MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri RCH2 plasmid pPSEST02

Total Repeats: 222

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019938	GC	3	6	45	50	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019938	TTGG	2	8	57	64	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019938	GGCA	2	8	70	77	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019938	GA	3	6	93	98	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019938	GAA	2	6	174	179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019938	GCC	2	6	271	276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_019938	CAG	2	6	283	288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019938	CGGCG	2	10	323	332	0 %	0 %	60 %	40 %	431925194
9	NC_019938	AAG	2	6	376	381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925194
10	NC_019938	GCG	2	6	394	399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925194
11	NC_019938	CCA	2	6	417	422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925194
12	NC_019938	GCT	2	6	435	440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925194
13	NC_019938	CCAG	2	8	448	455	25 %	0 %	25 %	50 %	431925194
14	NC_019938	CCG	2	6	476	481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925194
15	NC_019938	CCAG	2	8	488	495	25 %	0 %	25 %	50 %	431925194
16	NC_019938	GCA	2	6	496	501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925194
17	NC_019938	GTG	2	6	567	572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019938	CGC	2	6	790	795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925195
19	NC_019938	GCT	2	6	865	870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925195
20	NC_019938	AAG	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925195
21	NC_019938	ATCG	3	12	916	927	25 %	25 %	25 %	25 %	431925195
22	NC_019938	GCCG	2	8	940	947	0 %	0 %	50 %	50 %	431925195
23	NC_019938	TCG	2	6	996	1001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925195
24	NC_019938	CCA	2	6	1021	1026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925195
25	NC_019938	CGA	2	6	1048	1053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925195
26	NC_019938	CCGG	2	8	1059	1066	0 %	0 %	50 %	50 %	431925195
27	NC_019938	TGG	2	6	1092	1097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925195
28	NC_019938	ATG	2	6	1100	1105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925195
29	NC_019938	GCC	2	6	1106	1111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925195
30	NC_019938	AGC	2	6	1131	1136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925195
31	NC_019938	AAG	2	6	1163	1168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925195
32	NC_019938	AGG	2	6	1173	1178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431925195
33	NC_019938	GCC	2	6	1241	1246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925195
34	NC_019938	GAT	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925195
35	NC_019938	GAG	2	6	1331	1336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431925195
36	NC_019938	GCT	2	6	1339	1344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925195
37	NC_019938	GC	3	6	1349	1354	0 %	0 %	50 %	50 %	431925195
38	NC_019938	GC	3	6	1430	1435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019938	CTG	2	6	1567	1572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925196
40	NC_019938	AC	3	6	1695	1700	50 %	0 %	0 %	50 %	431925196
41	NC_019938	GGA	2	6	1727	1732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431925196
42	NC_019938	CTG	2	6	1740	1745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925196
43	NC_019938	CCA	2	6	1806	1811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925196
44	NC_019938	G	6	6	1823	1828	0 %	0 %	100 %	0 %	431925196
45	NC_019938	CGG	2	6	1920	1925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019938	C	6	6	1969	1974	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_019938	AGG	2	6	1991	1996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019938	TTTGCG	2	12	2059	2070	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019938	GC	3	6	2148	2153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019938	CCG	2	6	2160	2165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_019938	AC	3	6	2203	2208	50 %	0 %	0 %	50 %	431925197
52	NC_019938	GCAA	2	8	2219	2226	50 %	0 %	25 %	25 %	431925197
53	NC_019938	CCG	2	6	2228	2233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925197
54	NC_019938	CGA	2	6	2311	2316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925197
55	NC_019938	CTG	2	6	2417	2422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925198
56	NC_019938	GTG	2	6	2490	2495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925198
57	NC_019938	CTGC	2	8	2498	2505	0 %	25 %	25 %	50 %	431925198
58	NC_019938	GCTG	2	8	2584	2591	0 %	25 %	50 %	25 %	431925198
59	NC_019938	ACC	2	6	2678	2683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925198
60	NC_019938	GAGC	2	8	2697	2704	25 %	0 %	50 %	25 %	431925198
61	NC_019938	TGG	2	6	2777	2782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925198
62	NC_019938	GCC	2	6	2812	2817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925198
63	NC_019938	GC	3	6	2835	2840	0 %	0 %	50 %	50 %	431925198
64	NC_019938	CCG	2	6	2951	2956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925198
65	NC_019938	CG	3	6	3014	3019	0 %	0 %	50 %	50 %	431925198
66	NC_019938	GC	3	6	3064	3069	0 %	0 %	50 %	50 %	431925198
67	NC_019938	GTCGCT	2	12	3075	3086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925198
68	NC_019938	TCGC	2	8	3192	3199	0 %	25 %	25 %	50 %	431925198
69	NC_019938	GATGG	2	10	3203	3212	20 %	20 %	60 %	0 %	431925198
70	NC_019938	CGA	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925198
71	NC_019938	CAA	2	6	3336	3341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925198
72	NC_019938	GGC	2	6	3376	3381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925198
73	NC_019938	TTC	2	6	3397	3402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925198
74	NC_019938	GAC	2	6	3454	3459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925198
75	NC_019938	TTC	2	6	3470	3475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925198
76	NC_019938	TGG	2	6	3494	3499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925198
77	NC_019938	GACG	2	8	3570	3577	25 %	0 %	50 %	25 %	431925198
78	NC_019938	TCCG	2	8	3581	3588	0 %	25 %	25 %	50 %	431925198
79	NC_019938	GCC	2	6	3601	3606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925198
80	NC_019938	GCG	2	6	3618	3623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925198
81	NC_019938	TTC	2	6	3631	3636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925198
82	NC_019938	AAC	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925198
83	NC_019938	CAA	2	6	3675	3680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925198
84	NC_019938	CCG	2	6	3681	3686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925198
85	NC_019938	TGC	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925198
86	NC_019938	ACG	2	6	3830	3835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925198
87	NC_019938	GCA	2	6	3842	3847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925198
88	NC_019938	GAG	2	6	3859	3864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431925198
89	NC_019938	TGC	2	6	3926	3931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925198
90	NC_019938	GC	3	6	3980	3985	0 %	0 %	50 %	50 %	431925198
91	NC_019938	TGC	2	6	4013	4018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925198
92	NC_019938	CTG	2	6	4036	4041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925198
93	NC_019938	CTA	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925198
94	NC_019938	T	7	7	4114	4120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019938	GTG	2	6	4130	4135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019938	TGG	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019938	GTG	2	6	4160	4165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019938	CTT	2	6	4167	4172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019938	CCA	2	6	4182	4187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_019938	TGG	2	6	4226	4231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019938	TGG	2	6	4236	4241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019938	GCC	2	6	4292	4297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_019938	AC	3	6	4302	4307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019938	ACC	2	6	4330	4335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_019938	CAC	2	6	4342	4347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_019938	GTG	2	6	4385	4390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019938	GTG	2	6	4398	4403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019938	CCA	2	6	4409	4414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_019938	CAC	2	6	4418	4423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_019938	CCA	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_019938	GC	3	6	4478	4483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019938	C	6	6	4533	4538	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_019938	TG	3	6	4600	4605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019938	AC	3	6	4626	4631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_019938	AGC	2	6	4771	4776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925199
116	NC_019938	ACG	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925200
117	NC_019938	TCA	2	6	4840	4845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925200
118	NC_019938	GAA	2	6	4906	4911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925200
119	NC_019938	GCT	2	6	4975	4980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925200
120	NC_019938	AC	3	6	5046	5051	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019938	CCGC	2	8	5196	5203	0 %	0 %	25 %	75 %	431925201
122	NC_019938	CCGCAG	2	12	5301	5312	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_019938	CGA	2	6	5396	5401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925202
124	NC_019938	GCA	2	6	5402	5407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925202
125	NC_019938	CTG	2	6	5424	5429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925202
126	NC_019938	CA	3	6	5445	5450	50 %	0 %	0 %	50 %	431925202
127	NC_019938	GC	3	6	5480	5485	0 %	0 %	50 %	50 %	431925202
128	NC_019938	GCAG	2	8	5523	5530	25 %	0 %	50 %	25 %	431925202
129	NC_019938	CGA	2	6	5621	5626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925202
130	NC_019938	GA	3	6	5638	5643	50 %	0 %	50 %	0 %	431925202
131	NC_019938	CCA	2	6	5663	5668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_019938	T	6	6	5689	5694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019938	GC	3	6	5796	5801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019938	GCC	2	6	5865	5870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_019938	GA	3	6	5992	5997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019938	GGC	2	6	6017	6022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019938	CAG	2	6	6049	6054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019938	C	6	6	6170	6175	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_019938	AC	3	6	6181	6186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_019938	GACA	2	8	6189	6196	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_019938	CGC	2	6	6280	6285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_019938	ACT	2	6	6336	6341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019938	AC	3	6	6350	6355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019938	TCT	2	6	6366	6371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019938	GAC	2	6	6400	6405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019938	T	6	6	6412	6417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019938	CAG	2	6	6457	6462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_019938	GCC	2	6	6514	6519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_019938	TGC	2	6	6537	6542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_019938	GCC	2	6	6568	6573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_019938	CCA	2	6	6598	6603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_019938	CGC	3	9	6612	6620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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173	NC_019938	GGC	2	6	7427	7432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_019938	CTT	2	6	7453	7458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_019938	TGG	3	9	7480	7488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
176	NC_019938	GCC	2	6	7583	7588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
177	NC_019938	CTG	2	6	7745	7750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_019938	AC	3	6	7763	7768	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
179	NC_019938	CCAT	2	8	7839	7846	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
180	NC_019938	CTCGAC	2	12	7862	7873	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
181	NC_019938	CCCT	2	8	7901	7908	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
182	NC_019938	CGC	2	6	7990	7995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
183	NC_019938	CGG	2	6	8011	8016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_019938	GCC	3	9	8043	8051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
185	NC_019938	GCC	2	6	8054	8059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
186	NC_019938	GCT	2	6	8060	8065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.