MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Pseudomonas putida ND6 plasmid pND6-2

Total Repeats: 2224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018746	GAA	2	6	26030	26035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669225
502	NC_018746	GAT	2	6	26040	26045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669225
503	NC_018746	ACCGGG	2	12	26051	26062	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	408669225
504	NC_018746	GAT	2	6	26115	26120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669225
505	NC_018746	A	6	6	26125	26130	100 %	0 %	0 %	0 %	408669225
506	NC_018746	AAT	2	6	26150	26155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_018746	AAG	2	6	26232	26237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669226
508	NC_018746	CGA	2	6	26359	26364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669226
509	NC_018746	GTG	3	9	26402	26410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669226
510	NC_018746	TCG	2	6	26433	26438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669226
511	NC_018746	GAT	2	6	26558	26563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669226
512	NC_018746	ACT	2	6	26595	26600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669226
513	NC_018746	CCCTT	2	10	26640	26649	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
514	NC_018746	CTTCT	2	10	26691	26700	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
515	NC_018746	GTTT	2	8	26754	26761	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018746	AGA	2	6	26844	26849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669227
517	NC_018746	CCTG	2	8	26851	26858	0 %	25 %	25 %	50 %	408669227
518	NC_018746	ACG	2	6	26883	26888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669227
519	NC_018746	GCC	2	6	27027	27032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669228
520	NC_018746	CAA	2	6	27054	27059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669228
521	NC_018746	CTTT	2	8	27082	27089	0 %	75 %	0 %	25 %	408669228
522	NC_018746	AAC	2	6	27154	27159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669228
523	NC_018746	GCA	2	6	27213	27218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669228
524	NC_018746	GTCA	2	8	27262	27269	25 %	25 %	25 %	25 %	408669228
525	NC_018746	CAA	2	6	27271	27276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669228
526	NC_018746	AAG	2	6	27299	27304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669228
527	NC_018746	GAT	2	6	27373	27378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669228
528	NC_018746	GCG	2	6	27416	27421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669228
529	NC_018746	TCG	2	6	27490	27495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669228
530	NC_018746	GAG	2	6	27529	27534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669228
531	NC_018746	AGC	3	9	27552	27560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669228
532	NC_018746	A	6	6	27595	27600	100 %	0 %	0 %	0 %	408669228
533	NC_018746	CGAG	2	8	27609	27616	25 %	0 %	50 %	25 %	408669228
534	NC_018746	GATCA	2	10	27649	27658	40 %	20 %	20 %	20 %	408669228
535	NC_018746	AC	3	6	27707	27712	50 %	0 %	0 %	50 %	408669228
536	NC_018746	TC	3	6	27774	27779	0 %	50 %	0 %	50 %	408669228
537	NC_018746	GGT	2	6	27800	27805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669228
538	NC_018746	CTT	2	6	27946	27951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669228
539	NC_018746	GA	3	6	28019	28024	50 %	0 %	50 %	0 %	408669228
540	NC_018746	GCT	2	6	28026	28031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669228
541	NC_018746	GAG	2	6	28057	28062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669228
542	NC_018746	CCG	2	6	28101	28106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669228
543	NC_018746	TCC	2	6	28162	28167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669228
544	NC_018746	TAC	2	6	28177	28182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669228
545	NC_018746	GGTCA	2	10	28211	28220	20 %	20 %	40 %	20 %	408669228
546	NC_018746	GTC	2	6	28226	28231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669228
547	NC_018746	ATG	2	6	28309	28314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669228
548	NC_018746	TCC	2	6	28382	28387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669228
549	NC_018746	AAG	2	6	28396	28401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669228
550	NC_018746	GACTTC	2	12	28555	28566	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408669228
551	NC_018746	CGA	2	6	28632	28637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669229
552	NC_018746	GAT	2	6	28720	28725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669229
553	NC_018746	AGC	2	6	28730	28735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669229
554	NC_018746	GAC	2	6	28749	28754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669229
555	NC_018746	TCA	2	6	28848	28853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669229
556	NC_018746	GATG	2	8	28860	28867	25 %	25 %	50 %	0 %	408669229
557	NC_018746	ATG	2	6	28919	28924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669229
558	NC_018746	GAT	2	6	28956	28961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669229
559	NC_018746	CAG	2	6	29023	29028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669229
560	NC_018746	GCC	2	6	29068	29073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669229
561	NC_018746	C	6	6	29072	29077	0 %	0 %	0 %	100 %	408669229
562	NC_018746	GT	3	6	29092	29097	0 %	50 %	50 %	0 %	408669229
563	NC_018746	GCT	2	6	29241	29246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669229
564	NC_018746	TGC	2	6	29313	29318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669229
565	NC_018746	GCG	2	6	29345	29350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669229
566	NC_018746	CACC	2	8	29376	29383	25 %	0 %	0 %	75 %	408669229
567	NC_018746	G	6	6	29436	29441	0 %	0 %	100 %	0 %	408669229
568	NC_018746	CCG	2	6	29468	29473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669229
569	NC_018746	TG	3	6	29577	29582	0 %	50 %	50 %	0 %	408669229
570	NC_018746	GGC	2	6	29609	29614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669229
571	NC_018746	AGG	2	6	29651	29656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669229
572	NC_018746	AAT	2	6	29764	29769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408669229
573	NC_018746	AAAG	2	8	29796	29803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
574	NC_018746	T	6	6	29832	29837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018746	TCG	2	6	30250	30255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669231
576	NC_018746	GAT	2	6	30346	30351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669231
577	NC_018746	TCC	2	6	30365	30370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669231
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581	NC_018746	GGA	2	6	30535	30540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669231
582	NC_018746	TGG	2	6	30705	30710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669231
583	NC_018746	CCG	2	6	30726	30731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669231
584	NC_018746	GTA	2	6	30739	30744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669231
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588	NC_018746	TC	3	6	30894	30899	0 %	50 %	0 %	50 %	408669231
589	NC_018746	CTG	2	6	30941	30946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669231
590	NC_018746	TGC	2	6	31094	31099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669231
591	NC_018746	GAC	2	6	31121	31126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669231
592	NC_018746	ATG	2	6	31170	31175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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594	NC_018746	ATG	2	6	31200	31205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669232
595	NC_018746	CTTG	2	8	31207	31214	0 %	50 %	25 %	25 %	408669232
596	NC_018746	GCT	2	6	31370	31375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669232
597	NC_018746	AGG	2	6	31429	31434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669232
598	NC_018746	CGA	2	6	31516	31521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669232
599	NC_018746	CGA	2	6	31617	31622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669232
600	NC_018746	AGA	2	6	31623	31628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669232
601	NC_018746	AGC	2	6	31674	31679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669232
602	NC_018746	GCA	2	6	31695	31700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669232
603	NC_018746	CCT	2	6	31768	31773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669232
604	NC_018746	CTT	2	6	31780	31785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669232
605	NC_018746	ATGAG	2	10	31810	31819	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
606	NC_018746	ATG	2	6	31856	31861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_018746	CAA	2	6	31876	31881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_018746	GCC	2	6	32107	32112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669233
609	NC_018746	GGC	2	6	32273	32278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669233
610	NC_018746	GGA	2	6	32322	32327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669233
611	NC_018746	ACG	2	6	32342	32347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669233
612	NC_018746	TGA	2	6	32351	32356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669233
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614	NC_018746	TGT	2	6	32391	32396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669233
615	NC_018746	CCCTT	2	10	32406	32415	0 %	40 %	0 %	60 %	408669233
616	NC_018746	CA	3	6	32440	32445	50 %	0 %	0 %	50 %	408669233
617	NC_018746	GTC	2	6	32536	32541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669233
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622	NC_018746	CGAT	2	8	32759	32766	25 %	25 %	25 %	25 %	408669233
623	NC_018746	CGAG	2	8	32781	32788	25 %	0 %	50 %	25 %	408669233
624	NC_018746	AGC	3	9	32803	32811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669233
625	NC_018746	TCGA	2	8	32812	32819	25 %	25 %	25 %	25 %	408669233
626	NC_018746	CGGA	2	8	32885	32892	25 %	0 %	50 %	25 %	408669233
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628	NC_018746	GCT	2	6	33087	33092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669233
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755	NC_018746	CGC	2	6	39546	39551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669235
756	NC_018746	CCT	2	6	39639	39644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669235
757	NC_018746	GCT	2	6	39645	39650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669235
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759	NC_018746	CAT	2	6	39747	39752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669235
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761	NC_018746	GCT	2	6	39855	39860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669235
762	NC_018746	GC	3	6	39929	39934	0 %	0 %	50 %	50 %	408669235
763	NC_018746	GGC	2	6	39967	39972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669235
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766	NC_018746	GGA	2	6	40091	40096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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877	NC_018746	GAA	2	6	46565	46570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669245
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881	NC_018746	GCCT	2	8	46855	46862	0 %	25 %	25 %	50 %	408669246
882	NC_018746	CACC	2	8	46864	46871	25 %	0 %	0 %	75 %	408669246
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884	NC_018746	AGTG	2	8	46949	46956	25 %	25 %	50 %	0 %	408669246
885	NC_018746	CCGCG	2	10	46999	47008	0 %	0 %	40 %	60 %	408669246
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888	NC_018746	CCT	2	6	47173	47178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669246
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923	NC_018746	TAA	2	6	48536	48541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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984	NC_018746	A	7	7	52222	52228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
985	NC_018746	CCA	2	6	52305	52310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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991	NC_018746	GTT	2	6	52627	52632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669256
992	NC_018746	GAG	2	6	52702	52707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669256
993	NC_018746	TGG	2	6	52737	52742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669256
994	NC_018746	CTT	2	6	52753	52758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669256
995	NC_018746	CGA	2	6	52779	52784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669256
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997	NC_018746	TCA	2	6	52902	52907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669257
998	NC_018746	ATG	3	9	53077	53085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669257
999	NC_018746	TTG	2	6	53140	53145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669257
1000	NC_018746	GCT	2	6	53150	53155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669257

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