MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus furiosus COM1 chromosome

Total Repeats: 40179

< Previous12...69707172737475767778798081Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_018092	TCG	2	6	1901920	1901925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397652740
40002	NC_018092	TA	3	6	1901931	1901936	50 %	50 %	0 %	0 %	397652740
40003	NC_018092	TCA	2	6	1902023	1902028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397652740
40004	NC_018092	CT	3	6	1902072	1902077	0 %	50 %	0 %	50 %	397652741
40005	NC_018092	TTA	2	6	1902160	1902165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397652741
40006	NC_018092	TCT	2	6	1902207	1902212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397652741
40007	NC_018092	TCT	2	6	1902255	1902260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397652741
40008	NC_018092	T	6	6	1902274	1902279	0 %	100 %	0 %	0 %	397652741
40009	NC_018092	CTA	2	6	1902334	1902339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397652741
40010	NC_018092	AGG	2	6	1902411	1902416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397652741
40011	NC_018092	CTTT	2	8	1902520	1902527	0 %	75 %	0 %	25 %	397652741
40012	NC_018092	ACC	2	6	1902545	1902550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397652741
40013	NC_018092	CGT	2	6	1902619	1902624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397652741
40014	NC_018092	TGT	3	9	1902746	1902754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397652741
40015	NC_018092	TCC	2	6	1902764	1902769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397652741
40016	NC_018092	C	6	6	1902813	1902818	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40017	NC_018092	TAT	2	6	1902850	1902855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40018	NC_018092	TTTGC	2	10	1902883	1902892	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40019	NC_018092	ATG	2	6	1902945	1902950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40020	NC_018092	TAA	2	6	1903002	1903007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40021	NC_018092	TTA	2	6	1903017	1903022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40022	NC_018092	ATA	2	6	1903025	1903030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40023	NC_018092	TAT	2	6	1903067	1903072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397652742
40024	NC_018092	CCT	2	6	1903080	1903085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397652742
40025	NC_018092	AGT	2	6	1903097	1903102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397652742
40026	NC_018092	TGA	2	6	1903121	1903126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397652742
40027	NC_018092	A	7	7	1903187	1903193	100 %	0 %	0 %	0 %	397652742
40028	NC_018092	CTA	2	6	1903194	1903199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397652742
40029	NC_018092	ATTG	2	8	1903249	1903256	25 %	50 %	25 %	0 %	397652742
40030	NC_018092	TCT	2	6	1903260	1903265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397652742
40031	NC_018092	CT	3	6	1903268	1903273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40032	NC_018092	ATCA	2	8	1903276	1903283	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40033	NC_018092	GTG	2	6	1903371	1903376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40034	NC_018092	ATGG	2	8	1903392	1903399	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40035	NC_018092	GAG	2	6	1903408	1903413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40036	NC_018092	TTA	2	6	1903540	1903545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397652743
40037	NC_018092	TCA	2	6	1903657	1903662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397652743
40038	NC_018092	ATACC	2	10	1903678	1903687	40 %	20 %	0 %	40 %	397652743
40039	NC_018092	GTT	2	6	1903749	1903754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397652743
40040	NC_018092	CCT	2	6	1903755	1903760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397652743
40041	NC_018092	GAC	2	6	1903803	1903808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397652743
40042	NC_018092	AGT	2	6	1903832	1903837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397652743
40043	NC_018092	CAC	2	6	1903875	1903880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397652743
40044	NC_018092	TTC	2	6	1903882	1903887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397652743
40045	NC_018092	CTT	2	6	1903890	1903895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397652743
40046	NC_018092	CCA	2	6	1903974	1903979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397652743
40047	NC_018092	GTG	2	6	1904029	1904034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397652743
40048	NC_018092	CTC	2	6	1904103	1904108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397652743
40049	NC_018092	GAA	2	6	1904162	1904167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397652743
40050	NC_018092	TGT	2	6	1904363	1904368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397652743
40051	NC_018092	CTT	2	6	1904376	1904381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397652743
40052	NC_018092	TC	3	6	1904382	1904387	0 %	50 %	0 %	50 %	397652743
40053	NC_018092	TC	3	6	1904418	1904423	0 %	50 %	0 %	50 %	397652743
40054	NC_018092	TTGT	2	8	1904435	1904442	0 %	75 %	25 %	0 %	397652743
40055	NC_018092	CTTGG	2	10	1904450	1904459	0 %	40 %	40 %	20 %	397652743
40056	NC_018092	GTT	2	6	1904540	1904545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40057	NC_018092	GT	3	6	1904586	1904591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40058	NC_018092	GAG	2	6	1904601	1904606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40059	NC_018092	GGT	2	6	1904633	1904638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40060	NC_018092	ACC	2	6	1904663	1904668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40061	NC_018092	CCCT	2	8	1904711	1904718	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40062	NC_018092	CCCG	2	8	1904734	1904741	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40063	NC_018092	GAG	2	6	1904769	1904774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40064	NC_018092	TTA	2	6	1904844	1904849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397652744
40065	NC_018092	C	6	6	1904937	1904942	0 %	0 %	0 %	100 %	397652744
40066	NC_018092	AGCC	2	8	1904946	1904953	25 %	0 %	25 %	50 %	397652744
40067	NC_018092	TGG	2	6	1905026	1905031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397652744
40068	NC_018092	GAAAAA	2	12	1905171	1905182	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397652745
40069	NC_018092	AGA	2	6	1905219	1905224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397652745
40070	NC_018092	AGA	2	6	1905261	1905266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397652745
40071	NC_018092	GGA	2	6	1905318	1905323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397652745
40072	NC_018092	AGA	3	9	1905324	1905332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397652745
40073	NC_018092	GGAA	2	8	1905333	1905340	50 %	0 %	50 %	0 %	397652745
40074	NC_018092	AAT	2	6	1905369	1905374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397652745
40075	NC_018092	GAG	2	6	1905384	1905389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397652745
40076	NC_018092	TGGA	2	8	1905427	1905434	25 %	25 %	50 %	0 %	397652745
40077	NC_018092	A	7	7	1905516	1905522	100 %	0 %	0 %	0 %	397652745
40078	NC_018092	GA	3	6	1905538	1905543	50 %	0 %	50 %	0 %	397652745
40079	NC_018092	CTT	2	6	1905616	1905621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397652746
40080	NC_018092	ACTTTC	2	12	1905648	1905659	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397652746
40081	NC_018092	CTT	2	6	1905686	1905691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397652746
40082	NC_018092	TCT	2	6	1905739	1905744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397652746
40083	NC_018092	TC	3	6	1905757	1905762	0 %	50 %	0 %	50 %	397652746
40084	NC_018092	TGT	2	6	1905782	1905787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397652746
40085	NC_018092	TCT	2	6	1905853	1905858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397652746
40086	NC_018092	TTC	2	6	1905885	1905890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397652746
40087	NC_018092	TC	4	8	1905896	1905903	0 %	50 %	0 %	50 %	397652746
40088	NC_018092	AGC	2	6	1905969	1905974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397652746
40089	NC_018092	CTA	2	6	1906019	1906024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397652746
40090	NC_018092	CTT	2	6	1906064	1906069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397652746
40091	NC_018092	GTAA	2	8	1906116	1906123	50 %	25 %	25 %	0 %	397652746
40092	NC_018092	CCT	2	6	1906190	1906195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397652746
40093	NC_018092	GTAT	2	8	1906241	1906248	25 %	50 %	25 %	0 %	397652746
40094	NC_018092	CCT	2	6	1906317	1906322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397652746
40095	NC_018092	ATC	2	6	1906333	1906338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397652746
40096	NC_018092	CTG	2	6	1906346	1906351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397652746
40097	NC_018092	AGGC	2	8	1906381	1906388	25 %	0 %	50 %	25 %	397652746
40098	NC_018092	T	6	6	1906394	1906399	0 %	100 %	0 %	0 %	397652746
40099	NC_018092	TTC	2	6	1906416	1906421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397652746
40100	NC_018092	CCA	2	6	1906451	1906456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397652746
40101	NC_018092	CTG	2	6	1906469	1906474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397652746
40102	NC_018092	GCC	2	6	1906522	1906527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397652746
40103	NC_018092	CGC	2	6	1906568	1906573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397652746
40104	NC_018092	ATT	2	6	1906591	1906596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397652746
40105	NC_018092	TCC	2	6	1906660	1906665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397652746
40106	NC_018092	ATTT	2	8	1906677	1906684	25 %	75 %	0 %	0 %	397652746
40107	NC_018092	CGA	2	6	1906733	1906738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397652746
40108	NC_018092	TC	3	6	1906778	1906783	0 %	50 %	0 %	50 %	397652746
40109	NC_018092	TA	3	6	1906800	1906805	50 %	50 %	0 %	0 %	397652746
40110	NC_018092	TGA	2	6	1906864	1906869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397652746
40111	NC_018092	GA	3	6	1906873	1906878	50 %	0 %	50 %	0 %	397652746
40112	NC_018092	CAA	2	6	1906910	1906915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397652746
40113	NC_018092	TGGA	2	8	1906980	1906987	25 %	25 %	50 %	0 %	397652746
40114	NC_018092	TCT	2	6	1907005	1907010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397652746
40115	NC_018092	AATTTT	2	12	1907052	1907063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397652746
40116	NC_018092	ATG	2	6	1907121	1907126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397652747
40117	NC_018092	T	6	6	1907198	1907203	0 %	100 %	0 %	0 %	397652747
40118	NC_018092	TTAA	2	8	1907211	1907218	50 %	50 %	0 %	0 %	397652747
40119	NC_018092	TCT	2	6	1907270	1907275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397652747
40120	NC_018092	GTT	3	9	1907337	1907345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397652747
40121	NC_018092	TAGG	2	8	1907365	1907372	25 %	25 %	50 %	0 %	397652747
40122	NC_018092	AAT	2	6	1907495	1907500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397652747
40123	NC_018092	CT	3	6	1907525	1907530	0 %	50 %	0 %	50 %	397652747
40124	NC_018092	AGC	2	6	1907534	1907539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397652747
40125	NC_018092	TTTA	2	8	1907555	1907562	25 %	75 %	0 %	0 %	397652747
40126	NC_018092	TCA	2	6	1907640	1907645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397652747
40127	NC_018092	TTC	2	6	1907687	1907692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397652747
40128	NC_018092	ATT	2	6	1907706	1907711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397652747
40129	NC_018092	GTA	2	6	1907757	1907762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40130	NC_018092	GTG	2	6	1907773	1907778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40131	NC_018092	GAA	2	6	1907831	1907836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397652748
40132	NC_018092	TGA	2	6	1907902	1907907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397652748
40133	NC_018092	ATA	3	9	1907921	1907929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397652748
40134	NC_018092	AGA	2	6	1907950	1907955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397652748
40135	NC_018092	ATG	2	6	1907973	1907978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397652748
40136	NC_018092	G	6	6	1908005	1908010	0 %	0 %	100 %	0 %	397652748
40137	NC_018092	GAG	2	6	1908100	1908105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397652749
40138	NC_018092	ATT	2	6	1908115	1908120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397652749
40139	NC_018092	ATA	2	6	1908214	1908219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397652749
40140	NC_018092	TCCT	2	8	1908227	1908234	0 %	50 %	0 %	50 %	397652749
40141	NC_018092	GA	3	6	1908316	1908321	50 %	0 %	50 %	0 %	397652749
40142	NC_018092	A	6	6	1908368	1908373	100 %	0 %	0 %	0 %	397652749
40143	NC_018092	TGA	2	6	1908408	1908413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397652749
40144	NC_018092	TAA	2	6	1908452	1908457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397652749
40145	NC_018092	TAA	2	6	1908473	1908478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397652749
40146	NC_018092	GGT	2	6	1908484	1908489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397652749
40147	NC_018092	AGC	2	6	1908500	1908505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397652749
40148	NC_018092	ATT	2	6	1908515	1908520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397652750
40149	NC_018092	ATT	2	6	1908615	1908620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397652750
40150	NC_018092	TTA	2	6	1908646	1908651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397652750
40151	NC_018092	AGT	2	6	1908716	1908721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397652750
40152	NC_018092	CTTAA	2	10	1908756	1908765	40 %	40 %	0 %	20 %	397652750
40153	NC_018092	TGT	2	6	1908788	1908793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397652750
40154	NC_018092	CTA	2	6	1908796	1908801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397652750
40155	NC_018092	GGT	2	6	1908847	1908852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397652750
40156	NC_018092	ATA	2	6	1908862	1908867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397652750
40157	NC_018092	AAG	2	6	1908868	1908873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397652750
40158	NC_018092	CTT	2	6	1908891	1908896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397652750
40159	NC_018092	ATG	2	6	1908930	1908935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397652750
40160	NC_018092	AAG	2	6	1908950	1908955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397652750
40161	NC_018092	CAT	2	6	1908970	1908975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397652750
40162	NC_018092	TGA	2	6	1908992	1908997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397652750
40163	NC_018092	TAA	2	6	1909015	1909020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397652750
40164	NC_018092	CCT	2	6	1909067	1909072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397652751
40165	NC_018092	GAAT	2	8	1909114	1909121	50 %	25 %	25 %	0 %	397652751
40166	NC_018092	AAAC	2	8	1909154	1909161	75 %	0 %	0 %	25 %	397652751
40167	NC_018092	CTC	2	6	1909171	1909176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397652751
40168	NC_018092	ATT	2	6	1909194	1909199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397652751
40169	NC_018092	AAC	2	6	1909365	1909370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397652751
40170	NC_018092	CCA	2	6	1909392	1909397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397652751
40171	NC_018092	TTC	2	6	1909471	1909476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397652751
40172	NC_018092	TTA	2	6	1909487	1909492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397652751
40173	NC_018092	T	6	6	1909524	1909529	0 %	100 %	0 %	0 %	397652751
40174	NC_018092	TTTTC	2	10	1909667	1909676	0 %	80 %	0 %	20 %	397652751
40175	NC_018092	TGG	2	6	1909677	1909682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397652751
40176	NC_018092	CGA	2	6	1909693	1909698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397652751
40177	NC_018092	ACC	2	6	1909717	1909722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397652751
40178	NC_018092	AAT	2	6	1909728	1909733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397652751
40179	NC_018092	CTT	2	6	1909756	1909761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous12...69707172737475767778798081Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.