MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus furiosus COM1 chromosome

Total Repeats: 40179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018092	A	6	6	49	54	100 %	0 %	0 %	0 %	397650688
2	NC_018092	TTG	2	6	56	61	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397650688
3	NC_018092	AGC	2	6	120	125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650688
4	NC_018092	CAG	2	6	203	208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650688
5	NC_018092	ACC	2	6	290	295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397650688
6	NC_018092	ACC	2	6	367	372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397650688
7	NC_018092	AAG	2	6	373	378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
8	NC_018092	ATGTA	2	10	476	485	40 %	40 %	20 %	0 %	397650688
9	NC_018092	CTA	2	6	489	494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650688
10	NC_018092	CTC	2	6	586	591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397650688
11	NC_018092	GAA	2	6	607	612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
12	NC_018092	GTA	2	6	628	633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650688
13	NC_018092	AAG	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
14	NC_018092	TTG	2	6	740	745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397650688
15	NC_018092	AAG	2	6	859	864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
16	NC_018092	GAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
17	NC_018092	TTA	2	6	914	919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397650688
18	NC_018092	TGT	2	6	1131	1136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397650688
19	NC_018092	CAT	2	6	1220	1225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650688
20	NC_018092	TGA	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650688
21	NC_018092	AGA	2	6	1253	1258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
22	NC_018092	TGG	2	6	1284	1289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397650688
23	NC_018092	AAG	2	6	1357	1362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
24	NC_018092	AG	3	6	1384	1389	50 %	0 %	50 %	0 %	397650688
25	NC_018092	TCA	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650688
26	NC_018092	CAT	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650688
27	NC_018092	TCC	2	6	1442	1447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397650688
28	NC_018092	GTG	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397650688
29	NC_018092	AG	3	6	1603	1608	50 %	0 %	50 %	0 %	397650688
30	NC_018092	AAG	2	6	1633	1638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
31	NC_018092	TTGGAA	2	12	1682	1693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650688
32	NC_018092	AAG	2	6	1697	1702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
33	NC_018092	GA	3	6	1705	1710	50 %	0 %	50 %	0 %	397650688
34	NC_018092	TAC	2	6	1723	1728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650688
35	NC_018092	AGA	2	6	1783	1788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
36	NC_018092	TTA	2	6	1839	1844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397650688
37	NC_018092	TTCTC	2	10	1874	1883	0 %	60 %	0 %	40 %	397650688
38	NC_018092	TAC	2	6	1903	1908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650688
39	NC_018092	AGA	2	6	1980	1985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
40	NC_018092	TAC	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650688
41	NC_018092	CAG	2	6	2090	2095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650688
42	NC_018092	CTAA	2	8	2170	2177	50 %	25 %	0 %	25 %	397650688
43	NC_018092	TGC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397650688
44	NC_018092	CAG	2	6	2222	2227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650688
45	NC_018092	TTC	2	6	2239	2244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397650688
46	NC_018092	CAA	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397650688
47	NC_018092	CAG	2	6	2282	2287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650688
48	NC_018092	ACT	2	6	2362	2367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650688
49	NC_018092	ACC	2	6	2368	2373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397650688
50	NC_018092	ACC	2	6	2395	2400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397650688
51	NC_018092	ACT	2	6	2431	2436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650688
52	NC_018092	GGA	2	6	2458	2463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397650688
53	NC_018092	TTG	2	6	2483	2488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397650688
54	NC_018092	AGT	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650688
55	NC_018092	CTC	2	6	2506	2511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397650688
56	NC_018092	AAG	2	6	2524	2529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
57	NC_018092	T	6	6	2533	2538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018092	TGC	2	6	2589	2594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018092	AAATA	2	10	2628	2637	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018092	AGT	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018092	GAT	3	9	2666	2674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018092	CT	3	6	2771	2776	0 %	50 %	0 %	50 %	397650689
63	NC_018092	TAG	2	6	2787	2792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650689
64	NC_018092	TC	3	6	2870	2875	0 %	50 %	0 %	50 %	397650689
65	NC_018092	CAA	2	6	2879	2884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397650689
66	NC_018092	TA	3	6	2946	2951	50 %	50 %	0 %	0 %	397650689
67	NC_018092	GA	3	6	3047	3052	50 %	0 %	50 %	0 %	397650689
68	NC_018092	AAT	2	6	3064	3069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397650689
69	NC_018092	CTG	2	6	3095	3100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397650689
70	NC_018092	GCT	2	6	3155	3160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397650689
71	NC_018092	TGG	2	6	3230	3235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397650689
72	NC_018092	GGTT	2	8	3348	3355	0 %	50 %	50 %	0 %	397650689
73	NC_018092	TCA	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650689
74	NC_018092	TGG	2	6	3450	3455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397650689
75	NC_018092	AAGG	2	8	3478	3485	50 %	0 %	50 %	0 %	397650689
76	NC_018092	GTG	2	6	3564	3569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397650689
77	NC_018092	TCA	2	6	3669	3674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650689
78	NC_018092	TAA	2	6	3699	3704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397650689
79	NC_018092	AAGAGT	2	12	3736	3747	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	397650689
80	NC_018092	GGT	2	6	3770	3775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018092	AGA	2	6	3831	3836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650690
82	NC_018092	GA	3	6	3835	3840	50 %	0 %	50 %	0 %	397650690
83	NC_018092	ACC	2	6	3968	3973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397650690
84	NC_018092	GTG	2	6	3994	3999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397650690
85	NC_018092	GAA	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650690
86	NC_018092	ATT	2	6	4074	4079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397650690
87	NC_018092	ACA	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397650690
88	NC_018092	ATG	2	6	4102	4107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650690
89	NC_018092	CCTT	2	8	4167	4174	0 %	50 %	0 %	50 %	397650690
90	NC_018092	ACA	2	6	4242	4247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397650690
91	NC_018092	GA	3	6	4262	4267	50 %	0 %	50 %	0 %	397650690
92	NC_018092	GCG	2	6	4270	4275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397650690
93	NC_018092	TC	3	6	4481	4486	0 %	50 %	0 %	50 %	397650690
94	NC_018092	AATT	2	8	4495	4502	50 %	50 %	0 %	0 %	397650690
95	NC_018092	GAA	2	6	4510	4515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650690
96	NC_018092	GAT	2	6	4536	4541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650690
97	NC_018092	CAG	2	6	4609	4614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650690
98	NC_018092	TGGT	2	8	4627	4634	0 %	50 %	50 %	0 %	397650690
99	NC_018092	GCA	2	6	4653	4658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650690
100	NC_018092	GGA	2	6	4665	4670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397650690
101	NC_018092	ATG	2	6	4686	4691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650690
102	NC_018092	AATCCT	2	12	4730	4741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650690
103	NC_018092	TACT	2	8	4748	4755	25 %	50 %	0 %	25 %	397650690
104	NC_018092	GGA	2	6	4758	4763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397650690
105	NC_018092	CTG	2	6	4791	4796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397650690
106	NC_018092	TGGAAG	2	12	4895	4906	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	397650690
107	NC_018092	AAT	2	6	4907	4912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397650690
108	NC_018092	ATG	2	6	4923	4928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650690
109	NC_018092	TGG	3	9	5094	5102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397650690
110	NC_018092	CCA	2	6	5109	5114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397650690
111	NC_018092	GGATA	2	10	5168	5177	40 %	20 %	40 %	0 %	397650690
112	NC_018092	GGT	2	6	5205	5210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018092	AAG	2	6	5221	5226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650691
114	NC_018092	ACTTC	2	10	5258	5267	20 %	40 %	0 %	40 %	397650691
115	NC_018092	GA	3	6	5339	5344	50 %	0 %	50 %	0 %	397650691
116	NC_018092	GAA	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650691
117	NC_018092	G	6	6	5412	5417	0 %	0 %	100 %	0 %	397650691
118	NC_018092	AGA	2	6	5457	5462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650691
119	NC_018092	AGA	2	6	5489	5494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650691
120	NC_018092	TA	3	6	5537	5542	50 %	50 %	0 %	0 %	397650691
121	NC_018092	GAGG	2	8	5592	5599	25 %	0 %	75 %	0 %	397650691
122	NC_018092	TGGT	2	8	5633	5640	0 %	50 %	50 %	0 %	397650691
123	NC_018092	AG	3	6	5696	5701	50 %	0 %	50 %	0 %	397650691
124	NC_018092	CTC	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397650691
125	NC_018092	CGA	2	6	5748	5753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650691
126	NC_018092	ACA	2	6	5758	5763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397650691
127	NC_018092	GTA	2	6	5773	5778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650691
128	NC_018092	TGA	2	6	5801	5806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650691
129	NC_018092	AGA	2	6	5816	5821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650691
130	NC_018092	CGAG	2	8	5927	5934	25 %	0 %	50 %	25 %	397650691
131	NC_018092	CTA	2	6	5940	5945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650691
132	NC_018092	CCA	2	6	6037	6042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397650691
133	NC_018092	ACCC	2	8	6053	6060	25 %	0 %	0 %	75 %	397650691
134	NC_018092	GCA	2	6	6154	6159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650691
135	NC_018092	GTT	2	6	6165	6170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397650691
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273	NC_018092	CCT	2	6	11983	11988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397650699
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