MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri RCH2 chromosome

Total Repeats: 103961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_019936	AAC	2	6	642954	642959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925791
15003	NC_019936	CTG	2	6	643011	643016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925791
15004	NC_019936	GAA	2	6	643026	643031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925791
15005	NC_019936	TGG	2	6	643123	643128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925791
15006	NC_019936	CAGA	2	8	643190	643197	50 %	0 %	25 %	25 %	431925791
15007	NC_019936	CTA	2	6	643226	643231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925791
15008	NC_019936	AAT	2	6	643391	643396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431925791
15009	NC_019936	GCC	2	6	643411	643416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925791
15010	NC_019936	AGC	2	6	643417	643422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925791
15011	NC_019936	A	6	6	643515	643520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_019936	C	6	6	643533	643538	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15013	NC_019936	TGC	2	6	643578	643583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925792
15014	NC_019936	GGC	2	6	643620	643625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925792
15015	NC_019936	CAT	2	6	643629	643634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925792
15016	NC_019936	TCA	2	6	643649	643654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925792
15017	NC_019936	CAT	2	6	643671	643676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925792
15018	NC_019936	CGC	2	6	643691	643696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925792
15019	NC_019936	TCA	2	6	643697	643702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925792
15020	NC_019936	GATTGC	2	12	643770	643781	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	431925792
15021	NC_019936	CAT	2	6	643922	643927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925793
15022	NC_019936	CAA	2	6	643928	643933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925793
15023	NC_019936	GTT	2	6	643965	643970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431925793
15024	NC_019936	CGC	2	6	643976	643981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925793
15025	NC_019936	TGC	2	6	644077	644082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925793
15026	NC_019936	AAG	2	6	644490	644495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_019936	CCG	2	6	644547	644552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15028	NC_019936	GCG	2	6	644558	644563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15029	NC_019936	TGG	2	6	644602	644607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925795
15030	NC_019936	GAG	2	6	644622	644627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431925795
15031	NC_019936	CTT	2	6	644650	644655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925795
15032	NC_019936	GCTTT	2	10	644677	644686	0 %	60 %	20 %	20 %	431925795
15033	NC_019936	CCG	2	6	644803	644808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925795
15034	NC_019936	CGG	2	6	644875	644880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925795
15035	NC_019936	GTTG	2	8	644953	644960	0 %	50 %	50 %	0 %	431925796
15036	NC_019936	GGT	2	6	644968	644973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925796
15037	NC_019936	CGG	2	6	644987	644992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925796
15038	NC_019936	CAG	2	6	644998	645003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925796
15039	NC_019936	GAAC	2	8	645018	645025	50 %	0 %	25 %	25 %	431925796
15040	NC_019936	ATC	2	6	645047	645052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925796
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15042	NC_019936	GCG	2	6	645068	645073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925796
15043	NC_019936	GCA	2	6	645120	645125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925796
15044	NC_019936	TTC	2	6	645251	645256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925796
15045	NC_019936	CAG	2	6	645262	645267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925796
15046	NC_019936	CAG	2	6	645285	645290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925796
15047	NC_019936	ATG	2	6	645452	645457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925796
15048	NC_019936	ACG	2	6	645473	645478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925796
15049	NC_019936	AGCTTC	2	12	645479	645490	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	431925796
15050	NC_019936	GCTC	2	8	645497	645504	0 %	25 %	25 %	50 %	431925796
15051	NC_019936	CAC	2	6	645589	645594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925796
15052	NC_019936	GCC	2	6	645596	645601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925796
15053	NC_019936	GCG	2	6	645726	645731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925796
15054	NC_019936	ACC	2	6	645841	645846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925796
15055	NC_019936	CGAT	2	8	645861	645868	25 %	25 %	25 %	25 %	431925796
15056	NC_019936	GCG	3	9	645899	645907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925796
15057	NC_019936	CGAT	2	8	645911	645918	25 %	25 %	25 %	25 %	431925796
15058	NC_019936	GCC	2	6	645937	645942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925796
15059	NC_019936	TC	3	6	645949	645954	0 %	50 %	0 %	50 %	431925796
15060	NC_019936	T	6	6	645993	645998	0 %	100 %	0 %	0 %	431925796
15061	NC_019936	CGG	2	6	646105	646110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925796
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15063	NC_019936	GTC	2	6	646220	646225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925796
15064	NC_019936	GCGGG	2	10	646239	646248	0 %	0 %	80 %	20 %	431925796
15065	NC_019936	CTG	2	6	646327	646332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925796
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15069	NC_019936	CCA	2	6	646473	646478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925796
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15078	NC_019936	CAACG	2	10	647047	647056	40 %	0 %	20 %	40 %	431925796
15079	NC_019936	CTC	2	6	647065	647070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431925796
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15089	NC_019936	GACA	2	8	647869	647876	50 %	0 %	25 %	25 %	431925796
15090	NC_019936	GTC	3	9	647882	647890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925796
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15092	NC_019936	GACC	2	8	648004	648011	25 %	0 %	25 %	50 %	431925796
15093	NC_019936	CAG	2	6	648043	648048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925796
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15101	NC_019936	GC	3	6	648747	648752	0 %	0 %	50 %	50 %	431925797
15102	NC_019936	CGC	2	6	648899	648904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925797
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15104	NC_019936	GC	3	6	648933	648938	0 %	0 %	50 %	50 %	431925797
15105	NC_019936	GTTC	2	8	648946	648953	0 %	50 %	25 %	25 %	431925797
15106	NC_019936	GGC	2	6	648973	648978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925797
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15109	NC_019936	GC	3	6	649100	649105	0 %	0 %	50 %	50 %	431925797
15110	NC_019936	TCC	2	6	649120	649125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431925797
15111	NC_019936	TCG	2	6	649192	649197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925797
15112	NC_019936	TCT	3	9	649429	649437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925797
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15119	NC_019936	GCA	2	6	650191	650196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925798
15120	NC_019936	CAGC	2	8	650212	650219	25 %	0 %	25 %	50 %	431925798
15121	NC_019936	TGC	2	6	650222	650227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925798
15122	NC_019936	GCC	2	6	650267	650272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925798
15123	NC_019936	GCT	2	6	650323	650328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925798
15124	NC_019936	CGG	2	6	650377	650382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925798
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15126	NC_019936	AGCG	2	8	650542	650549	25 %	0 %	50 %	25 %	431925798
15127	NC_019936	TGCG	2	8	650626	650633	0 %	25 %	50 %	25 %	431925798
15128	NC_019936	CCA	2	6	650635	650640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925798
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15131	NC_019936	GGC	2	6	650753	650758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925798
15132	NC_019936	CGG	2	6	650765	650770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925798
15133	NC_019936	AATA	2	8	650776	650783	75 %	25 %	0 %	0 %	431925798
15134	NC_019936	GC	3	6	650831	650836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15135	NC_019936	AGC	2	6	650965	650970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15136	NC_019936	GGTC	2	8	651120	651127	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15137	NC_019936	CAT	2	6	651157	651162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15138	NC_019936	AGC	2	6	651230	651235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15139	NC_019936	AAGG	2	8	651241	651248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15140	NC_019936	CAAT	2	8	651296	651303	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15141	NC_019936	AAGCCT	2	12	651329	651340	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15142	NC_019936	GCTGA	2	10	651403	651412	20 %	20 %	40 %	20 %	431925799
15143	NC_019936	GCA	2	6	651427	651432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925799
15144	NC_019936	ATC	2	6	651433	651438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925799
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15147	NC_019936	GTGCCC	2	12	651634	651645	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	431925799
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15152	NC_019936	CG	3	6	651810	651815	0 %	0 %	50 %	50 %	431925799
15153	NC_019936	ATG	2	6	651844	651849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925799
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15155	NC_019936	TAGCTG	2	12	652050	652061	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	431925799
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15158	NC_019936	GCAA	2	8	652425	652432	50 %	0 %	25 %	25 %	431925799
15159	NC_019936	TGG	2	6	652649	652654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925799
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15178	NC_019936	AT	3	6	653807	653812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15179	NC_019936	GTAT	2	8	653881	653888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15180	NC_019936	GCT	2	6	653899	653904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15181	NC_019936	CTG	2	6	653931	653936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15182	NC_019936	GCCTA	2	10	653937	653946	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15183	NC_019936	TGA	2	6	653981	653986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15184	NC_019936	GAG	2	6	654095	654100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15185	NC_019936	AGTG	2	8	654178	654185	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15186	NC_019936	TC	3	6	654234	654239	0 %	50 %	0 %	50 %	431925800
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15189	NC_019936	GGA	2	6	654336	654341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15191	NC_019936	GTCA	2	8	654415	654422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15192	NC_019936	CCG	2	6	654426	654431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15193	NC_019936	AGGT	2	8	654471	654478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15194	NC_019936	TCGA	2	8	654479	654486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15195	NC_019936	GCTT	2	8	654587	654594	0 %	50 %	25 %	25 %	431925801
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15205	NC_019936	TAATT	2	10	655378	655387	40 %	60 %	0 %	0 %	431925801
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15212	NC_019936	GGT	2	6	655620	655625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15213	NC_019936	AGGG	2	8	655663	655670	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15214	NC_019936	GCGA	2	8	655671	655678	25 %	0 %	50 %	25 %	431925802
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15220	NC_019936	GGC	2	6	656122	656127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15221	NC_019936	CAT	2	6	656207	656212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15222	NC_019936	TTC	2	6	656287	656292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15223	NC_019936	TG	3	6	656331	656336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15224	NC_019936	ATG	2	6	656472	656477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15225	NC_019936	CAA	2	6	656525	656530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15226	NC_019936	CTG	2	6	656541	656546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15227	NC_019936	T	6	6	656561	656566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15228	NC_019936	TCT	2	6	656752	656757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15229	NC_019936	CCGG	2	8	656766	656773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15230	NC_019936	AAC	2	6	656811	656816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15231	NC_019936	TGA	2	6	656833	656838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15232	NC_019936	AGA	2	6	656839	656844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15233	NC_019936	CAA	2	6	656861	656866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15234	NC_019936	ACG	2	6	656905	656910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15235	NC_019936	ATT	2	6	656962	656967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15237	NC_019936	GAG	2	6	656995	657000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15238	NC_019936	T	6	6	657050	657055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15239	NC_019936	TGA	2	6	657061	657066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15240	NC_019936	CTG	2	6	657144	657149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15241	NC_019936	TCT	2	6	657238	657243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15243	NC_019936	GGC	2	6	657286	657291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15244	NC_019936	AGT	2	6	657350	657355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925803
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15354	NC_019936	TGGA	2	8	663840	663847	25 %	25 %	50 %	0 %	431925810
15355	NC_019936	TAT	2	6	663912	663917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431925810
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15357	NC_019936	TATCTG	2	12	664042	664053	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15358	NC_019936	T	7	7	664074	664080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15359	NC_019936	GAC	2	6	664121	664126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925811
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15486	NC_019936	CAG	2	6	670902	670907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15487	NC_019936	CATTA	2	10	670919	670928	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15488	NC_019936	CGC	2	6	671067	671072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15489	NC_019936	ATC	2	6	671073	671078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15490	NC_019936	CGT	2	6	671095	671100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15491	NC_019936	TAT	2	6	671222	671227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15492	NC_019936	T	6	6	671235	671240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15493	NC_019936	CATAAC	2	12	671300	671311	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	431925815
15494	NC_019936	GTT	2	6	671381	671386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431925815
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