MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida NBRC 14164 DNA

Total Repeats: 132394

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
128001	NC_021505	GGTCGG	2	12	5952157	5952168	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	512688315
128002	NC_021505	TTG	2	6	5952196	5952201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512688315
128003	NC_021505	GCAT	2	8	5952239	5952246	25 %	25 %	25 %	25 %	512688315
128004	NC_021505	CGA	2	6	5952280	5952285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512688315
128005	NC_021505	CCG	2	6	5952375	5952380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512688315
128006	NC_021505	GGCC	2	8	5952396	5952403	0 %	0 %	50 %	50 %	512688315
128007	NC_021505	TCG	2	6	5952440	5952445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512688315
128008	NC_021505	CAG	2	6	5952460	5952465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512688315
128009	NC_021505	CAG	2	6	5952487	5952492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512688315
128010	NC_021505	AAG	2	6	5952521	5952526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512688315
128011	NC_021505	GTT	2	6	5952603	5952608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512688315
128012	NC_021505	AGG	2	6	5952677	5952682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512688315
128013	NC_021505	CTG	2	6	5952703	5952708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512688315
128014	NC_021505	CAG	2	6	5952748	5952753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512688315
128015	NC_021505	GCG	2	6	5952812	5952817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512688315
128016	NC_021505	GGC	2	6	5952823	5952828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512688315
128017	NC_021505	CTC	2	6	5952866	5952871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128018	NC_021505	CAT	2	6	5952884	5952889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128019	NC_021505	CCG	2	6	5952898	5952903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128020	NC_021505	GGC	2	6	5952920	5952925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128021	NC_021505	CTG	2	6	5952929	5952934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128022	NC_021505	GCC	2	6	5953022	5953027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512688316
128023	NC_021505	CTG	2	6	5953043	5953048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512688316
128024	NC_021505	CAA	2	6	5953057	5953062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512688316
128025	NC_021505	CCG	2	6	5953125	5953130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512688316
128026	NC_021505	CTGCGC	2	12	5953142	5953153	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512688316
128027	NC_021505	GGCC	2	8	5953204	5953211	0 %	0 %	50 %	50 %	512688316
128028	NC_021505	GAA	2	6	5953264	5953269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512688316
128029	NC_021505	CTG	2	6	5953282	5953287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512688316
128030	NC_021505	CAC	2	6	5953336	5953341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512688316
128031	NC_021505	GAGCTG	2	12	5953460	5953471	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512688316
128032	NC_021505	GCC	2	6	5953511	5953516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512688316
128033	NC_021505	GCC	2	6	5953523	5953528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512688316
128034	NC_021505	CTG	2	6	5953580	5953585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512688316
128035	NC_021505	GAC	2	6	5953646	5953651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512688316
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128037	NC_021505	CTG	2	6	5953676	5953681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512688316
128038	NC_021505	GCA	2	6	5953683	5953688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512688316
128039	NC_021505	CTG	2	6	5953733	5953738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512688316
128040	NC_021505	GC	3	6	5953768	5953773	0 %	0 %	50 %	50 %	512688316
128041	NC_021505	GCCGC	2	10	5953796	5953805	0 %	0 %	40 %	60 %	512688316
128042	NC_021505	GCA	2	6	5953827	5953832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512688316
128043	NC_021505	CTG	2	6	5953844	5953849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512688316
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128049	NC_021505	CTG	2	6	5954063	5954068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512688316
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128052	NC_021505	CTG	2	6	5954153	5954158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512688316
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128057	NC_021505	GAA	3	9	5954481	5954489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512688317
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128063	NC_021505	GCA	2	6	5954807	5954812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512688317
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128065	NC_021505	GCG	2	6	5954871	5954876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128066	NC_021505	TCA	2	6	5954895	5954900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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128068	NC_021505	A	6	6	5954928	5954933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128069	NC_021505	GCC	2	6	5954935	5954940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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128089	NC_021505	CGA	2	6	5956082	5956087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512688319
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128111	NC_021505	TG	3	6	5956929	5956934	0 %	50 %	50 %	0 %	512688319
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128115	NC_021505	TGC	2	6	5957155	5957160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512688319
128116	NC_021505	CTTGC	2	10	5957200	5957209	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
128117	NC_021505	CGCTGC	2	12	5957283	5957294	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512688320
128118	NC_021505	TGA	2	6	5957348	5957353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512688320
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128121	NC_021505	GCCT	2	8	5957585	5957592	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128122	NC_021505	CA	3	6	5957708	5957713	50 %	0 %	0 %	50 %	512688321
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128145	NC_021505	TGG	2	6	5958789	5958794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512688321
128146	NC_021505	TGCA	2	8	5958861	5958868	25 %	25 %	25 %	25 %	512688321
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128189	NC_021505	A	6	6	5961182	5961187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128190	NC_021505	ACC	2	6	5961231	5961236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512688323
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128214	NC_021505	GCG	3	9	5962300	5962308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128215	NC_021505	CTT	2	6	5962333	5962338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128216	NC_021505	CG	3	6	5962350	5962355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128217	NC_021505	CGG	2	6	5962428	5962433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512688324
128218	NC_021505	GCA	2	6	5962450	5962455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512688324
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128220	NC_021505	CGA	2	6	5962597	5962602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512688324
128221	NC_021505	CAG	2	6	5962607	5962612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512688324
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128223	NC_021505	GCT	2	6	5962730	5962735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512688324
128224	NC_021505	CAG	3	9	5962805	5962813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512688324
128225	NC_021505	TGCC	2	8	5962819	5962826	0 %	25 %	25 %	50 %	512688324
128226	NC_021505	GCC	2	6	5962975	5962980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512688324
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128228	NC_021505	TGC	2	6	5963029	5963034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512688324
128229	NC_021505	GCCG	2	8	5963086	5963093	0 %	0 %	50 %	50 %	512688324
128230	NC_021505	CAG	2	6	5963111	5963116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512688324
128231	NC_021505	GCA	2	6	5963119	5963124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512688324
128232	NC_021505	GCAA	2	8	5963141	5963148	50 %	0 %	25 %	25 %	512688324
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128240	NC_021505	GC	3	6	5963555	5963560	0 %	0 %	50 %	50 %	512688324
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128256	NC_021505	G	6	6	5964004	5964009	0 %	0 %	100 %	0 %	512688324
128257	NC_021505	TGC	2	6	5964279	5964284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512688325
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128273	NC_021505	GAT	2	6	5964876	5964881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512688325
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128312	NC_021505	CTG	2	6	5966658	5966663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512688327
128313	NC_021505	GTC	2	6	5966670	5966675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512688327
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128339	NC_021505	CCA	2	6	5967880	5967885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512688328
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128342	NC_021505	TGC	2	6	5968011	5968016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512688328
128343	NC_021505	CTG	2	6	5968025	5968030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512688328
128344	NC_021505	GC	3	6	5968055	5968060	0 %	0 %	50 %	50 %	512688328
128345	NC_021505	GCTGG	2	10	5968067	5968076	0 %	20 %	60 %	20 %	512688328
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128425	NC_021505	CGCA	2	8	5971964	5971971	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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128433	NC_021505	ACT	2	6	5972282	5972287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512688335
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128440	NC_021505	GCCGAA	2	12	5972856	5972867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512688336
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128445	NC_021505	GCCA	2	8	5972988	5972995	25 %	0 %	25 %	50 %	512688336
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128450	NC_021505	CAG	2	6	5973137	5973142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512688336
128451	NC_021505	TGCG	2	8	5973145	5973152	0 %	25 %	50 %	25 %	512688336
128452	NC_021505	CGG	2	6	5973209	5973214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512688336
128453	NC_021505	TGCTGA	2	12	5973220	5973231	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512688336
128454	NC_021505	CCA	2	6	5973274	5973279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512688336
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128456	NC_021505	GC	3	6	5973335	5973340	0 %	0 %	50 %	50 %	512688336
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