MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri RCH2 chromosome

Total Repeats: 103961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_019936	GCT	2	6	464670	464675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925630
11002	NC_019936	ATC	2	6	464701	464706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925630
11003	NC_019936	CCT	2	6	464708	464713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431925630
11004	NC_019936	GCC	2	6	464726	464731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925630
11005	NC_019936	CAA	2	6	464742	464747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925630
11006	NC_019936	CAC	2	6	464823	464828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925630
11007	NC_019936	CCG	2	6	464950	464955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925630
11008	NC_019936	CGA	2	6	464971	464976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925630
11009	NC_019936	GTC	2	6	465060	465065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925630
11010	NC_019936	CGC	2	6	465092	465097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925630
11011	NC_019936	CCAG	2	8	465101	465108	25 %	0 %	25 %	50 %	431925630
11012	NC_019936	CTTC	2	8	465140	465147	0 %	50 %	0 %	50 %	431925630
11013	NC_019936	TCGGC	2	10	465161	465170	0 %	20 %	40 %	40 %	431925630
11014	NC_019936	GTA	2	6	465180	465185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925630
11015	NC_019936	TGA	2	6	465251	465256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_019936	CGG	2	6	465292	465297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925631
11017	NC_019936	T	6	6	465300	465305	0 %	100 %	0 %	0 %	431925631
11018	NC_019936	CG	3	6	465341	465346	0 %	0 %	50 %	50 %	431925631
11019	NC_019936	ATC	2	6	465371	465376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925631
11020	NC_019936	CTG	2	6	465380	465385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925631
11021	NC_019936	CTTG	2	8	465493	465500	0 %	50 %	25 %	25 %	431925631
11022	NC_019936	TTC	2	6	465518	465523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925631
11023	NC_019936	CCT	2	6	465549	465554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11024	NC_019936	CATC	2	8	465605	465612	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11025	NC_019936	GCA	2	6	465656	465661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_019936	GAC	2	6	465683	465688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_019936	CAC	2	6	465744	465749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11028	NC_019936	AAC	2	6	465769	465774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_019936	GTTT	2	8	465784	465791	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_019936	TCT	2	6	465885	465890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_019936	ACA	2	6	465922	465927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11032	NC_019936	GGC	2	6	465940	465945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11033	NC_019936	AGAAT	2	10	465996	466005	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_019936	CT	3	6	466031	466036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11035	NC_019936	GCA	2	6	466084	466089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11036	NC_019936	ATCA	2	8	466092	466099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11037	NC_019936	CCT	2	6	466103	466108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11038	NC_019936	GAA	2	6	466120	466125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_019936	TTC	2	6	466145	466150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_019936	GCC	2	6	466164	466169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11041	NC_019936	TGC	2	6	466326	466331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925632
11042	NC_019936	CGT	2	6	466348	466353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925632
11043	NC_019936	GGC	2	6	466361	466366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925632
11044	NC_019936	GTG	2	6	466404	466409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925632
11045	NC_019936	TGC	2	6	466419	466424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925632
11046	NC_019936	TC	3	6	466429	466434	0 %	50 %	0 %	50 %	431925632
11047	NC_019936	GGC	2	6	466490	466495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925632
11048	NC_019936	TCG	2	6	466549	466554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925632
11049	NC_019936	CAC	2	6	466577	466582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925632
11050	NC_019936	CGCTC	2	10	466647	466656	0 %	20 %	20 %	60 %	431925632
11051	NC_019936	CTCG	2	8	466703	466710	0 %	25 %	25 %	50 %	431925632
11052	NC_019936	GGTC	2	8	466711	466718	0 %	25 %	50 %	25 %	431925632
11053	NC_019936	CAG	3	9	466763	466771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925632
11054	NC_019936	CG	3	6	466783	466788	0 %	0 %	50 %	50 %	431925632
11055	NC_019936	TGC	2	6	466875	466880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925632
11056	NC_019936	CGC	2	6	466943	466948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925632
11057	NC_019936	CGT	2	6	466960	466965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925632
11058	NC_019936	CAGC	2	8	467060	467067	25 %	0 %	25 %	50 %	431925632
11059	NC_019936	ACC	2	6	467083	467088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925632
11060	NC_019936	CTTG	2	8	467150	467157	0 %	50 %	25 %	25 %	431925633
11061	NC_019936	GCCGAT	2	12	467191	467202	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	431925633
11062	NC_019936	CTG	2	6	467224	467229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925633
11063	NC_019936	AAG	2	6	467302	467307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925633
11064	NC_019936	ACC	2	6	467323	467328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925633
11065	NC_019936	GAT	2	6	467340	467345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925633
11066	NC_019936	CAAAAG	2	12	467409	467420	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	431925633
11067	NC_019936	AAG	2	6	467530	467535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925633
11068	NC_019936	CTT	2	6	467590	467595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925633
11069	NC_019936	AAC	2	6	467630	467635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925633
11070	NC_019936	GCG	2	6	467777	467782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925633
11071	NC_019936	TCG	2	6	467855	467860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925633
11072	NC_019936	CGA	2	6	467865	467870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925633
11073	NC_019936	TGC	2	6	467879	467884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925633
11074	NC_019936	GCT	2	6	467955	467960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925633
11075	NC_019936	ACG	2	6	468007	468012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925634
11076	NC_019936	CTGC	2	8	468021	468028	0 %	25 %	25 %	50 %	431925634
11077	NC_019936	TGG	2	6	468069	468074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925634
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11080	NC_019936	GCT	2	6	468137	468142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925634
11081	NC_019936	CCA	2	6	468148	468153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925634
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11083	NC_019936	GCC	2	6	468203	468208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925634
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11085	NC_019936	TGG	3	9	468301	468309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925634
11086	NC_019936	GC	3	6	468321	468326	0 %	0 %	50 %	50 %	431925634
11087	NC_019936	TGC	2	6	468367	468372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925634
11088	NC_019936	CGGT	2	8	468384	468391	0 %	25 %	50 %	25 %	431925634
11089	NC_019936	CAT	2	6	468410	468415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925634
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11091	NC_019936	TTC	2	6	468495	468500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925634
11092	NC_019936	CGA	2	6	468521	468526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925634
11093	NC_019936	GCG	2	6	468549	468554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925634
11094	NC_019936	TGC	3	9	468574	468582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925634
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11096	NC_019936	CGG	2	6	468683	468688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925634
11097	NC_019936	CAT	2	6	468719	468724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925634
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11101	NC_019936	TAG	2	6	468778	468783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925634
11102	NC_019936	TGC	2	6	468799	468804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925634
11103	NC_019936	TGC	2	6	468831	468836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925635
11104	NC_019936	CTG	2	6	468881	468886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925635
11105	NC_019936	TGA	2	6	468903	468908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925635
11106	NC_019936	CG	3	6	468933	468938	0 %	0 %	50 %	50 %	431925635
11107	NC_019936	GAT	2	6	468973	468978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925635
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11109	NC_019936	GC	3	6	469047	469052	0 %	0 %	50 %	50 %	431925635
11110	NC_019936	TGGGGC	2	12	469167	469178	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	431925635
11111	NC_019936	GCA	2	6	469190	469195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925635
11112	NC_019936	CTG	2	6	469442	469447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925635
11113	NC_019936	GCT	2	6	469492	469497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925635
11114	NC_019936	GCC	2	6	469559	469564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925635
11115	NC_019936	CGG	2	6	469594	469599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925635
11116	NC_019936	GCG	2	6	469604	469609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925635
11117	NC_019936	CG	3	6	469637	469642	0 %	0 %	50 %	50 %	431925635
11118	NC_019936	GATC	2	8	469657	469664	25 %	25 %	25 %	25 %	431925635
11119	NC_019936	GCT	2	6	469669	469674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925635
11120	NC_019936	GC	3	6	469720	469725	0 %	0 %	50 %	50 %	431925635
11121	NC_019936	CAT	2	6	469762	469767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925635
11122	NC_019936	GC	3	6	469784	469789	0 %	0 %	50 %	50 %	431925635
11123	NC_019936	GCG	2	6	469897	469902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925636
11124	NC_019936	GCA	2	6	469935	469940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925636
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11126	NC_019936	GAC	2	6	470160	470165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925636
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11131	NC_019936	GCA	2	6	470483	470488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925636
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11136	NC_019936	GCTTG	2	10	470728	470737	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11137	NC_019936	GAC	2	6	470911	470916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11141	NC_019936	GCTC	2	8	471138	471145	0 %	25 %	25 %	50 %	431925637
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11151	NC_019936	GCA	2	6	471663	471668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925637
11152	NC_019936	AGCC	2	8	471673	471680	25 %	0 %	25 %	50 %	431925637
11153	NC_019936	AGCG	2	8	471690	471697	25 %	0 %	50 %	25 %	431925637
11154	NC_019936	TTC	2	6	471780	471785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11155	NC_019936	GACT	2	8	471792	471799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11156	NC_019936	TC	3	6	471805	471810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11157	NC_019936	ATG	2	6	471840	471845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925638
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11164	NC_019936	AT	3	6	472192	472197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11165	NC_019936	TCA	2	6	472221	472226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11168	NC_019936	TGG	2	6	472369	472374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11169	NC_019936	GCA	2	6	472386	472391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11183	NC_019936	AT	3	6	473110	473115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11184	NC_019936	TGC	2	6	473116	473121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11237	NC_019936	GC	3	6	475764	475769	0 %	0 %	50 %	50 %	431925641
11238	NC_019936	TCG	2	6	475785	475790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925641
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11241	NC_019936	CAC	2	6	475904	475909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925641
11242	NC_019936	CTCC	2	8	475983	475990	0 %	25 %	0 %	75 %	431925641
11243	NC_019936	CT	3	6	476030	476035	0 %	50 %	0 %	50 %	431925641
11244	NC_019936	TGG	2	6	476063	476068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925641
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11256	NC_019936	TGC	2	6	476964	476969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925641
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11260	NC_019936	GCTT	2	8	477168	477175	0 %	50 %	25 %	25 %	431925641
11261	NC_019936	GCA	2	6	477260	477265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925641
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11270	NC_019936	GCTG	2	8	477843	477850	0 %	25 %	50 %	25 %	431925642
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11273	NC_019936	GGA	2	6	477933	477938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431925642
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11353	NC_019936	CGT	2	6	481959	481964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925644
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11356	NC_019936	GTAG	2	8	482155	482162	25 %	25 %	50 %	0 %	431925644
11357	NC_019936	CTT	2	6	482169	482174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11358	NC_019936	TCT	2	6	482208	482213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925645
11359	NC_019936	ATC	2	6	482268	482273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925645
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11481	NC_019936	CAG	2	6	487368	487373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925648
11482	NC_019936	GCA	2	6	487406	487411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925648
11483	NC_019936	GGC	2	6	487460	487465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925648
11484	NC_019936	GGC	2	6	487467	487472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925648
11485	NC_019936	GTAT	2	8	487477	487484	25 %	50 %	25 %	0 %	431925648
11486	NC_019936	GGCT	2	8	487526	487533	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11487	NC_019936	ATA	2	6	487573	487578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11488	NC_019936	CAT	2	6	487597	487602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925649
11489	NC_019936	GGC	2	6	487678	487683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925649
11490	NC_019936	GAA	2	6	487735	487740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925649
11491	NC_019936	GCT	2	6	487771	487776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925649
11492	NC_019936	GGCCA	2	10	487832	487841	20 %	0 %	40 %	40 %	431925649
11493	NC_019936	GCA	2	6	487914	487919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925649
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11499	NC_019936	CAG	2	6	488240	488245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925650
11500	NC_019936	CAG	2	6	488264	488269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925650

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