MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida NBRC 14164 DNA

Total Repeats: 132394

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021505	GCG	2	6	634022	634027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683612
13502	NC_021505	CGA	2	6	634050	634055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683612
13503	NC_021505	C	6	6	634075	634080	0 %	0 %	0 %	100 %	512683612
13504	NC_021505	CGAC	2	8	634100	634107	25 %	0 %	25 %	50 %	512683612
13505	NC_021505	GCT	3	9	634149	634157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683612
13506	NC_021505	CGTT	2	8	634165	634172	0 %	50 %	25 %	25 %	512683612
13507	NC_021505	GCC	2	6	634180	634185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683612
13508	NC_021505	GCC	2	6	634195	634200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683612
13509	NC_021505	CTGG	2	8	634260	634267	0 %	25 %	50 %	25 %	512683612
13510	NC_021505	ACC	2	6	634333	634338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683612
13511	NC_021505	TCACCG	2	12	634355	634366	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512683612
13512	NC_021505	CAGGC	2	10	634385	634394	20 %	0 %	40 %	40 %	512683612
13513	NC_021505	GC	3	6	634411	634416	0 %	0 %	50 %	50 %	512683612
13514	NC_021505	CTG	2	6	634426	634431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683612
13515	NC_021505	GGT	2	6	634438	634443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683612
13516	NC_021505	GGC	2	6	634455	634460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683612
13517	NC_021505	GC	3	6	634463	634468	0 %	0 %	50 %	50 %	512683612
13518	NC_021505	GCT	2	6	634518	634523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683612
13519	NC_021505	GCT	2	6	634566	634571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683612
13520	NC_021505	CGG	2	6	634586	634591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683612
13521	NC_021505	CTG	2	6	634691	634696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683612
13522	NC_021505	GCC	2	6	634712	634717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683612
13523	NC_021505	GCAG	2	8	634728	634735	25 %	0 %	50 %	25 %	512683612
13524	NC_021505	CGA	2	6	634749	634754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683612
13525	NC_021505	GCC	2	6	634776	634781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683612
13526	NC_021505	CTGG	2	8	634798	634805	0 %	25 %	50 %	25 %	512683612
13527	NC_021505	TCG	2	6	634814	634819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683612
13528	NC_021505	AGGGC	2	10	634848	634857	20 %	0 %	60 %	20 %	512683612
13529	NC_021505	GTTC	2	8	634964	634971	0 %	50 %	25 %	25 %	512683613
13530	NC_021505	TGG	2	6	635062	635067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683613
13531	NC_021505	TCG	2	6	635218	635223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683613
13532	NC_021505	CTGG	2	8	635240	635247	0 %	25 %	50 %	25 %	512683613
13533	NC_021505	GCT	2	6	635267	635272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683613
13534	NC_021505	CTT	2	6	635294	635299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683613
13535	NC_021505	CAT	2	6	635360	635365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683613
13536	NC_021505	CGA	2	6	635369	635374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683613
13537	NC_021505	CTGG	2	8	635396	635403	0 %	25 %	50 %	25 %	512683613
13538	NC_021505	TGC	2	6	635479	635484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683614
13539	NC_021505	GGC	2	6	635504	635509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683614
13540	NC_021505	GAG	2	6	635547	635552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512683614
13541	NC_021505	TGC	2	6	635599	635604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683614
13542	NC_021505	GGT	2	6	635633	635638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683614
13543	NC_021505	GC	3	6	635647	635652	0 %	0 %	50 %	50 %	512683614
13544	NC_021505	TGGG	2	8	635700	635707	0 %	25 %	75 %	0 %	512683614
13545	NC_021505	CAAG	2	8	635714	635721	50 %	0 %	25 %	25 %	512683614
13546	NC_021505	GCCTG	2	10	635830	635839	0 %	20 %	40 %	40 %	512683614
13547	NC_021505	GGCCA	2	10	636063	636072	20 %	0 %	40 %	40 %	512683614
13548	NC_021505	TG	3	6	636079	636084	0 %	50 %	50 %	0 %	512683614
13549	NC_021505	GCG	2	6	636121	636126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683614
13550	NC_021505	CAC	2	6	636244	636249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13551	NC_021505	GCCC	2	8	636355	636362	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13552	NC_021505	CGT	2	6	636433	636438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683615
13553	NC_021505	GCC	2	6	636446	636451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683615
13554	NC_021505	CATG	2	8	636484	636491	25 %	25 %	25 %	25 %	512683615
13555	NC_021505	CGA	2	6	636499	636504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683615
13556	NC_021505	CAGC	2	8	636610	636617	25 %	0 %	25 %	50 %	512683615
13557	NC_021505	CTG	2	6	636683	636688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683615
13558	NC_021505	TGG	2	6	636754	636759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683615
13559	NC_021505	GCC	2	6	636797	636802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683615
13560	NC_021505	TGA	2	6	636867	636872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683615
13561	NC_021505	TAC	2	6	636968	636973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683615
13562	NC_021505	GCG	2	6	637062	637067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683616
13563	NC_021505	TGG	2	6	637081	637086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683616
13564	NC_021505	TGG	3	9	637137	637145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683616
13565	NC_021505	CGGCG	2	10	637188	637197	0 %	0 %	60 %	40 %	512683616
13566	NC_021505	GC	3	6	637236	637241	0 %	0 %	50 %	50 %	512683616
13567	NC_021505	TGT	2	6	637325	637330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683616
13568	NC_021505	CGC	2	6	637353	637358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683616
13569	NC_021505	CTG	2	6	637399	637404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683616
13570	NC_021505	GTG	3	9	637417	637425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683616
13571	NC_021505	CTG	2	6	637467	637472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683617
13572	NC_021505	CTG	2	6	637479	637484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683617
13573	NC_021505	GGT	2	6	637526	637531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683617
13574	NC_021505	CGA	2	6	637577	637582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683617
13575	NC_021505	CTG	2	6	637584	637589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683617
13576	NC_021505	CAG	2	6	637618	637623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683617
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13578	NC_021505	GCA	2	6	637886	637891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683617
13579	NC_021505	GGT	2	6	637979	637984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683617
13580	NC_021505	GC	3	6	638010	638015	0 %	0 %	50 %	50 %	512683617
13581	NC_021505	TGC	3	9	638068	638076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683617
13582	NC_021505	CTGG	2	8	638094	638101	0 %	25 %	50 %	25 %	512683617
13583	NC_021505	TGCG	2	8	638143	638150	0 %	25 %	50 %	25 %	512683617
13584	NC_021505	TGG	2	6	638170	638175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683617
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13587	NC_021505	CTT	2	6	638295	638300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683618
13588	NC_021505	TAG	2	6	638312	638317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683618
13589	NC_021505	CAG	2	6	638359	638364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683618
13590	NC_021505	GCTTC	2	10	638373	638382	0 %	40 %	20 %	40 %	512683618
13591	NC_021505	GCC	2	6	638437	638442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683618
13592	NC_021505	TGCGGT	2	12	638445	638456	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512683618
13593	NC_021505	GGTCCA	2	12	638526	638537	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512683618
13594	NC_021505	GCG	2	6	638548	638553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683618
13595	NC_021505	CGG	2	6	638558	638563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683618
13596	NC_021505	GTCACG	2	12	638581	638592	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512683618
13597	NC_021505	GATC	2	8	638595	638602	25 %	25 %	25 %	25 %	512683618
13598	NC_021505	TTG	2	6	638638	638643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683618
13599	NC_021505	ATCGC	2	10	638717	638726	20 %	20 %	20 %	40 %	512683618
13600	NC_021505	GGC	2	6	638757	638762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683618
13601	NC_021505	GCTG	2	8	638775	638782	0 %	25 %	50 %	25 %	512683618
13602	NC_021505	GTA	2	6	638845	638850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683618
13603	NC_021505	CAG	2	6	638893	638898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683618
13604	NC_021505	CAT	2	6	638901	638906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683618
13605	NC_021505	GGT	2	6	638944	638949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683618
13606	NC_021505	GCC	2	6	638953	638958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683618
13607	NC_021505	CTG	2	6	638962	638967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683618
13608	NC_021505	CAG	3	9	639109	639117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683618
13609	NC_021505	GTT	2	6	639118	639123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683618
13610	NC_021505	GTC	2	6	639214	639219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683618
13611	NC_021505	TGC	2	6	639294	639299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683618
13612	NC_021505	CG	3	6	639339	639344	0 %	0 %	50 %	50 %	512683618
13613	NC_021505	TCG	2	6	639347	639352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683618
13614	NC_021505	GGCTCA	2	12	639417	639428	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512683618
13615	NC_021505	TTG	2	6	639440	639445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683618
13616	NC_021505	CGT	2	6	639453	639458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683618
13617	NC_021505	GTCGA	2	10	639488	639497	20 %	20 %	40 %	20 %	512683618
13618	NC_021505	GCCG	2	8	639499	639506	0 %	0 %	50 %	50 %	512683618
13619	NC_021505	TGC	2	6	639588	639593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683618
13620	NC_021505	CGG	2	6	639594	639599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683618
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13633	NC_021505	GCGGT	2	10	640250	640259	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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13656	NC_021505	CGGC	2	8	641264	641271	0 %	0 %	50 %	50 %	512683619
13657	NC_021505	GCCCTT	2	12	641325	641336	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512683619
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13676	NC_021505	GCT	2	6	642292	642297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13722	NC_021505	CCTG	2	8	644395	644402	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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13739	NC_021505	CCA	2	6	645449	645454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683623
13740	NC_021505	AGC	2	6	645472	645477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683623
13741	NC_021505	CAT	2	6	645542	645547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683623
13742	NC_021505	CGTG	2	8	645578	645585	0 %	25 %	50 %	25 %	512683623
13743	NC_021505	GAG	2	6	645597	645602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512683623
13744	NC_021505	TGA	2	6	645637	645642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683623
13745	NC_021505	CAAGGA	2	12	645713	645724	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512683623
13746	NC_021505	CGT	2	6	645725	645730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683623
13747	NC_021505	CGA	2	6	645731	645736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683623
13748	NC_021505	CAG	2	6	645780	645785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683623
13749	NC_021505	GGT	2	6	645797	645802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683623
13750	NC_021505	TG	5	10	645821	645830	0 %	50 %	50 %	0 %	512683623
13751	NC_021505	CA	3	6	645863	645868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13752	NC_021505	GC	3	6	646013	646018	0 %	0 %	50 %	50 %	512683624
13753	NC_021505	ACCCC	2	10	646041	646050	20 %	0 %	0 %	80 %	512683624
13754	NC_021505	AGCG	2	8	646121	646128	25 %	0 %	50 %	25 %	512683624
13755	NC_021505	GAGC	2	8	646195	646202	25 %	0 %	50 %	25 %	512683624
13756	NC_021505	TGC	2	6	646209	646214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683624
13757	NC_021505	TCA	2	6	646239	646244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683624
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13759	NC_021505	TCA	2	6	646296	646301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683624
13760	NC_021505	GAC	2	6	646316	646321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683624
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13762	NC_021505	GT	3	6	646638	646643	0 %	50 %	50 %	0 %	512683624
13763	NC_021505	AC	3	6	646698	646703	50 %	0 %	0 %	50 %	512683624
13764	NC_021505	ACCT	2	8	646745	646752	25 %	25 %	0 %	50 %	512683624
13765	NC_021505	TTC	2	6	646757	646762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683624
13766	NC_021505	TGA	2	6	646786	646791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683624
13767	NC_021505	CTG	2	6	646819	646824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683624
13768	NC_021505	CAG	2	6	646935	646940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13769	NC_021505	GCCGGA	2	12	646941	646952	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13770	NC_021505	GCT	2	6	646971	646976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683625
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13780	NC_021505	GCA	2	6	647295	647300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683625
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13790	NC_021505	GC	3	6	647589	647594	0 %	0 %	50 %	50 %	512683625
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13794	NC_021505	TCT	2	6	647766	647771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683625
13795	NC_021505	TCA	2	6	647847	647852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683625
13796	NC_021505	GAT	2	6	647899	647904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13800	NC_021505	CCAGGC	2	12	648049	648060	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512683626
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13804	NC_021505	TCGG	2	8	648387	648394	0 %	25 %	50 %	25 %	512683626
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13835	NC_021505	GT	3	6	650043	650048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13836	NC_021505	AAG	2	6	650050	650055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13837	NC_021505	CTG	2	6	650063	650068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13839	NC_021505	GCTG	2	8	650196	650203	0 %	25 %	50 %	25 %	512683628
13840	NC_021505	GGC	2	6	650263	650268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683628
13841	NC_021505	CTCG	2	8	650281	650288	0 %	25 %	25 %	50 %	512683628
13842	NC_021505	TGC	2	6	650331	650336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683628
13843	NC_021505	CAG	2	6	650394	650399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683628
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13845	NC_021505	GTC	2	6	650530	650535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683628
13846	NC_021505	GTACC	2	10	650610	650619	20 %	20 %	20 %	40 %	512683628
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13848	NC_021505	CGGCC	2	10	650656	650665	0 %	0 %	40 %	60 %	512683628
13849	NC_021505	CAG	2	6	650674	650679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683628
13850	NC_021505	ACCA	2	8	650774	650781	50 %	0 %	0 %	50 %	512683628
13851	NC_021505	GAA	2	6	650783	650788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683628
13852	NC_021505	GCCG	2	8	650816	650823	0 %	0 %	50 %	50 %	512683628
13853	NC_021505	TCG	2	6	650838	650843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683628
13854	NC_021505	GAC	2	6	650852	650857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683628
13855	NC_021505	CTA	2	6	650899	650904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683628
13856	NC_021505	GC	3	6	650907	650912	0 %	0 %	50 %	50 %	512683628
13857	NC_021505	GAC	2	6	650927	650932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683628
13858	NC_021505	CCA	2	6	650934	650939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683628
13859	NC_021505	GAA	2	6	650968	650973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683628
13860	NC_021505	ACT	2	6	651060	651065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683628
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13867	NC_021505	CAGC	2	8	651271	651278	25 %	0 %	25 %	50 %	512683628
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13890	NC_021505	CGT	2	6	652521	652526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13898	NC_021505	ATCC	2	8	652880	652887	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13979	NC_021505	TGG	2	6	657168	657173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683631
13980	NC_021505	TGC	2	6	657313	657318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683632
13981	NC_021505	TGG	2	6	657376	657381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683632
13982	NC_021505	ATC	3	9	657409	657417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683632
13983	NC_021505	GAA	2	6	657443	657448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683632
13984	NC_021505	AGCTT	2	10	657492	657501	20 %	40 %	20 %	20 %	512683632
13985	NC_021505	GCG	2	6	657504	657509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683632
13986	NC_021505	TTA	2	6	657564	657569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512683632
13987	NC_021505	TGATCG	2	12	657653	657664	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512683632
13988	NC_021505	GCTC	2	8	657693	657700	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13989	NC_021505	TA	3	6	657720	657725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13990	NC_021505	TAG	2	6	657762	657767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683633
13991	NC_021505	GTA	2	6	657778	657783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683633
13992	NC_021505	CTGG	2	8	657784	657791	0 %	25 %	50 %	25 %	512683633
13993	NC_021505	GAG	2	6	657802	657807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512683633
13994	NC_021505	A	7	7	657837	657843	100 %	0 %	0 %	0 %	512683633
13995	NC_021505	TTC	2	6	657894	657899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683633
13996	NC_021505	GC	3	6	658029	658034	0 %	0 %	50 %	50 %	512683633
13997	NC_021505	GGTT	2	8	658145	658152	0 %	50 %	50 %	0 %	512683633
13998	NC_021505	GTT	2	6	658171	658176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683633
13999	NC_021505	A	6	6	658262	658267	100 %	0 %	0 %	0 %	512683634
14000	NC_021505	AGC	2	6	658276	658281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683634

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