MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida ND6 plasmid pND6-2

Total Repeats: 2224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018746	CCT	2	6	53243	53248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669257
1002	NC_018746	GCC	2	6	53308	53313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669257
1003	NC_018746	CAC	2	6	53333	53338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669257
1004	NC_018746	TCG	2	6	53383	53388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669257
1005	NC_018746	GCA	2	6	53471	53476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669257
1006	NC_018746	TCA	2	6	53603	53608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669257
1007	NC_018746	CGC	2	6	53637	53642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669257
1008	NC_018746	GAT	2	6	53646	53651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669257
1009	NC_018746	GCC	2	6	53670	53675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669257
1010	NC_018746	TCG	2	6	53752	53757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669257
1011	NC_018746	GC	3	6	53830	53835	0 %	0 %	50 %	50 %	408669257
1012	NC_018746	CTT	2	6	53840	53845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669257
1013	NC_018746	GCG	2	6	53916	53921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669257
1014	NC_018746	GCTC	2	8	53929	53936	0 %	25 %	25 %	50 %	408669257
1015	NC_018746	AGGCC	2	10	54005	54014	20 %	0 %	40 %	40 %	408669257
1016	NC_018746	CCAG	2	8	54018	54025	25 %	0 %	25 %	50 %	408669257
1017	NC_018746	CA	3	6	54044	54049	50 %	0 %	0 %	50 %	408669257
1018	NC_018746	GAT	2	6	54113	54118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669257
1019	NC_018746	TCC	2	6	54133	54138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669257
1020	NC_018746	CAG	3	9	54180	54188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669257
1021	NC_018746	ACC	2	6	54189	54194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669257
1022	NC_018746	CTC	2	6	54262	54267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_018746	CAA	3	9	54310	54318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_018746	CTCG	2	8	54339	54346	0 %	25 %	25 %	50 %	408669258
1025	NC_018746	GCC	2	6	54361	54366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669258
1026	NC_018746	TCC	2	6	54451	54456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669259
1027	NC_018746	CAG	2	6	54543	54548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669259
1028	NC_018746	GCG	2	6	54556	54561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669259
1029	NC_018746	CCTC	2	8	54571	54578	0 %	25 %	0 %	75 %	408669259
1030	NC_018746	GCC	2	6	54658	54663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669259
1031	NC_018746	GTC	2	6	54762	54767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669259
1032	NC_018746	CAA	2	6	54817	54822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669259
1033	NC_018746	GCT	2	6	55087	55092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669260
1034	NC_018746	AGT	2	6	55094	55099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669260
1035	NC_018746	AAC	2	6	55167	55172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669261
1036	NC_018746	CAG	2	6	55190	55195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669261
1037	NC_018746	GCG	2	6	55206	55211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669261
1038	NC_018746	GCA	2	6	55226	55231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669261
1039	NC_018746	TAA	2	6	55462	55467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_018746	TTA	2	6	55473	55478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_018746	GCCA	2	8	55628	55635	25 %	0 %	25 %	50 %	408669262
1042	NC_018746	TCGA	2	8	55698	55705	25 %	25 %	25 %	25 %	408669262
1043	NC_018746	CCG	2	6	55717	55722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669262
1044	NC_018746	CAC	2	6	55765	55770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669262
1045	NC_018746	GAC	2	6	55856	55861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669262
1046	NC_018746	CGT	2	6	55900	55905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669262
1047	NC_018746	CGAC	2	8	55942	55949	25 %	0 %	25 %	50 %	408669262
1048	NC_018746	TGAG	2	8	56077	56084	25 %	25 %	50 %	0 %	408669262
1049	NC_018746	GCC	2	6	56100	56105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669262
1050	NC_018746	CTT	2	6	56132	56137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669262
1051	NC_018746	AGC	2	6	56142	56147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669262
1052	NC_018746	GGC	2	6	56250	56255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669263
1053	NC_018746	CGA	2	6	56267	56272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669263
1054	NC_018746	TGC	2	6	56326	56331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669263
1055	NC_018746	AGC	3	9	56332	56340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669263
1056	NC_018746	TCG	2	6	56350	56355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669263
1057	NC_018746	T	6	6	56396	56401	0 %	100 %	0 %	0 %	408669263
1058	NC_018746	CGC	2	6	56439	56444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669263
1059	NC_018746	GAA	2	6	56466	56471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669263
1060	NC_018746	GCT	2	6	56509	56514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669263
1061	NC_018746	CCG	2	6	56540	56545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669263
1062	NC_018746	TCG	2	6	56638	56643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669263
1063	NC_018746	AGA	2	6	56675	56680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669263
1064	NC_018746	GTC	3	9	56691	56699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669263
1065	NC_018746	ATG	2	6	56705	56710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669263
1066	NC_018746	CCG	2	6	56804	56809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669263
1067	NC_018746	CGCT	2	8	56923	56930	0 %	25 %	25 %	50 %	408669263
1068	NC_018746	GCA	2	6	57017	57022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669263
1069	NC_018746	GCTC	2	8	57032	57039	0 %	25 %	25 %	50 %	408669263
1070	NC_018746	CGC	2	6	57266	57271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669263
1071	NC_018746	GGCT	2	8	57332	57339	0 %	25 %	50 %	25 %	408669263
1072	NC_018746	ACC	2	6	57346	57351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669263
1073	NC_018746	CGA	2	6	57386	57391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669263
1074	NC_018746	GGC	2	6	57398	57403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669263
1075	NC_018746	ATC	2	6	57420	57425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669263
1076	NC_018746	CAG	2	6	57429	57434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669263
1077	NC_018746	GGTC	2	8	57646	57653	0 %	25 %	50 %	25 %	408669263
1078	NC_018746	TGC	2	6	57673	57678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669263
1079	NC_018746	GGCGA	2	10	57939	57948	20 %	0 %	60 %	20 %	408669263
1080	NC_018746	CGC	2	6	58011	58016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669263
1081	NC_018746	ACC	2	6	58077	58082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669263
1082	NC_018746	TGAA	2	8	58165	58172	50 %	25 %	25 %	0 %	408669263
1083	NC_018746	CTT	2	6	58185	58190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669263
1084	NC_018746	AG	3	6	58289	58294	50 %	0 %	50 %	0 %	408669264
1085	NC_018746	ACC	2	6	58295	58300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669264
1086	NC_018746	GCCA	2	8	58437	58444	25 %	0 %	25 %	50 %	408669264
1087	NC_018746	CCAAC	2	10	58522	58531	40 %	0 %	0 %	60 %	408669264
1088	NC_018746	GAAT	2	8	58592	58599	50 %	25 %	25 %	0 %	408669264
1089	NC_018746	CAA	2	6	58651	58656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_018746	ACC	2	6	58803	58808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_018746	GCA	2	6	58857	58862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_018746	CA	3	6	58926	58931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_018746	CCA	2	6	58962	58967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_018746	CCA	2	6	58984	58989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_018746	TCGC	2	8	59001	59008	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_018746	TGA	2	6	59091	59096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669265
1097	NC_018746	CTG	2	6	59124	59129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669265
1098	NC_018746	CTG	2	6	59131	59136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669265
1099	NC_018746	TCG	2	6	59159	59164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669265
1100	NC_018746	CCGTT	2	10	59202	59211	0 %	40 %	20 %	40 %	408669265
1101	NC_018746	GA	3	6	59233	59238	50 %	0 %	50 %	0 %	408669265
1102	NC_018746	GAT	2	6	59275	59280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669265
1103	NC_018746	ACG	2	6	59367	59372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_018746	AAAAT	2	10	59412	59421	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_018746	GC	3	6	59455	59460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_018746	ACG	2	6	59480	59485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_018746	CAT	3	9	59707	59715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_018746	CCT	2	6	59764	59769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669266
1109	NC_018746	CAT	2	6	59803	59808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669266
1110	NC_018746	GCC	2	6	59812	59817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669266
1111	NC_018746	TCG	2	6	59884	59889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669266
1112	NC_018746	TCG	2	6	60094	60099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_018746	GGC	2	6	60113	60118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_018746	GGC	2	6	60179	60184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_018746	CCT	2	6	60267	60272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_018746	ACC	2	6	60293	60298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_018746	CGAC	2	8	60310	60317	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_018746	AG	3	6	60349	60354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_018746	TCAACA	2	12	60438	60449	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408669267
1120	NC_018746	GC	3	6	60454	60459	0 %	0 %	50 %	50 %	408669267
1121	NC_018746	AAT	2	6	60464	60469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408669267
1122	NC_018746	TCG	2	6	60656	60661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669268
1123	NC_018746	AGC	2	6	60716	60721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669268
1124	NC_018746	CAA	2	6	60871	60876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669268
1125	NC_018746	GCCG	2	8	60902	60909	0 %	0 %	50 %	50 %	408669268
1126	NC_018746	ACG	2	6	61273	61278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669268
1127	NC_018746	TCA	2	6	61286	61291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669268
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