MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Pseudomonas putida ND6 plasmid pND6-2

Total Repeats: 2224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018746	A	6	6	77	82	100 %	0 %	0 %	0 %	408669192
2	NC_018746	C	7	7	89	95	0 %	0 %	0 %	100 %	408669192
3	NC_018746	ATG	3	9	134	142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669192
4	NC_018746	TCG	2	6	149	154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669192
5	NC_018746	CCA	2	6	207	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669192
6	NC_018746	CAG	2	6	223	228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669192
7	NC_018746	ACA	2	6	305	310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669192
8	NC_018746	CTG	2	6	325	330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669192
9	NC_018746	TGAT	2	8	356	363	25 %	50 %	25 %	0 %	408669192
10	NC_018746	ACC	2	6	365	370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669192
11	NC_018746	TTG	2	6	386	391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669192
12	NC_018746	ATC	2	6	572	577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669192
13	NC_018746	ATG	2	6	578	583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669192
14	NC_018746	GAG	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669192
15	NC_018746	TGG	2	6	833	838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669192
16	NC_018746	GAA	2	6	852	857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669192
17	NC_018746	GAC	2	6	882	887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669192
18	NC_018746	G	6	6	898	903	0 %	0 %	100 %	0 %	408669192
19	NC_018746	GCT	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669192
20	NC_018746	GCG	2	6	1112	1117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669192
21	NC_018746	TTC	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669192
22	NC_018746	GTT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669193
23	NC_018746	TCAA	2	8	1260	1267	50 %	25 %	0 %	25 %	408669193
24	NC_018746	ACG	2	6	1412	1417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018746	CAA	2	6	1438	1443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018746	CTT	2	6	1475	1480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018746	GACCT	2	10	1494	1503	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_018746	GTC	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018746	GTC	2	6	1558	1563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018746	GGAG	2	8	1630	1637	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018746	GTCTG	2	10	1647	1656	0 %	40 %	40 %	20 %	408669194
32	NC_018746	TCT	2	6	1659	1664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669194
33	NC_018746	CGG	2	6	1665	1670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669194
34	NC_018746	CAG	2	6	1774	1779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669194
35	NC_018746	AGG	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669194
36	NC_018746	GCTC	2	8	1827	1834	0 %	25 %	25 %	50 %	408669194
37	NC_018746	GCG	2	6	1850	1855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669194
38	NC_018746	T	6	6	2021	2026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018746	AAG	2	6	2054	2059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018746	CCG	2	6	2093	2098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669195
41	NC_018746	CGCCAC	2	12	2151	2162	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	408669195
42	NC_018746	GCC	2	6	2203	2208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669195
43	NC_018746	CGA	2	6	2241	2246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669195
44	NC_018746	ACC	2	6	2290	2295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669195
45	NC_018746	TGT	2	6	2325	2330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669195
46	NC_018746	ACG	2	6	2366	2371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669195
47	NC_018746	TCA	3	9	2376	2384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669195
48	NC_018746	GAC	2	6	2452	2457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669195
49	NC_018746	CAG	2	6	2500	2505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669195
50	NC_018746	GCC	2	6	2509	2514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669195
51	NC_018746	ATC	2	6	2561	2566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669195
52	NC_018746	TGGA	2	8	2608	2615	25 %	25 %	50 %	0 %	408669195
53	NC_018746	GAAC	2	8	2664	2671	50 %	0 %	25 %	25 %	408669195
54	NC_018746	TGA	2	6	2697	2702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669195
55	NC_018746	ATC	2	6	2708	2713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669195
56	NC_018746	AGC	2	6	2756	2761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669195
57	NC_018746	TGA	2	6	2769	2774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669195
58	NC_018746	AACC	2	8	2811	2818	50 %	0 %	0 %	50 %	408669195
59	NC_018746	TGC	2	6	2833	2838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669195
60	NC_018746	CAT	2	6	3001	3006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669195
61	NC_018746	CTT	2	6	3007	3012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669195
62	NC_018746	GTA	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669195
63	NC_018746	TCG	2	6	3110	3115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669195
64	NC_018746	CGA	2	6	3168	3173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669195
65	NC_018746	CGT	2	6	3222	3227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669195
66	NC_018746	CAGC	2	8	3265	3272	25 %	0 %	25 %	50 %	408669195
67	NC_018746	GGC	2	6	3283	3288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669195
68	NC_018746	GGC	3	9	3340	3348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669195
69	NC_018746	CGC	2	6	3373	3378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669195
70	NC_018746	CGA	2	6	3414	3419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669195
71	NC_018746	CTG	2	6	3421	3426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669195
72	NC_018746	ATC	2	6	3449	3454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669195
73	NC_018746	TGA	2	6	3495	3500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669195
74	NC_018746	TGT	2	6	3630	3635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669195
75	NC_018746	GCC	2	6	3655	3660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669195
76	NC_018746	TC	3	6	3696	3701	0 %	50 %	0 %	50 %	408669195
77	NC_018746	GAC	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669195
78	NC_018746	CGAC	2	8	3748	3755	25 %	0 %	25 %	50 %	408669195
79	NC_018746	CGC	2	6	3781	3786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669195
80	NC_018746	GGC	2	6	3814	3819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669195
81	NC_018746	AGC	2	6	3977	3982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669195
82	NC_018746	GCC	2	6	3988	3993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669195
83	NC_018746	TCCG	2	8	4032	4039	0 %	25 %	25 %	50 %	408669195
84	NC_018746	GTG	2	6	4082	4087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669195
85	NC_018746	CAC	2	6	4122	4127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669195
86	NC_018746	CAT	2	6	4138	4143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669195
87	NC_018746	CGC	2	6	4167	4172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669195
88	NC_018746	CTT	2	6	4221	4226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669195
89	NC_018746	CGG	3	9	4252	4260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669195
90	NC_018746	GCT	2	6	4298	4303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669195
91	NC_018746	GAA	2	6	4309	4314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669195
92	NC_018746	AGC	3	9	4334	4342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669195
93	NC_018746	TTG	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018746	GGGA	2	8	4397	4404	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018746	GGC	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018746	CGG	2	6	4499	4504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018746	GC	3	6	4508	4513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018746	GCTC	2	8	4546	4553	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018746	TGA	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018746	AGA	2	6	4630	4635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018746	CGG	2	6	4829	4834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669196
102	NC_018746	GCG	2	6	4837	4842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669196
103	NC_018746	GCTG	2	8	4845	4852	0 %	25 %	50 %	25 %	408669196
104	NC_018746	CTG	2	6	4870	4875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669196
105	NC_018746	TTC	2	6	4876	4881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669196
106	NC_018746	CAG	3	9	4893	4901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669196
107	NC_018746	GCA	2	6	4977	4982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669196
108	NC_018746	TTC	2	6	5071	5076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669196
109	NC_018746	CGA	2	6	5220	5225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669197
110	NC_018746	CAG	2	6	5261	5266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669197
111	NC_018746	AGG	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669197
112	NC_018746	TC	3	6	5367	5372	0 %	50 %	0 %	50 %	408669197
113	NC_018746	GGC	2	6	5381	5386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669197
114	NC_018746	AAG	2	6	5475	5480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669197
115	NC_018746	CTG	2	6	5487	5492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669197
116	NC_018746	TCG	2	6	5515	5520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669197
117	NC_018746	CCG	2	6	5604	5609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669197
118	NC_018746	CGG	2	6	5616	5621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669197
119	NC_018746	TGA	2	6	5661	5666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669198
120	NC_018746	T	6	6	5678	5683	0 %	100 %	0 %	0 %	408669198
121	NC_018746	TGG	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669198
122	NC_018746	TGC	2	6	5750	5755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669198
123	NC_018746	GCC	2	6	5771	5776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669198
124	NC_018746	GCC	2	6	5789	5794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669198
125	NC_018746	GTC	2	6	5806	5811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669198
126	NC_018746	CGA	2	6	5832	5837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669198
127	NC_018746	AGA	2	6	5853	5858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669198
128	NC_018746	TGA	2	6	5931	5936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669198
129	NC_018746	CGC	2	6	5950	5955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669198
130	NC_018746	GCT	2	6	6024	6029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669198
131	NC_018746	CAG	2	6	6133	6138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669198
132	NC_018746	CGG	2	6	6189	6194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669198
133	NC_018746	TTG	2	6	6269	6274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669198
134	NC_018746	GCT	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669198
135	NC_018746	CATT	2	8	6396	6403	25 %	50 %	0 %	25 %	408669198
136	NC_018746	CGC	2	6	6439	6444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669198
137	NC_018746	TC	3	6	6525	6530	0 %	50 %	0 %	50 %	408669198
138	NC_018746	CGGT	2	8	6559	6566	0 %	25 %	50 %	25 %	408669198
139	NC_018746	CTG	2	6	6617	6622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669198
140	NC_018746	TGGA	2	8	6656	6663	25 %	25 %	50 %	0 %	408669198
141	NC_018746	CAG	2	6	6677	6682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669198
142	NC_018746	CGG	2	6	6741	6746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669198
143	NC_018746	TGC	2	6	6810	6815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018746	AGC	2	6	6837	6842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018746	GCA	2	6	6865	6870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018746	CGTT	2	8	6908	6915	0 %	50 %	25 %	25 %	408669199
147	NC_018746	CTT	2	6	6947	6952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669199
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149	NC_018746	CCA	2	6	7020	7025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669199
150	NC_018746	CAG	2	6	7039	7044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669199
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152	NC_018746	CAG	2	6	7054	7059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669199
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158	NC_018746	GCC	2	6	7438	7443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669199
159	NC_018746	ACGTT	2	10	7460	7469	20 %	40 %	20 %	20 %	408669199
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164	NC_018746	ACT	2	6	7696	7701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669199
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172	NC_018746	AGG	2	6	8253	8258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
173	NC_018746	TGA	3	9	8555	8563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669201
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228	NC_018746	ATA	2	6	11821	11826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
229	NC_018746	TAACA	2	10	11841	11850	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
230	NC_018746	AGGTT	2	10	11874	11883	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
231	NC_018746	GGCT	2	8	12038	12045	0 %	25 %	50 %	25 %	408669207
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237	NC_018746	TA	3	6	12361	12366	50 %	50 %	0 %	0 %	408669208
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245	NC_018746	CTC	2	6	12734	12739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669209
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249	NC_018746	CGAT	2	8	12850	12857	25 %	25 %	25 %	25 %	408669209
250	NC_018746	TCGCT	2	10	12934	12943	0 %	40 %	20 %	40 %	408669209
251	NC_018746	CGG	2	6	12955	12960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669209
252	NC_018746	GCCC	2	8	12986	12993	0 %	0 %	25 %	75 %	408669209
253	NC_018746	AGG	2	6	12994	12999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669209
254	NC_018746	CCCTGC	2	12	13208	13219	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	408669209
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256	NC_018746	GGAC	2	8	13267	13274	25 %	0 %	50 %	25 %	408669209
257	NC_018746	CTCA	2	8	13340	13347	25 %	25 %	0 %	50 %	408669209
258	NC_018746	GC	3	6	13365	13370	0 %	0 %	50 %	50 %	408669209
259	NC_018746	CCGG	2	8	13456	13463	0 %	0 %	50 %	50 %	408669209
260	NC_018746	CTGAA	2	10	13495	13504	40 %	20 %	20 %	20 %	408669209
261	NC_018746	GCCA	2	8	13517	13524	25 %	0 %	25 %	50 %	408669209
262	NC_018746	TGG	2	6	13550	13555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669209
263	NC_018746	GCC	2	6	13573	13578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669209
264	NC_018746	GGA	2	6	13595	13600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669209
265	NC_018746	ACT	2	6	13702	13707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669209
266	NC_018746	GCA	2	6	13805	13810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669209
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268	NC_018746	GA	3	6	13890	13895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
269	NC_018746	CCG	2	6	14153	14158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669210
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301	NC_018746	AAG	2	6	16129	16134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669213
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304	NC_018746	GCAG	2	8	16183	16190	25 %	0 %	50 %	25 %	408669213
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387	NC_018746	TGGG	2	8	19445	19452	0 %	25 %	75 %	0 %	408669217
388	NC_018746	A	6	6	19454	19459	100 %	0 %	0 %	0 %	408669217
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390	NC_018746	GAA	2	6	19556	19561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669217
391	NC_018746	TC	3	6	19578	19583	0 %	50 %	0 %	50 %	408669217
392	NC_018746	GAC	2	6	19800	19805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669217
393	NC_018746	AGG	2	6	19839	19844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669217
394	NC_018746	GGC	2	6	19872	19877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669218
395	NC_018746	AGC	2	6	19926	19931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669218
396	NC_018746	CAT	2	6	19968	19973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669218
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399	NC_018746	TTA	2	6	20139	20144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408669218
400	NC_018746	AGCGT	2	10	20150	20159	20 %	20 %	40 %	20 %	408669218
401	NC_018746	TGA	2	6	20169	20174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669218
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403	NC_018746	GCA	2	6	20271	20276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669218
404	NC_018746	TGA	2	6	20309	20314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669219
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412	NC_018746	CGG	2	6	20766	20771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669220
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425	NC_018746	TC	3	6	21531	21536	0 %	50 %	0 %	50 %	408669222
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431	NC_018746	TGG	2	6	21746	21751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669222
432	NC_018746	CTGG	2	8	21768	21775	0 %	25 %	50 %	25 %	408669222
433	NC_018746	CT	3	6	21842	21847	0 %	50 %	0 %	50 %	408669222
434	NC_018746	GCG	2	6	21859	21864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669222
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437	NC_018746	GAAC	2	8	22457	22464	50 %	0 %	25 %	25 %	408669223
438	NC_018746	CAG	2	6	22503	22508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669223
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441	NC_018746	T	6	6	22720	22725	0 %	100 %	0 %	0 %	408669223
442	NC_018746	GAC	2	6	22752	22757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669223
443	NC_018746	GATG	2	8	22886	22893	25 %	25 %	50 %	0 %	408669223
444	NC_018746	TCA	2	6	22939	22944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669223
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446	NC_018746	GCCCT	2	10	23019	23028	0 %	20 %	20 %	60 %	408669223
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454	NC_018746	TAA	2	6	23393	23398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408669223
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468	NC_018746	CGG	2	6	24191	24196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669223
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480	NC_018746	CAT	2	6	24611	24616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669223
481	NC_018746	TCC	2	6	24650	24655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669223
482	NC_018746	GGA	2	6	24689	24694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669223
483	NC_018746	G	6	6	24723	24728	0 %	0 %	100 %	0 %	408669223
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489	NC_018746	GCA	2	6	25175	25180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669224
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491	NC_018746	AGGG	2	8	25327	25334	25 %	0 %	75 %	0 %	408669224
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499	NC_018746	CTT	2	6	25752	25757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669225
500	NC_018746	CAG	2	6	25894	25899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669225

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