MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida ND6 plasmid pND6-2

Total Repeats: 2224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018746	CGA	2	6	80441	80446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669288
1502	NC_018746	CCA	2	6	80451	80456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669288
1503	NC_018746	TTG	2	6	80554	80559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669288
1504	NC_018746	GTA	2	6	80571	80576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669288
1505	NC_018746	CCT	2	6	80585	80590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669288
1506	NC_018746	GCA	2	6	80635	80640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669288
1507	NC_018746	AGTT	2	8	80669	80676	25 %	50 %	25 %	0 %	408669288
1508	NC_018746	GAT	2	6	80850	80855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669288
1509	NC_018746	ATC	2	6	80860	80865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669288
1510	NC_018746	ACCG	2	8	80952	80959	25 %	0 %	25 %	50 %	408669288
1511	NC_018746	ACTGG	3	15	80967	80981	20 %	20 %	40 %	20 %	408669288
1512	NC_018746	CGA	2	6	81147	81152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669288
1513	NC_018746	CGC	2	6	81173	81178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669288
1514	NC_018746	GCGAG	2	10	81223	81232	20 %	0 %	60 %	20 %	408669288
1515	NC_018746	TTC	2	6	81319	81324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669288
1516	NC_018746	CCG	2	6	81338	81343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669288
1517	NC_018746	TTG	2	6	81364	81369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669288
1518	NC_018746	TGA	2	6	81386	81391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669288
1519	NC_018746	GCC	2	6	81429	81434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669288
1520	NC_018746	TCAA	2	8	81439	81446	50 %	25 %	0 %	25 %	408669288
1521	NC_018746	A	6	6	81445	81450	100 %	0 %	0 %	0 %	408669288
1522	NC_018746	AT	3	6	81546	81551	50 %	50 %	0 %	0 %	408669288
1523	NC_018746	CTG	2	6	81658	81663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669288
1524	NC_018746	ATC	2	6	81708	81713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669288
1525	NC_018746	GACC	2	8	81792	81799	25 %	0 %	25 %	50 %	408669288
1526	NC_018746	ACGA	2	8	81823	81830	50 %	0 %	25 %	25 %	408669288
1527	NC_018746	CGC	2	6	81858	81863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669288
1528	NC_018746	GCG	2	6	81896	81901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669288
1529	NC_018746	CTC	2	6	81915	81920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669288
1530	NC_018746	CGC	2	6	81947	81952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669288
1531	NC_018746	TGG	2	6	81953	81958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669288
1532	NC_018746	CCG	2	6	81959	81964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669288
1533	NC_018746	TGA	2	6	81983	81988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669288
1534	NC_018746	GCC	2	6	82158	82163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669288
1535	NC_018746	ATC	2	6	82231	82236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669288
1536	NC_018746	TGG	2	6	82238	82243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669288
1537	NC_018746	TCG	3	9	82300	82308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669288
1538	NC_018746	GAG	2	6	82368	82373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669288
1539	NC_018746	CGA	2	6	82388	82393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669288
1540	NC_018746	AATG	2	8	82523	82530	50 %	25 %	25 %	0 %	408669289
1541	NC_018746	AGA	2	6	82587	82592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669289
1542	NC_018746	CGA	2	6	82704	82709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669290
1543	NC_018746	GGA	2	6	82717	82722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669290
1544	NC_018746	AGA	2	6	82737	82742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669290
1545	NC_018746	GACC	2	8	82958	82965	25 %	0 %	25 %	50 %	408669290
1546	NC_018746	GCTCC	2	10	82985	82994	0 %	20 %	20 %	60 %	408669290
1547	NC_018746	AGT	2	6	83107	83112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669290
1548	NC_018746	TAC	2	6	83144	83149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669290
1549	NC_018746	GTT	2	6	83238	83243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669290
1550	NC_018746	TTC	2	6	83382	83387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669290
1551	NC_018746	TG	3	6	83465	83470	0 %	50 %	50 %	0 %	408669290
1552	NC_018746	A	6	6	83585	83590	100 %	0 %	0 %	0 %	408669290
1553	NC_018746	TA	3	6	83709	83714	50 %	50 %	0 %	0 %	408669290
1554	NC_018746	CCA	2	6	83766	83771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669290
1555	NC_018746	AGA	2	6	83799	83804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669290
1556	NC_018746	TCG	2	6	83857	83862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669290
1557	NC_018746	GCCAG	2	10	83918	83927	20 %	0 %	40 %	40 %	408669291
1558	NC_018746	GGC	2	6	83941	83946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669291
1559	NC_018746	GCT	2	6	84040	84045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669291
1560	NC_018746	CTC	2	6	84050	84055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669291
1561	NC_018746	TGG	2	6	84144	84149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669291
1562	NC_018746	TCGG	2	8	84152	84159	0 %	25 %	50 %	25 %	408669291
1563	NC_018746	CGG	2	6	84165	84170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669291
1564	NC_018746	CCG	2	6	84199	84204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669291
1565	NC_018746	GTT	2	6	84275	84280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669291
1566	NC_018746	CAGG	2	8	84301	84308	25 %	0 %	50 %	25 %	408669291
1567	NC_018746	ATT	2	6	84410	84415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408669291
1568	NC_018746	GTT	2	6	84456	84461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669291
1569	NC_018746	AAC	2	6	84593	84598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669291
1570	NC_018746	CGC	3	9	84657	84665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669292
1571	NC_018746	ACA	2	6	84714	84719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669292
1572	NC_018746	TGT	2	6	84783	84788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669292
1573	NC_018746	CTT	2	6	84790	84795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669292
1574	NC_018746	ACC	2	6	84829	84834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669292
1575	NC_018746	CGA	2	6	84890	84895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669292
1576	NC_018746	AAAC	2	8	84968	84975	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1577	NC_018746	CGA	2	6	85088	85093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669293
1578	NC_018746	T	6	6	85134	85139	0 %	100 %	0 %	0 %	408669293
1579	NC_018746	TCA	2	6	85147	85152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669293
1580	NC_018746	CCG	2	6	85176	85181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669293
1581	NC_018746	TTC	2	6	85303	85308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669293
1582	NC_018746	CGC	2	6	85379	85384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669293
1583	NC_018746	AGA	2	6	85385	85390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669293
1584	NC_018746	GGT	2	6	85404	85409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669293
1585	NC_018746	CAGT	2	8	85469	85476	25 %	25 %	25 %	25 %	408669293
1586	NC_018746	TCC	2	6	85513	85518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669293
1587	NC_018746	CTG	2	6	85530	85535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669293
1588	NC_018746	TCG	2	6	85553	85558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669293
1589	NC_018746	ATC	2	6	85567	85572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669293
1590	NC_018746	GAC	2	6	85591	85596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669294
1591	NC_018746	CTCCC	2	10	85690	85699	0 %	20 %	0 %	80 %	408669294
1592	NC_018746	CTG	2	6	85765	85770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669294
1593	NC_018746	CTT	2	6	85822	85827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669294
1594	NC_018746	ACTT	2	8	85854	85861	25 %	50 %	0 %	25 %	408669294
1595	NC_018746	CTT	2	6	85909	85914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669294
1596	NC_018746	TGC	2	6	85958	85963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669294
1597	NC_018746	CGT	2	6	86047	86052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669294
1598	NC_018746	GCT	2	6	86097	86102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669294
1599	NC_018746	GGT	2	6	86111	86116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669294
1600	NC_018746	CGG	2	6	86119	86124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669294
1601	NC_018746	GCT	2	6	86178	86183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669294
1602	NC_018746	G	6	6	86215	86220	0 %	0 %	100 %	0 %	408669294
1603	NC_018746	CCCCTG	2	12	86239	86250	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	408669294
1604	NC_018746	CTGCC	2	10	86260	86269	0 %	20 %	20 %	60 %	408669294
1605	NC_018746	GAA	2	6	86332	86337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669294
1606	NC_018746	AAC	2	6	86357	86362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669294
1607	NC_018746	CAA	2	6	86370	86375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669294
1608	NC_018746	TCA	2	6	86406	86411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669294
1609	NC_018746	TGT	2	6	86424	86429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669294
1610	NC_018746	TCG	2	6	86456	86461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669294
1611	NC_018746	CTG	2	6	86479	86484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669294
1612	NC_018746	CAT	2	6	86543	86548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669295
1613	NC_018746	GGCTA	2	10	86616	86625	20 %	20 %	40 %	20 %	408669295
1614	NC_018746	GCA	2	6	86656	86661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669295
1615	NC_018746	GAC	2	6	86697	86702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669295
1616	NC_018746	GTT	2	6	86726	86731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669295
1617	NC_018746	GGCC	2	8	86738	86745	0 %	0 %	50 %	50 %	408669295
1618	NC_018746	GTA	2	6	86914	86919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669295
1619	NC_018746	AGC	2	6	86968	86973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669295
1620	NC_018746	CTT	2	6	86993	86998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669295
1621	NC_018746	CTG	2	6	87102	87107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669295
1622	NC_018746	AGC	2	6	87117	87122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669295
1623	NC_018746	TCC	2	6	87138	87143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669295
1624	NC_018746	GGA	2	6	87207	87212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669295
1625	NC_018746	T	6	6	87223	87228	0 %	100 %	0 %	0 %	408669295
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