MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida NBRC 14164 DNA

Total Repeats: 132394

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_021505	GTT	2	6	705866	705871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_021505	GAG	2	6	705891	705896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_021505	TGT	2	6	705972	705977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683662
15004	NC_021505	TGT	2	6	705991	705996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683662
15005	NC_021505	GGT	2	6	706010	706015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683662
15006	NC_021505	TCACC	2	10	706054	706063	20 %	20 %	0 %	60 %	512683662
15007	NC_021505	TGC	2	6	706085	706090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683662
15008	NC_021505	GA	3	6	706097	706102	50 %	0 %	50 %	0 %	512683662
15009	NC_021505	GGC	2	6	706103	706108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683662
15010	NC_021505	T	6	6	706202	706207	0 %	100 %	0 %	0 %	512683662
15011	NC_021505	TCA	2	6	706224	706229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683662
15012	NC_021505	GTT	2	6	706315	706320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683662
15013	NC_021505	ATC	2	6	706397	706402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683662
15014	NC_021505	TGC	2	6	706433	706438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683662
15015	NC_021505	TTAA	2	8	706517	706524	50 %	50 %	0 %	0 %	512683662
15016	NC_021505	GGTGAT	2	12	706718	706729	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	512683662
15017	NC_021505	TGC	2	6	706753	706758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683662
15018	NC_021505	GGC	2	6	706769	706774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683662
15019	NC_021505	GAGGT	2	10	706778	706787	20 %	20 %	60 %	0 %	512683662
15020	NC_021505	T	6	6	706816	706821	0 %	100 %	0 %	0 %	512683662
15021	NC_021505	AAC	2	6	706872	706877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512683662
15022	NC_021505	AGCA	2	8	706955	706962	50 %	0 %	25 %	25 %	512683662
15023	NC_021505	TGC	2	6	707020	707025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683662
15024	NC_021505	AC	3	6	707087	707092	50 %	0 %	0 %	50 %	512683662
15025	NC_021505	GAG	2	6	707114	707119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512683662
15026	NC_021505	CG	3	6	707154	707159	0 %	0 %	50 %	50 %	512683662
15027	NC_021505	TGAC	2	8	707167	707174	25 %	25 %	25 %	25 %	512683662
15028	NC_021505	CCA	2	6	707211	707216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683663
15029	NC_021505	ATC	2	6	707273	707278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683663
15030	NC_021505	CCA	2	6	707392	707397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683663
15031	NC_021505	CTG	2	6	707474	707479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683663
15032	NC_021505	ATG	2	6	707490	707495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683663
15033	NC_021505	CAAG	2	8	707557	707564	50 %	0 %	25 %	25 %	512683663
15034	NC_021505	ACGC	2	8	707582	707589	25 %	0 %	25 %	50 %	512683663
15035	NC_021505	GCAA	2	8	707607	707614	50 %	0 %	25 %	25 %	512683663
15036	NC_021505	GCA	2	6	707692	707697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683663
15037	NC_021505	GC	3	6	707704	707709	0 %	0 %	50 %	50 %	512683663
15038	NC_021505	AGC	2	6	707718	707723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683663
15039	NC_021505	GAT	2	6	707747	707752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683663
15040	NC_021505	CCA	2	6	707843	707848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683663
15041	NC_021505	CAG	2	6	707870	707875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683663
15042	NC_021505	CG	3	6	707894	707899	0 %	0 %	50 %	50 %	512683663
15043	NC_021505	G	6	6	707907	707912	0 %	0 %	100 %	0 %	512683663
15044	NC_021505	GGC	2	6	707940	707945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683663
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15048	NC_021505	GCAG	2	8	708042	708049	25 %	0 %	50 %	25 %	512683663
15049	NC_021505	GCATCA	2	12	708064	708075	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512683663
15050	NC_021505	TGC	2	6	708102	708107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683663
15051	NC_021505	TCG	2	6	708117	708122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683663
15052	NC_021505	CAGG	2	8	708159	708166	25 %	0 %	50 %	25 %	512683664
15053	NC_021505	CGT	2	6	708176	708181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683664
15054	NC_021505	CTT	2	6	708189	708194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683664
15055	NC_021505	TGCC	2	8	708270	708277	0 %	25 %	25 %	50 %	512683664
15056	NC_021505	CA	3	6	708336	708341	50 %	0 %	0 %	50 %	512683664
15057	NC_021505	GCA	2	6	708374	708379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683664
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15059	NC_021505	GCC	2	6	708422	708427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683664
15060	NC_021505	CG	3	6	708493	708498	0 %	0 %	50 %	50 %	512683664
15061	NC_021505	TCG	2	6	708544	708549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683664
15062	NC_021505	CGG	2	6	708654	708659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683664
15063	NC_021505	TCG	2	6	708677	708682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683664
15064	NC_021505	ATTGA	2	10	708683	708692	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_021505	T	6	6	708790	708795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15067	NC_021505	GTG	2	6	708834	708839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15068	NC_021505	CGAG	2	8	708853	708860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15069	NC_021505	TGC	2	6	708934	708939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15070	NC_021505	TGC	2	6	708957	708962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15072	NC_021505	CAG	2	6	708980	708985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15096	NC_021505	CCTG	2	8	710249	710256	0 %	25 %	25 %	50 %	512683665
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15105	NC_021505	TTCAAC	2	12	710568	710579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683665
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15110	NC_021505	CAG	2	6	710894	710899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683665
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15118	NC_021505	GCCG	2	8	711315	711322	0 %	0 %	50 %	50 %	512683665
15119	NC_021505	CTA	2	6	711347	711352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683665
15120	NC_021505	AGA	2	6	711418	711423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683665
15121	NC_021505	GGC	2	6	711513	711518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683665
15122	NC_021505	CGA	2	6	711530	711535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683665
15123	NC_021505	GTGG	2	8	711546	711553	0 %	25 %	75 %	0 %	512683665
15124	NC_021505	CGC	2	6	711619	711624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683665
15125	NC_021505	CTA	2	6	711725	711730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683665
15126	NC_021505	TG	3	6	711940	711945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_021505	GCG	2	6	712037	712042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15128	NC_021505	A	6	6	712075	712080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15129	NC_021505	GTT	2	6	712089	712094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15130	NC_021505	GCT	2	6	712106	712111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683666
15131	NC_021505	GTT	2	6	712254	712259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683666
15132	NC_021505	GCA	2	6	712280	712285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683666
15133	NC_021505	CCT	2	6	712343	712348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512683666
15134	NC_021505	TGGGC	2	10	712533	712542	0 %	20 %	60 %	20 %	512683666
15135	NC_021505	TGGCG	2	10	712558	712567	0 %	20 %	60 %	20 %	512683666
15136	NC_021505	CA	3	6	712632	712637	50 %	0 %	0 %	50 %	512683666
15137	NC_021505	CGC	2	6	712676	712681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683666
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15140	NC_021505	CGCTG	2	10	712715	712724	0 %	20 %	40 %	40 %	512683666
15141	NC_021505	GCG	2	6	712726	712731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683666
15142	NC_021505	TTG	2	6	712841	712846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15143	NC_021505	A	9	9	712941	712949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15144	NC_021505	CCG	2	6	712951	712956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15145	NC_021505	T	8	8	712964	712971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15146	NC_021505	GCA	2	6	712995	713000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683667
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15148	NC_021505	GCG	2	6	713025	713030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683667
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15150	NC_021505	CTG	2	6	713108	713113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683667
15151	NC_021505	CAG	2	6	713117	713122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683667
15152	NC_021505	CCG	3	9	713205	713213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683667
15153	NC_021505	TCG	2	6	713214	713219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683667
15154	NC_021505	ACC	2	6	713286	713291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683667
15155	NC_021505	CGT	2	6	713311	713316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683667
15156	NC_021505	CGA	2	6	713383	713388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683667
15157	NC_021505	CCG	2	6	713485	713490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683667
15158	NC_021505	A	6	6	713534	713539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15159	NC_021505	GGC	2	6	713542	713547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15160	NC_021505	GCCTG	2	10	713580	713589	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15161	NC_021505	AGC	2	6	713649	713654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683668
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15181	NC_021505	GC	3	6	714384	714389	0 %	0 %	50 %	50 %	512683668
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15205	NC_021505	G	6	6	715204	715209	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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15226	NC_021505	GCCA	2	8	716844	716851	25 %	0 %	25 %	50 %	512683672
15227	NC_021505	GC	3	6	716891	716896	0 %	0 %	50 %	50 %	512683672
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15232	NC_021505	ATG	2	6	716964	716969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683672
15233	NC_021505	CAG	2	6	716990	716995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683672
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15236	NC_021505	TGGT	2	8	717036	717043	0 %	50 %	50 %	0 %	512683672
15237	NC_021505	CAG	2	6	717074	717079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683672
15238	NC_021505	CG	3	6	717107	717112	0 %	0 %	50 %	50 %	512683672
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15360	NC_021505	GGCC	2	8	721898	721905	0 %	0 %	50 %	50 %	512683675
15361	NC_021505	CTG	2	6	721914	721919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683675
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15363	NC_021505	GCG	2	6	721967	721972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683675
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15370	NC_021505	GCCCG	2	10	722184	722193	0 %	0 %	40 %	60 %	512683675
15371	NC_021505	GAT	2	6	722249	722254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683675
15372	NC_021505	GCT	2	6	722260	722265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683675
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15477	NC_021505	AC	3	6	726806	726811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15478	NC_021505	GCG	2	6	726862	726867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683680
15479	NC_021505	CTT	2	6	726878	726883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683680
15480	NC_021505	TGC	2	6	726904	726909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683680
15481	NC_021505	CTG	2	6	726923	726928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683680
15482	NC_021505	GTC	2	6	727023	727028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683680
15483	NC_021505	AAC	2	6	727051	727056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512683680
15484	NC_021505	CTT	2	6	727082	727087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683680
15485	NC_021505	GCG	2	6	727120	727125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683680
15486	NC_021505	TCG	2	6	727240	727245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683680
15487	NC_021505	GGC	2	6	727368	727373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683680
15488	NC_021505	CCA	3	9	727529	727537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683680
15489	NC_021505	GCG	2	6	727556	727561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683680
15490	NC_021505	AGC	2	6	727594	727599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683680
15491	NC_021505	GCA	2	6	727637	727642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683680
15492	NC_021505	TGGCCA	2	12	727720	727731	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512683680
15493	NC_021505	CCG	2	6	727753	727758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683680
15494	NC_021505	TGC	2	6	727766	727771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683680
15495	NC_021505	CGA	2	6	727814	727819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683680
15496	NC_021505	CAG	2	6	727851	727856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683680
15497	NC_021505	GC	3	6	727874	727879	0 %	0 %	50 %	50 %	512683680
15498	NC_021505	CGGCCT	2	12	727927	727938	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512683680
15499	NC_021505	GTC	2	6	728154	728159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683680
15500	NC_021505	GCTT	2	8	728188	728195	0 %	50 %	25 %	25 %	512683680

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