MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri RCH2 chromosome

Total Repeats: 103961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019936	CGA	2	6	43512	43517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925249
1002	NC_019936	GC	3	6	43530	43535	0 %	0 %	50 %	50 %	431925249
1003	NC_019936	AAGG	2	8	43624	43631	50 %	0 %	50 %	0 %	431925249
1004	NC_019936	AGC	2	6	43657	43662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925249
1005	NC_019936	ACA	2	6	43688	43693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925249
1006	NC_019936	GCAG	2	8	43706	43713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_019936	GGC	2	6	43714	43719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_019936	GCA	2	6	43726	43731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_019936	CCCG	2	8	43740	43747	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1010	NC_019936	TGT	2	6	43752	43757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_019936	GC	3	6	43789	43794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_019936	GCT	2	6	43813	43818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_019936	GCC	2	6	43824	43829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_019936	GCC	2	6	43865	43870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_019936	GCC	2	6	43934	43939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925250
1016	NC_019936	CG	3	6	44086	44091	0 %	0 %	50 %	50 %	431925250
1017	NC_019936	CTG	3	9	44147	44155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925250
1018	NC_019936	CGC	2	6	44221	44226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925250
1019	NC_019936	TCGAAC	2	12	44238	44249	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	431925250
1020	NC_019936	GCC	3	9	44279	44287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925250
1021	NC_019936	TGG	2	6	44301	44306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925250
1022	NC_019936	ACG	2	6	44325	44330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925250
1023	NC_019936	GCC	2	6	44357	44362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925250
1024	NC_019936	GCGA	2	8	44423	44430	25 %	0 %	50 %	25 %	431925250
1025	NC_019936	ATGG	2	8	44450	44457	25 %	25 %	50 %	0 %	431925250
1026	NC_019936	GCTG	2	8	44461	44468	0 %	25 %	50 %	25 %	431925250
1027	NC_019936	CGCA	2	8	44599	44606	25 %	0 %	25 %	50 %	431925250
1028	NC_019936	CGA	2	6	44623	44628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925250
1029	NC_019936	CCG	2	6	44631	44636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925250
1030	NC_019936	CGA	2	6	44659	44664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925250
1031	NC_019936	GGGT	2	8	44712	44719	0 %	25 %	75 %	0 %	431925250
1032	NC_019936	CAG	3	9	44879	44887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925250
1033	NC_019936	GCT	2	6	44911	44916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925250
1034	NC_019936	ACCC	2	8	44926	44933	25 %	0 %	0 %	75 %	431925250
1035	NC_019936	CGA	2	6	44941	44946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925250
1036	NC_019936	GCC	2	6	44972	44977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925250
1037	NC_019936	GAT	2	6	45037	45042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925250
1038	NC_019936	CTCGC	2	10	45053	45062	0 %	20 %	20 %	60 %	431925250
1039	NC_019936	AAC	2	6	45125	45130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925250
1040	NC_019936	GCA	2	6	45163	45168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925250
1041	NC_019936	CGC	2	6	45178	45183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925250
1042	NC_019936	TCGGC	2	10	45330	45339	0 %	20 %	40 %	40 %	431925250
1043	NC_019936	CTG	2	6	45353	45358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925250
1044	NC_019936	ACG	2	6	45368	45373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_019936	CTC	2	6	45374	45379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_019936	CAG	2	6	45386	45391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_019936	GCA	2	6	45447	45452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_019936	CAG	2	6	45453	45458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_019936	CTCA	2	8	45516	45523	25 %	25 %	0 %	50 %	431925251
1050	NC_019936	GC	3	6	45557	45562	0 %	0 %	50 %	50 %	431925251
1051	NC_019936	GTA	2	6	45570	45575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925251
1052	NC_019936	GCC	2	6	45613	45618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925251
1053	NC_019936	CGC	2	6	45635	45640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925251
1054	NC_019936	CCGG	2	8	45651	45658	0 %	0 %	50 %	50 %	431925251
1055	NC_019936	GCCAGC	2	12	45694	45705	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	431925251
1056	NC_019936	CGC	2	6	45719	45724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925251
1057	NC_019936	CTC	2	6	45837	45842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431925251
1058	NC_019936	CTG	2	6	45846	45851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925251
1059	NC_019936	TGCA	2	8	45921	45928	25 %	25 %	25 %	25 %	431925251
1060	NC_019936	CGA	2	6	45989	45994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925251
1061	NC_019936	CAGCTC	2	12	46011	46022	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	431925251
1062	NC_019936	GCA	2	6	46073	46078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925251
1063	NC_019936	CCG	2	6	46112	46117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925251
1064	NC_019936	GCC	2	6	46124	46129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925251
1065	NC_019936	CTC	2	6	46143	46148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431925251
1066	NC_019936	GCGCC	2	10	46173	46182	0 %	0 %	40 %	60 %	431925251
1067	NC_019936	CTC	2	6	46203	46208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431925251
1068	NC_019936	GGC	2	6	46220	46225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925251
1069	NC_019936	CGC	2	6	46234	46239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925251
1070	NC_019936	TCG	2	6	46369	46374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925251
1071	NC_019936	GGTT	2	8	46376	46383	0 %	50 %	50 %	0 %	431925251
1072	NC_019936	GGC	2	6	46432	46437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_019936	GCA	2	6	46449	46454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_019936	GTT	2	6	46466	46471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_019936	CGG	2	6	46486	46491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_019936	CGC	2	6	46509	46514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_019936	CAC	2	6	46637	46642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925252
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1079	NC_019936	GGC	2	6	46685	46690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925252
1080	NC_019936	TCG	2	6	46731	46736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925252
1081	NC_019936	CAG	2	6	46757	46762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925252
1082	NC_019936	CCG	2	6	46784	46789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925252
1083	NC_019936	TCG	2	6	46897	46902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925252
1084	NC_019936	CAC	2	6	46928	46933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925252
1085	NC_019936	GCC	2	6	46966	46971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925252
1086	NC_019936	CAA	3	9	46982	46990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925252
1087	NC_019936	CAC	2	6	47018	47023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925252
1088	NC_019936	CG	3	6	47145	47150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_019936	GCA	2	6	47233	47238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_019936	AAGG	2	8	47295	47302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_019936	GC	3	6	47311	47316	0 %	0 %	50 %	50 %	431925253
1092	NC_019936	AC	3	6	47348	47353	50 %	0 %	0 %	50 %	431925253
1093	NC_019936	GCG	2	6	47361	47366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925253
1094	NC_019936	GCT	2	6	47388	47393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925253
1095	NC_019936	GAT	2	6	47398	47403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925253
1096	NC_019936	CTG	2	6	47409	47414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925253
1097	NC_019936	GC	3	6	47440	47445	0 %	0 %	50 %	50 %	431925253
1098	NC_019936	TGC	2	6	47462	47467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925253
1099	NC_019936	CCG	2	6	47470	47475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925253
1100	NC_019936	CG	3	6	47474	47479	0 %	0 %	50 %	50 %	431925253
1101	NC_019936	AAAT	2	8	47552	47559	75 %	25 %	0 %	0 %	431925253
1102	NC_019936	A	6	6	47609	47614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_019936	A	6	6	47646	47651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_019936	GCA	2	6	47656	47661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_019936	ACA	2	6	47675	47680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_019936	CGG	2	6	47686	47691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_019936	CAT	2	6	47798	47803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_019936	CCA	2	6	47861	47866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_019936	GCA	2	6	47890	47895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_019936	A	8	8	47899	47906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_019936	TCGC	2	8	47932	47939	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_019936	CGCT	2	8	47942	47949	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_019936	GCC	2	6	47966	47971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_019936	A	6	6	47990	47995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_019936	GATG	2	8	47997	48004	25 %	25 %	50 %	0 %	431925254
1116	NC_019936	AT	3	6	48111	48116	50 %	50 %	0 %	0 %	431925254
1117	NC_019936	ATA	2	6	48244	48249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431925254
1118	NC_019936	GAA	2	6	48259	48264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925254
1119	NC_019936	TCGCT	2	10	48393	48402	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1120	NC_019936	CCCGT	2	10	48420	48429	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1121	NC_019936	CCA	2	6	48455	48460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_019936	ACT	2	6	48498	48503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_019936	AAG	2	6	48513	48518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_019936	GTT	2	6	48554	48559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431925255
1125	NC_019936	CG	3	6	48563	48568	0 %	0 %	50 %	50 %	431925255
1126	NC_019936	CG	3	6	48623	48628	0 %	0 %	50 %	50 %	431925255
1127	NC_019936	GAGGC	2	10	48649	48658	20 %	0 %	60 %	20 %	431925255
1128	NC_019936	GCT	2	6	48680	48685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925255
1129	NC_019936	GGC	2	6	48694	48699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925255
1130	NC_019936	GCTG	2	8	48722	48729	0 %	25 %	50 %	25 %	431925255
1131	NC_019936	CGAT	2	8	48742	48749	25 %	25 %	25 %	25 %	431925255
1132	NC_019936	CGC	2	6	48776	48781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925255
1133	NC_019936	GAT	2	6	48836	48841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925255
1134	NC_019936	TGA	2	6	48904	48909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925255
1135	NC_019936	TGC	2	6	48973	48978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925255
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1138	NC_019936	AGC	2	6	49124	49129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_019936	TACCCA	2	12	49179	49190	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1140	NC_019936	TGCCCA	2	12	49191	49202	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1141	NC_019936	TGCCCG	2	12	49203	49214	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1142	NC_019936	TGG	2	6	49238	49243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_019936	CGCTT	2	10	49258	49267	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1144	NC_019936	GCT	2	6	49333	49338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925256
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1153	NC_019936	GGCT	2	8	49566	49573	0 %	25 %	50 %	25 %	431925256
1154	NC_019936	GC	3	6	49614	49619	0 %	0 %	50 %	50 %	431925256
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1184	NC_019936	CGCC	2	8	50897	50904	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1240	NC_019936	AGGG	2	8	52798	52805	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1241	NC_019936	CGG	2	6	52876	52881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1242	NC_019936	CGC	2	6	52966	52971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925258
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1244	NC_019936	AT	3	6	53146	53151	50 %	50 %	0 %	0 %	431925258
1245	NC_019936	TGG	2	6	53185	53190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925258
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1248	NC_019936	CG	3	6	53498	53503	0 %	0 %	50 %	50 %	431925258
1249	NC_019936	GCA	2	6	53541	53546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925258
1250	NC_019936	CGC	2	6	53624	53629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1251	NC_019936	TCG	2	6	53636	53641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1252	NC_019936	GCC	2	6	53684	53689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1253	NC_019936	CGC	3	9	53741	53749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925259
1254	NC_019936	GCA	2	6	53750	53755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925259
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1256	NC_019936	GTG	2	6	53916	53921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925259
1257	NC_019936	CGC	2	6	54058	54063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1258	NC_019936	CGGCA	2	10	54066	54075	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1259	NC_019936	GCA	2	6	54084	54089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1374	NC_019936	GGC	2	6	58787	58792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925266
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1383	NC_019936	CTGC	2	8	59480	59487	0 %	25 %	25 %	50 %	431925267
1384	NC_019936	GGCC	2	8	59489	59496	0 %	0 %	50 %	50 %	431925267
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