MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri RCH2 chromosome

Total Repeats: 103961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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59002	NC_019936	CAG	2	6	2615433	2615438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431927564
59003	NC_019936	CGG	2	6	2615441	2615446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431927564
59004	NC_019936	GCC	2	6	2615487	2615492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431927564
59005	NC_019936	GCT	2	6	2615546	2615551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927564
59006	NC_019936	GCT	2	6	2615570	2615575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927564
59007	NC_019936	CGA	2	6	2615600	2615605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431927564
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59009	NC_019936	CTC	2	6	2615679	2615684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431927564
59010	NC_019936	CTC	2	6	2615712	2615717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431927564
59011	NC_019936	GGC	2	6	2615735	2615740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431927564
59012	NC_019936	GCC	2	6	2615811	2615816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431927564
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59014	NC_019936	GGT	2	6	2615964	2615969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431927564
59015	NC_019936	GCC	2	6	2615995	2616000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431927564
59016	NC_019936	GC	3	6	2616003	2616008	0 %	0 %	50 %	50 %	431927564
59017	NC_019936	CCTGGC	2	12	2616014	2616025	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	431927564
59018	NC_019936	CGG	2	6	2616026	2616031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431927564
59019	NC_019936	GCA	2	6	2616032	2616037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431927564
59020	NC_019936	CA	3	6	2616036	2616041	50 %	0 %	0 %	50 %	431927564
59021	NC_019936	CGGC	2	8	2616068	2616075	0 %	0 %	50 %	50 %	431927564
59022	NC_019936	CCG	2	6	2616092	2616097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431927564
59023	NC_019936	CG	3	6	2616096	2616101	0 %	0 %	50 %	50 %	431927564
59024	NC_019936	GGC	2	6	2616105	2616110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431927564
59025	NC_019936	CAG	2	6	2616138	2616143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431927564
59026	NC_019936	ACC	2	6	2616156	2616161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431927564
59027	NC_019936	CG	3	6	2616172	2616177	0 %	0 %	50 %	50 %	431927564
59028	NC_019936	CTG	2	6	2616178	2616183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927564
59029	NC_019936	ATC	2	6	2616198	2616203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431927564
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59032	NC_019936	GCG	2	6	2616306	2616311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431927565
59033	NC_019936	CGG	2	6	2616352	2616357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431927565
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59037	NC_019936	CG	4	8	2616457	2616464	0 %	0 %	50 %	50 %	431927565
59038	NC_019936	CAC	2	6	2616482	2616487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431927565
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59041	NC_019936	CGCGC	2	10	2616563	2616572	0 %	0 %	40 %	60 %	431927565
59042	NC_019936	CGG	2	6	2616610	2616615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431927565
59043	NC_019936	GCA	2	6	2616622	2616627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431927565
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59047	NC_019936	GC	3	6	2616788	2616793	0 %	0 %	50 %	50 %	431927565
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59052	NC_019936	GCC	2	6	2616950	2616955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431927565
59053	NC_019936	TTG	2	6	2617004	2617009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59054	NC_019936	CCTG	2	8	2617078	2617085	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59055	NC_019936	TGC	2	6	2617116	2617121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59056	NC_019936	CAA	2	6	2617162	2617167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59057	NC_019936	GC	4	8	2617179	2617186	0 %	0 %	50 %	50 %	431927566
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59061	NC_019936	TGC	2	6	2617479	2617484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927566
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59082	NC_019936	CCTG	2	8	2618255	2618262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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59100	NC_019936	GCTC	2	8	2619301	2619308	0 %	25 %	25 %	50 %	431927568
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59107	NC_019936	GCAGC	2	10	2619826	2619835	20 %	0 %	40 %	40 %	431927569
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59110	NC_019936	TGG	2	6	2620000	2620005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431927569
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59116	NC_019936	CTG	2	6	2620197	2620202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927569
59117	NC_019936	GCG	2	6	2620270	2620275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431927569
59118	NC_019936	TAC	2	6	2620281	2620286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431927569
59119	NC_019936	GGC	2	6	2620295	2620300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431927569
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59121	NC_019936	GTC	2	6	2620341	2620346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927569
59122	NC_019936	TCA	2	6	2620381	2620386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431927569
59123	NC_019936	GC	3	6	2620461	2620466	0 %	0 %	50 %	50 %	431927569
59124	NC_019936	CGC	2	6	2620470	2620475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431927569
59125	NC_019936	GCT	2	6	2620520	2620525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927569
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59127	NC_019936	TCG	2	6	2620543	2620548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927569
59128	NC_019936	GCT	2	6	2620550	2620555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927569
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59132	NC_019936	CAT	2	6	2620646	2620651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431927569
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59139	NC_019936	CTG	2	6	2620909	2620914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927570
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59143	NC_019936	GCC	2	6	2621047	2621052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431927570
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59146	NC_019936	TCG	2	6	2621348	2621353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927570
59147	NC_019936	CCA	2	6	2621393	2621398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431927570
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59182	NC_019936	ATC	2	6	2623147	2623152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431927572
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59185	NC_019936	TCG	2	6	2623344	2623349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927572
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59188	NC_019936	ATC	2	6	2623463	2623468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431927572
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59194	NC_019936	GCGCC	2	10	2623721	2623730	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
59195	NC_019936	CGTG	2	8	2623823	2623830	0 %	25 %	50 %	25 %	431927573
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59212	NC_019936	TCGT	2	8	2624543	2624550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59213	NC_019936	GCGA	2	8	2624554	2624561	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59214	NC_019936	GCCC	2	8	2624570	2624577	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59215	NC_019936	AGC	2	6	2624604	2624609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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59217	NC_019936	GCT	2	6	2624738	2624743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927574
59218	NC_019936	CG	3	6	2624778	2624783	0 %	0 %	50 %	50 %	431927574
59219	NC_019936	GCA	2	6	2624804	2624809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431927574
59220	NC_019936	GC	3	6	2624835	2624840	0 %	0 %	50 %	50 %	431927574
59221	NC_019936	GC	3	6	2624871	2624876	0 %	0 %	50 %	50 %	431927574
59222	NC_019936	GCT	2	6	2624906	2624911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927574
59223	NC_019936	ACG	2	6	2624925	2624930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431927574
59224	NC_019936	CAGCA	2	10	2624955	2624964	40 %	0 %	20 %	40 %	431927574
59225	NC_019936	CAA	2	6	2624984	2624989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431927574
59226	NC_019936	TTG	2	6	2625048	2625053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431927574
59227	NC_019936	GCCA	2	8	2625083	2625090	25 %	0 %	25 %	50 %	431927574
59228	NC_019936	GCA	2	6	2625149	2625154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431927574
59229	NC_019936	GCCA	2	8	2625274	2625281	25 %	0 %	25 %	50 %	431927574
59230	NC_019936	CGC	2	6	2625387	2625392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431927574
59231	NC_019936	TCG	2	6	2625460	2625465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927574
59232	NC_019936	GTC	2	6	2625471	2625476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927574
59233	NC_019936	CGG	3	9	2625483	2625491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431927574
59234	NC_019936	AGC	2	6	2625532	2625537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431927574
59235	NC_019936	GC	5	10	2625592	2625601	0 %	0 %	50 %	50 %	431927574
59236	NC_019936	GC	3	6	2625669	2625674	0 %	0 %	50 %	50 %	431927574
59237	NC_019936	CCAG	2	8	2625677	2625684	25 %	0 %	25 %	50 %	431927574
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59239	NC_019936	GCCTG	2	10	2625757	2625766	0 %	20 %	40 %	40 %	431927574
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59241	NC_019936	CTGC	2	8	2625851	2625858	0 %	25 %	25 %	50 %	431927574
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59243	NC_019936	GAG	2	6	2625956	2625961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431927574
59244	NC_019936	GTG	2	6	2626054	2626059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431927574
59245	NC_019936	GCG	2	6	2626091	2626096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431927574
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59335	NC_019936	CGG	2	6	2629601	2629606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431927577
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59346	NC_019936	CAC	2	6	2630080	2630085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431927577
59347	NC_019936	GCT	2	6	2630133	2630138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927577
59348	NC_019936	GC	4	8	2630256	2630263	0 %	0 %	50 %	50 %	431927577
59349	NC_019936	GC	3	6	2630267	2630272	0 %	0 %	50 %	50 %	431927577
59350	NC_019936	TGAAC	2	10	2630280	2630289	40 %	20 %	20 %	20 %	431927577
59351	NC_019936	CCG	2	6	2630344	2630349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431927577
59352	NC_019936	CGC	2	6	2630364	2630369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431927577
59353	NC_019936	CAGG	2	8	2630386	2630393	25 %	0 %	50 %	25 %	431927577
59354	NC_019936	GAT	2	6	2630406	2630411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431927577
59355	NC_019936	CG	3	6	2630445	2630450	0 %	0 %	50 %	50 %	431927577
59356	NC_019936	GCA	2	6	2630465	2630470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431927577
59357	NC_019936	GC	3	6	2630471	2630476	0 %	0 %	50 %	50 %	431927577
59358	NC_019936	CG	3	6	2630523	2630528	0 %	0 %	50 %	50 %	431927577
59359	NC_019936	ACG	2	6	2630539	2630544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431927577
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59361	NC_019936	TCGCG	2	10	2630610	2630619	0 %	20 %	40 %	40 %	431927577
59362	NC_019936	ATG	2	6	2630639	2630644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431927577
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59364	NC_019936	GAG	2	6	2630767	2630772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431927577
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59366	NC_019936	CCA	2	6	2630822	2630827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431927577
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59372	NC_019936	TGC	2	6	2631035	2631040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927577
59373	NC_019936	TGG	2	6	2631041	2631046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431927577
59374	NC_019936	TGA	2	6	2631053	2631058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431927577
59375	NC_019936	GCTGG	2	10	2631096	2631105	0 %	20 %	60 %	20 %	431927577
59376	NC_019936	AC	3	6	2631137	2631142	50 %	0 %	0 %	50 %	431927577
59377	NC_019936	CAG	2	6	2631171	2631176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431927577
59378	NC_019936	GAT	2	6	2631234	2631239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431927577
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59381	NC_019936	TGG	3	9	2631362	2631370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431927577
59382	NC_019936	GCG	2	6	2631390	2631395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431927577
59383	NC_019936	CGC	2	6	2631424	2631429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59384	NC_019936	GCCC	2	8	2631440	2631447	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59385	NC_019936	GTT	2	6	2631460	2631465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59386	NC_019936	GCCCG	2	10	2631483	2631492	0 %	0 %	40 %	60 %	431927578
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59400	NC_019936	TCCAGG	2	12	2632388	2632399	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	431927579
59401	NC_019936	TGT	2	6	2632401	2632406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431927579
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59412	NC_019936	CGA	2	6	2632925	2632930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431927580
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59438	NC_019936	CT	3	6	2633932	2633937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59439	NC_019936	GCACAA	2	12	2633942	2633953	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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59450	NC_019936	ACCA	2	8	2634440	2634447	50 %	0 %	0 %	50 %	431927581
59451	NC_019936	GC	3	6	2634490	2634495	0 %	0 %	50 %	50 %	431927581
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59463	NC_019936	TCG	2	6	2635044	2635049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431927581
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