MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida NBRC 14164 DNA

Total Repeats: 132394

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021505	AGGA	2	8	170171	170178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_021505	ACC	2	6	170197	170202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_021505	GAA	2	6	170436	170441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_021505	TGC	2	6	170512	170517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_021505	GTC	2	6	170524	170529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_021505	TCGTG	2	10	170533	170542	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3507	NC_021505	TGG	2	6	170602	170607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_021505	GGA	2	6	170638	170643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_021505	TCA	2	6	170663	170668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_021505	AC	3	6	170689	170694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_021505	AC	3	6	170858	170863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3512	NC_021505	GGA	2	6	170918	170923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_021505	CCT	2	6	170999	171004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_021505	CGA	2	6	171009	171014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_021505	CTG	2	6	171022	171027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_021505	GCCT	2	8	171220	171227	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3517	NC_021505	AGG	2	6	171235	171240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_021505	CCA	2	6	171265	171270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_021505	TGA	2	6	171319	171324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_021505	CTG	2	6	171403	171408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_021505	GTC	2	6	171476	171481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_021505	GAA	2	6	171523	171528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_021505	CAGC	2	8	171644	171651	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_021505	TAG	2	6	171754	171759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_021505	GCGA	2	8	171762	171769	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3526	NC_021505	G	6	6	171911	171916	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_021505	TCC	2	6	171921	171926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_021505	TAC	2	6	171936	171941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_021505	TGAC	2	8	171942	171949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3530	NC_021505	ACTG	2	8	172222	172229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3531	NC_021505	ACCGA	2	10	172234	172243	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3532	NC_021505	AC	3	6	172447	172452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3533	NC_021505	CGTC	2	8	172465	172472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_021505	AAC	2	6	172484	172489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_021505	AGG	2	6	172558	172563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_021505	AGC	2	6	172574	172579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_021505	AAAG	2	8	172588	172595	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_021505	AGTCG	2	10	172610	172619	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3539	NC_021505	GTTG	2	8	172955	172962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_021505	GGT	2	6	172974	172979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_021505	TGA	2	6	173023	173028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_021505	CGA	2	6	173044	173049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_021505	GGT	2	6	173124	173129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_021505	GA	3	6	173154	173159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_021505	TTA	2	6	173280	173285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_021505	CGG	2	6	173404	173409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_021505	GGC	2	6	173485	173490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_021505	TGAAAT	2	12	173513	173524	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_021505	ACC	2	6	173675	173680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_021505	TGG	2	6	173735	173740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_021505	TCC	2	6	173761	173766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3552	NC_021505	GGA	2	6	173778	173783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_021505	GC	3	6	173839	173844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_021505	AC	4	8	173856	173863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3555	NC_021505	GGT	2	6	173898	173903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_021505	CGG	2	6	173985	173990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_021505	TCA	2	6	174013	174018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_021505	CGT	2	6	174093	174098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_021505	GCT	2	6	174147	174152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_021505	ACG	2	6	174328	174333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_021505	GT	3	6	174346	174351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_021505	GGT	2	6	174440	174445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_021505	GAT	2	6	174449	174454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_021505	CAA	2	6	174471	174476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_021505	GAC	2	6	174544	174549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_021505	ACC	2	6	174564	174569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3567	NC_021505	ATCCC	2	10	174572	174581	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3568	NC_021505	AGT	2	6	174588	174593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_021505	CA	3	6	174754	174759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_021505	GAC	2	6	174769	174774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_021505	ACC	2	6	174789	174794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_021505	ATCCC	2	10	174797	174806	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3573	NC_021505	CAG	2	6	174812	174817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_021505	CAG	2	6	174990	174995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_021505	TTTCA	2	10	175000	175009	20 %	60 %	0 %	20 %	512683211
3576	NC_021505	GTT	2	6	175106	175111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683211
3577	NC_021505	AAC	2	6	175179	175184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512683211
3578	NC_021505	TTG	2	6	175347	175352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683211
3579	NC_021505	GCC	2	6	175415	175420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683211
3580	NC_021505	CAG	2	6	175421	175426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683211
3581	NC_021505	CTCCAG	2	12	175457	175468	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512683211
3582	NC_021505	GCT	2	6	175516	175521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683211
3583	NC_021505	GCGG	2	8	175636	175643	0 %	0 %	75 %	25 %	512683211
3584	NC_021505	GTG	2	6	175740	175745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683211
3585	NC_021505	TCC	2	6	175791	175796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512683211
3586	NC_021505	CCA	2	6	175852	175857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683211
3587	NC_021505	AC	3	6	175870	175875	50 %	0 %	0 %	50 %	512683211
3588	NC_021505	TGC	2	6	175881	175886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683211
3589	NC_021505	CAG	3	9	176021	176029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683211
3590	NC_021505	GT	3	6	176031	176036	0 %	50 %	50 %	0 %	512683211
3591	NC_021505	GCA	2	6	176065	176070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683211
3592	NC_021505	GAT	2	6	176078	176083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683211
3593	NC_021505	TCG	2	6	176100	176105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683211
3594	NC_021505	CCG	2	6	176106	176111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683211
3595	NC_021505	CTG	2	6	176261	176266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683211
3596	NC_021505	GAA	2	6	176303	176308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683211
3597	NC_021505	GCA	2	6	176341	176346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683211
3598	NC_021505	TGC	2	6	176391	176396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683211
3599	NC_021505	TTC	2	6	176468	176473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683211
3600	NC_021505	TTG	2	6	176475	176480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683211
3601	NC_021505	CTT	2	6	176636	176641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683211
3602	NC_021505	GGT	2	6	176642	176647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683211
3603	NC_021505	C	6	6	176661	176666	0 %	0 %	0 %	100 %	512683211
3604	NC_021505	CGT	2	6	176812	176817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683211
3605	NC_021505	TG	3	6	176850	176855	0 %	50 %	50 %	0 %	512683211
3606	NC_021505	ATC	2	6	176924	176929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683211
3607	NC_021505	CTG	2	6	176933	176938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683211
3608	NC_021505	ACC	2	6	176946	176951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683211
3609	NC_021505	CCA	2	6	176971	176976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683211
3610	NC_021505	TGC	2	6	177031	177036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683211
3611	NC_021505	GGC	2	6	177089	177094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683211
3612	NC_021505	CTGA	2	8	177134	177141	25 %	25 %	25 %	25 %	512683211
3613	NC_021505	GCGA	2	8	177269	177276	25 %	0 %	50 %	25 %	512683211
3614	NC_021505	GGCC	2	8	177301	177308	0 %	0 %	50 %	50 %	512683211
3615	NC_021505	ATGGC	2	10	177408	177417	20 %	20 %	40 %	20 %	512683211
3616	NC_021505	TGA	2	6	177510	177515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3618	NC_021505	GCA	2	6	177655	177660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683212
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3620	NC_021505	TCG	2	6	177723	177728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683212
3621	NC_021505	GC	3	6	177856	177861	0 %	0 %	50 %	50 %	512683212
3622	NC_021505	GCC	2	6	177887	177892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683212
3623	NC_021505	CAG	2	6	178010	178015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683212
3624	NC_021505	TCA	3	9	178060	178068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683212
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3626	NC_021505	CCGGTG	2	12	178185	178196	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512683212
3627	NC_021505	GCCA	2	8	178239	178246	25 %	0 %	25 %	50 %	512683212
3628	NC_021505	CCA	2	6	178258	178263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683212
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3632	NC_021505	GCTG	2	8	178312	178319	0 %	25 %	50 %	25 %	512683212
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3667	NC_021505	T	6	6	180067	180072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3749	NC_021505	GCA	2	6	183964	183969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683218
3750	NC_021505	TGGC	2	8	183971	183978	0 %	25 %	50 %	25 %	512683218
3751	NC_021505	CCTT	2	8	183996	184003	0 %	50 %	0 %	50 %	512683218
3752	NC_021505	CGA	2	6	184018	184023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683218
3753	NC_021505	TCT	2	6	184045	184050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683218
3754	NC_021505	GAC	2	6	184059	184064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683218
3755	NC_021505	GCCTT	2	10	184071	184080	0 %	40 %	20 %	40 %	512683218
3756	NC_021505	TCG	2	6	184095	184100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683218
3757	NC_021505	GAA	2	6	184136	184141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683218
3758	NC_021505	TTG	2	6	184200	184205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683218
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3762	NC_021505	CCA	2	6	184388	184393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683219
3763	NC_021505	CAG	2	6	184398	184403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683219
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3765	NC_021505	GCT	2	6	184460	184465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683219
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3768	NC_021505	GC	3	6	184541	184546	0 %	0 %	50 %	50 %	512683219
3769	NC_021505	GCC	2	6	184572	184577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683219
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3772	NC_021505	CAG	2	6	184818	184823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683219
3773	NC_021505	GCC	2	6	184827	184832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683219
3774	NC_021505	CGA	2	6	184850	184855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683219
3775	NC_021505	GAT	2	6	184896	184901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683219
3776	NC_021505	TTC	2	6	184939	184944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683219
3777	NC_021505	CTG	2	6	184956	184961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683219
3778	NC_021505	CTC	2	6	185031	185036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512683219
3779	NC_021505	CAT	2	6	185061	185066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683219
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3781	NC_021505	GCAA	2	8	185110	185117	50 %	0 %	25 %	25 %	512683219
3782	NC_021505	CCA	2	6	185171	185176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683219
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3790	NC_021505	ATG	2	6	185539	185544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683219
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3794	NC_021505	CAC	2	6	185853	185858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683219
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3804	NC_021505	CCCAG	2	10	186143	186152	20 %	0 %	20 %	60 %	512683219
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3816	NC_021505	TGG	2	6	186468	186473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683220
3817	NC_021505	GTGGG	2	10	186474	186483	0 %	20 %	80 %	0 %	512683220
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3821	NC_021505	ACG	2	6	186556	186561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3823	NC_021505	CAG	2	6	186704	186709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3824	NC_021505	AGTG	2	8	186729	186736	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3825	NC_021505	GCC	2	6	186738	186743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3826	NC_021505	GATC	2	8	186747	186754	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3827	NC_021505	TTG	2	6	186784	186789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3828	NC_021505	CAT	2	6	186878	186883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3829	NC_021505	TCTG	2	8	186916	186923	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3830	NC_021505	GGC	2	6	187124	187129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3831	NC_021505	GCA	2	6	187136	187141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3832	NC_021505	AAGC	2	8	187189	187196	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3833	NC_021505	GAT	2	6	187201	187206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3834	NC_021505	ACATT	2	10	187259	187268	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3835	NC_021505	ATC	2	6	187368	187373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3836	NC_021505	AGC	2	6	187453	187458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683221
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3838	NC_021505	CTG	2	6	187546	187551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683221
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3842	NC_021505	CGG	3	9	187794	187802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683221
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3846	NC_021505	GGGCT	2	10	187885	187894	0 %	20 %	60 %	20 %	512683221
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3850	NC_021505	GTC	2	6	188083	188088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683221
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3852	NC_021505	ACC	2	6	188215	188220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683221
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3862	NC_021505	GTGACC	2	12	188983	188994	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512683221
3863	NC_021505	ACA	2	6	189077	189082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512683221
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3865	NC_021505	ACC	2	6	189190	189195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683221
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3991	NC_021505	GGT	2	6	194730	194735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683221
3992	NC_021505	GGC	2	6	194860	194865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683221
3993	NC_021505	AAC	2	6	194866	194871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512683221
3994	NC_021505	CCG	2	6	194900	194905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683221
3995	NC_021505	CAA	2	6	194994	194999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512683221
3996	NC_021505	GC	3	6	195032	195037	0 %	0 %	50 %	50 %	512683221
3997	NC_021505	TGA	2	6	195060	195065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683221
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4000	NC_021505	ACC	2	6	195181	195186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683221

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