MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida NBRC 14164 DNA

Total Repeats: 132394

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021505	ACC	2	6	539664	539669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683515
11502	NC_021505	GCT	2	6	539707	539712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683515
11503	NC_021505	GAA	2	6	539732	539737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683515
11504	NC_021505	CAT	2	6	539786	539791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683515
11505	NC_021505	GCA	2	6	539815	539820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683515
11506	NC_021505	CAG	2	6	539822	539827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683515
11507	NC_021505	GCCA	2	8	539856	539863	25 %	0 %	25 %	50 %	512683515
11508	NC_021505	GCC	2	6	539864	539869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683515
11509	NC_021505	GTA	2	6	539882	539887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683515
11510	NC_021505	CGT	2	6	539908	539913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683515
11511	NC_021505	CCA	2	6	539921	539926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683515
11512	NC_021505	GCC	2	6	539982	539987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683515
11513	NC_021505	GCA	2	6	539997	540002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683515
11514	NC_021505	GCG	2	6	540014	540019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683515
11515	NC_021505	CAG	2	6	540047	540052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683515
11516	NC_021505	CAG	2	6	540074	540079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683515
11517	NC_021505	GCC	2	6	540129	540134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683515
11518	NC_021505	GAA	2	6	540244	540249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683515
11519	NC_021505	GC	4	8	540264	540271	0 %	0 %	50 %	50 %	512683515
11520	NC_021505	TCGAT	2	10	540285	540294	20 %	40 %	20 %	20 %	512683515
11521	NC_021505	ACC	2	6	540390	540395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683516
11522	NC_021505	TGC	2	6	540418	540423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683516
11523	NC_021505	TCG	2	6	540496	540501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683516
11524	NC_021505	GGC	2	6	540528	540533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683516
11525	NC_021505	CCAGG	2	10	540660	540669	20 %	0 %	40 %	40 %	512683516
11526	NC_021505	CTT	2	6	540677	540682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683516
11527	NC_021505	GCA	2	6	540688	540693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683516
11528	NC_021505	CA	3	6	540761	540766	50 %	0 %	0 %	50 %	512683516
11529	NC_021505	CTG	2	6	540813	540818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683516
11530	NC_021505	CGGG	2	8	540862	540869	0 %	0 %	75 %	25 %	512683516
11531	NC_021505	GCA	2	6	540884	540889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683516
11532	NC_021505	GCA	2	6	540914	540919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683516
11533	NC_021505	GCG	2	6	540932	540937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683516
11534	NC_021505	AGT	2	6	540938	540943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683516
11535	NC_021505	GCG	2	6	541002	541007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_021505	GCC	2	6	541091	541096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683517
11537	NC_021505	GCCA	2	8	541181	541188	25 %	0 %	25 %	50 %	512683517
11538	NC_021505	TCT	2	6	541197	541202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683517
11539	NC_021505	GGTCA	2	10	541205	541214	20 %	20 %	40 %	20 %	512683517
11540	NC_021505	T	6	6	541232	541237	0 %	100 %	0 %	0 %	512683517
11541	NC_021505	GTC	2	6	541298	541303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683517
11542	NC_021505	GAT	2	6	541310	541315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683517
11543	NC_021505	CCG	2	6	541318	541323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683517
11544	NC_021505	TGA	2	6	541336	541341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683517
11545	NC_021505	GCCG	2	8	541436	541443	0 %	0 %	50 %	50 %	512683518
11546	NC_021505	GCG	2	6	541451	541456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683518
11547	NC_021505	CCAG	2	8	541483	541490	25 %	0 %	25 %	50 %	512683518
11548	NC_021505	GCA	2	6	541495	541500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683518
11549	NC_021505	GCCA	2	8	541515	541522	25 %	0 %	25 %	50 %	512683518
11550	NC_021505	GCCG	2	8	541531	541538	0 %	0 %	50 %	50 %	512683518
11551	NC_021505	GC	3	6	541549	541554	0 %	0 %	50 %	50 %	512683518
11552	NC_021505	GGC	2	6	541748	541753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683518
11553	NC_021505	ATGGC	2	10	541845	541854	20 %	20 %	40 %	20 %	512683518
11554	NC_021505	GGC	2	6	541858	541863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683518
11555	NC_021505	TCG	2	6	541899	541904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683518
11556	NC_021505	CAG	2	6	541958	541963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683518
11557	NC_021505	CTT	2	6	541981	541986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683518
11558	NC_021505	GGCT	2	8	542019	542026	0 %	25 %	50 %	25 %	512683518
11559	NC_021505	CCA	2	6	542113	542118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683518
11560	NC_021505	GCCAGG	2	12	542154	542165	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512683518
11561	NC_021505	GC	3	6	542290	542295	0 %	0 %	50 %	50 %	512683519
11562	NC_021505	GCACTG	2	12	542353	542364	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	512683519
11563	NC_021505	CCG	2	6	542396	542401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683519
11564	NC_021505	TCG	3	9	542428	542436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683519
11565	NC_021505	CTTGC	2	10	542448	542457	0 %	40 %	20 %	40 %	512683519
11566	NC_021505	GCC	2	6	542463	542468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683519
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11568	NC_021505	AAG	2	6	542515	542520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683519
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11572	NC_021505	GTA	2	6	542617	542622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683519
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11584	NC_021505	TCC	2	6	543061	543066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512683519
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11590	NC_021505	ACC	3	9	543275	543283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683520
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11597	NC_021505	AGCC	2	8	543458	543465	25 %	0 %	25 %	50 %	512683520
11598	NC_021505	ATG	2	6	543524	543529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683520
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11600	NC_021505	GGAG	2	8	543688	543695	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_021505	GTC	2	6	543714	543719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11602	NC_021505	TAG	2	6	543723	543728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_021505	GTT	2	6	543759	543764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_021505	TAT	2	6	543783	543788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_021505	TCG	2	6	543846	543851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683521
11606	NC_021505	CTG	2	6	543887	543892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683521
11607	NC_021505	TCA	2	6	543921	543926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683521
11608	NC_021505	GGCG	2	8	543940	543947	0 %	0 %	75 %	25 %	512683521
11609	NC_021505	TGGCGG	2	12	543948	543959	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	512683521
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11613	NC_021505	CTG	2	6	544091	544096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683521
11614	NC_021505	GC	3	6	544185	544190	0 %	0 %	50 %	50 %	512683521
11615	NC_021505	GCCT	2	8	544218	544225	0 %	25 %	25 %	50 %	512683521
11616	NC_021505	GC	3	6	544253	544258	0 %	0 %	50 %	50 %	512683521
11617	NC_021505	CTT	2	6	544303	544308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683521
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11619	NC_021505	GTG	2	6	544386	544391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683521
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11742	NC_021505	TCA	2	6	551262	551267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11744	NC_021505	AC	3	6	551457	551462	50 %	0 %	0 %	50 %	512683526
11745	NC_021505	GGA	2	6	551517	551522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512683526
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11859	NC_021505	GGAC	2	8	557799	557806	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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11868	NC_021505	GAA	2	6	558405	558410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683530
11869	NC_021505	TGC	2	6	558423	558428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683530
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11871	NC_021505	CTG	2	6	558499	558504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683530
11872	NC_021505	GAC	2	6	558562	558567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683530
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11874	NC_021505	CTG	2	6	558607	558612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683530
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11985	NC_021505	GC	3	6	563667	563672	0 %	0 %	50 %	50 %	512683537
11986	NC_021505	GAA	2	6	563689	563694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683537
11987	NC_021505	ACC	2	6	563713	563718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683537
11988	NC_021505	GTG	2	6	563777	563782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683537
11989	NC_021505	GCC	2	6	563837	563842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683537
11990	NC_021505	GC	3	6	563851	563856	0 %	0 %	50 %	50 %	512683537
11991	NC_021505	ATCA	2	8	563860	563867	50 %	25 %	0 %	25 %	512683537
11992	NC_021505	AGC	2	6	563888	563893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683537
11993	NC_021505	CAC	2	6	563925	563930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683537
11994	NC_021505	ACC	2	6	563992	563997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683537
11995	NC_021505	CTG	2	6	564001	564006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683537
11996	NC_021505	GTC	2	6	564028	564033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683537
11997	NC_021505	ACC	2	6	564103	564108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683537
11998	NC_021505	ATG	2	6	564145	564150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683537
11999	NC_021505	GCC	2	6	564162	564167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683537
12000	NC_021505	TGC	2	6	564177	564182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683537

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