MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Prevotella dentalis DSM 3688 plasmid pPREDE01

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019961	GAAA	2	8	13	20	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019961	CGT	2	6	88	93	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019961	A	6	6	169	174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019961	CAAATT	2	12	211	222	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_019961	TCAC	2	8	275	282	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019961	TAAT	2	8	416	423	50 %	50 %	0 %	0 %	433653594
7	NC_019961	TATT	2	8	430	437	25 %	75 %	0 %	0 %	433653594
8	NC_019961	TTC	3	9	465	473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653594
9	NC_019961	AT	3	6	542	547	50 %	50 %	0 %	0 %	433653594
10	NC_019961	T	6	6	663	668	0 %	100 %	0 %	0 %	433653594
11	NC_019961	TAA	2	6	680	685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653594
12	NC_019961	CTATCA	2	12	688	699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653594
13	NC_019961	A	6	6	743	748	100 %	0 %	0 %	0 %	433653594
14	NC_019961	ATC	2	6	795	800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653594
15	NC_019961	TCAAAA	2	12	802	813	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	433653594
16	NC_019961	ATA	2	6	856	861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653594
17	NC_019961	TTC	2	6	882	887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653594
18	NC_019961	GCTTTA	2	12	988	999	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	433653594
19	NC_019961	TTTG	2	8	1003	1010	0 %	75 %	25 %	0 %	433653594
20	NC_019961	ATT	2	6	1071	1076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653594
21	NC_019961	TTA	2	6	1078	1083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653594
22	NC_019961	CAA	2	6	1091	1096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433653594
23	NC_019961	GTAA	2	8	1205	1212	50 %	25 %	25 %	0 %	433653594
24	NC_019961	A	6	6	1236	1241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019961	ATT	2	6	1254	1259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019961	AAG	2	6	1263	1268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019961	AT	4	8	1281	1288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019961	A	6	6	1337	1342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019961	CA	3	6	1375	1380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019961	CTT	2	6	1404	1409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019961	T	7	7	1414	1420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019961	TTTA	2	8	1467	1474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019961	ATCTTT	2	12	1504	1515	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_019961	ATT	2	6	1600	1605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653595
35	NC_019961	T	6	6	1609	1614	0 %	100 %	0 %	0 %	433653595
36	NC_019961	ATT	2	6	1624	1629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653595
37	NC_019961	TCT	2	6	1637	1642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653595
38	NC_019961	TTTAT	2	10	1655	1664	20 %	80 %	0 %	0 %	433653595
39	NC_019961	T	6	6	1674	1679	0 %	100 %	0 %	0 %	433653595
40	NC_019961	TAA	2	6	1704	1709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653595
41	NC_019961	TTCT	2	8	1755	1762	0 %	75 %	0 %	25 %	433653595
42	NC_019961	ATT	2	6	1768	1773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653595
43	NC_019961	A	8	8	1808	1815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019961	T	6	6	1825	1830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019961	TCT	2	6	1842	1847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019961	CAA	2	6	1850	1855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019961	TAG	2	6	1861	1866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019961	A	6	6	1868	1873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019961	T	6	6	1891	1896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019961	AACTAA	2	12	1910	1921	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_019961	GCT	3	9	1987	1995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019961	T	7	7	2015	2021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019961	GTA	3	9	2086	2094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019961	ACC	2	6	2124	2129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_019961	T	7	7	2156	2162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019961	T	6	6	2169	2174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019961	AAT	2	6	2177	2182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019961	TTTTA	2	10	2196	2205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019961	TTG	2	6	2228	2233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019961	GCTTGG	2	12	2251	2262	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_019961	TGT	2	6	2298	2303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019961	TAA	2	6	2322	2327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019961	T	6	6	2339	2344	0 %	100 %	0 %	0 %	433653596
64	NC_019961	TA	3	6	2385	2390	50 %	50 %	0 %	0 %	433653596
65	NC_019961	ATAAA	2	10	2489	2498	80 %	20 %	0 %	0 %	433653596
66	NC_019961	ACA	2	6	2508	2513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433653596
67	NC_019961	T	7	7	2605	2611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019961	ATTT	2	8	2649	2656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019961	T	6	6	2654	2659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019961	T	7	7	2709	2715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019961	TAAA	2	8	2728	2735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019961	CTTT	2	8	2740	2747	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019961	AT	3	6	2755	2760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019961	TTTA	2	8	2766	2773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019961	T	6	6	2783	2788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019961	T	6	6	2806	2811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019961	ATT	2	6	2814	2819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019961	CGA	2	6	2837	2842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019961	TGC	2	6	2843	2848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019961	TAA	2	6	2855	2860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019961	TTTC	2	8	2998	3005	0 %	75 %	0 %	25 %	433653597
82	NC_019961	ATAA	2	8	3022	3029	75 %	25 %	0 %	0 %	433653597
83	NC_019961	ACCAA	2	10	3072	3081	60 %	0 %	0 %	40 %	433653597
84	NC_019961	AAC	2	6	3203	3208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433653597
85	NC_019961	AAT	2	6	3227	3232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653597
86	NC_019961	T	7	7	3243	3249	0 %	100 %	0 %	0 %	433653597
87	NC_019961	CTT	2	6	3273	3278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653597
88	NC_019961	TCA	2	6	3296	3301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653597
89	NC_019961	ATG	2	6	3326	3331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653597
90	NC_019961	TCG	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433653597
91	NC_019961	GTT	2	6	3453	3458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433653598
92	NC_019961	TGA	3	9	3510	3518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653598
93	NC_019961	TTGTT	2	10	3521	3530	0 %	80 %	20 %	0 %	433653598
94	NC_019961	T	6	6	3529	3534	0 %	100 %	0 %	0 %	433653598
95	NC_019961	TTC	3	9	3647	3655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653598
96	NC_019961	ATTT	2	8	3730	3737	25 %	75 %	0 %	0 %	433653598
97	NC_019961	CAATTT	2	12	3844	3855	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	433653598
98	NC_019961	T	6	6	3853	3858	0 %	100 %	0 %	0 %	433653598
99	NC_019961	ATC	2	6	3866	3871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653598
100	NC_019961	ATC	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653598
101	NC_019961	GTTT	2	8	3987	3994	0 %	75 %	25 %	0 %	433653598
102	NC_019961	GTT	3	9	4006	4014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433653598
103	NC_019961	T	7	7	4028	4034	0 %	100 %	0 %	0 %	433653598
104	NC_019961	TGA	2	6	4113	4118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653598
105	NC_019961	GTTT	2	8	4248	4255	0 %	75 %	25 %	0 %	433653598
106	NC_019961	T	6	6	4297	4302	0 %	100 %	0 %	0 %	433653598
107	NC_019961	ATTG	2	8	4325	4332	25 %	50 %	25 %	0 %	433653598
108	NC_019961	GTT	2	6	4365	4370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433653598
109	NC_019961	CAT	3	9	4373	4381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653598
110	NC_019961	TATTT	2	10	4404	4413	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019961	CCAA	2	8	4423	4430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019961	ACAA	2	8	4434	4441	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_019961	TAAG	2	8	4443	4450	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019961	AAAATC	2	12	4476	4487	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_019961	ATATT	2	10	4602	4611	40 %	60 %	0 %	0 %	433653599
116	NC_019961	CAT	2	6	4618	4623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653599
117	NC_019961	ATGTTG	2	12	4637	4648	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	433653599
118	NC_019961	CTTTAA	2	12	4814	4825	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	433653599
119	NC_019961	GTT	2	6	4919	4924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433653599

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.