MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri RCH2 plasmid pPSEST03

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019939	CGC	2	6	32	37	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_019939	TGG	2	6	73	78	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431929442
3	NC_019939	GTT	2	6	88	93	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431929442
4	NC_019939	GGA	2	6	112	117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431929442
5	NC_019939	GCA	2	6	138	143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929442
6	NC_019939	TAGC	2	8	183	190	25 %	25 %	25 %	25 %	431929442
7	NC_019939	CAA	2	6	218	223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431929442
8	NC_019939	GGTTGC	2	12	337	348	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	431929442
9	NC_019939	TCA	2	6	349	354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431929442
10	NC_019939	GAA	2	6	420	425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431929443
11	NC_019939	CGG	2	6	452	457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431929443
12	NC_019939	TCA	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431929443
13	NC_019939	ACC	2	6	493	498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431929443
14	NC_019939	TGT	2	6	599	604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431929443
15	NC_019939	TCAT	2	8	625	632	25 %	50 %	0 %	25 %	431929443
16	NC_019939	CGT	3	9	633	641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019939	TA	3	6	657	662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019939	AT	3	6	678	683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019939	GTTG	2	8	809	816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019939	TGG	2	6	818	823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019939	AGC	2	6	844	849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019939	AGGG	2	8	915	922	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019939	CGAGGT	2	12	972	983	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019939	GCT	2	6	1064	1069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019939	GCA	2	6	1072	1077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019939	CGC	2	6	1240	1245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_019939	TGAT	2	8	1286	1293	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019939	AGGAT	2	10	1370	1379	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019939	GT	3	6	1394	1399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019939	CTC	2	6	1400	1405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_019939	GGT	2	6	1448	1453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019939	CGG	2	6	1525	1530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431929444
33	NC_019939	GCC	2	6	1595	1600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431929444
34	NC_019939	CAG	2	6	1606	1611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929444
35	NC_019939	AGC	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929444
36	NC_019939	TGA	2	6	1645	1650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431929444
37	NC_019939	GGT	2	6	1681	1686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431929444
38	NC_019939	ATC	2	6	1691	1696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431929444
39	NC_019939	ACC	2	6	1697	1702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431929444
40	NC_019939	GCG	2	6	1707	1712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431929444
41	NC_019939	TCG	3	9	1713	1721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929444
42	NC_019939	TCG	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929444
43	NC_019939	TGCC	2	8	1873	1880	0 %	25 %	25 %	50 %	431929444
44	NC_019939	TGG	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431929444
45	NC_019939	CGC	2	6	1951	1956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431929444
46	NC_019939	TGG	2	6	1957	1962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431929444
47	NC_019939	GAG	2	6	2027	2032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431929444
48	NC_019939	CGG	2	6	2226	2231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431929444
49	NC_019939	AGG	2	6	2262	2267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431929444
50	NC_019939	GCA	2	6	2391	2396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929444
51	NC_019939	GGC	2	6	2500	2505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431929444
52	NC_019939	GC	3	6	2611	2616	0 %	0 %	50 %	50 %	431929444
53	NC_019939	G	9	9	2645	2653	0 %	0 %	100 %	0 %	431929444
54	NC_019939	CTG	2	6	2729	2734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019939	GAT	2	6	2777	2782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019939	ATG	2	6	2786	2791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.