MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida ND6 plasmid pND6-2

Total Repeats: 2224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_018746	TC	3	6	106094	106099	0 %	50 %	0 %	50 %	408669317
2002	NC_018746	AGC	2	6	106175	106180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669317
2003	NC_018746	GCC	2	6	106190	106195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669317
2004	NC_018746	CCG	2	6	106203	106208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669317
2005	NC_018746	GTGG	2	8	106217	106224	0 %	25 %	75 %	0 %	408669317
2006	NC_018746	GCA	2	6	106234	106239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669317
2007	NC_018746	GTG	2	6	106287	106292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669317
2008	NC_018746	CGACTA	2	12	106301	106312	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408669317
2009	NC_018746	TCG	2	6	106500	106505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669318
2010	NC_018746	GCGA	2	8	106562	106569	25 %	0 %	50 %	25 %	408669318
2011	NC_018746	CGC	2	6	106585	106590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669318
2012	NC_018746	GGTC	2	8	106753	106760	0 %	25 %	50 %	25 %	408669318
2013	NC_018746	CCG	2	6	106872	106877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669318
2014	NC_018746	GGC	2	6	106886	106891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669318
2015	NC_018746	CCG	2	6	106904	106909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669318
2016	NC_018746	G	6	6	106927	106932	0 %	0 %	100 %	0 %	408669318
2017	NC_018746	CGGCC	2	10	106996	107005	0 %	0 %	40 %	60 %	408669318
2018	NC_018746	GCT	2	6	107011	107016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669318
2019	NC_018746	TCT	2	6	107082	107087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669318
2020	NC_018746	CTG	3	9	107169	107177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669318
2021	NC_018746	GAA	2	6	107551	107556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669318
2022	NC_018746	TGC	2	6	107572	107577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669318
2023	NC_018746	AGC	2	6	107612	107617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669318
2024	NC_018746	CAC	2	6	107695	107700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669318
2025	NC_018746	TCGC	2	8	107730	107737	0 %	25 %	25 %	50 %	408669318
2026	NC_018746	ACC	2	6	107765	107770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669318
2027	NC_018746	CTG	2	6	107873	107878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669318
2028	NC_018746	GCG	2	6	107928	107933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669318
2029	NC_018746	ACA	2	6	107934	107939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669318
2030	NC_018746	GCA	2	6	108045	108050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669318
2031	NC_018746	AGGC	2	8	108051	108058	25 %	0 %	50 %	25 %	408669318
2032	NC_018746	ACA	2	6	108105	108110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669318
2033	NC_018746	TCG	2	6	108123	108128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669318
2034	NC_018746	GGA	2	6	108171	108176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669319
2035	NC_018746	CAT	2	6	108339	108344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669319
2036	NC_018746	GAA	2	6	108363	108368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669319
2037	NC_018746	CGA	2	6	108573	108578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669319
2038	NC_018746	CAA	2	6	108618	108623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669319
2039	NC_018746	TGG	2	6	108647	108652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669319
2040	NC_018746	AAGA	2	8	108664	108671	75 %	0 %	25 %	0 %	408669319
2041	NC_018746	AGC	2	6	108683	108688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669319
2042	NC_018746	TGT	2	6	108759	108764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669319
2043	NC_018746	TTC	2	6	108766	108771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669319
2044	NC_018746	GAA	2	6	108787	108792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669319
2045	NC_018746	AGA	2	6	108825	108830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669319
2046	NC_018746	CAG	2	6	108868	108873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669319
2047	NC_018746	GTT	2	6	109004	109009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669319
2048	NC_018746	TCA	2	6	109067	109072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669319
2049	NC_018746	GCC	2	6	109096	109101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669319
2050	NC_018746	CTT	2	6	109110	109115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669319
2051	NC_018746	GGC	2	6	109128	109133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669319
2052	NC_018746	GGC	2	6	109165	109170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669319
2053	NC_018746	AGC	2	6	109184	109189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669319
2054	NC_018746	GCT	2	6	109197	109202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669319
2055	NC_018746	TCA	2	6	109247	109252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669319
2056	NC_018746	AGA	2	6	109266	109271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669319
2057	NC_018746	GAA	2	6	109320	109325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669319
2058	NC_018746	CGC	2	6	109367	109372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669319
2059	NC_018746	CGAA	2	8	109379	109386	50 %	0 %	25 %	25 %	408669319
2060	NC_018746	GA	3	6	109481	109486	50 %	0 %	50 %	0 %	408669319
2061	NC_018746	CTG	2	6	109509	109514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669320
2062	NC_018746	TGC	2	6	109602	109607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669320
2063	NC_018746	CAGG	2	8	109633	109640	25 %	0 %	50 %	25 %	408669320
2064	NC_018746	GGC	2	6	109664	109669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669320
2065	NC_018746	CGG	2	6	109675	109680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669320
2066	NC_018746	GTC	2	6	109696	109701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669320
2067	NC_018746	GGC	2	6	109703	109708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669320
2068	NC_018746	GTTT	2	8	109774	109781	0 %	75 %	25 %	0 %	408669320
2069	NC_018746	TGC	2	6	109804	109809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669320
2070	NC_018746	CGG	2	6	109828	109833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669320
2071	NC_018746	AGG	2	6	109879	109884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669320
2072	NC_018746	CGCA	2	8	109911	109918	25 %	0 %	25 %	50 %	408669320
2073	NC_018746	GA	3	6	110021	110026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_018746	CTA	2	6	110050	110055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669321
2075	NC_018746	CGG	2	6	110087	110092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669321
2076	NC_018746	CGGC	2	8	110292	110299	0 %	0 %	50 %	50 %	408669321
2077	NC_018746	CGGT	2	8	110317	110324	0 %	25 %	50 %	25 %	408669321
2078	NC_018746	GAA	2	6	110331	110336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669321
2079	NC_018746	GCG	2	6	110389	110394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669321
2080	NC_018746	GTC	2	6	110469	110474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669321
2081	NC_018746	TG	3	6	110533	110538	0 %	50 %	50 %	0 %	408669321
2082	NC_018746	CCGA	2	8	110643	110650	25 %	0 %	25 %	50 %	408669321
2083	NC_018746	CGGC	2	8	110689	110696	0 %	0 %	50 %	50 %	408669321
2084	NC_018746	CTG	2	6	110721	110726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669321
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2086	NC_018746	ATC	2	6	110772	110777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669321
2087	NC_018746	T	6	6	110779	110784	0 %	100 %	0 %	0 %	408669321
2088	NC_018746	ACC	2	6	110811	110816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669321
2089	NC_018746	CTG	2	6	110838	110843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669321
2090	NC_018746	GC	3	6	110976	110981	0 %	0 %	50 %	50 %	408669321
2091	NC_018746	TGG	2	6	111022	111027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669321
2092	NC_018746	GGC	2	6	111056	111061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669321
2093	NC_018746	GAC	2	6	111095	111100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669321
2094	NC_018746	TCG	2	6	111118	111123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669321
2095	NC_018746	TGA	2	6	111184	111189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669321
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2097	NC_018746	GT	3	6	111324	111329	0 %	50 %	50 %	0 %	408669321
2098	NC_018746	GTT	2	6	111337	111342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669321
2099	NC_018746	GGT	2	6	111377	111382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669321
2100	NC_018746	ATG	2	6	111393	111398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669321
2101	NC_018746	GA	3	6	111427	111432	50 %	0 %	50 %	0 %	408669321
2102	NC_018746	GGC	2	6	111474	111479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669321
2103	NC_018746	TGA	2	6	111508	111513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669321
2104	NC_018746	GT	3	6	111521	111526	0 %	50 %	50 %	0 %	408669321
2105	NC_018746	CGA	2	6	111563	111568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669321
2106	NC_018746	CTC	2	6	111712	111717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669322
2107	NC_018746	GAA	2	6	111762	111767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669322
2108	NC_018746	AGCG	2	8	111773	111780	25 %	0 %	50 %	25 %	408669322
2109	NC_018746	CGC	2	6	111882	111887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669322
2110	NC_018746	ATC	2	6	111937	111942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669322
2111	NC_018746	CTG	2	6	111973	111978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669322
2112	NC_018746	CGT	2	6	111992	111997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669322
2113	NC_018746	CCA	2	6	112037	112042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669322
2114	NC_018746	CGT	2	6	112125	112130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669322
2115	NC_018746	TTCCTG	2	12	112168	112179	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	408669322
2116	NC_018746	TCC	2	6	112277	112282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669322
2117	NC_018746	TGA	2	6	112295	112300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669322
2118	NC_018746	CTCC	2	8	112326	112333	0 %	25 %	0 %	75 %	408669322
2119	NC_018746	GAT	2	6	112335	112340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669322
2120	NC_018746	TGC	2	6	112380	112385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669322
2121	NC_018746	G	6	6	112405	112410	0 %	0 %	100 %	0 %	408669322
2122	NC_018746	AAG	2	6	112456	112461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669322
2123	NC_018746	GAA	2	6	112539	112544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669322
2124	NC_018746	CGG	2	6	112587	112592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669322
2125	NC_018746	ATC	2	6	112594	112599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669322
2126	NC_018746	CGGT	2	8	112601	112608	0 %	25 %	50 %	25 %	408669322
2127	NC_018746	TGA	2	6	112616	112621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669322
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2151	NC_018746	GATC	2	8	113344	113351	25 %	25 %	25 %	25 %	408669324
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2220	NC_018746	CA	3	6	116574	116579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2221	NC_018746	CCAC	2	8	116638	116645	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.