MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri RCH2 plasmid pPSEST01

Total Repeats: 253

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019937	T	8	8	87	94	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019937	A	7	7	101	107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019937	GA	3	6	130	135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019937	GCG	2	6	179	184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019937	CAT	2	6	189	194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019937	AG	3	6	202	207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019937	GC	3	6	214	219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019937	TCG	2	6	231	236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019937	GTCG	3	12	233	244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019937	CTGC	2	8	250	257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019937	CAAG	2	8	273	280	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019937	CGG	2	6	310	315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019937	CAG	2	6	350	355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019937	GCG	2	6	356	361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019937	CGAC	2	8	370	377	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019937	AGCGC	2	10	455	464	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_019937	AGCGA	2	10	475	484	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019937	CAG	2	6	514	519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019937	A	6	6	526	531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019937	GCT	2	6	630	635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019937	ATC	2	6	656	661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019937	AC	3	6	952	957	50 %	0 %	0 %	50 %	431929446
23	NC_019937	ATC	2	6	1030	1035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431929446
24	NC_019937	GC	3	6	1062	1067	0 %	0 %	50 %	50 %	431929446
25	NC_019937	GGC	2	6	1153	1158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431929446
26	NC_019937	GAT	2	6	1200	1205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431929446
27	NC_019937	CTG	2	6	1227	1232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929446
28	NC_019937	ACCT	2	8	1266	1273	25 %	25 %	0 %	50 %	431929446
29	NC_019937	A	6	6	1312	1317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019937	ACC	2	6	1398	1403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_019937	ATT	2	6	1456	1461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019937	GAT	2	6	1485	1490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019937	GTC	2	6	1684	1689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929447
34	NC_019937	CGC	3	9	1694	1702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431929447
35	NC_019937	CTG	2	6	1833	1838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929447
36	NC_019937	TTC	2	6	1842	1847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431929447
37	NC_019937	AGC	2	6	1861	1866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929447
38	NC_019937	CTC	2	6	1917	1922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431929447
39	NC_019937	GCCA	2	8	1934	1941	25 %	0 %	25 %	50 %	431929447
40	NC_019937	CTT	2	6	1968	1973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431929447
41	NC_019937	GCT	2	6	1988	1993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929447
42	NC_019937	AGG	2	6	2088	2093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431929447
43	NC_019937	AGG	2	6	2134	2139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431929447
44	NC_019937	ATC	2	6	2170	2175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019937	GCA	2	6	2194	2199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019937	CTT	2	6	2341	2346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019937	CAC	2	6	2453	2458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_019937	CAC	2	6	2533	2538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_019937	ACCT	2	8	2557	2564	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019937	TCC	2	6	2699	2704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_019937	GCCT	2	8	2836	2843	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019937	GTA	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431929448
53	NC_019937	GCCT	2	8	2977	2984	0 %	25 %	25 %	50 %	431929448
54	NC_019937	AGA	2	6	2988	2993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431929448
55	NC_019937	GAT	2	6	3003	3008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431929448
56	NC_019937	GCA	3	9	3058	3066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929448
57	NC_019937	GAA	2	6	3139	3144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431929448
58	NC_019937	A	6	6	3215	3220	100 %	0 %	0 %	0 %	431929448
59	NC_019937	GGCCG	2	10	3239	3248	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
60	NC_019937	GGC	2	6	3259	3264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019937	GAT	2	6	3323	3328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019937	TGA	2	6	3347	3352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019937	AT	3	6	3375	3380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019937	TTG	2	6	3386	3391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019937	CCTCCC	2	12	3403	3414	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
66	NC_019937	G	6	6	3443	3448	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019937	T	6	6	3576	3581	0 %	100 %	0 %	0 %	431929449
68	NC_019937	AAG	2	6	3582	3587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431929449
69	NC_019937	GCA	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929449
70	NC_019937	CGA	2	6	3756	3761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929449
71	NC_019937	CGA	2	6	3803	3808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929449
72	NC_019937	CATG	2	8	3917	3924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019937	ATG	2	6	4051	4056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019937	ATC	2	6	4081	4086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019937	TGGT	2	8	4103	4110	0 %	50 %	50 %	0 %	431929450
76	NC_019937	GAA	2	6	4117	4122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431929450
77	NC_019937	GCGA	2	8	4219	4226	25 %	0 %	50 %	25 %	431929450
78	NC_019937	ACA	2	6	4250	4255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431929450
79	NC_019937	TCT	2	6	4364	4369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019937	CAA	2	6	4452	4457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431929451
81	NC_019937	GAAGA	2	10	4545	4554	60 %	0 %	40 %	0 %	431929451
82	NC_019937	ACC	2	6	4659	4664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431929451
83	NC_019937	CTG	2	6	4668	4673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929451
84	NC_019937	AAAG	2	8	4692	4699	75 %	0 %	25 %	0 %	431929451
85	NC_019937	CT	3	6	4879	4884	0 %	50 %	0 %	50 %	431929451
86	NC_019937	ACG	2	6	4907	4912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929451
87	NC_019937	GAA	2	6	4920	4925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431929451
88	NC_019937	CCT	2	6	4952	4957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431929451
89	NC_019937	CT	3	6	4989	4994	0 %	50 %	0 %	50 %	431929451
90	NC_019937	C	6	6	5026	5031	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_019937	AGCC	2	8	5037	5044	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_019937	TCG	2	6	5206	5211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929452
93	NC_019937	CGA	2	6	5261	5266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929452
94	NC_019937	TGA	2	6	5309	5314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431929452
95	NC_019937	GCC	2	6	5417	5422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431929453
96	NC_019937	CCT	2	6	5429	5434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431929453
97	NC_019937	GCA	2	6	5447	5452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929453
98	NC_019937	CGG	2	6	5486	5491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431929453
99	NC_019937	GTA	2	6	5541	5546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431929453
100	NC_019937	CAT	2	6	5730	5735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431929454
101	NC_019937	AG	3	6	5748	5753	50 %	0 %	50 %	0 %	431929454
102	NC_019937	CGC	2	6	5787	5792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431929454
103	NC_019937	ATC	2	6	5860	5865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431929454
104	NC_019937	AGCA	2	8	5898	5905	50 %	0 %	25 %	25 %	431929454
105	NC_019937	CAG	2	6	5981	5986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929455
106	NC_019937	ACC	2	6	6025	6030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431929455
107	NC_019937	ACC	2	6	6121	6126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431929455
108	NC_019937	TCGT	2	8	6164	6171	0 %	50 %	25 %	25 %	431929455
109	NC_019937	CT	3	6	6334	6339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019937	AGC	2	6	6361	6366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019937	TAG	3	9	6394	6402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019937	CA	3	6	6404	6409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019937	GTGA	2	8	6437	6444	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019937	AGC	2	6	6506	6511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019937	TAG	3	9	6539	6547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019937	CA	3	6	6549	6554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019937	GCT	2	6	6640	6645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929456
118	NC_019937	CCCTT	2	10	6669	6678	0 %	40 %	0 %	60 %	431929456
119	NC_019937	CTG	2	6	6706	6711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929456
120	NC_019937	TCGC	2	8	6794	6801	0 %	25 %	25 %	50 %	431929456
121	NC_019937	GC	3	6	6800	6805	0 %	0 %	50 %	50 %	431929456
122	NC_019937	TGA	2	6	6817	6822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431929456
123	NC_019937	CTC	2	6	6842	6847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431929456
124	NC_019937	TTC	2	6	6882	6887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431929456
125	NC_019937	CCG	2	6	6915	6920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431929456
126	NC_019937	GGCCTT	2	12	6947	6958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929456
127	NC_019937	TCG	2	6	6978	6983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929456
128	NC_019937	GCA	2	6	6984	6989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929456
129	NC_019937	GCT	2	6	7009	7014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929456
130	NC_019937	TGA	2	6	7035	7040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431929456
131	NC_019937	GACA	2	8	7065	7072	50 %	0 %	25 %	25 %	431929456
132	NC_019937	CAGTG	2	10	7089	7098	20 %	20 %	40 %	20 %	431929456
133	NC_019937	GCC	2	6	7260	7265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431929456
134	NC_019937	GCA	2	6	7288	7293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929456
135	NC_019937	GCA	2	6	7318	7323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929456
136	NC_019937	GCT	2	6	7324	7329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929456
137	NC_019937	GCT	2	6	7361	7366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929456
138	NC_019937	CG	3	6	7441	7446	0 %	0 %	50 %	50 %	431929456
139	NC_019937	GGC	2	6	7529	7534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431929456
140	NC_019937	ACC	2	6	7590	7595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431929456
141	NC_019937	AG	3	6	7596	7601	50 %	0 %	50 %	0 %	431929456
142	NC_019937	TCG	2	6	7653	7658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929456
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148	NC_019937	TGA	2	6	7999	8004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_019937	CTG	2	6	8153	8158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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252	NC_019937	CCA	2	6	12692	12697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431929461
253	NC_019937	GCT	3	9	12716	12724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929461

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.