MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida DOT-T1E chromosome

Total Repeats: 132053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018220	CCA	2	6	213519	213524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692961
4502	NC_018220	TGC	2	6	213567	213572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4503	NC_018220	CGC	2	6	213604	213609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692961
4504	NC_018220	GCA	2	6	213633	213638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4505	NC_018220	TTCG	2	8	213645	213652	0 %	50 %	25 %	25 %	397692961
4506	NC_018220	CAG	2	6	213676	213681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4507	NC_018220	ATG	2	6	213682	213687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397692961
4508	NC_018220	GTC	2	6	213827	213832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4509	NC_018220	GCTG	2	8	213924	213931	0 %	25 %	50 %	25 %	397692961
4510	NC_018220	TGA	2	6	213939	213944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397692961
4511	NC_018220	GCT	2	6	213951	213956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4512	NC_018220	ACCC	2	8	214062	214069	25 %	0 %	0 %	75 %	397692961
4513	NC_018220	TCA	2	6	214082	214087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397692961
4514	NC_018220	GAA	2	6	214090	214095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397692961
4515	NC_018220	TC	3	6	214148	214153	0 %	50 %	0 %	50 %	397692961
4516	NC_018220	TC	3	6	214237	214242	0 %	50 %	0 %	50 %	397692961
4517	NC_018220	CTG	2	6	214291	214296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4518	NC_018220	AAC	2	6	214310	214315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397692961
4519	NC_018220	GGTG	2	8	214354	214361	0 %	25 %	75 %	0 %	397692961
4520	NC_018220	GCTC	2	8	214419	214426	0 %	25 %	25 %	50 %	397692961
4521	NC_018220	CTG	2	6	214455	214460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4522	NC_018220	CTT	2	6	214513	214518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397692961
4523	NC_018220	TCGC	2	8	214525	214532	0 %	25 %	25 %	50 %	397692961
4524	NC_018220	ATT	2	6	214576	214581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397692961
4525	NC_018220	ATC	2	6	214705	214710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397692961
4526	NC_018220	GCC	2	6	214778	214783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692961
4527	NC_018220	C	6	6	214828	214833	0 %	0 %	0 %	100 %	397692961
4528	NC_018220	GGTG	2	8	214857	214864	0 %	25 %	75 %	0 %	397692961
4529	NC_018220	AGC	2	6	214964	214969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4530	NC_018220	GGC	2	6	214973	214978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692961
4531	NC_018220	CGGG	2	8	214992	214999	0 %	0 %	75 %	25 %	397692961
4532	NC_018220	GTT	2	6	215044	215049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397692961
4533	NC_018220	TCG	2	6	215078	215083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4534	NC_018220	GGCCA	2	10	215095	215104	20 %	0 %	40 %	40 %	397692961
4535	NC_018220	ACA	2	6	215183	215188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397692961
4536	NC_018220	CAG	2	6	215191	215196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4537	NC_018220	AGC	2	6	215378	215383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4538	NC_018220	GCC	2	6	215410	215415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692961
4539	NC_018220	CG	3	6	215428	215433	0 %	0 %	50 %	50 %	397692961
4540	NC_018220	CAG	2	6	215452	215457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4541	NC_018220	GGC	2	6	215481	215486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692961
4542	NC_018220	ACA	2	6	215556	215561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397692961
4543	NC_018220	GAT	2	6	215578	215583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397692961
4544	NC_018220	CT	3	6	215618	215623	0 %	50 %	0 %	50 %	397692961
4545	NC_018220	CTT	2	6	215676	215681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397692961
4546	NC_018220	GCA	2	6	215753	215758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4547	NC_018220	GCC	2	6	215860	215865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692961
4548	NC_018220	TG	3	6	215946	215951	0 %	50 %	50 %	0 %	397692961
4549	NC_018220	CAC	2	6	215953	215958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692961
4550	NC_018220	CCT	2	6	215960	215965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397692961
4551	NC_018220	GGC	2	6	215979	215984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692961
4552	NC_018220	T	9	9	216009	216017	0 %	100 %	0 %	0 %	397692961
4553	NC_018220	TCT	2	6	216024	216029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397692961
4554	NC_018220	AGCCC	2	10	216036	216045	20 %	0 %	20 %	60 %	397692961
4555	NC_018220	TCA	2	6	216086	216091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397692961
4556	NC_018220	GGT	2	6	216114	216119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397692961
4557	NC_018220	GCA	2	6	216123	216128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4558	NC_018220	CGC	2	6	216148	216153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692961
4559	NC_018220	GTAG	2	8	216237	216244	25 %	25 %	50 %	0 %	397692961
4560	NC_018220	AGCCC	2	10	216294	216303	20 %	0 %	20 %	60 %	397692961
4561	NC_018220	A	6	6	216331	216336	100 %	0 %	0 %	0 %	397692961
4562	NC_018220	CAA	2	6	216439	216444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397692961
4563	NC_018220	TCA	2	6	216500	216505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397692961
4564	NC_018220	GCCGA	2	10	216539	216548	20 %	0 %	40 %	40 %	397692961
4565	NC_018220	CAT	2	6	216724	216729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397692961
4566	NC_018220	GCA	2	6	216738	216743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4567	NC_018220	GTT	2	6	216750	216755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397692961
4568	NC_018220	CGT	2	6	216756	216761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4569	NC_018220	GC	3	6	216797	216802	0 %	0 %	50 %	50 %	397692961
4570	NC_018220	AAC	2	6	216803	216808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397692961
4571	NC_018220	TGC	2	6	216809	216814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4572	NC_018220	GCA	2	6	216894	216899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4573	NC_018220	GC	3	6	216922	216927	0 %	0 %	50 %	50 %	397692961
4574	NC_018220	CAG	2	6	216948	216953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4575	NC_018220	CTCGA	2	10	216962	216971	20 %	20 %	20 %	40 %	397692961
4576	NC_018220	GCA	2	6	217059	217064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4577	NC_018220	CCA	2	6	217071	217076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692961
4578	NC_018220	GCA	2	6	217130	217135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692961
4579	NC_018220	GCG	2	6	217244	217249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692961
4580	NC_018220	TGC	2	6	217356	217361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_018220	GCG	2	6	217386	217391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_018220	CACG	2	8	217461	217468	25 %	0 %	25 %	50 %	397692962
4583	NC_018220	TCTGG	2	10	217470	217479	0 %	40 %	40 %	20 %	397692962
4584	NC_018220	CGG	2	6	217573	217578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692962
4585	NC_018220	CTCG	2	8	217579	217586	0 %	25 %	25 %	50 %	397692962
4586	NC_018220	CTT	2	6	217635	217640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397692962
4587	NC_018220	CAT	2	6	217642	217647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397692962
4588	NC_018220	CTT	2	6	217728	217733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397692962
4589	NC_018220	GGC	2	6	217837	217842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692962
4590	NC_018220	GC	3	6	217850	217855	0 %	0 %	50 %	50 %	397692962
4591	NC_018220	CAC	2	6	217867	217872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692962
4592	NC_018220	CAGCAC	2	12	217909	217920	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	397692962
4593	NC_018220	CAG	2	6	217984	217989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692962
4594	NC_018220	CAC	2	6	218011	218016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692962
4595	NC_018220	ACC	2	6	218027	218032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692962
4596	NC_018220	TCG	2	6	218051	218056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692962
4597	NC_018220	GCC	2	6	218062	218067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692962
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4600	NC_018220	AGCCA	2	10	218288	218297	40 %	0 %	20 %	40 %	397692962
4601	NC_018220	CAG	2	6	218317	218322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692962
4602	NC_018220	CGA	2	6	218382	218387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692962
4603	NC_018220	CCA	2	6	218404	218409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692962
4604	NC_018220	CAGC	2	8	218437	218444	25 %	0 %	25 %	50 %	397692962
4605	NC_018220	CGC	2	6	218559	218564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692962
4606	NC_018220	CAG	2	6	218566	218571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692962
4607	NC_018220	ATG	2	6	218600	218605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397692962
4608	NC_018220	GGC	2	6	218619	218624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692962
4609	NC_018220	GCCA	2	8	218668	218675	25 %	0 %	25 %	50 %	397692962
4610	NC_018220	CAC	2	6	218686	218691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692962
4611	NC_018220	CAG	2	6	218692	218697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692962
4612	NC_018220	GAC	2	6	218741	218746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692962
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4615	NC_018220	CCA	2	6	218928	218933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397692962
4616	NC_018220	GC	3	6	218992	218997	0 %	0 %	50 %	50 %	397692962
4617	NC_018220	AGT	2	6	219036	219041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397692962
4618	NC_018220	CAG	2	6	219070	219075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692962
4619	NC_018220	ATACCG	2	12	219080	219091	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397692962
4620	NC_018220	GTC	2	6	219139	219144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692962
4621	NC_018220	GAC	2	6	219190	219195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692962
4622	NC_018220	CAG	2	6	219199	219204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692962
4623	NC_018220	GTA	2	6	219226	219231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397692962
4624	NC_018220	CGG	2	6	219282	219287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692962
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4630	NC_018220	CTG	2	6	219557	219562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4633	NC_018220	ATTG	2	8	219794	219801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_018220	TCAA	2	8	219807	219814	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4635	NC_018220	GCC	2	6	219844	219849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4636	NC_018220	GTC	2	6	219851	219856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4637	NC_018220	GAG	2	6	219870	219875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4638	NC_018220	CAG	2	6	219917	219922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692963
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4651	NC_018220	GC	3	6	220331	220336	0 %	0 %	50 %	50 %	397692963
4652	NC_018220	AGC	2	6	220464	220469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692963
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4654	NC_018220	GC	3	6	220505	220510	0 %	0 %	50 %	50 %	397692963
4655	NC_018220	CA	3	6	220555	220560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4656	NC_018220	GCGCC	2	10	220795	220804	0 %	0 %	40 %	60 %	397692964
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4661	NC_018220	CGG	2	6	221263	221268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692964
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4703	NC_018220	CTG	2	6	222964	222969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692965
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4731	NC_018220	GCCA	2	8	224933	224940	25 %	0 %	25 %	50 %	397692966
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4734	NC_018220	TGG	2	6	225017	225022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397692966
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4738	NC_018220	CGA	2	6	225197	225202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692966
4739	NC_018220	CGT	2	6	225231	225236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692966
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4741	NC_018220	TCG	2	6	225277	225282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692966
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4863	NC_018220	CTG	3	9	230114	230122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692968
4864	NC_018220	CTGG	2	8	230125	230132	0 %	25 %	50 %	25 %	397692968
4865	NC_018220	ACG	2	6	230173	230178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692968
4866	NC_018220	GCGT	2	8	230191	230198	0 %	25 %	50 %	25 %	397692968
4867	NC_018220	AAGG	2	8	230219	230226	50 %	0 %	50 %	0 %	397692968
4868	NC_018220	TCA	2	6	230241	230246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397692968
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4887	NC_018220	CTG	2	6	230981	230986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692968
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4892	NC_018220	GCC	2	6	231420	231425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4893	NC_018220	CGCC	2	8	231502	231509	0 %	0 %	25 %	75 %	397692969
4894	NC_018220	TGC	2	6	231534	231539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692969
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4897	NC_018220	CTCGAC	2	12	231596	231607	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	397692969
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4902	NC_018220	TCG	2	6	231857	231862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692969
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4950	NC_018220	GACC	2	8	234344	234351	25 %	0 %	25 %	50 %	397692972
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4974	NC_018220	GCG	2	6	235171	235176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692972
4975	NC_018220	AT	3	6	235281	235286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4976	NC_018220	T	6	6	235315	235320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4977	NC_018220	CCCG	2	8	235337	235344	0 %	0 %	25 %	75 %	397692973
4978	NC_018220	C	6	6	235360	235365	0 %	0 %	0 %	100 %	397692973
4979	NC_018220	TCC	2	6	235366	235371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397692973
4980	NC_018220	GCG	2	6	235456	235461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692973
4981	NC_018220	ATG	2	6	235500	235505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397692973
4982	NC_018220	AGC	2	6	235545	235550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397692973
4983	NC_018220	CTG	2	6	235590	235595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692973
4984	NC_018220	GCC	2	6	235659	235664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397692973
4985	NC_018220	GGC	2	6	235751	235756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692973
4986	NC_018220	ACCT	2	8	235767	235774	25 %	25 %	0 %	50 %	397692973
4987	NC_018220	TGGCC	2	10	235802	235811	0 %	20 %	40 %	40 %	397692973
4988	NC_018220	CGG	2	6	235826	235831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692973
4989	NC_018220	GGC	2	6	235842	235847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692973
4990	NC_018220	GCGG	2	8	235852	235859	0 %	0 %	75 %	25 %	397692973
4991	NC_018220	TCA	2	6	235861	235866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397692973
4992	NC_018220	GGC	2	6	235917	235922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397692973
4993	NC_018220	TGG	2	6	235930	235935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397692973
4994	NC_018220	TGC	2	6	235957	235962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692973
4995	NC_018220	CTG	2	6	236007	236012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692973
4996	NC_018220	CTT	2	6	236069	236074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397692973
4997	NC_018220	CTG	2	6	236121	236126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397692973
4998	NC_018220	GGT	2	6	236171	236176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397692973
4999	NC_018220	GC	3	6	236212	236217	0 %	0 %	50 %	50 %	397692973
5000	NC_018220	TGA	2	6	236284	236289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397692973

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