MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri CCUG 29243 chromosome

Total Repeats: 107443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_018028	CCGA	2	8	636658	636665	25 %	0 %	25 %	50 %	392419650
15002	NC_018028	CGA	2	6	636671	636676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419650
15003	NC_018028	GCC	2	6	636771	636776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419650
15004	NC_018028	CTT	2	6	636786	636791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419650
15005	NC_018028	CGA	2	6	636800	636805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419650
15006	NC_018028	GC	3	6	636886	636891	0 %	0 %	50 %	50 %	392419650
15007	NC_018028	GTG	2	6	636904	636909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419650
15008	NC_018028	GAA	2	6	636939	636944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419650
15009	NC_018028	GCC	3	9	636954	636962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419650
15010	NC_018028	TCA	2	6	636971	636976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419650
15011	NC_018028	CCG	2	6	636986	636991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419650
15012	NC_018028	CTG	2	6	636999	637004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419650
15013	NC_018028	GCGCC	2	10	637010	637019	0 %	0 %	40 %	60 %	392419650
15014	NC_018028	AGA	2	6	637025	637030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419650
15015	NC_018028	CAG	2	6	637074	637079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419650
15016	NC_018028	TTC	2	6	637089	637094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419650
15017	NC_018028	CAG	2	6	637167	637172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419650
15018	NC_018028	ACC	3	9	637219	637227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419650
15019	NC_018028	GCT	2	6	637235	637240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419650
15020	NC_018028	CGC	2	6	637250	637255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419650
15021	NC_018028	TCG	2	6	637270	637275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419650
15022	NC_018028	TCA	2	6	637280	637285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419650
15023	NC_018028	CGG	2	6	637364	637369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419650
15024	NC_018028	GGC	2	6	637413	637418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419650
15025	NC_018028	GGT	2	6	637422	637427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419650
15026	NC_018028	GCA	2	6	637517	637522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15027	NC_018028	GCT	2	6	637585	637590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15028	NC_018028	GGT	2	6	637625	637630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_018028	GGCC	2	8	637716	637723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15030	NC_018028	TCC	2	6	637760	637765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15031	NC_018028	CG	3	6	637790	637795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15032	NC_018028	CCGCG	2	10	637801	637810	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15033	NC_018028	CCG	2	6	637827	637832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419651
15034	NC_018028	TGT	2	6	637846	637851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419651
15035	NC_018028	GCT	3	9	637976	637984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419651
15036	NC_018028	ACG	2	6	637993	637998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419651
15037	NC_018028	GC	3	6	638010	638015	0 %	0 %	50 %	50 %	392419651
15038	NC_018028	AGC	2	6	638083	638088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419651
15039	NC_018028	CCG	2	6	638137	638142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419651
15040	NC_018028	CCG	2	6	638184	638189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419651
15041	NC_018028	GCTG	2	8	638218	638225	0 %	25 %	50 %	25 %	392419651
15042	NC_018028	CGG	3	9	638272	638280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419651
15043	NC_018028	GGTGCG	2	12	638303	638314	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	392419651
15044	NC_018028	ACAGGC	2	12	638468	638479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419652
15045	NC_018028	CTT	2	6	638526	638531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419652
15046	NC_018028	GAT	2	6	638544	638549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419652
15047	NC_018028	CGA	2	6	638576	638581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419652
15048	NC_018028	ATC	3	9	638587	638595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419652
15049	NC_018028	CTGA	2	8	638631	638638	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15050	NC_018028	CGA	2	6	638642	638647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15051	NC_018028	GCG	2	6	638676	638681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15052	NC_018028	CG	3	6	638754	638759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15053	NC_018028	GGCG	2	8	638761	638768	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15054	NC_018028	GCG	2	6	638774	638779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15055	NC_018028	GCC	2	6	638804	638809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419653
15056	NC_018028	CTG	2	6	638860	638865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419653
15057	NC_018028	CGT	2	6	638877	638882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419653
15058	NC_018028	CGC	2	6	638905	638910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419653
15059	NC_018028	GCT	2	6	638946	638951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419653
15060	NC_018028	GC	3	6	638973	638978	0 %	0 %	50 %	50 %	392419653
15061	NC_018028	GC	3	6	639032	639037	0 %	0 %	50 %	50 %	392419653
15062	NC_018028	AGC	2	6	639038	639043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419653
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15064	NC_018028	GAA	2	6	639127	639132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419653
15065	NC_018028	GCA	2	6	639145	639150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419653
15066	NC_018028	CCG	2	6	639227	639232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15067	NC_018028	CCGG	2	8	639258	639265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15068	NC_018028	GCA	2	6	639310	639315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15069	NC_018028	ACGC	2	8	639420	639427	25 %	0 %	25 %	50 %	392419654
15070	NC_018028	CTG	2	6	639468	639473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419654
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15074	NC_018028	CGT	2	6	639692	639697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419654
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15078	NC_018028	ATTG	2	8	639883	639890	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_018028	GTG	2	6	639935	639940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_018028	GCA	2	6	639990	639995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15081	NC_018028	ACC	2	6	640007	640012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15082	NC_018028	CG	3	6	640063	640068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15083	NC_018028	AAG	2	6	640069	640074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_018028	ATC	2	6	640080	640085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15085	NC_018028	TGG	2	6	640143	640148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_018028	CGG	2	6	640188	640193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419655
15087	NC_018028	CA	4	8	640269	640276	50 %	0 %	0 %	50 %	392419655
15088	NC_018028	AGA	2	6	640490	640495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419655
15089	NC_018028	CAG	2	6	640668	640673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419655
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15091	NC_018028	ATC	2	6	640699	640704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419655
15092	NC_018028	GC	3	6	640724	640729	0 %	0 %	50 %	50 %	392419655
15093	NC_018028	CAG	2	6	640746	640751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419655
15094	NC_018028	CGA	2	6	640772	640777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419655
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15097	NC_018028	AGT	2	6	640877	640882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419655
15098	NC_018028	AGC	2	6	640900	640905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419655
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15101	NC_018028	CAG	2	6	640995	641000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419655
15102	NC_018028	CG	3	6	641084	641089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15103	NC_018028	TCA	2	6	641092	641097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419656
15104	NC_018028	GGC	2	6	641119	641124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419656
15105	NC_018028	GTC	2	6	641164	641169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419656
15106	NC_018028	GAT	2	6	641200	641205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419656
15107	NC_018028	GATC	2	8	641223	641230	25 %	25 %	25 %	25 %	392419656
15108	NC_018028	TCG	3	9	641282	641290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419656
15109	NC_018028	CAG	2	6	641356	641361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419656
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15112	NC_018028	GAT	2	6	641488	641493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419656
15113	NC_018028	CCT	2	6	641517	641522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15114	NC_018028	GAT	2	6	641562	641567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_018028	CATCC	2	10	641703	641712	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
15116	NC_018028	CG	3	6	641741	641746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15117	NC_018028	CGT	2	6	641757	641762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15118	NC_018028	CCG	2	6	641792	641797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15119	NC_018028	CCGGG	2	10	641810	641819	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15120	NC_018028	CGG	2	6	641834	641839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15121	NC_018028	GCA	2	6	641850	641855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15122	NC_018028	CCGG	2	8	641887	641894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15123	NC_018028	GCA	2	6	641915	641920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419657
15124	NC_018028	CGC	2	6	641934	641939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419657
15125	NC_018028	GTCA	2	8	641986	641993	25 %	25 %	25 %	25 %	392419657
15126	NC_018028	CCG	2	6	641995	642000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419657
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15132	NC_018028	CGGG	2	8	642238	642245	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15133	NC_018028	GTT	2	6	642253	642258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15224	NC_018028	GGCCAG	2	12	645531	645542	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	392419659
15225	NC_018028	GATC	2	8	645563	645570	25 %	25 %	25 %	25 %	392419659
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15228	NC_018028	AGC	2	6	645638	645643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15229	NC_018028	AGGC	2	8	645685	645692	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15230	NC_018028	TGG	2	6	645759	645764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419660
15231	NC_018028	CGG	2	6	645772	645777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419660
15232	NC_018028	CG	3	6	645794	645799	0 %	0 %	50 %	50 %	392419660
15233	NC_018028	GC	3	6	645825	645830	0 %	0 %	50 %	50 %	392419660
15234	NC_018028	GCA	2	6	645877	645882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419660
15235	NC_018028	CAC	2	6	645893	645898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419660
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15237	NC_018028	TGG	3	9	645966	645974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419660
15238	NC_018028	CGG	2	6	645982	645987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419660
15239	NC_018028	CAA	2	6	646003	646008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419660
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15241	NC_018028	GC	3	6	646089	646094	0 %	0 %	50 %	50 %	392419660
15242	NC_018028	CGG	2	6	646135	646140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419660
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15248	NC_018028	GCGCCG	2	12	646423	646434	0 %	0 %	50 %	50 %	392419660
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15252	NC_018028	CTG	2	6	646508	646513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419660
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15265	NC_018028	CGG	2	6	647087	647092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419662
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15347	NC_018028	CGG	2	6	650009	650014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419664
15348	NC_018028	GC	3	6	650018	650023	0 %	0 %	50 %	50 %	392419664
15349	NC_018028	GCT	2	6	650051	650056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419664
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15352	NC_018028	GCG	2	6	650151	650156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419664
15353	NC_018028	GGC	2	6	650163	650168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419664
15354	NC_018028	ACA	2	6	650360	650365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419664
15355	NC_018028	CGC	2	6	650436	650441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419664
15356	NC_018028	GTT	3	9	650512	650520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15357	NC_018028	A	6	6	650522	650527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15358	NC_018028	CGT	2	6	650617	650622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419665
15359	NC_018028	GC	3	6	650634	650639	0 %	0 %	50 %	50 %	392419665
15360	NC_018028	CGG	2	6	650657	650662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419665
15361	NC_018028	GTC	2	6	650829	650834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419665
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15363	NC_018028	GCGT	2	8	650862	650869	0 %	25 %	50 %	25 %	392419665
15364	NC_018028	GCGAG	2	10	650879	650888	20 %	0 %	60 %	20 %	392419665
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15389	NC_018028	TGC	2	6	651857	651862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15465	NC_018028	GC	3	6	654962	654967	0 %	0 %	50 %	50 %	392419669
15466	NC_018028	CGAA	2	8	654973	654980	50 %	0 %	25 %	25 %	392419669
15467	NC_018028	CG	3	6	654993	654998	0 %	0 %	50 %	50 %	392419669
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15475	NC_018028	CAG	3	9	655358	655366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419670
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15478	NC_018028	AGC	2	6	655413	655418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419670
15479	NC_018028	GCT	2	6	655480	655485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419670
15480	NC_018028	GAA	2	6	655499	655504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419670
15481	NC_018028	CAG	2	6	655544	655549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419670
15482	NC_018028	TTC	2	6	655574	655579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419670
15483	NC_018028	GCG	2	6	655621	655626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419670
15484	NC_018028	CAG	3	9	655637	655645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419670
15485	NC_018028	GCA	2	6	655714	655719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419670
15486	NC_018028	CAC	3	9	655760	655768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419670
15487	NC_018028	CTG	2	6	655793	655798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419670
15488	NC_018028	CCA	2	6	655807	655812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419670
15489	NC_018028	CAG	2	6	655835	655840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419670
15490	NC_018028	ATC	2	6	655860	655865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419670
15491	NC_018028	TGC	2	6	655893	655898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419670
15492	NC_018028	CGC	2	6	655904	655909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419670
15493	NC_018028	GCCAGC	2	12	655914	655925	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392419670
15494	NC_018028	CAG	2	6	655952	655957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419670
15495	NC_018028	CCA	2	6	656014	656019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419670
15496	NC_018028	CAG	2	6	656105	656110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419670
15497	NC_018028	CAG	2	6	656129	656134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419670
15498	NC_018028	GC	3	6	656149	656154	0 %	0 %	50 %	50 %	392419670
15499	NC_018028	CGC	2	6	656170	656175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15500	NC_018028	CTG	2	6	656215	656220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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