MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida NBRC 14164 DNA

Total Repeats: 132394

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_021505	CTGG	2	8	914961	914968	0 %	25 %	50 %	25 %	512683846
19503	NC_021505	GTAGCC	2	12	914976	914987	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512683846
19504	NC_021505	CGG	2	6	915038	915043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683846
19505	NC_021505	TGG	2	6	915047	915052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683846
19506	NC_021505	CCAGGG	2	12	915053	915064	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512683846
19507	NC_021505	GTC	2	6	915084	915089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683846
19508	NC_021505	CGG	2	6	915101	915106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683846
19509	NC_021505	GCA	2	6	915107	915112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683846
19510	NC_021505	TCG	2	6	915124	915129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683846
19511	NC_021505	GGC	2	6	915153	915158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683846
19512	NC_021505	CGGC	2	8	915167	915174	0 %	0 %	50 %	50 %	512683846
19513	NC_021505	CAGC	2	8	915230	915237	25 %	0 %	25 %	50 %	512683846
19514	NC_021505	TTG	2	6	915265	915270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683846
19515	NC_021505	GT	3	6	915334	915339	0 %	50 %	50 %	0 %	512683846
19516	NC_021505	ACC	2	6	915408	915413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683846
19517	NC_021505	AGAA	2	8	915414	915421	75 %	0 %	25 %	0 %	512683846
19518	NC_021505	ATC	2	6	915430	915435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683846
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19520	NC_021505	CGC	2	6	915549	915554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683847
19521	NC_021505	TTGACC	2	12	915614	915625	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512683847
19522	NC_021505	GGC	2	6	915655	915660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683847
19523	NC_021505	CGG	2	6	915690	915695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683847
19524	NC_021505	GCT	2	6	915708	915713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683847
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19526	NC_021505	GTA	2	6	915814	915819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683847
19527	NC_021505	GCC	2	6	915853	915858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683847
19528	NC_021505	GCT	2	6	915901	915906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683847
19529	NC_021505	TGC	2	6	915949	915954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683847
19530	NC_021505	GCTG	2	8	915964	915971	0 %	25 %	50 %	25 %	512683847
19531	NC_021505	GCG	2	6	916025	916030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683847
19532	NC_021505	GGCC	2	8	916068	916075	0 %	0 %	50 %	50 %	512683847
19533	NC_021505	CT	3	6	916126	916131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19534	NC_021505	GAC	2	6	916156	916161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683848
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19536	NC_021505	GCT	2	6	916224	916229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683848
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19539	NC_021505	GCA	2	6	916331	916336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683848
19540	NC_021505	GGCCGT	2	12	916340	916351	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	512683848
19541	NC_021505	CTG	2	6	916386	916391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683848
19542	NC_021505	TACC	2	8	916436	916443	25 %	25 %	0 %	50 %	512683848
19543	NC_021505	GTT	2	6	916461	916466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683848
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19545	NC_021505	CGGG	2	8	916506	916513	0 %	0 %	75 %	25 %	512683848
19546	NC_021505	TGC	2	6	916514	916519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683848
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19552	NC_021505	GC	3	6	916887	916892	0 %	0 %	50 %	50 %	512683848
19553	NC_021505	GAT	2	6	916902	916907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683848
19554	NC_021505	GCTG	2	8	916919	916926	0 %	25 %	50 %	25 %	512683848
19555	NC_021505	TGC	3	9	916930	916938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683848
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19595	NC_021505	C	6	6	918813	918818	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19596	NC_021505	CTT	2	6	918906	918911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19597	NC_021505	C	6	6	919007	919012	0 %	0 %	0 %	100 %	512683850
19598	NC_021505	GGTC	2	8	919125	919132	0 %	25 %	50 %	25 %	512683850
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19842	NC_021505	GGCA	2	8	929291	929298	25 %	0 %	50 %	25 %	512683857
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19856	NC_021505	ATC	2	6	929855	929860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683857
19857	NC_021505	GGT	2	6	929896	929901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683857
19858	NC_021505	GGC	2	6	929910	929915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683857
19859	NC_021505	GCA	2	6	929934	929939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683857
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19862	NC_021505	CCAAA	2	10	930075	930084	60 %	0 %	0 %	40 %	512683857
19863	NC_021505	AG	3	6	930139	930144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19864	NC_021505	AAAT	2	8	930220	930227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19865	NC_021505	A	6	6	930280	930285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19866	NC_021505	T	6	6	930346	930351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19867	NC_021505	GTA	2	6	930467	930472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19869	NC_021505	A	6	6	930705	930710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19870	NC_021505	A	6	6	930727	930732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19871	NC_021505	TG	3	6	930766	930771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19872	NC_021505	GGT	3	9	930772	930780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19873	NC_021505	T	6	6	930780	930785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19874	NC_021505	G	6	6	930838	930843	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19875	NC_021505	GCA	2	6	930854	930859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19878	NC_021505	GTA	3	9	931022	931030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683858
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19888	NC_021505	GTC	2	6	931442	931447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683858
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19892	NC_021505	GTC	2	6	931652	931657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683858
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19961	NC_021505	CGA	2	6	934441	934446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683860
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19963	NC_021505	CAT	2	6	934480	934485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683860
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19966	NC_021505	CGC	2	6	934701	934706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19967	NC_021505	AGC	2	6	934725	934730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19969	NC_021505	GCT	2	6	934800	934805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19970	NC_021505	GAGCA	2	10	934882	934891	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19971	NC_021505	GGGC	2	8	934916	934923	0 %	0 %	75 %	25 %	512683861
19972	NC_021505	GAT	2	6	935011	935016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683861
19973	NC_021505	GGC	2	6	935077	935082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683861
19974	NC_021505	GAA	2	6	935083	935088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683861
19975	NC_021505	CTG	2	6	935312	935317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683861
19976	NC_021505	CGG	2	6	935326	935331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683861
19977	NC_021505	ATG	2	6	935359	935364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683861
19978	NC_021505	CTG	2	6	935401	935406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683862
19979	NC_021505	TGG	2	6	935468	935473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683862
19980	NC_021505	GCT	2	6	935493	935498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683862
19981	NC_021505	GC	4	8	935519	935526	0 %	0 %	50 %	50 %	512683862
19982	NC_021505	TGA	2	6	935547	935552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683862
19983	NC_021505	TGA	2	6	935568	935573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683862
19984	NC_021505	TTC	2	6	935581	935586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683862
19985	NC_021505	CCG	2	6	935587	935592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683862
19986	NC_021505	GCA	2	6	935624	935629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683863
19987	NC_021505	CATG	2	8	935663	935670	25 %	25 %	25 %	25 %	512683863
19988	NC_021505	GGT	2	6	935693	935698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683863
19989	NC_021505	AGC	2	6	935815	935820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683863
19990	NC_021505	TGC	2	6	935845	935850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683863
19991	NC_021505	GGC	2	6	935918	935923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683863
19992	NC_021505	TCA	2	6	935941	935946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683863
19993	NC_021505	GAA	2	6	935978	935983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683863
19994	NC_021505	GCG	2	6	936039	936044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683863
19995	NC_021505	AGC	2	6	936180	936185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19996	NC_021505	GTG	2	6	936196	936201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683864
19997	NC_021505	CAG	2	6	936262	936267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683864
19998	NC_021505	TCC	2	6	936299	936304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512683864
19999	NC_021505	CGC	2	6	936324	936329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683864
20000	NC_021505	CCCG	2	8	936335	936342	0 %	0 %	25 %	75 %	512683864

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