MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida NBRC 14164 DNA

Total Repeats: 132394

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021505	AGC	3	9	470152	470160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683456
10002	NC_021505	ACCT	2	8	470163	470170	25 %	25 %	0 %	50 %	512683456
10003	NC_021505	TGC	2	6	470245	470250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683456
10004	NC_021505	ACA	2	6	470338	470343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512683456
10005	NC_021505	GGC	2	6	470439	470444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683456
10006	NC_021505	TGA	2	6	470518	470523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683456
10007	NC_021505	CGGCC	2	10	470552	470561	0 %	0 %	40 %	60 %	512683456
10008	NC_021505	GC	3	6	470601	470606	0 %	0 %	50 %	50 %	512683456
10009	NC_021505	ATC	2	6	470736	470741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683456
10010	NC_021505	TGC	2	6	470764	470769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683456
10011	NC_021505	GAA	2	6	470856	470861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683456
10012	NC_021505	CTG	2	6	470883	470888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683456
10013	NC_021505	CGG	2	6	470966	470971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683456
10014	NC_021505	CAC	2	6	471044	471049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683456
10015	NC_021505	TGA	2	6	471088	471093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683456
10016	NC_021505	GGC	2	6	471191	471196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683456
10017	NC_021505	CAA	2	6	471200	471205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512683456
10018	NC_021505	GCC	2	6	471240	471245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683456
10019	NC_021505	GAA	2	6	471258	471263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683456
10020	NC_021505	GCCT	2	8	471306	471313	0 %	25 %	25 %	50 %	512683456
10021	NC_021505	CGCC	2	8	471335	471342	0 %	0 %	25 %	75 %	512683456
10022	NC_021505	GCTG	2	8	471356	471363	0 %	25 %	50 %	25 %	512683456
10023	NC_021505	GC	3	6	471408	471413	0 %	0 %	50 %	50 %	512683456
10024	NC_021505	CAA	2	6	471476	471481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512683456
10025	NC_021505	T	6	6	471571	471576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_021505	GCA	2	6	471610	471615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_021505	CGC	2	6	471796	471801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683457
10028	NC_021505	GA	3	6	471811	471816	50 %	0 %	50 %	0 %	512683457
10029	NC_021505	TGC	3	9	471864	471872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683457
10030	NC_021505	CCG	2	6	471898	471903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683457
10031	NC_021505	ATG	2	6	471920	471925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683457
10032	NC_021505	CTA	2	6	471943	471948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683457
10033	NC_021505	CTG	3	9	472031	472039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683457
10034	NC_021505	GCT	2	6	472171	472176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683457
10035	NC_021505	CTGG	2	8	472180	472187	0 %	25 %	50 %	25 %	512683457
10036	NC_021505	CTG	2	6	472271	472276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683457
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10039	NC_021505	CTG	2	6	472331	472336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683457
10040	NC_021505	TGC	2	6	472350	472355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683457
10041	NC_021505	CAT	2	6	472387	472392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683457
10042	NC_021505	TGA	2	6	472410	472415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683457
10043	NC_021505	ACG	2	6	472584	472589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683457
10044	NC_021505	CGG	2	6	472639	472644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683457
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10046	NC_021505	TGG	2	6	472663	472668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683457
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10050	NC_021505	AGC	2	6	472778	472783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683457
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10052	NC_021505	GCG	2	6	472830	472835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683457
10053	NC_021505	ACC	2	6	472884	472889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683457
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10055	NC_021505	TGA	2	6	473035	473040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_021505	GTT	2	6	473058	473063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_021505	CCCGA	2	10	473110	473119	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10058	NC_021505	TGAA	2	8	473179	473186	50 %	25 %	25 %	0 %	512683458
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10073	NC_021505	TCGA	2	8	473895	473902	25 %	25 %	25 %	25 %	512683458
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10090	NC_021505	TGA	2	6	474542	474547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683458
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10092	NC_021505	GCGG	2	8	474752	474759	0 %	0 %	75 %	25 %	512683458
10093	NC_021505	TGC	2	6	474832	474837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683458
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10100	NC_021505	GAC	2	6	475181	475186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_021505	ACC	2	6	475192	475197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10102	NC_021505	CGG	2	6	475257	475262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_021505	GCG	2	6	475303	475308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683459
10104	NC_021505	GGCG	2	8	475321	475328	0 %	0 %	75 %	25 %	512683459
10105	NC_021505	TCC	2	6	475338	475343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512683459
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10112	NC_021505	GGCCC	2	10	475478	475487	0 %	0 %	40 %	60 %	512683459
10113	NC_021505	TGG	2	6	475495	475500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683459
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10117	NC_021505	CAGCAT	2	12	475628	475639	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512683459
10118	NC_021505	CTT	2	6	475670	475675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683459
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10120	NC_021505	CAG	3	9	475730	475738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683459
10121	NC_021505	AGC	2	6	475800	475805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683459
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10123	NC_021505	AGC	2	6	475881	475886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683459
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10239	NC_021505	TGG	2	6	481530	481535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683465
10240	NC_021505	GCT	2	6	481565	481570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683465
10241	NC_021505	GCG	2	6	481592	481597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683465
10242	NC_021505	CGT	2	6	481738	481743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683465
10243	NC_021505	GTA	2	6	481835	481840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683465
10244	NC_021505	GATG	2	8	481915	481922	25 %	25 %	50 %	0 %	512683465
10245	NC_021505	GTA	2	6	481925	481930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683465
10246	NC_021505	GC	3	6	481941	481946	0 %	0 %	50 %	50 %	512683465
10247	NC_021505	GGCT	2	8	481996	482003	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10248	NC_021505	TTC	2	6	482091	482096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10249	NC_021505	GC	3	6	482207	482212	0 %	0 %	50 %	50 %	512683466
10250	NC_021505	TCG	2	6	482225	482230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683466
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10253	NC_021505	CCACG	2	10	482358	482367	20 %	0 %	20 %	60 %	512683466
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10267	NC_021505	CGG	3	9	483030	483038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683466
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10269	NC_021505	CGG	2	6	483107	483112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10270	NC_021505	GGGTT	2	10	483233	483242	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
10271	NC_021505	CTA	2	6	483249	483254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10272	NC_021505	ATT	2	6	483335	483340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10273	NC_021505	GTT	2	6	483378	483383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683467
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10275	NC_021505	GT	3	6	483539	483544	0 %	50 %	50 %	0 %	512683467
10276	NC_021505	TCG	2	6	483588	483593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683467
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10278	NC_021505	GGT	2	6	483661	483666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683467
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10284	NC_021505	G	7	7	483930	483936	0 %	0 %	100 %	0 %	512683467
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10297	NC_021505	CTG	2	6	484574	484579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683467
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10312	NC_021505	GCG	2	6	485583	485588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683467
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10315	NC_021505	GC	3	6	485795	485800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10338	NC_021505	CCT	2	6	486614	486619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10339	NC_021505	AGTC	2	8	486622	486629	25 %	25 %	25 %	25 %	512683469
10340	NC_021505	CCGGG	2	10	486668	486677	0 %	0 %	60 %	40 %	512683469
10341	NC_021505	GGGT	2	8	486685	486692	0 %	25 %	75 %	0 %	512683469
10342	NC_021505	CCAC	2	8	486755	486762	25 %	0 %	0 %	75 %	512683469
10343	NC_021505	CGT	2	6	486779	486784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683469
10344	NC_021505	GCT	2	6	486806	486811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683469
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10346	NC_021505	CTG	2	6	486825	486830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683469
10347	NC_021505	GAT	2	6	486942	486947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683469
10348	NC_021505	TCT	2	6	486977	486982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683469
10349	NC_021505	GCA	2	6	487028	487033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683469
10350	NC_021505	GTC	2	6	487086	487091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683469
10351	NC_021505	AGGT	2	8	487105	487112	25 %	25 %	50 %	0 %	512683469
10352	NC_021505	CGGT	2	8	487126	487133	0 %	25 %	50 %	25 %	512683469
10353	NC_021505	TCA	2	6	487145	487150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683469
10354	NC_021505	GTCCTT	2	12	487170	487181	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	512683469
10355	NC_021505	CGA	2	6	487215	487220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683469
10356	NC_021505	T	6	6	487256	487261	0 %	100 %	0 %	0 %	512683469
10357	NC_021505	CAG	2	6	487299	487304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683469
10358	NC_021505	GGC	2	6	487373	487378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683469
10359	NC_021505	CGG	2	6	487382	487387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683469
10360	NC_021505	GCGCG	2	10	487413	487422	0 %	0 %	60 %	40 %	512683469
10361	NC_021505	CCG	2	6	487516	487521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683469
10362	NC_021505	TGG	2	6	487534	487539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683469
10363	NC_021505	TCG	2	6	487540	487545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683469
10364	NC_021505	TCA	2	6	487553	487558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683469
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10366	NC_021505	GTC	2	6	487704	487709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683469
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10370	NC_021505	GTA	2	6	487872	487877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683469
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10379	NC_021505	TGC	2	6	488192	488197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683469
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10381	NC_021505	TCG	2	6	488224	488229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683469
10382	NC_021505	GCT	2	6	488267	488272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683469
10383	NC_021505	CGG	2	6	488279	488284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683469
10384	NC_021505	AG	3	6	488321	488326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10385	NC_021505	GGAGC	2	10	488336	488345	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10386	NC_021505	TTA	2	6	488394	488399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10387	NC_021505	TCG	2	6	488432	488437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10388	NC_021505	CAG	2	6	488649	488654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683470
10389	NC_021505	GGCT	2	8	488687	488694	0 %	25 %	50 %	25 %	512683470
10390	NC_021505	T	7	7	488711	488717	0 %	100 %	0 %	0 %	512683470
10391	NC_021505	TTC	2	6	488727	488732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683470
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10393	NC_021505	AGC	2	6	488954	488959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10394	NC_021505	CTCG	2	8	488993	489000	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10395	NC_021505	G	6	6	489014	489019	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10396	NC_021505	CAA	2	6	489024	489029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10397	NC_021505	TGG	2	6	489069	489074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10398	NC_021505	ACG	2	6	489203	489208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10400	NC_021505	CG	3	6	489237	489242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10401	NC_021505	AAAC	2	8	489268	489275	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10402	NC_021505	GAGC	2	8	489280	489287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10403	NC_021505	CG	3	6	489305	489310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10404	NC_021505	TAGG	2	8	489400	489407	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10405	NC_021505	CGC	2	6	489517	489522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10424	NC_021505	CTAGC	2	10	490199	490208	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10425	NC_021505	GC	3	6	490255	490260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10426	NC_021505	TGG	2	6	490283	490288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10435	NC_021505	GACATC	2	12	490563	490574	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512683473
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10450	NC_021505	ATC	2	6	491318	491323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512683475
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10452	NC_021505	CAA	2	6	491413	491418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512683475
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10460	NC_021505	A	7	7	491768	491774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10461	NC_021505	TGG	2	6	491802	491807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10469	NC_021505	GTC	2	6	492231	492236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683476
10470	NC_021505	T	6	6	492258	492263	0 %	100 %	0 %	0 %	512683476
10471	NC_021505	CTT	2	6	492287	492292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512683476
10472	NC_021505	ATG	2	6	492304	492309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683476
10473	NC_021505	TGGC	2	8	492393	492400	0 %	25 %	50 %	25 %	512683476
10474	NC_021505	TGC	2	6	492451	492456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683476
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10477	NC_021505	GGC	2	6	492553	492558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683476
10478	NC_021505	CTTTGG	2	12	492758	492769	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	512683476
10479	NC_021505	GAA	2	6	492861	492866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512683476
10480	NC_021505	CAG	2	6	492906	492911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683476
10481	NC_021505	TTG	2	6	492913	492918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683476
10482	NC_021505	GCA	2	6	492956	492961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683476
10483	NC_021505	GAT	2	6	492963	492968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512683476
10484	NC_021505	TCG	2	6	492973	492978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683476
10485	NC_021505	AGC	2	6	493045	493050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683476
10486	NC_021505	GTG	2	6	493212	493217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512683476
10487	NC_021505	CAGC	2	8	493326	493333	25 %	0 %	25 %	50 %	512683476
10488	NC_021505	TTG	2	6	493360	493365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512683476
10489	NC_021505	GGC	2	6	493413	493418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683476
10490	NC_021505	CGG	2	6	493562	493567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683476
10491	NC_021505	GGC	2	6	493584	493589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683476
10492	NC_021505	CGC	2	6	493658	493663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512683476
10493	NC_021505	GCG	2	6	493716	493721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683476
10494	NC_021505	TGCGTT	2	12	493775	493786	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	512683476
10495	NC_021505	GGC	2	6	493859	493864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512683476
10496	NC_021505	AGC	2	6	493885	493890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512683476
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10498	NC_021505	GCTG	2	8	493994	494001	0 %	25 %	50 %	25 %	512683476
10499	NC_021505	CCA	3	9	494015	494023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512683476
10500	NC_021505	TGC	2	6	494087	494092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512683476

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