MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri CCUG 29243 chromosome

Total Repeats: 107443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018028	CAGC	2	8	45255	45262	25 %	0 %	25 %	50 %	392419131
1002	NC_018028	GAC	3	9	45310	45318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419131
1003	NC_018028	CAG	2	6	45349	45354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419131
1004	NC_018028	GAG	2	6	45367	45372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419131
1005	NC_018028	GCAC	2	8	45385	45392	25 %	0 %	25 %	50 %	392419131
1006	NC_018028	AGC	3	9	45461	45469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419131
1007	NC_018028	AGCG	2	8	45478	45485	25 %	0 %	50 %	25 %	392419131
1008	NC_018028	ATC	2	6	45598	45603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419131
1009	NC_018028	CGA	2	6	45642	45647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419131
1010	NC_018028	GGC	2	6	45652	45657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419131
1011	NC_018028	CAA	2	6	45672	45677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419131
1012	NC_018028	GCA	2	6	45683	45688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419131
1013	NC_018028	AGC	2	6	45692	45697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419131
1014	NC_018028	AGC	2	6	45728	45733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419131
1015	NC_018028	GCC	2	6	45784	45789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419131
1016	NC_018028	GCC	2	6	45798	45803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419131
1017	NC_018028	TC	3	6	45816	45821	0 %	50 %	0 %	50 %	392419131
1018	NC_018028	CGA	2	6	45915	45920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419131
1019	NC_018028	GCG	2	6	45924	45929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419131
1020	NC_018028	CGC	2	6	45976	45981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419131
1021	NC_018028	ACG	2	6	45989	45994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419131
1022	NC_018028	TGGC	2	8	46033	46040	0 %	25 %	50 %	25 %	392419131
1023	NC_018028	GCCA	2	8	46090	46097	25 %	0 %	25 %	50 %	392419131
1024	NC_018028	CGGC	2	8	46136	46143	0 %	0 %	50 %	50 %	392419131
1025	NC_018028	ACT	2	6	46202	46207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419131
1026	NC_018028	CGG	2	6	46239	46244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419131
1027	NC_018028	AGC	2	6	46286	46291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419131
1028	NC_018028	GAA	2	6	46311	46316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419131
1029	NC_018028	ACCG	2	8	46321	46328	25 %	0 %	25 %	50 %	392419131
1030	NC_018028	CTA	2	6	46329	46334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419131
1031	NC_018028	ACG	2	6	46349	46354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419131
1032	NC_018028	CGCT	2	8	46387	46394	0 %	25 %	25 %	50 %	392419131
1033	NC_018028	GCTG	2	8	46456	46463	0 %	25 %	50 %	25 %	392419132
1034	NC_018028	GCG	2	6	46504	46509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419132
1035	NC_018028	TCG	2	6	46522	46527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1036	NC_018028	TGC	2	6	46587	46592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1037	NC_018028	GCG	2	6	46605	46610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419132
1038	NC_018028	GCC	2	6	46614	46619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419132
1039	NC_018028	CGG	2	6	46664	46669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419132
1040	NC_018028	CGC	2	6	46672	46677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419132
1041	NC_018028	CTG	2	6	46683	46688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1042	NC_018028	GCT	2	6	46706	46711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1043	NC_018028	CG	3	6	46721	46726	0 %	0 %	50 %	50 %	392419132
1044	NC_018028	CG	3	6	46775	46780	0 %	0 %	50 %	50 %	392419132
1045	NC_018028	GAA	2	6	46824	46829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419132
1046	NC_018028	CGA	2	6	46889	46894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1047	NC_018028	TGG	2	6	46936	46941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419132
1048	NC_018028	GCT	2	6	47063	47068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1049	NC_018028	GGTGCT	2	12	47075	47086	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392419132
1050	NC_018028	GCT	2	6	47105	47110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1051	NC_018028	GCTGGC	2	12	47163	47174	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392419132
1052	NC_018028	CAC	2	6	47181	47186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419132
1053	NC_018028	GCT	2	6	47213	47218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1054	NC_018028	CTGG	2	8	47222	47229	0 %	25 %	50 %	25 %	392419132
1055	NC_018028	GCC	2	6	47289	47294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419132
1056	NC_018028	GC	3	6	47501	47506	0 %	0 %	50 %	50 %	392419132
1057	NC_018028	CTG	2	6	47508	47513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1058	NC_018028	CAG	2	6	47544	47549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1059	NC_018028	ACT	2	6	47584	47589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419132
1060	NC_018028	TGC	2	6	47641	47646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1061	NC_018028	CGA	2	6	47657	47662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1062	NC_018028	CGTGC	2	10	47733	47742	0 %	20 %	40 %	40 %	392419132
1063	NC_018028	GCT	2	6	47756	47761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1064	NC_018028	TGC	2	6	47785	47790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1065	NC_018028	GCT	2	6	47798	47803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1066	NC_018028	CTG	3	9	47814	47822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1067	NC_018028	TGC	2	6	47863	47868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1068	NC_018028	GCC	2	6	47878	47883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419132
1069	NC_018028	ACG	2	6	47897	47902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1070	NC_018028	GTC	2	6	47933	47938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419132
1071	NC_018028	CGG	2	6	47959	47964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419132
1072	NC_018028	AGA	2	6	48053	48058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419133
1073	NC_018028	TGG	2	6	48076	48081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419133
1074	NC_018028	TGT	2	6	48091	48096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419133
1075	NC_018028	CG	3	6	48172	48177	0 %	0 %	50 %	50 %	392419133
1076	NC_018028	CAT	2	6	48224	48229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419133
1077	NC_018028	GC	3	6	48283	48288	0 %	0 %	50 %	50 %	392419133
1078	NC_018028	TGG	2	6	48338	48343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419133
1079	NC_018028	TGC	2	6	48436	48441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419133
1080	NC_018028	CGA	2	6	48482	48487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419133
1081	NC_018028	CA	3	6	48499	48504	50 %	0 %	0 %	50 %	392419133
1082	NC_018028	TGG	2	6	48571	48576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419133
1083	NC_018028	GAG	2	6	48585	48590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419133
1084	NC_018028	GCT	2	6	48599	48604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419133
1085	NC_018028	GCCG	2	8	48614	48621	0 %	0 %	50 %	50 %	392419133
1086	NC_018028	CTG	2	6	48639	48644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419133
1087	NC_018028	CCG	2	6	48645	48650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419133
1088	NC_018028	TCG	2	6	48682	48687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419133
1089	NC_018028	TCT	2	6	48706	48711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419133
1090	NC_018028	AGG	2	6	48808	48813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419133
1091	NC_018028	CGACC	2	10	48836	48845	20 %	0 %	20 %	60 %	392419133
1092	NC_018028	GCA	2	6	48854	48859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419133
1093	NC_018028	GC	3	6	48901	48906	0 %	0 %	50 %	50 %	392419133
1094	NC_018028	TGC	2	6	48910	48915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419133
1095	NC_018028	GCT	2	6	49007	49012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419133
1096	NC_018028	CGG	2	6	49034	49039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419133
1097	NC_018028	CGA	2	6	49070	49075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419133
1098	NC_018028	CGC	2	6	49079	49084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419133
1099	NC_018028	CGG	2	6	49094	49099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419133
1100	NC_018028	TCA	2	6	49120	49125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419133
1101	NC_018028	CCCG	2	8	49126	49133	0 %	0 %	25 %	75 %	392419133
1102	NC_018028	GCT	2	6	49148	49153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419133
1103	NC_018028	ATG	2	6	49179	49184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419133
1104	NC_018028	GGC	2	6	49329	49334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419133
1105	NC_018028	CAC	2	6	49430	49435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419133
1106	NC_018028	CGC	2	6	49448	49453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419133
1107	NC_018028	CGGCC	2	10	49484	49493	0 %	0 %	40 %	60 %	392419133
1108	NC_018028	CTG	2	6	49524	49529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419133
1109	NC_018028	GGCGAT	2	12	49629	49640	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392419133
1110	NC_018028	CGG	2	6	49658	49663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419133
1111	NC_018028	CCG	2	6	49702	49707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419133
1112	NC_018028	AGC	2	6	49750	49755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419133
1113	NC_018028	AGCA	2	8	49830	49837	50 %	0 %	25 %	25 %	392419133
1114	NC_018028	CTGC	2	8	49890	49897	0 %	25 %	25 %	50 %	392419133
1115	NC_018028	GCCGA	2	10	49935	49944	20 %	0 %	40 %	40 %	392419133
1116	NC_018028	CTGC	2	8	49958	49965	0 %	25 %	25 %	50 %	392419133
1117	NC_018028	GGT	2	6	49985	49990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419133
1118	NC_018028	CAT	2	6	49994	49999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419133
1119	NC_018028	CGA	2	6	50027	50032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419133
1120	NC_018028	GTG	2	6	50082	50087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419133
1121	NC_018028	GCGCC	2	10	50089	50098	0 %	0 %	40 %	60 %	392419133
1122	NC_018028	GC	3	6	50163	50168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_018028	CGC	2	6	50177	50182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_018028	GCT	2	6	50224	50229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419134
1125	NC_018028	GCT	2	6	50239	50244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419134
1126	NC_018028	TGCCC	2	10	50245	50254	0 %	20 %	20 %	60 %	392419134
1127	NC_018028	GCCC	2	8	50274	50281	0 %	0 %	25 %	75 %	392419134
1128	NC_018028	GCA	2	6	50284	50289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419134
1129	NC_018028	GCG	2	6	50304	50309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419134
1130	NC_018028	CGC	3	9	50326	50334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419134
1131	NC_018028	CAG	2	6	50402	50407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419134
1132	NC_018028	CG	3	6	50409	50414	0 %	0 %	50 %	50 %	392419134
1133	NC_018028	TGG	2	6	50421	50426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419134
1134	NC_018028	GGT	2	6	50429	50434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419134
1135	NC_018028	CGA	2	6	50521	50526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419134
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1137	NC_018028	TCGC	2	8	50796	50803	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1138	NC_018028	GCG	2	6	50818	50823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_018028	CGGAT	2	10	50835	50844	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1140	NC_018028	CAGA	2	8	50867	50874	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1141	NC_018028	GCC	2	6	50876	50881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1142	NC_018028	GTGACC	2	12	50903	50914	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392419135
1143	NC_018028	CGA	2	6	50926	50931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419135
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1145	NC_018028	CGA	2	6	51013	51018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419135
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1154	NC_018028	GCTC	2	8	51442	51449	0 %	25 %	25 %	50 %	392419136
1155	NC_018028	CCG	2	6	51478	51483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419136
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1164	NC_018028	CGA	2	6	51677	51682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419136
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1191	NC_018028	CGG	2	6	52871	52876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1192	NC_018028	GCG	2	6	52885	52890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1193	NC_018028	TCG	2	6	52907	52912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1202	NC_018028	GGC	2	6	53204	53209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1203	NC_018028	CGT	2	6	53224	53229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1206	NC_018028	GC	3	6	53299	53304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1208	NC_018028	GCCGTA	2	12	53394	53405	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392419138
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1212	NC_018028	CTG	2	6	53562	53567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419138
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1229	NC_018028	TGG	2	6	54295	54300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419138
1230	NC_018028	CAG	3	9	54369	54377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419138
1231	NC_018028	CGA	2	6	54431	54436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419138
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1233	NC_018028	GTCG	2	8	54473	54480	0 %	25 %	50 %	25 %	392419138
1234	NC_018028	GAT	2	6	54527	54532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419138
1235	NC_018028	CTCGC	2	10	54543	54552	0 %	20 %	20 %	60 %	392419138
1236	NC_018028	AAC	2	6	54615	54620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419138
1237	NC_018028	GGC	2	6	54644	54649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419138
1238	NC_018028	GCA	2	6	54653	54658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419138
1239	NC_018028	CGC	2	6	54668	54673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419138
1240	NC_018028	TTCGG	2	10	54819	54828	0 %	40 %	40 %	20 %	392419138
1241	NC_018028	GCG	2	6	54950	54955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1242	NC_018028	ACCTGC	2	12	55049	55060	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1243	NC_018028	TCCG	2	8	55102	55109	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1244	NC_018028	TCG	2	6	55123	55128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1245	NC_018028	GCC	2	6	55134	55139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1246	NC_018028	CTG	2	6	55141	55146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1247	NC_018028	GA	3	6	55204	55209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1248	NC_018028	ACGC	2	8	55210	55217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1249	NC_018028	TTCA	2	8	55266	55273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1250	NC_018028	GC	3	6	55401	55406	0 %	0 %	50 %	50 %	392419139
1251	NC_018028	GAA	2	6	55423	55428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419139
1252	NC_018028	TGC	2	6	55523	55528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419139
1253	NC_018028	CG	3	6	55534	55539	0 %	0 %	50 %	50 %	392419139
1254	NC_018028	GCG	2	6	55592	55597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419139
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1256	NC_018028	CAT	2	6	55665	55670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419139
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1259	NC_018028	GAG	2	6	55735	55740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419139
1260	NC_018028	CAGCCT	2	12	55803	55814	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392419139
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1351	NC_018028	CAC	2	6	59275	59280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1352	NC_018028	CTT	2	6	59353	59358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1353	NC_018028	ATG	2	6	59374	59379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419142
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1360	NC_018028	AGA	2	6	60012	60017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419142
1361	NC_018028	ATC	2	6	60075	60080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419142
1362	NC_018028	ATA	2	6	60094	60099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392419142
1363	NC_018028	CAAA	2	8	60156	60163	75 %	0 %	0 %	25 %	392419142
1364	NC_018028	AAG	2	6	60331	60336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1365	NC_018028	CGC	2	6	60468	60473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1366	NC_018028	GGCA	2	8	60529	60536	25 %	0 %	50 %	25 %	392419143
1367	NC_018028	TTG	2	6	60552	60557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419143
1368	NC_018028	CAT	2	6	60567	60572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419143
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1372	NC_018028	GCCC	2	8	60773	60780	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1373	NC_018028	ATGA	2	8	60837	60844	50 %	25 %	25 %	0 %	392419144
1374	NC_018028	GAA	2	6	60858	60863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419144
1375	NC_018028	GGC	2	6	60923	60928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419144
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1377	NC_018028	CAA	2	6	61094	61099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419144
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1494	NC_018028	GCG	2	6	66289	66294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419150
1495	NC_018028	GCG	2	6	66301	66306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419150
1496	NC_018028	GCG	2	6	66345	66350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419150
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1499	NC_018028	GC	3	6	66524	66529	0 %	0 %	50 %	50 %	392419151
1500	NC_018028	GGGC	2	8	66604	66611	0 %	0 %	75 %	25 %	392419151

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