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021669	GAA	2	6	2567	2572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021669	GAA	2	6	2589	2594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021669	GAA	2	6	2610	2615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021669	AT	3	6	2719	2724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021669	ATA	2	6	2730	2735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021669	A	6	6	2744	2749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021669	TA	3	6	2806	2811	50 %	50 %	0 %	0 %	521206443
57	NC_021669	TAA	2	6	2839	2844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	521206443
58	NC_021669	CCA	2	6	3077	3082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	521206443
59	NC_021669	CAC	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	521206443
60	NC_021669	TC	3	6	3110	3115	0 %	50 %	0 %	50 %	521206443
61	NC_021669	CAG	2	6	3141	3146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	521206443
62	NC_021669	TTA	2	6	3206	3211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	521206443
63	NC_021669	ATT	2	6	3215	3220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	521206443
64	NC_021669	ATCT	2	8	3224	3231	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021669	AGT	2	6	3243	3248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021669	TAT	2	6	3309	3314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021669	AAT	2	6	3320	3325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021669	AC	3	6	3330	3335	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021669	ATTGT	2	10	3336	3345	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021669	AC	4	8	3460	3467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021669	CTA	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021669	TG	3	6	3503	3508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021669	C	6	6	3530	3535	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74	NC_021669	C	6	6	3540	3545	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75	NC_021669	TCAG	2	8	3565	3572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021669	A	6	6	3592	3597	100 %	0 %	0 %	0 %	521206444
77	NC_021669	CAAT	2	8	3829	3836	50 %	25 %	0 %	25 %	521206444
78	NC_021669	GAATT	2	10	3838	3847	40 %	40 %	20 %	0 %	521206444
79	NC_021669	GTG	2	6	3917	3922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.